EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSPCAG00000002880 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: AGO2
Alias: CASC7|EIF2C2|LINC00980|Q10|hAGO2
Full Name: argonaute 2%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Procavia_capensis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 36643 bases
Position: chrGeneScaffold_5605:264371-301013
Accession: 3263
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPCAP00000002746	PAZ	PF02170.22	5.4e-27	1	1
ENSPCAP00000002746	Piwi	PF02171.17	7.2e-92	1	2
ENSPCAP00000002746	Piwi	PF02171.17	7.2e-92	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPCAT00000002919	AGO2-201	2556	-	ENSPCAP00000002746	851 (aa)	-	UPI00018B0C55

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	65.304	ENSPCAG00000010090	AGO3	99	65.304
ENSPCAG00000002880	AGO2	56	85.283	ENSPCAG00000005604	AGO1	64	85.283

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	94.194	ENSG00000123908	AGO2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSPCAG00000002880	AGO2	98	88.319	ENSAPOG00000017586	ago2	97	87.765	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.640	ENSAMEG00000005019	AGO2	99	93.640	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPCAG00000002880	AGO2	82	87.770	ENSACIG00000001179	ago2	96	87.770	Amphilophus_citrinellus
ENSPCAG00000002880	AGO2	98	88.796	ENSAOCG00000015307	ago2	97	88.235	Amphiprion_ocellaris
ENSPCAG00000002880	AGO2	98	88.796	ENSAPEG00000018425	ago2	97	88.235	Amphiprion_percula
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	88.312	ENSATEG00000000529	ago2	97	88.312	Anabas_testudineus
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.270	ENSAPLG00000010465	AGO2	99	93.270	Anas_platyrhynchos
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.042	ENSACAG00000000167	AGO2	97	93.042	Anolis_carolinensis
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.979	ENSANAG00000027399	AGO2	99	93.979	Aotus_nancymaae
ENSPCAG00000002880	AGO2	81	88.630	ENSACLG00000024684	ago2	98	88.630	Astatotilapia_calliptera
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	87.750	ENSAMXG00000014587	ago2	99	87.529	Astyanax_mexicanus
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.979	ENSBTAG00000001579	AGO2	99	93.979	Bos_taurus
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	63.647	WBGene00000105	alg-1	87	63.647	Caenorhabditis_elegans
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	63.084	WBGene00000106	alg-2	96	63.084	Caenorhabditis_elegans
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.979	ENSCJAG00000004132	AGO2	99	93.979	Callithrix_jacchus
ENSPCAG00000002880	AGO2	95	94.096	ENSCAFG00000001196	AGO2	100	94.096	Canis_familiaris
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.861	ENSCAFG00020014198	AGO2	99	93.861	Canis_lupus_dingo
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.979	ENSCHIG00000010156	AGO2	99	93.743	Capra_hircus
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.861	ENSTSYG00000007281	AGO2	98	93.861	Carlito_syrichta
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	78.766	ENSCAPG00000013707	AGO2	98	78.538	Cavia_aperea
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.979	ENSCPOG00000010428	AGO2	99	93.979	Cavia_porcellus
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.979	ENSCCAG00000035031	AGO2	99	93.979	Cebus_capucinus
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	90.537	ENSCATG00000038820	AGO2	100	90.533	Cercocebus_atys
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.979	ENSCLAG00000001381	AGO2	99	93.979	Chinchilla_lanigera
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.979	ENSCSAG00000009574	AGO2	94	93.979	Chlorocebus_sabaeus
ENSPCAG00000002880	AGO2	74	100.000	ENSCHOG00000008938	-	75	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.514	ENSCPBG00000019183	AGO2	97	93.514	Chrysemys_picta_bellii
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	67.791	ENSCING00000007310	-	99	67.791	Ciona_intestinalis
ENSPCAG00000002880	AGO2	98	69.104	ENSCSAVG00000005282	-	100	69.104	Ciona_savignyi
