EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSPCAG00000010581 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: REXO4
Alias: XPMC2H|hPMC2
Full Name: REX4 homolog%2C 3'-5' exonuclease
Gene Type: protein_coding
Species: Procavia_capensis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9353 bases
Position: chrGeneScaffold_7335:23175-32527
Accession: 12820
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPCAP00000009862	RNase_T	PF00929.24	8.6e-18	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPCAT00000010572	REXO4-201	1233	-	ENSPCAP00000009862	410 (aa)	-	UPI00018ADF0E

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPCAG00000010581	REXO4	99	67.464	ENSG00000148300	REXO4	99	68.421	Homo_sapiens
ENSPCAG00000010581	REXO4	86	47.253	ENSAPOG00000019264	rexo4	85	47.123	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPCAG00000010581	REXO4	95	64.925	ENSAMEG00000011649	REXO4	97	64.925	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPCAG00000010581	REXO4	86	47.671	ENSAOCG00000004087	rexo4	84	47.802	Amphiprion_ocellaris
ENSPCAG00000010581	REXO4	86	47.283	ENSAPEG00000009106	rexo4	84	47.527	Amphiprion_percula
ENSPCAG00000010581	REXO4	84	48.725	ENSATEG00000017662	rexo4	83	47.875	Anabas_testudineus
ENSPCAG00000010581	REXO4	81	55.000	ENSAPLG00000005865	REXO4	99	55.000	Anas_platyrhynchos
ENSPCAG00000010581	REXO4	99	66.507	ENSANAG00000028404	REXO4	99	67.703	Aotus_nancymaae
ENSPCAG00000010581	REXO4	90	45.288	ENSACLG00000006007	rexo4	85	46.594	Astatotilapia_calliptera
ENSPCAG00000010581	REXO4	84	45.989	ENSAMXG00000013291	rexo4	82	45.989	Astyanax_mexicanus
ENSPCAG00000010581	REXO4	99	58.738	ENSBTAG00000019721	REXO4	98	58.413	Bos_taurus
ENSPCAG00000010581	REXO4	99	67.225	ENSCJAG00000009774	REXO4	99	68.421	Callithrix_jacchus
ENSPCAG00000010581	REXO4	96	60.000	ENSCAFG00000019767	REXO4	99	60.000	Canis_familiaris
ENSPCAG00000010581	REXO4	99	60.664	ENSCAFG00020000983	-	98	60.664	Canis_lupus_dingo
ENSPCAG00000010581	REXO4	90	58.182	ENSCHIG00000009517	REXO4	98	57.554	Capra_hircus
ENSPCAG00000010581	REXO4	99	63.702	ENSTSYG00000027492	REXO4	98	63.702	Carlito_syrichta
ENSPCAG00000010581	REXO4	81	62.426	ENSCAPG00000014583	REXO4	98	63.127	Cavia_aperea
ENSPCAG00000010581	REXO4	85	60.270	ENSCPOG00000001386	REXO4	95	58.531	Cavia_porcellus
ENSPCAG00000010581	REXO4	99	61.005	ENSCCAG00000027049	REXO4	99	61.962	Cebus_capucinus
ENSPCAG00000010581	REXO4	99	67.464	ENSCATG00000028646	REXO4	99	68.421	Cercocebus_atys
ENSPCAG00000010581	REXO4	78	63.609	ENSCLAG00000006919	REXO4	98	63.609	Chinchilla_lanigera
ENSPCAG00000010581	REXO4	99	66.507	ENSCSAG00000015280	REXO4	99	67.464	Chlorocebus_sabaeus
ENSPCAG00000010581	REXO4	98	49.881	ENSCPBG00000021152	REXO4	92	51.175	Chrysemys_picta_bellii
ENSPCAG00000010581	REXO4	51	55.238	ENSCING00000010751	-	77	55.238	Ciona_intestinalis
