EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPCAG00000000812 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Procavia_capensis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 35469 bases
Position: chrGeneScaffold_2999:11648-47116
Accession: 30858
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPCAP00000000824	GTP_EFTU	PF00009.27	7.7e-46	1	1
ENSPCAP00000000824	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	6.5e-13	1	1
ENSPCAP00000000824	EFG_IV	PF03764.18	1.3e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPCAT00000000871	EFTUD2-201	2919	-	ENSPCAP00000000824	972 (aa)	-	UPI00018AF428

Gene Model

Click here to download ENSPCAG00000000812's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPCAG00000000812's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.576	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.272	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	88.066	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.473	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	95.473	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	84.774	ENSACIG00000009096	eftud2	100	84.568	Amphilophus_citrinellus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	87	83.882	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	83.882	Amphiprion_ocellaris
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.374	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	88.169	Amphiprion_percula
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.889	ENSATEG00000000457	eftud2	100	88.683	Anabas_testudineus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	99	90.216	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	90.216	Anas_platyrhynchos
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	93.519	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	93.519	Anolis_carolinensis
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.679	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	95.679	Aotus_nancymaae
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.477	ENSACLG00000001296	eftud2	100	88.272	Astatotilapia_calliptera
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	87.718	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	88.025	Astyanax_mexicanus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.165	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	95.165	Bos_taurus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	99	67.045	WBGene00001166	eftu-2	99	66.736	Caenorhabditis_elegans
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.679	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	95.679	Callithrix_jacchus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.473	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	95.473	Canis_familiaris
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.473	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	95.473	Canis_lupus_dingo
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.165	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	95.165	Capra_hircus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.267	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	95.267	Carlito_syrichta
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	94.650	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	94.650	Cavia_aperea
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	94.650	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	94.650	Cavia_porcellus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.679	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	95.679	Cebus_capucinus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.679	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	95.679	Cercocebus_atys
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	94.547	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	94.547	Chinchilla_lanigera
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.679	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	95.679	Chlorocebus_sabaeus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	88	86.150	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	95	86.150	Choloepus_hoffmanni
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	94.547	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	94.547	Chrysemys_picta_bellii
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	74.256	ENSCING00000009372	-	100	74.256	Ciona_intestinalis
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	99	74.695	ENSCSAVG00000004985	-	99	76.651	Ciona_savignyi
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.679	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	95.679	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.165	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	95.165	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.165	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	95.165	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.066	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	87.860	Cynoglossus_semilaevis
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.272	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	88.066	Cyprinodon_variegatus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	87.140	ENSDARG00000012261	eftud2	100	87.701	Danio_rerio
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.062	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	95.062	Dasypus_novemcinctus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.062	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	95.062	Dipodomys_ordii
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	71.692	FBgn0039566	CG4849	100	71.692	Drosophila_melanogaster
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	92	88.873	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	88.873	Echinops_telfairi
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	69	96.078	ENSEBUG00000004047	-	89	87.183	Eptatretus_burgeri
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.473	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	95.473	Equus_asinus_asinus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.370	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	95.370	Equus_caballus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	83	77.713	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	77.713	Erinaceus_europaeus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	86.934	ENSELUG00000017169	eftud2	100	86.934	Esox_lucius
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.576	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	95.576	Felis_catus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	93.724	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	93.724	Ficedula_albicollis
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	94.856	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	94.856	Fukomys_damarensis
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.374	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	88.169	Fundulus_heteroclitus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	87.654	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	87.654	Gadus_morhua
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	93.827	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	93.827	Gallus_gallus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.272	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	88.169	Gambusia_affinis
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	87.963	ENSGACG00000009163	eftud2	100	87.757	Gasterosteus_aculeatus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.679	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	95.679	Gorilla_gorilla
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.374	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	88.169	Haplochromis_burtoni
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	94.444	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	94.444	Heterocephalus_glaber_female
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	96	100.000	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	94.444	Heterocephalus_glaber_male
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	87.243	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	87.243	Hippocampus_comes
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	87.551	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	88.169	Ictalurus_punctatus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	89.815	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	93.909	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	95	95.765	ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	95.765	Jaculus_jaculus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	87.860	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	87.654	Kryptolebias_marmoratus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	93	91.271	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	89.765	Labrus_bergylta
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	90.329	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	90.853	Latimeria_chalumnae
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.374	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	88.374	Lepisosteus_oculatus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.576	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	95.576	Loxodonta_africana
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.679	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	95.679	Macaca_fascicularis
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.679	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.679	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	95.679	Macaca_nemestrina
