EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPCAG00000006798 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: XPO1
Alias: CRM1|emb
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Procavia_capensis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 32065 bases
Position: chrscaffold_10038:8451-40515
Accession: 12825
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPCAP00000006439	CRM1_C	PF08767.11	7.2e-125	1	1
ENSPCAP00000006439	Xpo1	PF08389.12	3.9e-41	1	1
ENSPCAP00000006439	IBN_N	PF03810.19	1.1e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPCAT00000006885	XPO1-201	3033	-	ENSPCAP00000006439	1010 (aa)	-	UPI00018AE305

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	95.335	ENSG00000082898	XPO1	96	95.335	Homo_sapiens
ENSPCAG00000006798	XPO1	91	87.021	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	87.021	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	93.294	ENSAPOG00000004984	-	96	93.294	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	96.408	ENSAMEG00000003460	XPO1	96	96.408	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPCAG00000006798	XPO1	91	93.085	ENSACIG00000010818	-	100	93.085	Amphilophus_citrinellus
ENSPCAG00000006798	XPO1	91	89.362	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	89.362	Amphilophus_citrinellus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	93.294	ENSAOCG00000010121	-	100	90.938	Amphiprion_ocellaris
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	89.407	ENSAOCG00000018914	xpo1a	96	89.407	Amphiprion_ocellaris
ENSPCAG00000006798	XPO1	94	89.392	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	89.392	Amphiprion_percula
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	93.294	ENSAPEG00000007038	-	99	91.045	Amphiprion_percula
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	89.213	ENSATEG00000020750	xpo1a	98	89.231	Anabas_testudineus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	93.294	ENSATEG00000008816	-	96	93.294	Anabas_testudineus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	96.307	ENSAPLG00000004008	XPO1	96	96.307	Anas_platyrhynchos
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	96.113	ENSACAG00000002501	XPO1	96	96.113	Anolis_carolinensis
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	95.335	ENSANAG00000020802	XPO1	96	95.335	Aotus_nancymaae
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	93.197	ENSACLG00000015192	-	96	93.197	Astatotilapia_calliptera
ENSPCAG00000006798	XPO1	91	89.681	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	89.681	Astatotilapia_calliptera
ENSPCAG00000006798	XPO1	91	90.360	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	90.360	Astyanax_mexicanus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	93.780	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	91.605	Astyanax_mexicanus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	96.501	ENSBTAG00000013254	XPO1	96	96.501	Bos_taurus
ENSPCAG00000006798	XPO1	99	50.864	WBGene00002078	xpo-1	96	50.864	Caenorhabditis_elegans
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	95.335	ENSCJAG00000008877	XPO1	96	95.335	Callithrix_jacchus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	96.501	ENSCAFG00000003050	XPO1	96	96.501	Canis_familiaris
ENSPCAG00000006798	XPO1	97	96.285	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	96.285	Canis_lupus_dingo
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	96.501	ENSCHIG00000018132	XPO1	96	96.501	Capra_hircus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	96.501	ENSTSYG00000004330	XPO1	96	96.501	Carlito_syrichta
ENSPCAG00000006798	XPO1	55	93.617	ENSCAPG00000006454	-	100	93.617	Cavia_aperea
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	95.712	ENSCPOG00000034053	XPO1	96	95.712	Cavia_porcellus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	75.386	ENSCCAG00000037445	XPO1	95	75.579	Cebus_capucinus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	93.689	ENSCATG00000032674	XPO1	100	95.000	Cercocebus_atys
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	96.210	ENSCLAG00000012953	XPO1	96	96.210	Chinchilla_lanigera
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	95.335	ENSCSAG00000014606	XPO1	96	95.335	Chlorocebus_sabaeus
ENSPCAG00000006798	XPO1	82	96.296	ENSCHOG00000012088	XPO1	79	96.296	Choloepus_hoffmanni
