EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSORLG00020021857 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Oryzias_latipes_hni
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10610 bases
Position: chr17:5227807-5238416
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSORLP00020020860	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-44	1	8
ENSORLP00020020860	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-44	2	8
ENSORLP00020020860	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-44	3	8
ENSORLP00020020860	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-44	4	8
ENSORLP00020020860	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-44	5	8
ENSORLP00020020860	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-44	6	8
ENSORLP00020020860	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-44	7	8
ENSORLP00020020860	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-44	8	8
ENSORLP00020020860	zf-met	PF12874.7	2.4e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSORLT00020030340	-	4657	-	ENSORLP00020020860	572 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSORLG00020021857	-	88	60.938	ENSORLG00020010171	-	98	60.938
ENSORLG00020021857	-	51	60.481	ENSORLG00020000246	-	99	50.118
ENSORLG00020021857	-	68	62.037	ENSORLG00020011234	-	97	62.037
ENSORLG00020021857	-	70	65.128	ENSORLG00020000161	-	95	65.128
ENSORLG00020021857	-	82	47.119	ENSORLG00020000481	-	94	48.582
ENSORLG00020021857	-	53	38.516	ENSORLG00020008744	-	64	38.516
ENSORLG00020021857	-	59	49.615	ENSORLG00020017514	-	97	49.615
ENSORLG00020021857	-	70	57.653	ENSORLG00020007074	-	97	55.307
ENSORLG00020021857	-	95	65.714	ENSORLG00020009089	-	92	62.332
ENSORLG00020021857	-	55	63.054	ENSORLG00020004353	-	96	63.054
ENSORLG00020021857	-	73	68.452	ENSORLG00020004370	-	98	68.452
ENSORLG00020021857	-	81	61.303	ENSORLG00020010636	-	91	61.303
ENSORLG00020021857	-	88	51.707	ENSORLG00020015703	-	51	51.707
ENSORLG00020021857	-	51	39.815	ENSORLG00020017076	si:ch211-216l23.1	61	39.815
ENSORLG00020021857	-	61	57.835	ENSORLG00020011149	-	97	57.835
ENSORLG00020021857	-	71	56.098	ENSORLG00020009857	-	99	60.944
ENSORLG00020021857	-	79	57.778	ENSORLG00020007967	-	98	57.674
ENSORLG00020021857	-	72	52.273	ENSORLG00020016037	-	93	50.216
ENSORLG00020021857	-	71	59.113	ENSORLG00020008933	-	99	59.113
ENSORLG00020021857	-	52	38.028	ENSORLG00020010285	znf646	73	38.028
ENSORLG00020021857	-	72	60.563	ENSORLG00020016754	-	91	56.364
ENSORLG00020021857	-	50	43.662	ENSORLG00020003719	GFI1B	55	43.662
ENSORLG00020021857	-	90	63.846	ENSORLG00020009943	-	99	71.939
ENSORLG00020021857	-	81	49.497	ENSORLG00020008018	-	96	50.746
ENSORLG00020021857	-	54	52.466	ENSORLG00020001707	-	76	52.466
ENSORLG00020021857	-	57	38.224	ENSORLG00020002128	-	94	38.224
ENSORLG00020021857	-	55	41.727	ENSORLG00020009554	-	78	41.727
ENSORLG00020021857	-	66	61.654	ENSORLG00020011075	-	91	61.654
ENSORLG00020021857	-	51	47.561	ENSORLG00020009139	-	98	45.455
ENSORLG00020021857	-	79	71.784	ENSORLG00020010560	-	89	71.784
ENSORLG00020021857	-	65	55.469	ENSORLG00020017164	-	99	52.381
ENSORLG00020021857	-	77	50.237	ENSORLG00020017483	-	96	52.809
ENSORLG00020021857	-	53	40.359	ENSORLG00020018495	-	64	40.807
ENSORLG00020021857	-	86	65.534	ENSORLG00020009419	-	97	65.714
ENSORLG00020021857	-	52	35.028	ENSORLG00020009680	znf652	57	35.028
ENSORLG00020021857	-	81	63.710	ENSORLG00020008424	-	97	63.710
ENSORLG00020021857	-	80	54.464	ENSORLG00020010250	-	91	56.849
ENSORLG00020021857	-	70	51.691	ENSORLG00020018069	-	99	49.407
