EuRBPDB

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPCAG00000002300 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: MSI1
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Procavia_capensis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 19375 bases
Position: chrGeneScaffold_990:56270-75644
Accession: 7330
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPCAP00000002146	RRM_1	PF00076.22	1.1e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPCAT00000002282	MSI1-201	822	-	ENSPCAP00000002146	273 (aa)	-	UPI00018AF246

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPCAG00000002300	MSI1	58	45.223	ENSPCAG00000010552	MSI2	65	45.223

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.923	ENSG00000135097	MSI1	98	76.923	Homo_sapiens
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	89.340	ENSAPOG00000003191	MSI1	76	89.340	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	90.355	ENSAPOG00000023458	-	76	90.355	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	90.355	ENSAMEG00000013302	MSI1	65	90.355	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	84.694	ENSACIG00000017754	-	64	95.082	Amphilophus_citrinellus
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	89.340	ENSAOCG00000003804	MSI1	76	89.340	Amphiprion_ocellaris
ENSPCAG00000002300	MSI1	62	88.095	ENSAOCG00000009031	-	77	81.967	Amphiprion_ocellaris
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	90.355	ENSAPEG00000006857	-	64	90.355	Amphiprion_percula
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	89.340	ENSAPEG00000003245	MSI1	76	89.340	Amphiprion_percula
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	90.355	ENSATEG00000017059	MSI1	76	90.355	Anabas_testudineus
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	84.772	ENSATEG00000023779	-	75	84.772	Anabas_testudineus
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	98.985	ENSACAG00000002762	MSI1	80	98.985	Anolis_carolinensis
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.923	ENSANAG00000027151	MSI1	98	76.923	Aotus_nancymaae
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	96.447	ENSANAG00000027901	-	88	96.447	Aotus_nancymaae
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	89.848	ENSACLG00000000117	-	81	89.848	Astatotilapia_calliptera
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	89.340	ENSACLG00000011230	MSI1	76	89.340	Astatotilapia_calliptera
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	88.832	ENSAMXG00000038960	msi1	61	88.832	Astyanax_mexicanus
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.923	ENSBTAG00000009800	MSI1	78	100.000	Bos_taurus
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.923	ENSCJAG00000008578	MSI1	98	76.923	Callithrix_jacchus
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.557	ENSCAFG00000010283	MSI1	98	76.557	Canis_familiaris
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.923	ENSCAFG00020020585	MSI1	88	76.923	Canis_lupus_dingo
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	70.357	ENSCHIG00000024304	MSI1	98	70.357	Capra_hircus
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	100.000	ENSTSYG00000033949	MSI1	73	100.000	Carlito_syrichta
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	100.000	ENSCAPG00000003919	MSI1	56	100.000	Cavia_aperea
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.923	ENSCPOG00000012361	MSI1	78	100.000	Cavia_porcellus
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.923	ENSCCAG00000035567	MSI1	98	76.923	Cebus_capucinus
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.923	ENSCATG00000030019	MSI1	98	76.923	Cercocebus_atys
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.923	ENSCLAG00000011329	MSI1	78	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSPCAG00000002300	MSI1	67	94.681	ENSCSAG00000002265	MSI1	93	94.681	Chlorocebus_sabaeus
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	99.492	ENSCPBG00000011349	MSI1	81	99.492	Chrysemys_picta_bellii
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.923	ENSCANG00000040651	MSI1	99	76.923	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.923	ENSCGRG00001018883	Msi1	98	76.923	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.923	ENSCGRG00000002191	Msi1	72	76.923	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	87.817	ENSCSEG00000008352	-	76	87.817	Cynoglossus_semilaevis
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	77.665	ENSCSEG00000011032	MSI1	79	77.665	Cynoglossus_semilaevis