ENSPCAG00000010581	REXO4	99	67.464	ENSCANG00000029855	REXO4	99	68.421	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPCAG00000010581	REXO4	85	61.433	ENSCGRG00001013126	Rexo4	88	59.278	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPCAG00000010581	REXO4	85	61.433	ENSCGRG00000009819	Rexo4	91	59.278	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPCAG00000010581	REXO4	88	44.920	ENSCSEG00000019343	rexo4	86	45.067	Cynoglossus_semilaevis
ENSPCAG00000010581	REXO4	52	58.986	ENSCVAG00000014963	rexo4	59	58.986	Cyprinodon_variegatus
ENSPCAG00000010581	REXO4	54	59.735	ENSDARG00000088619	rexo4	84	59.735	Danio_rerio
ENSPCAG00000010581	REXO4	96	59.607	ENSDNOG00000002429	REXO4	94	65.374	Dasypus_novemcinctus
ENSPCAG00000010581	REXO4	79	63.855	ENSDORG00000006190	Rexo4	97	63.554	Dipodomys_ordii
ENSPCAG00000010581	REXO4	58	62.602	ENSEASG00005009915	-	79	63.008	Equus_asinus_asinus
ENSPCAG00000010581	REXO4	89	64.973	ENSECAG00000007896	REXO4	87	64.411	Equus_caballus
ENSPCAG00000010581	REXO4	85	46.684	ENSELUG00000003539	rexo4	84	46.702	Esox_lucius
ENSPCAG00000010581	REXO4	99	63.133	ENSFCAG00000011652	REXO4	95	63.133	Felis_catus
ENSPCAG00000010581	REXO4	87	52.632	ENSFALG00000001520	REXO4	90	51.200	Ficedula_albicollis
ENSPCAG00000010581	REXO4	98	60.386	ENSFDAG00000016050	REXO4	98	62.228	Fukomys_damarensis
ENSPCAG00000010581	REXO4	83	46.221	ENSFHEG00000002413	rexo4	84	45.930	Fundulus_heteroclitus
ENSPCAG00000010581	REXO4	51	53.917	ENSGMOG00000012876	rexo4	65	53.917	Gadus_morhua
ENSPCAG00000010581	REXO4	65	45.520	ENSGAFG00000015404	-	83	45.035	Gambusia_affinis
ENSPCAG00000010581	REXO4	83	49.708	ENSGACG00000008065	rexo4	80	50.000	Gasterosteus_aculeatus
ENSPCAG00000010581	REXO4	86	52.762	ENSGAGG00000010260	REXO4	91	51.724	Gopherus_agassizii
ENSPCAG00000010581	REXO4	99	67.464	ENSGGOG00000014508	REXO4	99	68.421	Gorilla_gorilla
ENSPCAG00000010581	REXO4	90	44.764	ENSHBUG00000000542	rexo4	85	46.049	Haplochromis_burtoni
ENSPCAG00000010581	REXO4	98	63.043	ENSHGLG00000016901	REXO4	98	62.802	Heterocephalus_glaber_female
ENSPCAG00000010581	REXO4	98	63.043	ENSHGLG00100017444	REXO4	98	62.802	Heterocephalus_glaber_male
ENSPCAG00000010581	REXO4	51	57.346	ENSHCOG00000018196	rexo4	55	58.294	Hippocampus_comes
ENSPCAG00000010581	REXO4	85	46.995	ENSIPUG00000021084	rexo4	82	46.721	Ictalurus_punctatus
ENSPCAG00000010581	REXO4	99	64.916	ENSSTOG00000003754	REXO4	99	64.678	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPCAG00000010581	REXO4	85	62.604	ENSJJAG00000013002	Rexo4	82	62.953	Jaculus_jaculus
ENSPCAG00000010581	REXO4	82	47.414	ENSKMAG00000015039	rexo4	82	47.414	Kryptolebias_marmoratus
ENSPCAG00000010581	REXO4	83	47.606	ENSLBEG00000025570	rexo4	81	47.324	Labrus_bergylta
ENSPCAG00000010581	REXO4	88	50.794	ENSLACG00000012399	REXO4	88	50.794	Latimeria_chalumnae
ENSPCAG00000010581	REXO4	84	48.876	ENSLOCG00000003577	rexo4	85	47.165	Lepisosteus_oculatus
ENSPCAG00000010581	REXO4	94	70.352	ENSLAFG00000011274	REXO4	96	70.352	Loxodonta_africana
ENSPCAG00000010581	REXO4	99	66.746	ENSMFAG00000042425	REXO4	99	67.703	Macaca_fascicularis
ENSPCAG00000010581	REXO4	99	66.029	ENSMMUG00000000935	REXO4	99	66.986	Macaca_mulatta
ENSPCAG00000010581	REXO4	99	66.746	ENSMNEG00000031604	REXO4	99	67.703	Macaca_nemestrina