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	96.404	ENSCPBG00000026239	XPO1	97	96.189	Chrysemys_picta_bellii
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	79.612	ENSCING00000024562	-	96	79.612	Ciona_intestinalis
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	77.810	ENSCSAVG00000005965	-	97	77.810	Ciona_savignyi
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	91.059	ENSCANG00000028883	XPO1	100	96.809	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	95.335	ENSCGRG00001000263	Xpo1	96	95.335	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	95.335	ENSCGRG00000001520	Xpo1	96	95.335	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPCAG00000006798	XPO1	91	91.915	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	91.915	Cynoglossus_semilaevis
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	93.294	ENSCVAG00000016788	-	96	93.294	Cyprinodon_variegatus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	88.824	ENSCVAG00000016558	xpo1a	96	88.824	Cyprinodon_variegatus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	90.573	ENSDARG00000078041	xpo1a	96	90.573	Danio_rerio
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	93.975	ENSDARG00000063229	xpo1b	96	93.975	Danio_rerio
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	96.404	ENSDNOG00000005805	XPO1	96	96.404	Dasypus_novemcinctus
ENSPCAG00000006798	XPO1	92	93.075	ENSDORG00000013050	Xpo1	95	93.075	Dipodomys_ordii
ENSPCAG00000006798	XPO1	99	68.902	FBgn0020497	emb	96	68.999	Drosophila_melanogaster
ENSPCAG00000006798	XPO1	94	96.559	ENSETEG00000018045	XPO1	90	96.559	Echinops_telfairi
ENSPCAG00000006798	XPO1	93	76.012	ENSEBUG00000012580	-	100	84.536	Eptatretus_burgeri
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	96.501	ENSEASG00005007223	XPO1	96	96.501	Equus_asinus_asinus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	96.501	ENSECAG00000024920	XPO1	99	96.285	Equus_caballus
ENSPCAG00000006798	XPO1	91	100.000	ENSEEUG00000009479	XPO1	88	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSPCAG00000006798	XPO1	91	91.702	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	91.702	Esox_lucius
ENSPCAG00000006798	XPO1	90	90.043	ENSELUG00000014306	-	99	90.043	Esox_lucius
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	96.501	ENSFCAG00000002702	XPO1	96	96.501	Felis_catus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	96.016	ENSFALG00000010989	XPO1	96	96.016	Ficedula_albicollis
ENSPCAG00000006798	XPO1	99	94.650	ENSFDAG00000014716	XPO1	96	94.650	Fukomys_damarensis
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	89.116	ENSFHEG00000002412	xpo1a	96	89.116	Fundulus_heteroclitus
ENSPCAG00000006798	XPO1	55	82.175	ENSFHEG00000018974	-	100	82.175	Fundulus_heteroclitus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	87.075	ENSGMOG00000019063	-	96	87.075	Gadus_morhua
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	90.282	ENSGMOG00000004441	xpo1a	96	90.282	Gadus_morhua
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	96.307	ENSGALG00000029476	XPO1	96	96.307	Gallus_gallus
ENSPCAG00000006798	XPO1	94	92.894	ENSGAFG00000003355	-	98	92.894	Gambusia_affinis
ENSPCAG00000006798	XPO1	91	89.468	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	89.468	Gambusia_affinis
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	88.921	ENSGACG00000019736	xpo1a	96	88.921	Gasterosteus_aculeatus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	93.003	ENSGACG00000002743	-	96	93.003	Gasterosteus_aculeatus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	96.307	ENSGAGG00000017558	XPO1	96	96.307	Gopherus_agassizii
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	95.335	ENSGGOG00000034878	XPO1	96	95.335	Gorilla_gorilla
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	93.294	ENSHBUG00000020037	-	96	93.294	Haplochromis_burtoni
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	89.602	ENSHBUG00000007128	xpo1a	96	89.602	Haplochromis_burtoni
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	96.113	ENSHGLG00000003115	XPO1	96	96.113	Heterocephalus_glaber_female
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	96.113	ENSHGLG00100012227	XPO1	96	96.113	Heterocephalus_glaber_male
ENSPCAG00000006798	XPO1	91	92.128	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	92.128	Hippocampus_comes
