EuRBPDB

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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPCAG00000005604 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: AGO1
Alias: EIF2C1|hAGO1
Full Name: argonaute 1%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Procavia_capensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 28569 bases
Position: chrGeneScaffold_1068:396-28964
Accession: 3262
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPCAP00000005271	PAZ	PF02170.22	4.7e-24	1	1
ENSPCAP00000005271	Piwi	PF02171.17	2.7e-52	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPCAT00000005646	AGO1-201	2253	-	ENSPCAP00000005271	751 (aa)	-	UPI00018AEB40

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPCAG00000005604	AGO1	64	85.283	ENSPCAG00000002880	AGO2	56	85.283
ENSPCAG00000005604	AGO1	63	87.838	ENSPCAG00000010090	AGO3	56	87.838

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSG00000092847	AGO1	58	100.000	Homo_sapiens
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	98.868	ENSAPOG00000024299	ago1	58	98.868	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSAMEG00000000504	AGO1	58	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPCAG00000005604	AGO1	51	99.153	ENSACIG00000005298	ago1	56	99.153	Amphilophus_citrinellus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	98.868	ENSAOCG00000017727	ago1	58	98.868	Amphiprion_ocellaris
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	98.868	ENSAPEG00000004458	ago1	58	98.868	Amphiprion_percula
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	98.868	ENSATEG00000008523	ago1	58	98.868	Anabas_testudineus
ENSPCAG00000005604	AGO1	65	100.000	ENSAPLG00000010440	AGO1	56	100.000	Anas_platyrhynchos
ENSPCAG00000005604	AGO1	55	100.000	ENSACAG00000029174	AGO1	53	100.000	Anolis_carolinensis
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSANAG00000037711	AGO1	58	100.000	Aotus_nancymaae
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	98.649	ENSACLG00000000890	ago1	58	98.649	Astatotilapia_calliptera
ENSPCAG00000005604	AGO1	55	98.649	ENSAMXG00000001917	ago1	59	98.649	Astyanax_mexicanus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSBTAG00000012253	AGO1	58	100.000	Bos_taurus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSCJAG00000032023	AGO1	58	100.000	Callithrix_jacchus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSCAFG00000003443	AGO1	58	100.000	Canis_familiaris
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSCAFG00020009251	AGO1	58	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSCHIG00000011848	-	58	100.000	Capra_hircus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSTSYG00000009767	-	58	100.000	Carlito_syrichta
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	89.189	ENSTSYG00000032426	-	63	89.189	Carlito_syrichta
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSCPOG00000011568	AGO1	58	100.000	Cavia_porcellus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSCCAG00000011823	AGO1	58	100.000	Cebus_capucinus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSCATG00000031521	AGO1	59	100.000	Cercocebus_atys
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSCLAG00000011507	AGO1	58	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSCSAG00000001091	AGO1	58	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSCPBG00000018594	AGO1	58	100.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSCANG00000039798	AGO1	59	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSCGRG00001022708	Ago1	58	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPCAG00000005604	AGO1	65	100.000	ENSCGRG00000010386	Ago1	58	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPCAG00000005604	AGO1	65	98.868	ENSCSEG00000001051	ago1	57	98.868	Cynoglossus_semilaevis
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	98.868	ENSCVAG00000018173	ago1	58	98.868	Cyprinodon_variegatus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	99.245	ENSDARG00000092644	ago1	58	99.245	Danio_rerio
ENSPCAG00000005604	AGO1	55	100.000	ENSDNOG00000008077	AGO1	53	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSPCAG00000005604	AGO1	57	100.000	ENSDORG00000008494	Ago1	54	100.000	Dipodomys_ordii
ENSPCAG00000005604	AGO1	62	100.000	ENSETEG00000007626	AGO1	65	100.000	Echinops_telfairi
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSEASG00005012086	AGO1	58	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSECAG00000024353	AGO1	58	100.000	Equus_caballus
ENSPCAG00000005604	AGO1	55	98.868	ENSELUG00000016803	ago1	53	98.868	Esox_lucius
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSFCAG00000000746	AGO1	58	100.000	Felis_catus
ENSPCAG00000005604	AGO1	55	100.000	ENSFALG00000000790	AGO1	53	100.000	Ficedula_albicollis
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSFDAG00000017210	AGO1	58	100.000	Fukomys_damarensis
ENSPCAG00000005604	AGO1	63	98.868	ENSFHEG00000017927	ago1	57	98.868	Fundulus_heteroclitus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSGALG00000002249	AGO1	58	100.000	Gallus_gallus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	98.868	ENSGAFG00000009775	ago1	58	98.868	Gambusia_affinis
ENSPCAG00000005604	AGO1	55	98.868	ENSGACG00000012443	ago1	55	98.868	Gasterosteus_aculeatus
ENSPCAG00000005604	AGO1	55	100.000	ENSGAGG00000012893	-	53	100.000	Gopherus_agassizii
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSGGOG00000003316	AGO1	58	100.000	Gorilla_gorilla
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	98.649	ENSHBUG00000010459	ago1	58	98.649	Haplochromis_burtoni
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSHGLG00000011540	AGO1	58	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSHGLG00100005568	AGO1	58	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSPCAG00000005604	AGO1	65	98.868	ENSHCOG00000005708	ago1	58	98.868	Hippocampus_comes