ENSPCAG00000010581	REXO4	99	67.703	ENSMLEG00000037716	REXO4	99	68.660	Mandrillus_leucophaeus
ENSPCAG00000010581	REXO4	83	45.799	ENSMAMG00000011251	rexo4	82	47.592	Mastacembelus_armatus
ENSPCAG00000010581	REXO4	90	46.154	ENSMZEG00005012336	rexo4	85	46.049	Maylandia_zebra
ENSPCAG00000010581	REXO4	83	53.719	ENSMGAG00000006521	REXO4	99	53.168	Meleagris_gallopavo
ENSPCAG00000010581	REXO4	85	61.281	ENSMAUG00000015137	Rexo4	88	59.115	Mesocricetus_auratus
ENSPCAG00000010581	REXO4	97	66.093	ENSMICG00000008422	REXO4	97	66.093	Microcebus_murinus
ENSPCAG00000010581	REXO4	85	60.278	ENSMOCG00000020607	Rexo4	88	58.073	Microtus_ochrogaster
ENSPCAG00000010581	REXO4	88	55.585	ENSMODG00000012817	REXO4	98	54.197	Monodelphis_domestica
ENSPCAG00000010581	REXO4	83	48.406	ENSMALG00000019705	rexo4	81	48.116	Monopterus_albus
ENSPCAG00000010581	REXO4	85	64.507	MGP_CAROLIEiJ_G0023332	-	86	64.225	Mus_caroli
ENSPCAG00000010581	REXO4	85	62.500	ENSMUSG00000052406	Rexo4	86	62.222	Mus_musculus
ENSPCAG00000010581	REXO4	85	63.056	MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	86	63.611	Mus_pahari
ENSPCAG00000010581	REXO4	85	63.056	MGP_SPRETEiJ_G0024249	-	86	62.778	Mus_spretus
ENSPCAG00000010581	REXO4	80	64.095	ENSMPUG00000012315	REXO4	95	64.095	Mustela_putorius_furo
ENSPCAG00000010581	REXO4	98	59.036	ENSNGAG00000010700	Rexo4	87	62.396	Nannospalax_galili
ENSPCAG00000010581	REXO4	91	44.987	ENSNBRG00000011712	rexo4	86	45.822	Neolamprologus_brichardi
ENSPCAG00000010581	REXO4	99	59.233	ENSNLEG00000007556	-	99	60.432	Nomascus_leucogenys
ENSPCAG00000010581	REXO4	99	67.064	ENSNLEG00000013130	-	99	67.780	Nomascus_leucogenys
ENSPCAG00000010581	REXO4	87	46.027	ENSMEUG00000006513	-	100	44.581	Notamacropus_eugenii
ENSPCAG00000010581	REXO4	82	59.312	ENSODEG00000015721	REXO4	98	59.884	Octodon_degus
ENSPCAG00000010581	REXO4	90	45.573	ENSONIG00000020052	rexo4	85	46.791	Oreochromis_niloticus
ENSPCAG00000010581	REXO4	87	54.047	ENSOANG00000002453	REXO4	97	53.786	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPCAG00000010581	REXO4	83	49.148	ENSORLG00000006904	rexo4	81	48.718	Oryzias_latipes
ENSPCAG00000010581	REXO4	83	49.003	ENSORLG00020013768	rexo4	81	49.003	Oryzias_latipes_hni
ENSPCAG00000010581	REXO4	83	49.148	ENSORLG00015012070	rexo4	81	48.725	Oryzias_latipes_hsok
ENSPCAG00000010581	REXO4	86	49.582	ENSOMEG00000018327	rexo4	83	49.304	Oryzias_melastigma
ENSPCAG00000010581	REXO4	98	62.162	ENSOGAG00000014040	REXO4	98	63.145	Otolemur_garnettii
ENSPCAG00000010581	REXO4	99	67.703	ENSPPAG00000027911	REXO4	99	68.660	Pan_paniscus
ENSPCAG00000010581	REXO4	97	63.614	ENSPPRG00000002894	REXO4	99	63.614	Panthera_pardus
ENSPCAG00000010581	REXO4	92	55.039	ENSPTIG00000012007	REXO4	91	54.805	Panthera_tigris_altaica
ENSPCAG00000010581	REXO4	99	67.464	ENSPTRG00000023363	REXO4	99	68.421	Pan_troglodytes
ENSPCAG00000010581	REXO4	99	67.703	ENSPANG00000026040	REXO4	99	68.660	Papio_anubis
ENSPCAG00000010581	REXO4	84	49.718	ENSPKIG00000024761	rexo4	83	49.584	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPCAG00000010581	REXO4	89	50.663	ENSPSIG00000016908	REXO4	98	49.029	Pelodiscus_sinensis