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	91.351	ENSIPUG00000024394	XPO1	96	91.351	Ictalurus_punctatus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	93.780	ENSIPUG00000012891	Xpo1	96	93.780	Ictalurus_punctatus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	96.307	ENSSTOG00000016122	XPO1	96	96.307	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	96.210	ENSJJAG00000020468	Xpo1	96	96.210	Jaculus_jaculus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	89.213	ENSKMAG00000004830	xpo1a	96	89.213	Kryptolebias_marmoratus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	92.809	ENSKMAG00000016218	-	98	92.585	Kryptolebias_marmoratus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	93.197	ENSLBEG00000005740	-	96	93.197	Labrus_bergylta
ENSPCAG00000006798	XPO1	91	86.653	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	86.653	Labrus_bergylta
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	75.720	ENSLACG00000018213	XPO1	96	75.720	Latimeria_chalumnae
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	93.780	ENSLOCG00000016095	xpo1b	96	93.780	Lepisosteus_oculatus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	96.696	ENSLAFG00000014553	XPO1	96	96.696	Loxodonta_africana
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	95.335	ENSMFAG00000038679	XPO1	96	95.335	Macaca_fascicularis
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	95.335	ENSMMUG00000006941	XPO1	96	95.335	Macaca_mulatta
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	95.335	ENSMNEG00000030909	XPO1	96	95.335	Macaca_nemestrina
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	93.774	ENSMLEG00000032004	XPO1	96	93.774	Mandrillus_leucophaeus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	93.197	ENSMAMG00000010568	-	99	92.865	Mastacembelus_armatus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	89.310	ENSMAMG00000023037	xpo1a	99	88.989	Mastacembelus_armatus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	89.602	ENSMZEG00005005105	xpo1a	96	89.602	Maylandia_zebra
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	93.197	ENSMZEG00005018158	-	98	92.894	Maylandia_zebra
ENSPCAG00000006798	XPO1	70	95.179	ENSMGAG00000001496	-	100	95.179	Meleagris_gallopavo
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	95.335	ENSMAUG00000006769	Xpo1	96	95.335	Mesocricetus_auratus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	96.501	ENSMICG00000027770	XPO1	96	96.501	Microcebus_murinus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	95.627	ENSMOCG00000012169	Xpo1	96	95.627	Microtus_ochrogaster
ENSPCAG00000006798	XPO1	91	92.743	ENSMMOG00000008001	-	99	92.743	Mola_mola
ENSPCAG00000006798	XPO1	91	89.362	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	89.362	Mola_mola
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	95.238	ENSMODG00000002831	XPO1	96	95.238	Monodelphis_domestica
ENSPCAG00000006798	XPO1	91	88.417	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	88.417	Monopterus_albus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	92.809	ENSMALG00000007085	-	99	91.055	Monopterus_albus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	95.530	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	96	95.530	Mus_caroli
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	95.627	ENSMUSG00000020290	Xpo1	96	95.627	Mus_musculus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	95.530	MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	96	95.530	Mus_pahari
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	95.627	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	96	95.627	Mus_spretus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	96.501	ENSMPUG00000005560	XPO1	96	96.501	Mustela_putorius_furo
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	96.404	ENSMLUG00000010670	XPO1	96	96.404	Myotis_lucifugus
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	96.307	ENSNGAG00000022158	Xpo1	96	96.307	Nannospalax_galili
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	89.602	ENSNBRG00000003776	xpo1a	96	89.602	Neolamprologus_brichardi
ENSPCAG00000006798	XPO1	96	92.533	ENSNBRG00000012229	-	100	93.191	Neolamprologus_brichardi
ENSPCAG00000006798	XPO1	100	91.391	ENSNLEG00000009680	XPO1	96	91.391	Nomascus_leucogenys
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