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	98.649	ENSIPUG00000023216	ago1	58	98.649	Ictalurus_punctatus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSSTOG00000010857	AGO1	58	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSJJAG00000019449	Ago1	58	100.000	Jaculus_jaculus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	98.868	ENSKMAG00000019464	ago1	58	98.868	Kryptolebias_marmoratus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	98.868	ENSLBEG00000007694	ago1	58	98.868	Labrus_bergylta
ENSPCAG00000005604	AGO1	65	100.000	ENSLACG00000017009	AGO1	58	100.000	Latimeria_chalumnae
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	98.113	ENSLOCG00000000504	AGO1	58	98.113	Lepisosteus_oculatus
ENSPCAG00000005604	AGO1	65	100.000	ENSLAFG00000010835	AGO1	58	100.000	Loxodonta_africana
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSMFAG00000002846	AGO1	59	100.000	Macaca_fascicularis
ENSPCAG00000005604	AGO1	65	100.000	ENSMMUG00000006251	AGO1	60	100.000	Macaca_mulatta
ENSPCAG00000005604	AGO1	65	100.000	ENSMNEG00000028881	AGO1	58	100.000	Macaca_nemestrina
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSMLEG00000038388	AGO1	58	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	98.868	ENSMAMG00000008381	ago1	59	98.649	Mastacembelus_armatus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	98.649	ENSMZEG00005007996	ago1	58	98.649	Maylandia_zebra
ENSPCAG00000005604	AGO1	62	100.000	ENSMGAG00000003822	AGO1	55	100.000	Meleagris_gallopavo
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSMAUG00000015189	Ago1	58	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSMICG00000016147	AGO1	58	100.000	Microcebus_murinus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSMOCG00000000537	Ago1	58	100.000	Microtus_ochrogaster
ENSPCAG00000005604	AGO1	55	98.868	ENSMMOG00000018459	ago1	58	98.868	Mola_mola
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSMODG00000023335	AGO1	58	100.000	Monodelphis_domestica
ENSPCAG00000005604	AGO1	65	98.649	ENSMALG00000011057	ago1	58	98.649	Monopterus_albus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	67	100.000	Mus_caroli
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSMUSG00000041530	Ago1	67	100.000	Mus_musculus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	67	100.000	Mus_pahari
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	67	100.000	Mus_spretus
ENSPCAG00000005604	AGO1	55	100.000	ENSMPUG00000014872	AGO1	58	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSNGAG00000017448	Ago1	58	100.000	Nannospalax_galili
ENSPCAG00000005604	AGO1	55	98.649	ENSNBRG00000010867	ago1	53	98.649	Neolamprologus_brichardi
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSNLEG00000011181	AGO1	59	100.000	Nomascus_leucogenys
ENSPCAG00000005604	AGO1	54	99.623	ENSMEUG00000013429	AGO1	51	99.623	Notamacropus_eugenii
ENSPCAG00000005604	AGO1	58	100.000	ENSOPRG00000012325	AGO1	51	100.000	Ochotona_princeps
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSODEG00000005321	AGO1	58	100.000	Octodon_degus
ENSPCAG00000005604	AGO1	65	98.649	ENSONIG00000016345	ago1	58	98.649	Oreochromis_niloticus
ENSPCAG00000005604	AGO1	63	100.000	ENSOANG00000002080	AGO1	55	100.000	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSOCUG00000023116	AGO1	58	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	98.868	ENSORLG00000014965	ago1	58	98.868	Oryzias_latipes
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	98.868	ENSORLG00020018253	ago1	58	98.868	Oryzias_latipes_hni
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	98.868	ENSORLG00015003287	ago1	58	98.868	Oryzias_latipes_hsok
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	98.868	ENSOMEG00000020528	ago1	58	98.868	Oryzias_melastigma
ENSPCAG00000005604	AGO1	65	100.000	ENSOGAG00000010279	AGO1	57	100.000	Otolemur_garnettii
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSOARG00000019591	AGO1	58	100.000	Ovis_aries
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSPPAG00000034838	AGO1	58	100.000	Pan_paniscus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSPPRG00000006475	AGO1	58	100.000	Panthera_pardus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSPTIG00000020991	AGO1	58	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSPTRG00000000528	AGO1	58	100.000	Pan_troglodytes
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSPANG00000009060	AGO1	58	100.000	Papio_anubis
ENSPCAG00000005604	AGO1	64	100.000	ENSPSIG00000017482	AGO1	57	100.000	Pelodiscus_sinensis
ENSPCAG00000005604	AGO1	55	98.868	ENSPMGG00000024099	ago1	59	98.868	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSPEMG00000023313	Ago1	58	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSPCIG00000000172	AGO1	58	100.000	Phascolarctos_cinereus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	98.868	ENSPFOG00000005867	ago1	58	98.868	Poecilia_formosa
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	98.868	ENSPLAG00000002824	ago1	59	98.868	Poecilia_latipinna
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	98.868	ENSPMEG00000001787	ago1	59	98.868	Poecilia_mexicana
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	98.868	ENSPREG00000006534	ago1	58	98.868	Poecilia_reticulata
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSPPYG00000001551	AGO1	58	100.000	Pongo_abelii
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSPCOG00000022061	AGO1	58	100.000	Propithecus_coquereli
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSPVAG00000005082	AGO1	58	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSPCAG00000005604	AGO1	55	98.649	ENSPNYG00000012586	ago1	51	98.649	Pundamilia_nyererei
ENSPCAG00000005604	AGO1	63	98.868	ENSPNAG00000000597	ago1	59	98.868	Pygocentrus_nattereri
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSRNOG00000055915	Ago1	58	100.000	Rattus_norvegicus
ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	ENSRBIG00000032611	AGO1	58	100.000	Rhinopithecus_bieti
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