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	90.488	ENSCANG00000030899	AGO2	99	90.083	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPCAG00000002880	AGO2	100	93.545	ENSCGRG00001013557	Ago2	99	93.545	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPCAG00000002880	AGO2	100	93.545	ENSCGRG00000002120	Ago2	100	93.545	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPCAG00000002880	AGO2	98	88.319	ENSCSEG00000012273	ago2	98	87.676	Cynoglossus_semilaevis
ENSPCAG00000002880	AGO2	98	87.843	ENSCVAG00000008763	ago2	100	87.365	Cyprinodon_variegatus
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	87.529	ENSDARG00000061268	ago2	97	87.529	Danio_rerio
ENSPCAG00000002880	AGO2	92	91.646	ENSDNOG00000033433	AGO2	100	91.646	Dasypus_novemcinctus
ENSPCAG00000002880	AGO2	100	93.310	ENSDORG00000011242	Ago2	99	93.310	Dipodomys_ordii
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	69.641	FBgn0262739	AGO1	90	69.641	Drosophila_melanogaster
ENSPCAG00000002880	AGO2	95	82.054	ENSEBUG00000011986	-	100	82.054	Eptatretus_burgeri
ENSPCAG00000002880	AGO2	81	80.640	ENSEBUG00000008202	-	99	80.640	Eptatretus_burgeri
ENSPCAG00000002880	AGO2	93	51.016	ENSEBUG00000014681	ago2	99	51.016	Eptatretus_burgeri
ENSPCAG00000002880	AGO2	82	82.853	ENSEBUG00000014654	ago2	100	82.853	Eptatretus_burgeri
ENSPCAG00000002880	AGO2	81	80.669	ENSEBUG00000006807	-	100	80.669	Eptatretus_burgeri
ENSPCAG00000002880	AGO2	95	94.219	ENSEASG00005021922	AGO2	100	94.219	Equus_asinus_asinus
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.861	ENSECAG00000006078	AGO2	98	93.861	Equus_caballus
ENSPCAG00000002880	AGO2	61	100.000	ENSEEUG00000008564	-	61	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSPCAG00000002880	AGO2	98	87.738	ENSELUG00000019378	ago2	97	87.146	Esox_lucius
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.861	ENSFCAG00000002782	AGO2	99	93.861	Felis_catus
ENSPCAG00000002880	AGO2	100	92.849	ENSFALG00000002838	AGO2	99	92.849	Ficedula_albicollis
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.979	ENSFDAG00000004759	AGO2	99	93.979	Fukomys_damarensis
ENSPCAG00000002880	AGO2	95	88.104	ENSFHEG00000016080	ago2	98	87.317	Fundulus_heteroclitus
ENSPCAG00000002880	AGO2	98	87.485	ENSGMOG00000013651	ago2	99	86.895	Gadus_morhua
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.160	ENSGALG00000040957	AGO2	98	93.160	Gallus_gallus
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	88.000	ENSGAFG00000018026	ago2	98	88.000	Gambusia_affinis
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	88.076	ENSGACG00000006796	ago2	99	88.076	Gasterosteus_aculeatus
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.514	ENSGAGG00000003914	AGO2	100	93.487	Gopherus_agassizii
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.979	ENSGGOG00000011412	AGO2	99	93.979	Gorilla_gorilla
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	88.430	ENSHBUG00000018515	ago2	99	88.430	Haplochromis_burtoni
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.979	ENSHGLG00000005548	AGO2	99	93.979	Heterocephalus_glaber_female
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.743	ENSHGLG00100015994	-	99	93.743	Heterocephalus_glaber_male
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	85.748	ENSHGLG00100000694	-	98	85.478	Heterocephalus_glaber_male
ENSPCAG00000002880	AGO2	98	88.677	ENSHCOG00000006200	ago2	99	88.312	Hippocampus_comes
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	87.412	ENSIPUG00000001018	ago2	99	87.412	Ictalurus_punctatus
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.979	ENSSTOG00000008113	AGO2	99	93.979	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.743	ENSJJAG00000018712	Ago2	98	93.743	Jaculus_jaculus
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	87.957	ENSKMAG00000019999	ago2	99	87.957	Kryptolebias_marmoratus
ENSPCAG00000002880	AGO2	98	88.319	ENSLBEG00000005112	ago2	98	87.662	Labrus_bergylta
ENSPCAG00000002880	AGO2	100	82.339	ENSLACG00000001277	-	99	82.339	Latimeria_chalumnae
ENSPCAG00000002880	AGO2	98	88.200	ENSLOCG00000007766	ago2	98	87.529	Lepisosteus_oculatus
ENSPCAG00000002880	AGO2	100	93.545	ENSLAFG00000012905	AGO2	99	93.545	Loxodonta_africana
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.979	ENSMFAG00000015384	AGO2	99	94.153	Macaca_fascicularis
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.979	ENSMMUG00000008045	AGO2	98	93.979	Macaca_mulatta
