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Description
Ensembl ID
ENSORLG00020022674 (Gene tree)
Gene ID
-
Gene Symbol
RBMS3
Alias
-
Full Name
RNA binding motif single stranded interacting protein 3
Gene Type
protein_coding
Species
Oryzias_latipes_hni
Status
putative
Strand
Minus strand
Length
133982 bases
Position
chr16:12564057-12698038
Accession
13427
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein IDDomain Pfam IDE-value Domain number Total number
ENSORLP00020021100RRM_1PF00076.227.8e-3312
ENSORLP00020021100RRM_1PF00076.227.8e-3322
ENSORLP00020021099RRM_1PF00076.223.2e-3212
ENSORLP00020021099RRM_1PF00076.223.2e-3222
ENSORLP00020021098RRM_1PF00076.223.7e-3212
ENSORLP00020021098RRM_1PF00076.223.7e-3222
Transcripts
Transcript IDNameLengthRefSeq ID Protein IDLengthRefSeq IDUniportKB ID
ENSORLT00020015433RBMS3-2011266-ENSORLP00020021098421 (aa)--
ENSORLT00020015434RBMS3-2021215-ENSORLP00020021099404 (aa)--
ENSORLT00020015435RBMS3-2031668-ENSORLP00020021100245 (aa)--
Gene Model
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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy ParalogGene SymbolCoverageIdentiy
ENSORLG00020022674RBMS39981.473ENSORLG00020008496-9981.473
ENSORLG00020022674RBMS35638.202ENSORLG00020006562-5340.789
ENSORLG00020022674RBMS39065.535ENSORLG00020007010rbms2b8567.120
ENSORLG00020022674RBMS36337.654ENSORLG00020016040ELAVL26337.430
ENSORLG00020022674RBMS36476.282ENSORLG00020018663rbms1a8462.081
ENSORLG00020022674RBMS36540.789ENSORLG00020003560celf5a7640.789
ENSORLG00020022674RBMS35938.333ENSORLG00020014277elavl45837.356
ENSORLG00020022674RBMS37867.262ENSORLG00020022335RBMS18864.247
ENSORLG00020022674RBMS37336.667ENSORLG00020012447-5335.567
ENSORLG00020022674RBMS37640.789ENSORLG00020008454celf46140.260
ENSORLG00020022674RBMS38769.210ENSORLG00020016803rbms2a9067.486
ENSORLG00020022674RBMS37338.158ENSORLG00020008839celf3b8638.889
ENSORLG00020022674RBMS36638.158ENSORLG00020007978celf3a7638.158
ENSORLG00020022674RBMS36336.667ENSORLG00020019326elavl1a7035.484
ENSORLG00020022674RBMS35936.667ENSORLG00020004570elavl36736.207
ENSORLG00020022674RBMS36631.683ENSORLG00020021193pabpc1l7131.683
ENSORLG00020022674RBMS36533.010ENSORLG00020018644pabpc46233.010
ENSORLG00020022674RBMS36239.474ENSORLG00020021262si:dkey-205h23.26239.474
Orthologs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy OrthologGene SymbolCoverageIdentiy Species
ENSORLG00020022674RBMS310080.142ENSG00000144642RBMS310085.606Homo_sapiens
ENSORLG00020022674RBMS39981.235ENSAPOG00000003432-9981.235Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020022674RBMS310084.279ENSAPOG00000007266rbms39394.010Acanthochromis_polyacanthus
ENSORLG00020022674RBMS36874.098ENSAMEG00000005947RBMS310074.098Ailuropoda_melanoleuca
ENSORLG00020022674RBMS38782.656ENSACIG00000021113RBMS39682.927Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020022674RBMS37286.755ENSACIG00000006987-8187.000Amphilophus_citrinellus
ENSORLG00020022674RBMS310093.443ENSAOCG00000021274rbms310093.443Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020022674RBMS39975.227ENSAOCG00000024104-9975.455Amphiprion_ocellaris
ENSORLG00020022674RBMS39976.214ENSAPEG00000009481-9976.214Amphiprion_percula
ENSORLG00020022674RBMS38294.587ENSAPEG00000016299rbms38696.330Amphiprion_percula
ENSORLG00020022674RBMS39981.235ENSATEG00000008433-9981.235Anabas_testudineus
ENSORLG00020022674RBMS310092.235ENSATEG00000024295rbms310092.471Anabas_testudineus
ENSORLG00020022674RBMS39977.931ENSAPLG00000012270RBMS310078.391Anas_platyrhynchos
ENSORLG00020022674RBMS310080.615ENSACAG00000028664RBMS39981.087Anolis_carolinensis
ENSORLG00020022674RBMS310077.752ENSANAG00000021899RBMS310077.752Aotus_nancymaae
ENSORLG00020022674RBMS310092.453ENSACLG00000018506rbms310092.689Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020022674RBMS38688.152ENSACLG00000008976-9474.324Astatotilapia_calliptera
