EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPCAG00000005883 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: EEFSEC
Alias: EFSEC|SELB|eEFSec
Full Name: eukaryotic elongation factor%2C selenocysteine-tRNA specific
Gene Type: protein_coding
Species: Procavia_capensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 100830 bases
Position: chrGeneScaffold_3069:5395-106224
Accession: 24614
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPCAP00000005455	GTP_EFTU	PF00009.27	1.3e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPCAT00000005844	EEFSEC-201	1581	-	ENSPCAP00000005455	527 (aa)	-	UPI00018AFAAB

Gene Model

Click here to download ENSPCAG00000005883's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPCAG00000005883's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	78.799	ENSG00000132394	EEFSEC	98	72.614	Homo_sapiens
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	56.979	ENSAPOG00000015931	eefsec	88	56.979	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	78	80.145	ENSAMEG00000015165	EEFSEC	83	80.145	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	51	80.769	ENSACIG00000022407	eefsec	72	80.769	Amphilophus_citrinellus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	57.361	ENSAOCG00000008603	eefsec	88	57.361	Amphiprion_ocellaris
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	56.530	ENSAPEG00000017090	eefsec	88	56.530	Amphiprion_percula
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	56.343	ENSATEG00000002753	eefsec	95	56.343	Anabas_testudineus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	78	68.613	ENSAPLG00000006745	EEFSEC	96	68.613	Anas_platyrhynchos
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	79.174	ENSANAG00000032691	EEFSEC	99	71.458	Aotus_nancymaae
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	56.822	ENSACLG00000024565	eefsec	71	75.926	Astatotilapia_calliptera
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	58.302	ENSAMXG00000002260	eefsec	87	58.302	Astyanax_mexicanus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	76.792	ENSBTAG00000030962	EEFSEC	89	76.792	Bos_taurus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	68	38.144	WBGene00008133	efsc-1	66	37.755	Caenorhabditis_elegans
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	79.174	ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	71.663	Callithrix_jacchus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	78.090	ENSCAFG00000004135	EEFSEC	72	78.957	Canis_familiaris
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	78.212	ENSCAFG00020004811	EEFSEC	90	78.957	Canis_lupus_dingo
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	76.660	ENSCHIG00000021838	EEFSEC	89	76.660	Capra_hircus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	79.737	ENSTSYG00000012922	EEFSEC	98	73.029	Carlito_syrichta
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	78	70.218	ENSCAPG00000000084	EEFSEC	82	70.218	Cavia_aperea
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	75.803	ENSCPOG00000024352	EEFSEC	89	75.803	Cavia_porcellus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	79.362	ENSCCAG00000031336	EEFSEC	99	71.663	Cebus_capucinus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	79.737	ENSCATG00000019414	EEFSEC	99	71.869	Cercocebus_atys
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	77.316	ENSCLAG00000006973	EEFSEC	89	77.316	Chinchilla_lanigera
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	79.550	ENSCSAG00000008599	EEFSEC	89	79.550	Chlorocebus_sabaeus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	66.540	ENSCPBG00000014356	EEFSEC	86	67.490	Chrysemys_picta_bellii
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	47.575	ENSCSAVG00000002208	-	77	67.273	Ciona_savignyi
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	78.987	ENSCANG00000031492	EEFSEC	99	71.869	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	75.660	ENSCGRG00001018089	Eefsec	89	75.660	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	74.906	ENSCGRG00000010063	Eefsec	89	74.906	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	55.473	ENSCSEG00000003008	eefsec	71	78.846	Cynoglossus_semilaevis
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	57.170	ENSCVAG00000005381	eefsec	88	57.170	Cyprinodon_variegatus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	57.519	ENSDARG00000004696	eefsec	89	57.519	Danio_rerio
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	76.850	ENSDNOG00000008925	EEFSEC	89	76.850	Dasypus_novemcinctus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	78	67.153	ENSDORG00000000264	Eefsec	75	86.538	Dipodomys_ordii
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	98	38.269	FBgn0034627	eEFSec	93	38.269	Drosophila_melanogaster
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	90	77.731	ENSETEG00000007406	EEFSEC	81	77.731	Echinops_telfairi
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	70	65.657	ENSEBUG00000015029	eefsec	93	43.478	Eptatretus_burgeri
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	80.827	ENSEASG00005006786	EEFSEC	89	81.203	Equus_asinus_asinus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	80.827	ENSECAG00000016565	EEFSEC	90	81.203	Equus_caballus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	55.431	ENSELUG00000016632	eefsec	88	55.431	Esox_lucius