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	88.832	ENSCSEG00000005834	-	76	88.832	Cynoglossus_semilaevis
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	89.848	ENSCVAG00000009100	MSI1	76	89.848	Cyprinodon_variegatus
ENSPCAG00000002300	MSI1	57	64.516	ENSCVAG00000017463	-	59	64.516	Cyprinodon_variegatus
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	90.355	ENSDARG00000010710	msi1	92	90.355	Danio_rerio
ENSPCAG00000002300	MSI1	56	87.582	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	64	87.582	Danio_rerio
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	100.000	ENSDNOG00000005713	MSI1	73	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.923	ENSDORG00000005610	Msi1	93	76.923	Dipodomys_ordii
ENSPCAG00000002300	MSI1	68	99.459	ENSETEG00000004756	MSI1	73	99.459	Echinops_telfairi
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.923	ENSEASG00005004736	MSI1	98	76.923	Equus_asinus_asinus
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.923	ENSECAG00000017526	MSI1	98	76.923	Equus_caballus
ENSPCAG00000002300	MSI1	67	85.870	ENSELUG00000023280	-	77	85.870	Esox_lucius
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	84.762	ENSELUG00000023219	MSI1	74	84.762	Esox_lucius
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.923	ENSFCAG00000011007	MSI1	98	76.923	Felis_catus
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	98.985	ENSFALG00000007574	MSI1	66	98.985	Ficedula_albicollis
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.557	ENSFDAG00000019586	MSI1	99	76.557	Fukomys_damarensis
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	90.355	ENSFHEG00000022446	MSI1	76	90.355	Fundulus_heteroclitus
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	89.340	ENSFHEG00000003560	-	76	89.340	Fundulus_heteroclitus
ENSPCAG00000002300	MSI1	67	89.674	ENSGMOG00000001006	MSI1	73	89.674	Gadus_morhua
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	89.286	ENSGMOG00000017838	-	55	89.286	Gadus_morhua
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	98.985	ENSGALG00000007227	MSI1	70	98.985	Gallus_gallus
ENSPCAG00000002300	MSI1	71	63.212	ENSGAFG00000005860	-	69	63.212	Gambusia_affinis
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	87.817	ENSGAFG00000021522	MSI1	76	87.817	Gambusia_affinis
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	68.864	ENSGACG00000008674	-	94	68.864	Gasterosteus_aculeatus
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	90.355	ENSGACG00000012679	MSI1	76	90.355	Gasterosteus_aculeatus
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	99.492	ENSGAGG00000016037	MSI1	76	99.492	Gopherus_agassizii
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.923	ENSGGOG00000010328	MSI1	87	76.923	Gorilla_gorilla
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	89.848	ENSHBUG00000011841	-	76	89.848	Haplochromis_burtoni
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	89.340	ENSHBUG00000021921	MSI1	76	89.340	Haplochromis_burtoni
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.557	ENSHGLG00000012782	MSI1	98	76.557	Heterocephalus_glaber_female
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.557	ENSHGLG00100016848	MSI1	99	76.557	Heterocephalus_glaber_male
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	89.340	ENSHCOG00000012067	-	77	95.161	Hippocampus_comes
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	88.265	ENSHCOG00000012019	MSI1	79	88.265	Hippocampus_comes
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	87.817	ENSIPUG00000001976	msi1	77	87.817	Ictalurus_punctatus
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.923	ENSSTOG00000009799	MSI1	88	76.923	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.923	ENSJJAG00000010463	Msi1	98	76.923	Jaculus_jaculus
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	86.294	ENSJJAG00000010643	-	79	86.294	Jaculus_jaculus
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	88.832	ENSKMAG00000011251	MSI1	76	88.832	Kryptolebias_marmoratus
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	83.756	ENSKMAG00000019877	-	79	83.756	Kryptolebias_marmoratus
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	88.325	ENSLBEG00000001375	-	76	88.325	Labrus_bergylta
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	90.355	ENSLBEG00000008789	MSI1	76	90.355	Labrus_bergylta
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	69.597	ENSLACG00000018287	MSI1	100	69.597	Latimeria_chalumnae