ENSORLG00020022674RBMS38484.058ENSAMXG00000043770-10079.848Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020022674RBMS310079.953ENSAMXG00000020388rbms310082.311Astyanax_mexicanus
ENSORLG00020022674RBMS310080.615ENSBTAG00000044062RBMS310080.615Bos_taurus
ENSORLG00020022674RBMS310077.752ENSCJAG00000004312RBMS310077.752Callithrix_jacchus
ENSORLG00020022674RBMS310077.169ENSCAFG00000005464RBMS39977.169Canis_familiaris
ENSORLG00020022674RBMS310077.169ENSCAFG00020024980RBMS310077.169Canis_lupus_dingo
ENSORLG00020022674RBMS310080.142ENSCHIG00000009144RBMS39980.142Capra_hircus
ENSORLG00020022674RBMS37677.177ENSTSYG00000002615RBMS310077.177Carlito_syrichta
ENSORLG00020022674RBMS38778.689ENSCAPG00000017783RBMS39378.689Cavia_aperea
ENSORLG00020022674RBMS310078.487ENSCPOG00000006457RBMS39980.142Cavia_porcellus
ENSORLG00020022674RBMS310077.752ENSCCAG00000008671RBMS310077.752Cebus_capucinus
ENSORLG00020022674RBMS310077.523ENSCATG00000013222RBMS310077.523Cercocebus_atys
ENSORLG00020022674RBMS310080.378ENSCLAG00000005866RBMS39980.378Chinchilla_lanigera
ENSORLG00020022674RBMS36476.923ENSCSAG00000009655RBMS39976.923Chlorocebus_sabaeus
ENSORLG00020022674RBMS38684.000ENSCHOG00000000758RBMS38177.746Choloepus_hoffmanni
ENSORLG00020022674RBMS310080.615ENSCPBG00000022678RBMS39981.087Chrysemys_picta_bellii
ENSORLG00020022674RBMS310077.752ENSCANG00000032137RBMS310077.752Colobus_angolensis_palliatus
ENSORLG00020022674RBMS310074.941ENSCGRG00001007243Rbms39978.251Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSORLG00020022674RBMS310074.941ENSCGRG00000004599Rbms39978.251Cricetulus_griseus_crigri
ENSORLG00020022674RBMS310081.132ENSCSEG00000014677-9487.500Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020022674RBMS310090.845ENSCSEG00000010011RBMS310091.315Cynoglossus_semilaevis
ENSORLG00020022674RBMS310092.654ENSCVAG00000022354rbms310092.654Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020022674RBMS39978.622ENSCVAG00000022814-9978.622Cyprinodon_variegatus
ENSORLG00020022674RBMS310081.517ENSDARG00000044574rbms39097.674Danio_rerio
ENSORLG00020022674RBMS310079.433ENSDNOG00000016645RBMS310079.310Dasypus_novemcinctus
ENSORLG00020022674RBMS310079.669ENSDORG00000007220Rbms39979.669Dipodomys_ordii
ENSORLG00020022674RBMS36293.750ENSETEG00000009485-8164.124Echinops_telfairi
ENSORLG00020022674RBMS36670.732ENSEBUG00000005830rbms38356.202Eptatretus_burgeri
ENSORLG00020022674RBMS310079.905ENSEASG00005006152RBMS39979.905Equus_asinus_asinus
ENSORLG00020022674RBMS310079.905ENSECAG00000017871RBMS39979.905Equus_caballus
ENSORLG00020022674RBMS39071.646ENSEEUG00000014337RBMS310071.646Erinaceus_europaeus
ENSORLG00020022674RBMS310079.812ENSELUG00000002862rbms39481.572Esox_lucius
ENSORLG00020022674RBMS38687.678ENSELUG00000006905-9887.097Esox_lucius
ENSORLG00020022674RBMS310079.669ENSFCAG00000002130RBMS39979.669Felis_catus
ENSORLG00020022674RBMS310080.615ENSFALG00000009165RBMS39981.087Ficedula_albicollis
ENSORLG00020022674RBMS310079.905ENSFDAG00000008278RBMS39979.905Fukomys_damarensis
ENSORLG00020022674RBMS35478.947ENSFHEG00000016746-9378.947Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020022674RBMS39778.049ENSFHEG00000004787RBMS39583.740Fundulus_heteroclitus
ENSORLG00020022674RBMS38777.041ENSGMOG00000002600-9377.436Gadus_morhua
ENSORLG00020022674RBMS310080.615ENSGALG00000011439RBMS39981.087Gallus_gallus
ENSORLG00020022674RBMS310094.076ENSGAFG00000000168rbms310094.076Gambusia_affinis
ENSORLG00020022674RBMS39980.998ENSGAFG00000003329-9980.998Gambusia_affinis
ENSORLG00020022674RBMS36577.737ENSGAGG00000004039RBMS310077.737Gopherus_agassizii
ENSORLG00020022674RBMS310077.752ENSGGOG00000007228RBMS310077.752Gorilla_gorilla
ENSORLG00020022674RBMS310077.324ENSHBUG00000019785-9677.324Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020022674RBMS38794.419ENSHBUG00000021196rbms39492.937Haplochromis_burtoni