ENSORLG00020021857	-	78	58.757	ENSORLG00020008240	-	73	58.757
ENSORLG00020021857	-	83	68.018	ENSORLG00020010953	-	96	68.018
ENSORLG00020021857	-	82	67.089	ENSORLG00020008346	-	98	67.089
ENSORLG00020021857	-	90	63.424	ENSORLG00020010804	-	95	67.164
ENSORLG00020021857	-	59	39.382	ENSORLG00020018051	prdm5	84	39.382
ENSORLG00020021857	-	92	63.711	ENSORLG00020006148	-	97	63.918
ENSORLG00020021857	-	53	48.571	ENSORLG00020001912	znf236	73	48.571
ENSORLG00020021857	-	82	44.601	ENSORLG00020018921	-	93	44.601
ENSORLG00020021857	-	51	39.116	ENSORLG00020010950	-	94	47.170
ENSORLG00020021857	-	86	69.323	ENSORLG00020010880	-	96	72.821
ENSORLG00020021857	-	68	59.690	ENSORLG00020010020	-	98	59.690
ENSORLG00020021857	-	74	50.661	ENSORLG00020021196	-	69	47.783
ENSORLG00020021857	-	81	62.500	ENSORLG00020010916	-	92	59.794
ENSORLG00020021857	-	58	36.101	ENSORLG00020018503	-	68	36.502
ENSORLG00020021857	-	89	67.089	ENSORLG00020008891	-	94	67.089
ENSORLG00020021857	-	97	48.649	ENSORLG00020000639	-	75	48.113
ENSORLG00020021857	-	77	44.633	ENSORLG00020000219	-	87	44.633
ENSORLG00020021857	-	67	43.864	ENSORLG00020007018	-	88	44.125
ENSORLG00020021857	-	90	51.172	ENSORLG00020017850	-	95	54.202
ENSORLG00020021857	-	82	62.577	ENSORLG00020004313	-	72	62.577
ENSORLG00020021857	-	59	75.000	ENSORLG00020009180	-	97	69.507
ENSORLG00020021857	-	72	54.106	ENSORLG00020009184	-	94	54.106
ENSORLG00020021857	-	55	44.776	ENSORLG00020016666	-	64	44.776
ENSORLG00020021857	-	77	35.455	ENSORLG00020020419	-	93	41.528
ENSORLG00020021857	-	64	51.015	ENSORLG00020008484	-	98	55.455
ENSORLG00020021857	-	61	64.557	ENSORLG00020010647	-	93	61.481
ENSORLG00020021857	-	51	53.763	ENSORLG00020009965	-	73	53.763
ENSORLG00020021857	-	50	42.405	ENSORLG00020002817	GFI1	63	42.254
ENSORLG00020021857	-	73	45.064	ENSORLG00020007599	-	83	45.064
ENSORLG00020021857	-	58	36.800	ENSORLG00020004889	ZNF319	93	42.512
ENSORLG00020021857	-	77	45.695	ENSORLG00020000264	-	71	45.695

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSORLG00020021857	-	53	51.190	ENSAPOG00000000601	-	78	51.190	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020021857	-	51	53.125	ENSAPOG00000010330	-	72	53.125	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020021857	-	70	49.558	ENSAPOG00000010645	-	84	49.558	Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020021857	-	98	58.209	ENSATEG00000007658	-	68	52.970	Anabas_testudineus
ENSORLG00020021857	-	53	45.614	ENSAMXG00000013492	-	96	47.917	Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020021857	-	73	32.086	ENSCVAG00000018383	-	93	32.086	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020021857	-	90	56.944	ENSCVAG00000016924	-	77	57.627	Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020021857	-	53	45.415	ENSEBUG00000000422	-	71	44.872	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020021857	-	51	44.976	ENSEBUG00000001308	-	64	44.976	Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020021857	-	77	48.289	ENSELUG00000022942	-	86	48.289	Esox_lucius
ENSORLG00020021857	-	92	48.246	ENSELUG00000000423	-	92	48.246	Esox_lucius
ENSORLG00020021857	-	79	48.701	ENSELUG00000000281	-	75	53.237	Esox_lucius
ENSORLG00020021857	-	81	46.358	ENSELUG00000007694	-	91	43.777	Esox_lucius
ENSORLG00020021857	-	55	51.880	ENSGMOG00000005588	-	100	51.880	Gadus_morhua
ENSORLG00020021857	-	51	51.282	ENSGAFG00000021139	-	86	51.282	Gambusia_affinis
ENSORLG00020021857	-	69	52.941	ENSGAFG00000021143	-	86	52.941	Gambusia_affinis
ENSORLG00020021857	-	73	46.296	ENSGAFG00000013366	-	63	46.296	Gambusia_affinis
