EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020021850 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3536 bases
Position: chr17:5286397-5289932
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020020852	RVT_1	PF00078.27	2.6e-42	1	1

Transcripts

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ENSORLT00020030329	-	3536	-	ENSORLP00020020852	1090 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
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ENSORLG00020021850	-	61	47.438	ENSORLG00020016342	-	90	47.438
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ENSORLG00020021850	-	73	42.170	ENSORLG00020016049	-	99	42.170
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ENSORLG00020021850	-	83	41.978	ENSORLG00020012549	-	100	41.978
ENSORLG00020021850	-	61	47.584	ENSORLG00020008999	-	90	47.584
ENSORLG00020021850	-	70	44.459	ENSORLG00020004554	-	99	44.659
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ENSORLG00020021850	-	51	48.936	ENSORLG00020011898	-	99	48.936
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ENSORLG00020021850	-	55	47.673	ENSORLG00020003775	-	90	47.673
ENSORLG00020021850	-	54	47.541	ENSORLG00020003779	-	89	47.541
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ENSORLG00020021850	-	60	30.058	ENSORLG00020013338	-	81	30.058
ENSORLG00020021850	-	100	56.965	ENSORLG00020008178	-	99	57.143
ENSORLG00020021850	-	83	42.308	ENSORLG00020014097	-	100	42.308
ENSORLG00020021850	-	85	41.882	ENSORLG00020008688	-	97	41.882
ENSORLG00020021850	-	85	41.554	ENSORLG00020004158	-	93	41.554
ENSORLG00020021850	-	67	44.906	ENSORLG00020005659	-	99	44.906

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020021850	-	78	48.312	ENSATEG00000019512	-	99	48.312	Anabas_testudineus
ENSORLG00020021850	-	50	36.726	ENSATEG00000014055	-	85	36.726	Anabas_testudineus
ENSORLG00020021850	-	78	48.312	ENSATEG00000010674	-	99	48.312	Anabas_testudineus
ENSORLG00020021850	-	88	36.636	ENSATEG00000012907	-	99	36.739	Anabas_testudineus
ENSORLG00020021850	-	75	37.150	ENSATEG00000005707	-	99	37.272	Anabas_testudineus
ENSORLG00020021850	-	55	51.064	ENSATEG00000002739	-	98	51.064	Anabas_testudineus
ENSORLG00020021850	-	55	51.391	ENSATEG00000015490	-	98	51.391	Anabas_testudineus
ENSORLG00020021850	-	58	39.968	ENSATEG00000023197	-	99	40.126	Anabas_testudineus
ENSORLG00020021850	-	50	42.259	ENSATEG00000004798	-	96	42.259	Anabas_testudineus
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ENSORLG00020021850	-	58	46.635	ENSACLG00000023557	-	99	46.635	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020021850	-	71	39.795	ENSACLG00000018252	-	98	39.795	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020021850	-	76	42.367	ENSACLG00000008383	-	100	42.367	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020021850	-	52	49.215	ENSACLG00000022169	-	97	49.215	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020021850	-	61	44.843	ENSACLG00000000536	-	99	44.843	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020021850	-	83	41.776	ENSACLG00000025376	-	99	41.776	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020021850	-	61	44.925	ENSACLG00000008571	-	99	44.925	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020021850	-	83	41.776	ENSACLG00000015650	-	99	41.776	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020021850	-	51	46.524	ENSACLG00000000182	-	99	46.524	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020021850	-	83	41.667	ENSACLG00000025119	-	99	41.667	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020021850	-	54	48.805	ENSACLG00000015659	-	99	48.805	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020021850	-	61	45.373	ENSACLG00000001405	-	99	45.373	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020021850	-	76	49.519	ENSACLG00000021051	-	99	49.519	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020021850	-	85	63.402	ENSACLG00000017412	-	99	63.402	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020021850	-	75	42.099	ENSACLG00000017448	-	99	42.099	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020021850	-	67	59.553	ENSACLG00000013805	-	88	59.553	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020021850	-	56	38.250	ENSACLG00000012279	-	98	38.562	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020021850	-	83	41.996	ENSACLG00000022844	-	99	41.996	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020021850	-	51	46.346	ENSACLG00000021814	-	99	46.346	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020021850	-	80	41.610	ENSACLG00000000395	-	100	41.610	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020021850	-	83	41.447	ENSACLG00000000393	-	99	41.447	Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020021850	-	83	41.886	ENSACLG00000015667	-	99	41.886	Astatotilapia_calliptera
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ENSORLG00020021850	-	61	45.373	ENSPNYG00000008434	-	99	45.373	Pundamilia_nyererei
ENSORLG00020021850	-	51	59.425	ENSPNYG00000010678	-	99	59.425	Pundamilia_nyererei
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ENSORLG00020021850	-	99	48.224	ENSXMAG00000021735	-	99	48.490	Xiphophorus_maculatus