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	64.364	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	64.364	Loxodonta_africana
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	100.000	ENSMFAG00000001798	MSI1	78	100.000	Macaca_fascicularis
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.923	ENSMMUG00000031527	MSI1	97	76.923	Macaca_mulatta
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.923	ENSMNEG00000040034	MSI1	98	76.923	Macaca_nemestrina
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.923	ENSMLEG00000003921	MSI1	99	76.923	Mandrillus_leucophaeus
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	89.340	ENSMAMG00000002279	MSI1	76	89.340	Mastacembelus_armatus
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	88.832	ENSMAMG00000018426	-	76	88.832	Mastacembelus_armatus
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	89.848	ENSMZEG00005000340	-	76	89.848	Maylandia_zebra
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	89.340	ENSMZEG00005026892	MSI1	76	89.340	Maylandia_zebra
ENSPCAG00000002300	MSI1	55	98.675	ENSMGAG00000016518	-	89	98.675	Meleagris_gallopavo
ENSPCAG00000002300	MSI1	64	100.000	ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.923	ENSMICG00000033181	MSI1	98	76.923	Microcebus_murinus
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.557	ENSMOCG00000002286	Msi1	98	76.557	Microtus_ochrogaster
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	83.249	ENSMMOG00000012265	-	78	83.249	Mola_mola
ENSPCAG00000002300	MSI1	57	94.194	ENSMMOG00000010492	MSI1	75	94.194	Mola_mola
ENSPCAG00000002300	MSI1	65	51.381	ENSMODG00000003189	-	71	51.381	Monodelphis_domestica
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	89.848	ENSMALG00000017889	MSI1	76	89.848	Monopterus_albus
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	88.325	ENSMALG00000001426	-	80	88.325	Monopterus_albus
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.190	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	87	89.848	Mus_caroli
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.190	ENSMUSG00000054256	Msi1	80	98.985	Mus_musculus
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	75.824	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	79	98.477	Mus_pahari
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.190	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	87	89.848	Mus_spretus
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.923	ENSMPUG00000003168	MSI1	88	76.923	Mustela_putorius_furo
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	85.572	ENSMLUG00000010313	MSI1	76	85.572	Myotis_lucifugus
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.923	ENSNGAG00000014508	Msi1	99	76.923	Nannospalax_galili
ENSPCAG00000002300	MSI1	66	78.453	ENSNBRG00000018012	MSI1	74	78.453	Neolamprologus_brichardi
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	89.848	ENSNBRG00000000841	-	76	89.848	Neolamprologus_brichardi
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	64.835	ENSNLEG00000015636	MSI1	81	64.835	Nomascus_leucogenys
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	61.538	ENSMEUG00000015759	MSI1	83	61.538	Notamacropus_eugenii
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	88.325	ENSOPRG00000016879	MSI1	78	88.325	Ochotona_princeps
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.923	ENSODEG00000006328	MSI1	99	76.923	Octodon_degus
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	89.848	ENSONIG00000011182	MSI1	76	89.848	Oreochromis_niloticus
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	69.231	ENSONIG00000019452	-	94	69.231	Oreochromis_niloticus
ENSPCAG00000002300	MSI1	100	76.923	ENSOCUG00000027716	MSI1	88	76.923	Oryctolagus_cuniculus
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	88.325	ENSORLG00000029593	MSI1	77	88.325	Oryzias_latipes
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	90.355	ENSORLG00000019978	-	76	90.355	Oryzias_latipes
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	90.355	ENSORLG00020001208	-	54	90.355	Oryzias_latipes_hni
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	88.325	ENSORLG00020008266	MSI1	77	88.325	Oryzias_latipes_hni
ENSPCAG00000002300	MSI1	72	90.355	ENSORLG00015013672	-	54	90.355	Oryzias_latipes_hsok
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ENSPCAG00000002300	MSI1	72	90.355	ENSOMEG00000017536	MSI1	76	90.355	Oryzias_melastigma
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