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.679	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	95.679	Mandrillus_leucophaeus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.683	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	88.477	Mastacembelus_armatus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.477	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	88.272	Maylandia_zebra
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	93.840	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	93.840	Meleagris_gallopavo
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.165	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	95.165	Mesocricetus_auratus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.679	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	95.679	Microcebus_murinus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	92	81.348	ENSMOCG00000017653	-	90	81.348	Microtus_ochrogaster
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.267	ENSMOCG00000009039	-	100	95.267	Microtus_ochrogaster
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	87	89.647	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	89.647	Mola_mola
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.473	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	95.473	Monodelphis_domestica
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	87	87.882	ENSMALG00000014501	eftud2	100	87.882	Monopterus_albus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	94.959	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	94.959	Mus_caroli
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.062	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	94.959	Mus_musculus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	94.959	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	94.959	Mus_pahari
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	94.959	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	94.959	Mus_spretus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	93	99.006	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	87	99.006	Mustela_putorius_furo
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.473	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	95.473	Myotis_lucifugus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.165	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	95.165	Nannospalax_galili
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.374	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	88.169	Neolamprologus_brichardi
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	93	97.459	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	92	97.459	Nomascus_leucogenys
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	99.280	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	99.280	Notamacropus_eugenii
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	87.140	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	87.140	Ochotona_princeps
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	94.444	ENSODEG00000018041	-	100	94.444	Octodon_degus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	93	75.575	ENSODEG00000003385	-	100	75.575	Octodon_degus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.477	ENSONIG00000000912	eftud2	100	88.272	Oreochromis_niloticus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.473	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	95.473	Oryctolagus_cuniculus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.066	ENSORLG00000003109	eftud2	100	88.066	Oryzias_latipes
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	87.963	ENSORLG00020009865	eftud2	100	87.963	Oryzias_latipes_hni
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	87.963	ENSORLG00015002611	eftud2	100	89.542	Oryzias_latipes_hsok
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	93.621	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	93.621	Otolemur_garnettii
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.165	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	95.165	Ovis_aries
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.576	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	95.576	Pan_paniscus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.473	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	95.473	Panthera_pardus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.473	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	95.473	Panthera_tigris_altaica
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.576	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	95.576	Pan_troglodytes
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.679	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	95.679	Papio_anubis
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	93	96.582	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.582	Pelodiscus_sinensis
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	80.658	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	80.658	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.165	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	95.165	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.576	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	95.576	Phascolarctos_cinereus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.272	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	88.169	Poecilia_formosa
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.272	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	88.169	Poecilia_latipinna
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.272	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	88.169	Poecilia_mexicana
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	94.239	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	94.239	Pongo_abelii
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.576	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	95.576	Propithecus_coquereli
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	90.535	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	90.535	Pteropus_vampyrus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.374	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	88.169	Pundamilia_nyererei
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	87.963	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	88.477	Pygocentrus_nattereri
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.165	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	94.959	Rattus_norvegicus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.576	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	95.576	Rhinopithecus_bieti
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.576	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	95.576	Rhinopithecus_roxellana
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	93	33.094	YKL173W	SNU114	87	33.627	Saccharomyces_cerevisiae
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.679	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	95.679	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	95	95.548	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	95.548	Sarcophilus_harrisii
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.066	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	88.193	Scleropages_formosus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.066	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	87.860	Scophthalmus_maximus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.374	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	88.169	Seriola_dumerili
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.477	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	88.272	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	87.037	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	87.037	Sorex_araneus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	93.519	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	93.519	Sphenodon_punctatus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.477	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	88.272	Stegastes_partitus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.473	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	95.473	Sus_scrofa
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	84	96.837	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	96.837	Taeniopygia_guttata
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	87.551	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	87.346	Takifugu_rubripes
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	83.299	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	83.094	Tetraodon_nigroviridis
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	90.021	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	90.021	Tupaia_belangeri
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	86.831	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	86.831	Tursiops_truncatus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	94.353	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	94.353	Ursus_americanus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.473	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	95.473	Ursus_maritimus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	84	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	84	100.000	Vicugna_pacos
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.473	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	95.473	Vulpes_vulpes
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	97	90.938	ENSXETG00000003394	eftud2	98	91.839	Xenopus_tropicalis
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	81	93.614	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.614	Xiphophorus_couchianus
ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	88.272	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	88.169	Xiphophorus_maculatus