ENSORLG00020021857	-	50	55.030	ENSGAGG00000010492	-	73	55.030	Gopherus_agassizii
ENSORLG00020021857	-	52	38.298	ENSHBUG00000007316	-	69	38.298	Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020021857	-	87	45.620	ENSHCOG00000001256	-	87	51.172	Hippocampus_comes
ENSORLG00020021857	-	53	51.046	ENSHCOG00000007681	-	83	51.046	Hippocampus_comes
ENSORLG00020021857	-	98	48.858	ENSHCOG00000014797	-	54	48.858	Hippocampus_comes
ENSORLG00020021857	-	89	51.786	ENSHCOG00000014792	-	63	51.786	Hippocampus_comes
ENSORLG00020021857	-	54	49.794	ENSHCOG00000001238	-	89	49.794	Hippocampus_comes
ENSORLG00020021857	-	52	52.709	ENSHCOG00000007358	-	75	53.807	Hippocampus_comes
ENSORLG00020021857	-	51	47.162	ENSHCOG00000001793	-	72	46.610	Hippocampus_comes
ENSORLG00020021857	-	78	45.714	ENSHCOG00000001242	-	84	45.714	Hippocampus_comes
ENSORLG00020021857	-	99	49.123	ENSHCOG00000001870	-	94	49.123	Hippocampus_comes
ENSORLG00020021857	-	67	48.603	ENSHCOG00000001318	-	98	48.603	Hippocampus_comes
ENSORLG00020021857	-	82	49.333	ENSHCOG00000014781	-	95	49.660	Hippocampus_comes
ENSORLG00020021857	-	80	44.961	ENSHCOG00000001245	-	90	44.961	Hippocampus_comes
ENSORLG00020021857	-	79	56.213	ENSHCOG00000019454	-	81	56.213	Hippocampus_comes
ENSORLG00020021857	-	79	50.299	ENSHCOG00000020924	-	83	50.299	Hippocampus_comes
ENSORLG00020021857	-	60	52.717	ENSHCOG00000015355	-	86	54.630	Hippocampus_comes
ENSORLG00020021857	-	56	44.783	ENSHCOG00000008742	-	78	44.635	Hippocampus_comes
ENSORLG00020021857	-	100	51.429	ENSHCOG00000019006	-	97	51.429	Hippocampus_comes
ENSORLG00020021857	-	80	51.546	ENSHCOG00000020976	-	84	51.546	Hippocampus_comes
ENSORLG00020021857	-	99	44.068	ENSKMAG00000000556	-	95	47.727	Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020021857	-	75	52.632	ENSLBEG00000008733	-	68	52.632	Labrus_bergylta
ENSORLG00020021857	-	51	38.272	ENSONIG00000011529	-	97	42.857	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020021857	-	50	41.406	ENSONIG00000018151	-	98	41.406	Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020021857	-	85	61.412	ENSORLG00000027366	-	97	59.259	Oryzias_latipes
ENSORLG00020021857	-	90	56.771	ENSORLG00000027053	-	69	53.811	Oryzias_latipes
ENSORLG00020021857	-	87	63.281	ENSORLG00000022677	-	90	63.281	Oryzias_latipes
ENSORLG00020021857	-	92	64.574	ENSORLG00000028456	-	97	65.000	Oryzias_latipes
ENSORLG00020021857	-	90	56.771	ENSORLG00000025540	-	69	53.811	Oryzias_latipes
ENSORLG00020021857	-	77	45.695	ENSORLG00000028261	-	60	45.695	Oryzias_latipes
ENSORLG00020021857	-	70	65.368	ENSORLG00000028381	-	95	64.463	Oryzias_latipes
ENSORLG00020021857	-	72	63.602	ENSORLG00000028433	-	90	63.602	Oryzias_latipes
ENSORLG00020021857	-	90	58.216	ENSORLG00000027974	-	90	55.909	Oryzias_latipes
ENSORLG00020021857	-	70	56.522	ENSORLG00000012485	-	75	53.299	Oryzias_latipes
ENSORLG00020021857	-	100	58.757	ENSORLG00000025200	-	73	58.757	Oryzias_latipes
ENSORLG00020021857	-	76	61.481	ENSORLG00000029896	-	96	61.481	Oryzias_latipes
ENSORLG00020021857	-	85	56.883	ENSORLG00000000247	-	93	58.298	Oryzias_latipes
ENSORLG00020021857	-	56	58.898	ENSORLG00000027271	-	95	64.423	Oryzias_latipes
ENSORLG00020021857	-	77	52.439	ENSORLG00000024263	-	81	51.765	Oryzias_latipes
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ENSORLG00020021857	-	99	54.726	ENSSDUG00000019911	-	73	56.164	Seriola_dumerili
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ENSORLG00020021857	-	55	46.369	ENSXMAG00000028785	-	73	52.113	Xiphophorus_maculatus