EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSPCAG00000002272 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: PUSL1
Alias: FLJ90811
Full Name: pseudouridine synthase like 1
Gene Type: protein_coding
Species: Procavia_capensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1992 bases
Position: chrGeneScaffold_5033:28362-30353
Accession: 26914
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPCAP00000002118	PseudoU_synth_1	PF01416.20	1.2e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPCAT00000002253	PUSL1-201	726	-	ENSPCAP00000002118	242 (aa)	-	UPI00018AF2DD

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	72.016	ENSG00000169972	PUSL1	98	59.350	Homo_sapiens
ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	50.794	ENSAPOG00000016290	pusl1	63	50.794	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	73.361	ENSAMEG00000013752	PUSL1	81	73.361	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPCAG00000002272	PUSL1	96	42.194	ENSACIG00000015240	pusl1	90	42.194	Amphilophus_citrinellus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	51.852	ENSAOCG00000019419	pusl1	59	52.432	Amphiprion_ocellaris
ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	51.852	ENSAPEG00000005452	pusl1	63	51.852	Amphiprion_percula
ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	49.735	ENSATEG00000024154	pusl1	63	49.735	Anabas_testudineus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	55.263	ENSAPLG00000004946	PUSL1	63	55.263	Anas_platyrhynchos
ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	54.211	ENSACAG00000014111	PUSL1	71	54.211	Anolis_carolinensis
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	71.074	ENSANAG00000037456	PUSL1	80	71.074	Aotus_nancymaae
ENSPCAG00000002272	PUSL1	98	42.562	ENSACLG00000008675	pusl1	91	42.562	Astatotilapia_calliptera
ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	48.387	ENSAMXG00000044007	pusl1	68	48.387	Astyanax_mexicanus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	72.131	ENSBTAG00000007619	PUSL1	84	72.131	Bos_taurus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	71.488	ENSCJAG00000010972	PUSL1	80	71.488	Callithrix_jacchus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	72.016	ENSCAFG00000019291	PUSL1	80	72.016	Canis_familiaris
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	72.016	ENSCAFG00020011568	PUSL1	79	72.016	Canis_lupus_dingo
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	72.131	ENSCHIG00000012615	PUSL1	85	72.131	Capra_hircus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	50	60.484	ENSCAPG00000011911	-	92	60.484	Cavia_aperea
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	69.959	ENSCPOG00000005149	PUSL1	79	69.959	Cavia_porcellus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	71.488	ENSCCAG00000027475	PUSL1	80	71.488	Cebus_capucinus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	72.428	ENSCATG00000018260	PUSL1	80	72.428	Cercocebus_atys
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	70.782	ENSCLAG00000005232	PUSL1	80	70.782	Chinchilla_lanigera
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	71.605	ENSCSAG00000000680	PUSL1	80	71.605	Chlorocebus_sabaeus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	97	50.207	ENSCPBG00000022621	PUSL1	82	50.207	Chrysemys_picta_bellii
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	72.016	ENSCANG00000034373	PUSL1	80	72.016	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	66.667	ENSCGRG00001012429	Pusl1	84	66.667	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	66.667	ENSCGRG00000006466	Pusl1	84	66.667	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	49.735	ENSCSEG00000005159	pusl1	63	49.735	Cynoglossus_semilaevis
ENSPCAG00000002272	PUSL1	93	37.991	ENSCVAG00000012923	pusl1	87	37.991	Cyprinodon_variegatus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	42.857	ENSDARG00000074565	pusl1	94	40.394	Danio_rerio
ENSPCAG00000002272	PUSL1	73	33.668	FBgn0083976	CG34140	64	33.668	Drosophila_melanogaster
ENSPCAG00000002272	PUSL1	100	75.510	ENSECAG00000006248	PUSL1	81	75.510	Equus_caballus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	65.844	ENSEEUG00000000837	PUSL1	82	65.844	Erinaceus_europaeus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	48.677	ENSELUG00000015945	pusl1	64	48.677	Esox_lucius
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	73.967	ENSFCAG00000007617	PUSL1	80	73.967	Felis_catus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	50	58.871	ENSFDAG00000010007	-	95	58.871	Fukomys_damarensis
ENSPCAG00000002272	PUSL1	98	45.455	ENSFHEG00000006370	pusl1	80	45.455	Fundulus_heteroclitus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	53.158	ENSGMOG00000019388	pusl1	67	53.158	Gadus_morhua
ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	54.737	ENSGALG00000001714	PUSL1	70	54.737	Gallus_gallus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	43.265	ENSGAFG00000007546	pusl1	83	43.265	Gambusia_affinis
ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	49.474	ENSGACG00000007848	pusl1	62	49.474	Gasterosteus_aculeatus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	97	50.622	ENSGAGG00000004730	PUSL1	82	50.622	Gopherus_agassizii
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	72.016	ENSGGOG00000005364	PUSL1	94	72.016	Gorilla_gorilla
ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	47.619	ENSHBUG00000001264	pusl1	64	47.619	Haplochromis_burtoni
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	68.980	ENSHGLG00000017570	PUSL1	80	68.980	Heterocephalus_glaber_female
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	68.980	ENSHGLG00100007641	PUSL1	81	68.980	Heterocephalus_glaber_male
ENSPCAG00000002272	PUSL1	95	46.383	ENSHCOG00000010077	pusl1	84	46.383	Hippocampus_comes
ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	47.619	ENSIPUG00000023921	pusl1	64	47.619	Ictalurus_punctatus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	100	72.245	ENSSTOG00000001783	PUSL1	77	72.245	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	100	71.020	ENSJJAG00000020471	Pusl1	83	71.020	Jaculus_jaculus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	50.265	ENSKMAG00000005154	pusl1	64	50.265	Kryptolebias_marmoratus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	48.148	ENSLBEG00000013469	pusl1	66	48.148	Labrus_bergylta
ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	54.787	ENSLACG00000018795	PUSL1	92	54.787	Latimeria_chalumnae
ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	49.206	ENSLOCG00000002210	pusl1	64	49.206	Lepisosteus_oculatus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	100	77.143	ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	77.143	Loxodonta_africana
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	71.193	ENSMFAG00000046288	PUSL1	80	71.193	Macaca_fascicularis
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	57.613	ENSMMUG00000016279	PUSL1	78	57.613	Macaca_mulatta
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	71.605	ENSMNEG00000037989	PUSL1	80	71.605	Macaca_nemestrina
ENSPCAG00000002272	PUSL1	51	57.812	ENSMLEG00000039224	-	98	57.812	Mandrillus_leucophaeus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	49.206	ENSMAMG00000016538	pusl1	62	49.206	Mastacembelus_armatus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	96	42.437	ENSMZEG00005026990	pusl1	90	42.437	Maylandia_zebra
ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	53.684	ENSMGAG00000003037	PUSL1	64	53.684	Meleagris_gallopavo
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	67.901	ENSMAUG00000019924	Pusl1	84	67.901	Mesocricetus_auratus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	100	70.204	ENSMICG00000014171	PUSL1	83	70.204	Microcebus_murinus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	66.255	ENSMOCG00000005602	Pusl1	84	66.255	Microtus_ochrogaster
ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	47.619	ENSMMOG00000003269	pusl1	65	50.000	Mola_mola
ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	48.677	ENSMALG00000021686	pusl1	62	48.677	Monopterus_albus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	67.490	MGP_CAROLIEiJ_G0026911	Pusl1	84	67.490	Mus_caroli
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	67.490	ENSMUSG00000051557	Pusl1	84	67.490	Mus_musculus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	67.490	MGP_PahariEiJ_G0029260	Pusl1	84	67.490	Mus_pahari
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	67.490	MGP_SPRETEiJ_G0027906	Pusl1	84	67.490	Mus_spretus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	72.541	ENSMPUG00000014313	PUSL1	80	72.541	Mustela_putorius_furo
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	65.984	ENSNGAG00000004647	Pusl1	73	65.984	Nannospalax_galili
ENSPCAG00000002272	PUSL1	98	41.736	ENSNBRG00000014762	pusl1	88	41.736	Neolamprologus_brichardi
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	72.428	ENSNLEG00000000051	PUSL1	88	72.428	Nomascus_leucogenys
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	47.521	ENSMEUG00000005176	-	94	47.521	Notamacropus_eugenii
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	56.790	ENSMEUG00000011649	-	85	56.790	Notamacropus_eugenii
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	67.490	ENSODEG00000008247	PUSL1	78	67.490	Octodon_degus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	41.700	ENSONIG00000019361	pusl1	83	41.700	Oreochromis_niloticus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	95	43.404	ENSORLG00000016228	pusl1	79	43.404	Oryzias_latipes
ENSPCAG00000002272	PUSL1	95	44.255	ENSORLG00020013710	pusl1	79	44.255	Oryzias_latipes_hni
ENSPCAG00000002272	PUSL1	95	43.404	ENSORLG00015008715	pusl1	82	43.404	Oryzias_latipes_hsok
ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	48.148	ENSOMEG00000018897	pusl1	64	48.148	Oryzias_melastigma
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	69.421	ENSOGAG00000031692	PUSL1	84	69.421	Otolemur_garnettii
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	72.016	ENSOARG00000004905	PUSL1	91	72.016	Ovis_aries
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	71.605	ENSPPAG00000029283	PUSL1	80	71.605	Pan_paniscus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	74.486	ENSPPRG00000023329	PUSL1	81	74.486	Panthera_pardus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	74.590	ENSPTIG00000018532	PUSL1	90	74.590	Panthera_tigris_altaica
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	72.016	ENSPTRG00000000021	PUSL1	80	72.016	Pan_troglodytes
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	71.193	ENSPANG00000000591	PUSL1	80	71.193	Papio_anubis
ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	48.148	ENSPKIG00000002447	pusl1	65	48.148	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPCAG00000002272	PUSL1	98	48.971	ENSPSIG00000002781	PUSL1	89	48.971	Pelodiscus_sinensis
ENSPCAG00000002272	PUSL1	76	48.663	ENSPMGG00000011051	pusl1	67	47.340	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	68.724	ENSPEMG00000013541	Pusl1	84	68.724	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	57.613	ENSPCIG00000007816	-	56	57.613	Phascolarctos_cinereus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	98	46.888	ENSPFOG00000015448	pusl1	84	46.888	Poecilia_formosa
ENSPCAG00000002272	PUSL1	98	46.694	ENSPLAG00000004348	pusl1	81	46.694	Poecilia_latipinna
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ENSPCAG00000002272	PUSL1	99	70.370	ENSPPYG00000002014	PUSL1	87	70.370	Pongo_abelii
ENSPCAG00000002272	PUSL1	50	56.452	ENSPCOG00000024685	-	88	56.452	Propithecus_coquereli
ENSPCAG00000002272	PUSL1	66	89.189	ENSPVAG00000001016	PUSL1	53	89.189	Pteropus_vampyrus
ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	47.090	ENSPNYG00000006588	pusl1	78	47.090	Pundamilia_nyererei
ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	49.468	ENSPNAG00000024441	pusl1	64	49.468	Pygocentrus_nattereri
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