ENSORLG00020022674RBMS310079.905ENSHGLG00000002170RBMS39979.905Heterocephalus_glaber_female
ENSORLG00020022674RBMS310079.905ENSHGLG00100014278RBMS39979.905Heterocephalus_glaber_male
ENSORLG00020022674RBMS39980.569ENSHCOG00000007894-9980.569Hippocampus_comes
ENSORLG00020022674RBMS310081.132ENSIPUG00000017680rbms310083.491Ictalurus_punctatus
ENSORLG00020022674RBMS310080.142ENSSTOG00000006324RBMS39980.142Ictidomys_tridecemlineatus
ENSORLG00020022674RBMS310077.069ENSJJAG00000014708Rbms39977.069Jaculus_jaculus
ENSORLG00020022674RBMS39980.998ENSKMAG00000012586-9980.998Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020022674RBMS310092.541ENSKMAG00000020500rbms310092.774Kryptolebias_marmoratus
ENSORLG00020022674RBMS36083.270ENSLBEG00000006677rbms39783.270Labrus_bergylta
ENSORLG00020022674RBMS39980.238ENSLBEG00000027388-9980.714Labrus_bergylta
ENSORLG00020022674RBMS310082.742ENSLACG00000010581RBMS310082.742Latimeria_chalumnae
ENSORLG00020022674RBMS36980.952ENSLOCG00000002328rbms310080.952Lepisosteus_oculatus
ENSORLG00020022674RBMS310077.169ENSLAFG00000000354RBMS310077.169Loxodonta_africana
ENSORLG00020022674RBMS310080.142ENSMFAG00000033300RBMS39980.142Macaca_fascicularis
ENSORLG00020022674RBMS310080.142ENSMMUG00000004404RBMS39980.142Macaca_mulatta
ENSORLG00020022674RBMS310077.752ENSMNEG00000035839RBMS310077.752Macaca_nemestrina
ENSORLG00020022674RBMS310077.523ENSMLEG00000029464RBMS310077.523Mandrillus_leucophaeus
ENSORLG00020022674RBMS39979.426ENSMAMG00000002176-8384.252Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020022674RBMS310092.254ENSMAMG00000024043rbms310092.254Mastacembelus_armatus
ENSORLG00020022674RBMS310092.453ENSMZEG00005006308rbms310092.689Maylandia_zebra
ENSORLG00020022674RBMS310078.391ENSMZEG00005026469-9678.621Maylandia_zebra
ENSORLG00020022674RBMS310074.941ENSMAUG00000016436Rbms39978.251Mesocricetus_auratus
ENSORLG00020022674RBMS310077.752ENSMICG00000049249RBMS310077.752Microcebus_murinus
ENSORLG00020022674RBMS310076.832ENSMOCG00000006997Rbms39978.014Microtus_ochrogaster
ENSORLG00020022674RBMS38293.983ENSMMOG00000008471RBMS38995.719Mola_mola
ENSORLG00020022674RBMS39980.907ENSMMOG00000015071-9980.907Mola_mola
ENSORLG00020022674RBMS310071.616ENSMODG00000015125RBMS39973.274Monodelphis_domestica
ENSORLG00020022674RBMS310090.353ENSMALG00000019536RBMS310092.958Monopterus_albus
ENSORLG00020022674RBMS39981.710ENSMALG00000009155-9981.710Monopterus_albus
ENSORLG00020022674RBMS310076.596MGP_CAROLIEiJ_G0032783Rbms39977.778Mus_caroli
ENSORLG00020022674RBMS310074.941ENSMUSG00000039607Rbms39986.256Mus_musculus
ENSORLG00020022674RBMS310074.764MGP_PahariEiJ_G0015650Rbms39986.256Mus_pahari
ENSORLG00020022674RBMS310074.941MGP_SPRETEiJ_G0033930Rbms39986.256Mus_spretus
ENSORLG00020022674RBMS310077.169ENSMPUG00000011956RBMS310077.169Mustela_putorius_furo
ENSORLG00020022674RBMS310080.142ENSMLUG00000000659RBMS310080.142Myotis_lucifugus
ENSORLG00020022674RBMS310077.069ENSNGAG00000014039Rbms39979.196Nannospalax_galili
ENSORLG00020022674RBMS39980.998ENSNBRG00000018065-9980.998Neolamprologus_brichardi
ENSORLG00020022674RBMS310077.752ENSNLEG00000004129RBMS310077.752Nomascus_leucogenys
ENSORLG00020022674RBMS39971.071ENSMEUG00000004772RBMS310071.982Notamacropus_eugenii
ENSORLG00020022674RBMS39977.346ENSOPRG00000006808RBMS38577.346Ochotona_princeps
ENSORLG00020022674RBMS310079.905ENSODEG00000003651RBMS39979.905Octodon_degus
ENSORLG00020022674RBMS310091.111ENSONIG00000007172rbms310091.358Oreochromis_niloticus
ENSORLG00020022674RBMS310078.588ENSOANG00000010529RBMS39978.588Ornithorhynchus_anatinus
ENSORLG00020022674RBMS310076.712ENSOCUG00000004840RBMS39976.712Oryctolagus_cuniculus
ENSORLG00020022674RBMS39981.473ENSORLG00000002306-9981.473Oryzias_latipes
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