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.979	ENSMNEG00000019904	AGO2	99	93.979	Macaca_nemestrina
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.979	ENSMLEG00000038874	AGO2	99	93.979	Mandrillus_leucophaeus
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	88.312	ENSMAMG00000008662	ago2	99	86.429	Mastacembelus_armatus
ENSPCAG00000002880	AGO2	98	88.796	ENSMZEG00005008998	ago2	98	88.630	Maylandia_zebra
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.270	ENSMGAG00000012942	AGO2	99	93.270	Meleagris_gallopavo
ENSPCAG00000002880	AGO2	100	85.094	ENSMAUG00000007785	Ago2	99	85.094	Mesocricetus_auratus
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.979	ENSMICG00000004427	AGO2	98	93.979	Microcebus_murinus
ENSPCAG00000002880	AGO2	100	93.545	ENSMOCG00000000300	Ago2	100	93.545	Microtus_ochrogaster
ENSPCAG00000002880	AGO2	98	85.697	ENSMMOG00000020165	ago2	100	85.697	Mola_mola
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.160	ENSMODG00000000748	AGO2	98	93.160	Monodelphis_domestica
ENSPCAG00000002880	AGO2	98	88.558	ENSMALG00000020610	ago2	98	88.194	Monopterus_albus
ENSPCAG00000002880	AGO2	100	93.192	MGP_CAROLIEiJ_G0019861	Ago2	99	93.192	Mus_caroli
ENSPCAG00000002880	AGO2	100	93.192	ENSMUSG00000036698	Ago2	99	93.192	Mus_musculus
ENSPCAG00000002880	AGO2	100	92.958	MGP_PahariEiJ_G0019867	Ago2	99	92.958	Mus_pahari
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.120	MGP_SPRETEiJ_G0020759	Ago2	98	100.000	Mus_spretus
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	94.076	ENSMPUG00000001930	AGO2	99	94.076	Mustela_putorius_furo
ENSPCAG00000002880	AGO2	67	79.438	ENSMLUG00000004552	-	100	79.438	Myotis_lucifugus
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	94.418	ENSNGAG00000014556	Ago2	99	94.418	Nannospalax_galili
ENSPCAG00000002880	AGO2	98	88.796	ENSNBRG00000006100	ago2	98	88.028	Neolamprologus_brichardi
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	88.784	ENSNLEG00000001461	AGO2	96	88.784	Nomascus_leucogenys
ENSPCAG00000002880	AGO2	88	88.136	ENSMEUG00000001395	AGO2	87	88.136	Notamacropus_eugenii
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	81.228	ENSOPRG00000008795	-	99	81.228	Ochotona_princeps
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.979	ENSODEG00000014145	AGO2	99	93.979	Octodon_degus
ENSPCAG00000002880	AGO2	98	88.796	ENSONIG00000010747	ago2	98	88.028	Oreochromis_niloticus
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.506	ENSOANG00000007125	AGO2	98	93.506	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	92.062	ENSOCUG00000006066	AGO2	99	92.062	Oryctolagus_cuniculus
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	87.839	ENSORLG00000004615	ago2	99	87.839	Oryzias_latipes
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	87.839	ENSORLG00020003449	ago2	99	87.839	Oryzias_latipes_hni
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	87.839	ENSORLG00015015319	ago2	99	87.839	Oryzias_latipes_hsok
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	87.957	ENSOMEG00000017751	ago2	99	87.957	Oryzias_melastigma
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	94.194	ENSOGAG00000007933	AGO2	99	94.194	Otolemur_garnettii
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	92.335	ENSOARG00000003763	AGO2	99	92.335	Ovis_aries
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	94.194	ENSPPAG00000037787	AGO2	99	94.194	Pan_paniscus
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	93.861	ENSPPRG00000002594	AGO2	99	93.861	Panthera_pardus
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	92.562	ENSPTIG00000007438	AGO2	98	92.562	Panthera_tigris_altaica
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	94.194	ENSPTRG00000020622	AGO2	98	94.194	Pan_troglodytes
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	91.578	ENSPANG00000005604	AGO2	99	91.274	Papio_anubis
ENSPCAG00000002880	AGO2	98	87.485	ENSPKIG00000001824	ago2	100	87.773	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPCAG00000002880	AGO2	99	91.745	ENSPSIG00000004064	AGO2	98	91.745	Pelodiscus_sinensis
ENSPCAG00000002880	AGO2	100	93.427	ENSPEMG00000008137	Ago2	100	93.427	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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