ENSPCAG00000010581	REXO4	83	44.892	ENSPMGG00000005312	rexo4	59	58.772	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPCAG00000010581	REXO4	87	61.096	ENSPEMG00000017982	Rexo4	88	60.822	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPCAG00000010581	REXO4	98	55.635	ENSPCIG00000017379	REXO4	98	54.676	Phascolarctos_cinereus
ENSPCAG00000010581	REXO4	83	45.902	ENSPFOG00000017751	rexo4	83	47.414	Poecilia_formosa
ENSPCAG00000010581	REXO4	83	45.652	ENSPLAG00000010487	rexo4	82	47.550	Poecilia_latipinna
ENSPCAG00000010581	REXO4	83	47.159	ENSPMEG00000020767	rexo4	83	47.727	Poecilia_mexicana
ENSPCAG00000010581	REXO4	83	45.380	ENSPREG00000021841	rexo4	83	47.009	Poecilia_reticulata
ENSPCAG00000010581	REXO4	99	66.029	ENSPPYG00000019735	REXO4	99	66.986	Pongo_abelii
ENSPCAG00000010581	REXO4	99	64.096	ENSPCOG00000025466	REXO4	99	64.096	Propithecus_coquereli
ENSPCAG00000010581	REXO4	99	58.780	ENSPVAG00000001429	REXO4	98	59.512	Pteropus_vampyrus
ENSPCAG00000010581	REXO4	90	44.764	ENSPNYG00000013712	rexo4	85	46.049	Pundamilia_nyererei
ENSPCAG00000010581	REXO4	84	45.730	ENSPNAG00000019227	rexo4	80	46.739	Pygocentrus_nattereri
ENSPCAG00000010581	REXO4	87	60.598	ENSRNOG00000027867	Rexo4	89	60.598	Rattus_norvegicus
ENSPCAG00000010581	REXO4	99	67.464	ENSRBIG00000037515	REXO4	99	67.464	Rhinopithecus_bieti
ENSPCAG00000010581	REXO4	99	67.225	ENSRROG00000028864	REXO4	99	67.225	Rhinopithecus_roxellana
ENSPCAG00000010581	REXO4	99	55.263	ENSSBOG00000032587	REXO4	99	57.656	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPCAG00000010581	REXO4	83	56.534	ENSSHAG00000005827	REXO4	90	56.056	Sarcophilus_harrisii
ENSPCAG00000010581	REXO4	52	64.977	ENSSFOG00015017394	rexo4	60	64.977	Scleropages_formosus
ENSPCAG00000010581	REXO4	88	49.593	ENSSMAG00000015441	rexo4	85	49.593	Scophthalmus_maximus
ENSPCAG00000010581	REXO4	83	46.556	ENSSDUG00000023346	rexo4	80	46.537	Seriola_dumerili
ENSPCAG00000010581	REXO4	88	46.296	ENSSLDG00000011085	rexo4	86	46.277	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPCAG00000010581	REXO4	97	50.957	ENSSPUG00000015868	REXO4	97	51.084	Sphenodon_punctatus
ENSPCAG00000010581	REXO4	86	48.780	ENSSPAG00000007221	rexo4	85	47.790	Stegastes_partitus
ENSPCAG00000010581	REXO4	98	62.560	ENSSSCG00000023173	REXO4	97	62.560	Sus_scrofa
ENSPCAG00000010581	REXO4	86	52.128	ENSTGUG00000005537	REXO4	94	51.579	Taeniopygia_guttata
ENSPCAG00000010581	REXO4	83	47.619	ENSTRUG00000013225	rexo4	86	47.059	Takifugu_rubripes
ENSPCAG00000010581	REXO4	86	48.077	ENSTNIG00000005873	rexo4	99	48.077	Tetraodon_nigroviridis
ENSPCAG00000010581	REXO4	98	63.835	ENSUAMG00000018676	REXO4	96	64.320	Ursus_americanus
ENSPCAG00000010581	REXO4	84	58.074	ENSUMAG00000023164	REXO4	95	58.640	Ursus_maritimus
ENSPCAG00000010581	REXO4	99	60.900	ENSVVUG00000027337	REXO4	98	60.900	Vulpes_vulpes
ENSPCAG00000010581	REXO4	77	50.153	ENSXETG00000023096	rexo4	99	46.543	Xenopus_tropicalis
ENSPCAG00000010581	REXO4	83	46.797	ENSXMAG00000013686	rexo4	86	46.518	Xiphophorus_maculatus