EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020021835 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: si:dkey-86e18.1
Alias: -
Full Name: si:dkey-86e18.1
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 105721 bases
Position: chr4:25536406-25642126
Accession: ZDB-GENE-041014-18
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020020837	Isy1	PF06246.12	4e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020030314	-	2579	-	ENSORLP00020020837	296 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSORLG00020021835's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSORLG00020021835's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	99	59.615	ENSAPOG00000002792	si:dkey-86e18.1	99	59.615	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	100	55.000	ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	100	55.000	Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	99	57.576	ENSAOCG00000014440	si:dkey-86e18.1	99	57.576	Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	99	57.843	ENSAPEG00000011831	si:dkey-86e18.1	99	57.843	Amphiprion_percula
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	99	58.086	ENSATEG00000018061	si:dkey-86e18.1	100	58.086	Anabas_testudineus
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	97	57.388	ENSACLG00000012308	si:dkey-86e18.1	100	57.667	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	99	50.168	ENSAMXG00000038638	si:dkey-86e18.1	99	49.495	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	99	50.163	ENSCSEG00000007482	-	99	50.163	Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	100	55.128	ENSCVAG00000020099	si:dkey-86e18.1	99	55.128	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	99	45.424	ENSDARG00000043536	si:dkey-86e18.1	99	45.424	Danio_rerio
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	100	48.125	ENSELUG00000007229	si:dkey-86e18.1	100	47.500	Esox_lucius
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	99	57.605	ENSFHEG00000023250	si:dkey-86e18.1	99	57.605	Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	76	65.145	ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	80	65.145	Gambusia_affinis
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	97	57.388	ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	57.667	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	99	44.781	ENSIPUG00000012213	si:dkey-86e18.1	99	44.108	Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	99	58.413	ENSKMAG00000008387	si:dkey-86e18.1	99	58.413	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	97	50.680	ENSLBEG00000008055	si:dkey-86e18.1	98	50.667	Labrus_bergylta
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	99	39.610	ENSLACG00000003926	si:dkey-86e18.1	99	39.344	Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	99	44.369	ENSLOCG00000008902	si:dkey-86e18.1	99	45.638	Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	100	56.508	ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	56.508	Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	97	57.388	ENSMZEG00005019446	si:dkey-86e18.1	100	57.667	Maylandia_zebra
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	100	55.853	ENSMMOG00000002257	si:dkey-86e18.1	100	55.853	Mola_mola
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	100	56.151	ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	100	53.488	Monopterus_albus
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	97	54.514	ENSNBRG00000023611	si:dkey-86e18.1	100	54.882	Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	97	56.701	ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	56.667	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	100	95.425	ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	100	95.425	Oryzias_latipes
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	100	95.098	ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	100	95.098	Oryzias_latipes_hsok
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	99	78.947	ENSOMEG00000001778	si:dkey-86e18.1	100	78.947	Oryzias_melastigma
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	99	40.273	ENSPKIG00000009550	si:dkey-86e18.1	99	40.273	Paramormyrops_kingsleyae
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	99	48.322	ENSPMGG00000008481	si:dkey-86e18.1	98	48.322	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	100	59.236	ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	59.236	Poecilia_formosa
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	100	58.786	ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	100	58.786	Poecilia_latipinna
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	100	58.599	ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	100	58.599	Poecilia_mexicana
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	100	56.522	ENSPREG00000002081	si:dkey-86e18.1	100	56.522	Poecilia_reticulata
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	97	57.045	ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	57.333	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	99	46.980	ENSPNAG00000008048	si:dkey-86e18.1	99	46.512	Pygocentrus_nattereri
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	99	41.860	ENSSFOG00015002284	si:dkey-86e18.1	99	41.694	Scleropages_formosus
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	96	55.195	ENSSMAG00000017672	si:dkey-86e18.1	98	55.836	Scophthalmus_maximus
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	100	58.805	ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	100	58.805	Seriola_dumerili
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	100	57.994	ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	100	57.994	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	100	60.317	ENSSPAG00000014712	si:dkey-86e18.1	100	60.317	Stegastes_partitus
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	100	53.667	ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	100	54.333	Takifugu_rubripes
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	100	55.000	ENSXCOG00000008851	si:dkey-86e18.1	100	55.000	Xiphophorus_couchianus
ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	100	57.051	ENSXMAG00000011403	si:dkey-86e18.1	100	57.051	Xiphophorus_maculatus