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	79.813	ENSFCAG00000006153	EEFSEC	98	73.760	Felis_catus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	78	67.640	ENSFALG00000007901	EEFSEC	84	67.640	Ficedula_albicollis
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	78	78.935	ENSFDAG00000010243	EEFSEC	84	78.935	Fukomys_damarensis
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	57.736	ENSFHEG00000007155	eefsec	88	57.736	Fundulus_heteroclitus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	53.890	ENSGMOG00000007705	eefsec	88	54.442	Gadus_morhua
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	68.130	ENSGALG00000038684	EEFSEC	92	68.130	Gallus_gallus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	57.467	ENSGAFG00000021692	eefsec	88	57.576	Gambusia_affinis
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	57.985	ENSGACG00000000793	eefsec	91	57.553	Gasterosteus_aculeatus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	66.160	ENSGAGG00000002059	EEFSEC	91	66.920	Gopherus_agassizii
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	86	77.462	ENSGGOG00000001445	EEFSEC	98	68.966	Gorilla_gorilla
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	57.935	ENSHBUG00000008917	eefsec	97	57.276	Haplochromis_burtoni
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	77.127	ENSHGLG00000000094	EEFSEC	89	77.127	Heterocephalus_glaber_female
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	77.127	ENSHGLG00100011393	EEFSEC	85	77.127	Heterocephalus_glaber_male
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	57.824	ENSHCOG00000004193	eefsec	88	57.824	Hippocampus_comes
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	57.765	ENSIPUG00000017291	eefsec	97	57.736	Ictalurus_punctatus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	78	73.966	ENSSTOG00000019802	EEFSEC	84	73.966	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	56.981	ENSKMAG00000019907	eefsec	94	56.981	Kryptolebias_marmoratus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	57.036	ENSLBEG00000017908	eefsec	88	57.036	Labrus_bergylta
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	84	62.247	ENSLACG00000013137	EEFSEC	85	62.247	Latimeria_chalumnae
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	58.935	ENSLOCG00000014535	eefsec	88	58.935	Lepisosteus_oculatus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	79.356	ENSLAFG00000001997	EEFSEC	89	79.356	Loxodonta_africana
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	79.925	ENSMFAG00000042128	EEFSEC	99	72.074	Macaca_fascicularis
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	91	72.074	ENSMMUG00000018663	EEFSEC	99	72.074	Macaca_mulatta
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	79.737	ENSMNEG00000028574	EEFSEC	99	72.074	Macaca_nemestrina
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	78	79.661	ENSMLEG00000041771	EEFSEC	77	79.661	Mandrillus_leucophaeus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	56.367	ENSMAMG00000023964	eefsec	71	76.923	Mastacembelus_armatus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	51	75.926	ENSMZEG00005009380	eefsec	71	75.926	Maylandia_zebra
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	71	64.267	ENSMGAG00000007243	EEFSEC	96	64.267	Meleagris_gallopavo
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	75.283	ENSMAUG00000011197	Eefsec	97	75.283	Mesocricetus_auratus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	76.038	ENSMOCG00000017748	Eefsec	89	76.038	Microtus_ochrogaster
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	51	78.431	ENSMMOG00000021820	eefsec	73	78.431	Mola_mola
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	71.375	ENSMODG00000008034	EEFSEC	81	71.375	Monodelphis_domestica
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	57.435	ENSMALG00000016211	eefsec	99	57.435	Monopterus_albus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	77.358	MGP_CAROLIEiJ_G0028627	Eefsec	97	77.358	Mus_caroli
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	77.170	ENSMUSG00000033216	Eefsec	97	77.642	Mus_musculus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	76.981	MGP_PahariEiJ_G0022366	Eefsec	97	77.236	Mus_pahari
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	77.170	MGP_SPRETEiJ_G0029640	Eefsec	97	77.642	Mus_spretus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	79.362	ENSMPUG00000017340	EEFSEC	86	79.362	Mustela_putorius_furo
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	78	77.482	ENSMLUG00000004261	EEFSEC	84	77.482	Myotis_lucifugus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	57.009	ENSNBRG00000002387	eefsec	71	78.846	Neolamprologus_brichardi
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	78.612	ENSNLEG00000014303	EEFSEC	98	72.614	Nomascus_leucogenys
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	78	72.019	ENSMEUG00000005747	EEFSEC	84	72.019	Notamacropus_eugenii
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	78.987	ENSOPRG00000011276	EEFSEC	90	78.987	Ochotona_princeps
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	76.371	ENSODEG00000002928	EEFSEC	89	76.371	Octodon_degus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	78	55.687	ENSONIG00000019038	eefsec	86	56.265	Oreochromis_niloticus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	78	70.316	ENSOANG00000009108	EEFSEC	85	70.316	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	79.962	ENSOCUG00000016517	EEFSEC	89	79.962	Oryctolagus_cuniculus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	57.576	ENSORLG00000001377	eefsec	71	79.630	Oryzias_latipes
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	57.386	ENSORLG00020000729	eefsec	71	77.778	Oryzias_latipes_hni
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	57.576	ENSORLG00015001986	eefsec	88	57.576	Oryzias_latipes_hsok
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	78	56.867	ENSOMEG00000010071	eefsec	75	56.867	Oryzias_melastigma
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	78	80.630	ENSOGAG00000014084	EEFSEC	92	80.630	Otolemur_garnettii
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	68	73.889	ENSOARG00000004600	EEFSEC	96	73.889	Ovis_aries
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	78.799	ENSPPAG00000030936	EEFSEC	98	72.614	Pan_paniscus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	80.488	ENSPPRG00000002846	EEFSEC	98	73.859	Panthera_pardus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	78	81.114	ENSPTIG00000013855	EEFSEC	75	81.114	Panthera_tigris_altaica
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	78.799	ENSPTRG00000015353	EEFSEC	98	72.614	Pan_troglodytes
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	79.925	ENSPANG00000017041	EEFSEC	99	72.074	Papio_anubis
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	58.333	ENSPKIG00000005220	eefsec	89	58.519	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	67.748	ENSPSIG00000015135	EEFSEC	97	67.748	Pelodiscus_sinensis
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	56.061	ENSPMGG00000020300	eefsec	88	56.061	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	75.660	ENSPEMG00000013677	Eefsec	89	75.660	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	57.008	ENSPMAG00000006779	eefsec	98	57.386	Petromyzon_marinus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	78	71.776	ENSPCIG00000020494	EEFSEC	85	71.776	Phascolarctos_cinereus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	57.089	ENSPFOG00000003748	eefsec	88	57.089	Poecilia_formosa
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	57.089	ENSPLAG00000018012	eefsec	94	57.089	Poecilia_latipinna
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	57.089	ENSPMEG00000001202	eefsec	88	57.197	Poecilia_mexicana
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	57.089	ENSPREG00000012235	eefsec	88	57.197	Poecilia_reticulata
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	79.174	ENSPPYG00000013436	EEFSEC	89	80.113	Pongo_abelii
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	73.535	ENSPCOG00000023432	EEFSEC	98	66.109	Propithecus_coquereli
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	57.009	ENSPNYG00000005726	eefsec	71	77.778	Pundamilia_nyererei
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	57.895	ENSPNAG00000016724	eefsec	89	57.895	Pygocentrus_nattereri
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	76.981	ENSRNOG00000012954	Eefsec	89	76.981	Rattus_norvegicus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	78.799	ENSRBIG00000032635	EEFSEC	99	71.869	Rhinopithecus_bieti
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	89	70.886	ENSSBOG00000031478	EEFSEC	99	70.886	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	78	71.533	ENSSHAG00000014760	EEFSEC	85	71.533	Sarcophilus_harrisii
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	58.429	ENSSFOG00015021109	eefsec	88	56.330	Scleropages_formosus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	55.970	ENSSMAG00000001454	eefsec	95	55.970	Scophthalmus_maximus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	55.970	ENSSDUG00000007924	eefsec	71	73.077	Seriola_dumerili
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	55.784	ENSSLDG00000024985	eefsec	90	55.784	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	51	88.235	ENSSARG00000003789	-	50	88.235	Sorex_araneus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	78	67.153	ENSSPUG00000004191	EEFSEC	86	66.910	Sphenodon_punctatus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	55.701	ENSSPAG00000001320	eefsec	72	76.923	Stegastes_partitus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	77.903	ENSSSCG00000011619	EEFSEC	98	77.903	Sus_scrofa
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	67.552	ENSTGUG00000007895	EEFSEC	89	67.552	Taeniopygia_guttata
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	57.223	ENSTRUG00000010327	eefsec	94	57.223	Takifugu_rubripes
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	57.276	ENSTNIG00000003225	eefsec	89	57.276	Tetraodon_nigroviridis
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	78.450	ENSTTRG00000000994	EEFSEC	90	78.450	Tursiops_truncatus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	100	80.488	ENSUAMG00000017283	EEFSEC	89	80.488	Ursus_americanus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	78	79.903	ENSVVUG00000018372	EEFSEC	87	79.903	Vulpes_vulpes
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	90	63.235	ENSXETG00000002066	eefsec	99	63.235	Xenopus_tropicalis
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	57.467	ENSXCOG00000019916	eefsec	89	57.576	Xiphophorus_couchianus
ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	57.576	ENSXMAG00000001839	eefsec	94	57.467	Xiphophorus_maculatus