EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPCAG00000012297 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: PAPOLG
Alias: FLJ12972
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Procavia_capensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 24070 bases
Position: chrscaffold_3685:17357-41426
Accession: 14982
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPCAP00000011567	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.2e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPCAT00000012383	PAPOLG-201	2205	-	ENSPCAP00000011567	734 (aa)	-	UPI00018AEB90

Gene Model

Click here to download ENSPCAG00000012297's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPCAG00000012297's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	54	75.750	ENSPCAG00000004199	PAPOLA	100	53.789

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.633	ENSG00000115421	PAPOLG	100	93.162	Homo_sapiens
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	64.926	ENSAPOG00000004798	papolg	99	62.908	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	82.177	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	99	82.177	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	60.734	ENSACIG00000010546	papolg	99	61.601	Amphilophus_citrinellus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	64.619	ENSAOCG00000010254	papolg	89	64.926	Amphiprion_ocellaris
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	64.619	ENSAPEG00000006944	papolg	89	64.926	Amphiprion_percula
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	65.013	ENSATEG00000009007	papolg	76	83.403	Anabas_testudineus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	65.583	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	65.583	Anas_platyrhynchos
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	70	77.811	ENSACAG00000015048	-	84	77.811	Anolis_carolinensis
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.633	ENSANAG00000024627	PAPOLG	99	81.633	Aotus_nancymaae
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	86	83.019	ENSACLG00000015592	papolg	88	63.434	Astatotilapia_calliptera
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	65.113	ENSAMXG00000004611	papolg	99	65.113	Astyanax_mexicanus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.905	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	99	81.905	Bos_taurus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.769	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	99	81.769	Callithrix_jacchus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.633	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	90	81.633	Canis_familiaris
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.107	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	99	81.107	Canis_lupus_dingo
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.633	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	99	81.633	Capra_hircus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.769	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	99	81.769	Carlito_syrichta
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	52	86.089	ENSCAPG00000014901	-	100	86.089	Cavia_aperea
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.769	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	99	81.769	Cavia_porcellus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.905	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	99	81.905	Cebus_capucinus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	90	91.111	ENSCATG00000044395	PAPOLG	99	91.111	Cercocebus_atys
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	82.449	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	99	82.449	Chinchilla_lanigera
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	82.177	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	99	82.177	Chlorocebus_sabaeus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	90	85.432	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	85.432	Choloepus_hoffmanni
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	64	64.496	ENSCING00000024664	-	88	64.496	Ciona_intestinalis
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	63	64.103	ENSCSAVG00000009085	-	94	64.103	Ciona_savignyi
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	82.041	ENSCANG00000038120	PAPOLG	99	82.041	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	80.628	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	80.628	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	80.628	ENSCGRG00000005552	-	100	80.628	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	78	83.864	ENSCSEG00000000771	papolg	98	63.562	Cynoglossus_semilaevis
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	87	82.390	ENSCVAG00000016602	papolg	85	82.563	Cyprinodon_variegatus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	93	81.551	ENSDARG00000012141	papolg	99	64.847	Danio_rerio
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	80.272	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	99	80.272	Dasypus_novemcinctus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	57	93.381	ENSDORG00000016228	Papolg	99	93.381	Dipodomys_ordii
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	66.486	ENSETEG00000011815	PAPOLG	99	66.486	Echinops_telfairi
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	51	73.668	ENSEBUG00000004020	papolg	77	73.668	Eptatretus_burgeri
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	59	57.275	ENSEBUG00000005042	-	73	57.275	Eptatretus_burgeri
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	82.313	ENSEASG00005002038	PAPOLG	99	82.313	Equus_asinus_asinus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	82.449	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	82.449	Equus_caballus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	71.973	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	99	71.973	Erinaceus_europaeus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	65.976	ENSELUG00000014497	papolg	96	66.519	Esox_lucius
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.905	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	99	81.905	Felis_catus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	58.289	ENSFALG00000011079	PAPOLG	95	58.863	Ficedula_albicollis
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.633	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	96	81.633	Fukomys_damarensis
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	60	85.470	ENSFHEG00000019080	papolg	81	85.470	Fundulus_heteroclitus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	73	82.489	ENSGMOG00000018772	papolg	81	83.015	Gadus_morhua
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	86	83.120	ENSGALG00000007853	PAPOLG	84	83.120	Gallus_gallus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	86	83.439	ENSGAFG00000003263	papolg	96	64.000	Gambusia_affinis
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	64.603	ENSGACG00000002718	papolg	99	65.047	Gasterosteus_aculeatus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.769	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	99	81.769	Gorilla_gorilla
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	86	83.019	ENSHBUG00000004882	papolg	88	63.804	Haplochromis_burtoni
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.905	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	99	81.905	Heterocephalus_glaber_female
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.905	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	81.905	Heterocephalus_glaber_male
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	62.753	ENSHCOG00000006782	papolg	87	63.428	Hippocampus_comes
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	64.276	ENSIPUG00000021642	papolg	100	64.409	Ictalurus_punctatus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	82.313	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	99	82.313	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	57	93.144	ENSJJAG00000015601	Papolg	99	93.144	Jaculus_jaculus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	64.238	ENSKMAG00000016439	papolg	95	62.055	Kryptolebias_marmoratus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	61.429	ENSLBEG00000023218	papolg	88	61.818	Labrus_bergylta
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	61.580	ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	61.580	Latimeria_chalumnae
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	64.729	ENSLOCG00000016130	papolg	99	64.729	Lepisosteus_oculatus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	83.537	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	93.617	Loxodonta_africana
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	82.041	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	99	82.041	Macaca_fascicularis
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	82.041	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	99	82.041	Macaca_mulatta
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	73.514	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	99	73.514	Macaca_nemestrina
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.905	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	99	81.905	Mandrillus_leucophaeus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	65.060	ENSMAMG00000010667	papolg	99	63.043	Mastacembelus_armatus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	86	83.019	ENSMZEG00005018140	papolg	99	63.115	Maylandia_zebra
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	85	82.090	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	85	82.090	Meleagris_gallopavo
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	80.491	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	80.491	Mesocricetus_auratus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	82.585	ENSMICG00000010042	PAPOLG	99	82.585	Microcebus_murinus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	80.952	ENSMOCG00000006857	Papolg	99	80.952	Microtus_ochrogaster
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	64.219	ENSMMOG00000008020	papolg	99	64.486	Mola_mola
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	76.312	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	76.312	Monodelphis_domestica
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	64.603	ENSMALG00000007012	papolg	88	64.603	Monopterus_albus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.497	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	98	93.839	Mus_caroli
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.497	ENSMUSG00000020273	Papolg	98	93.839	Mus_musculus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.224	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	81.173	Mus_pahari
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.361	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	98	93.839	Mus_spretus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.905	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	89	81.905	Mustela_putorius_furo
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	80.544	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	99	80.544	Myotis_lucifugus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	80.952	ENSNGAG00000001120	Papolg	99	80.952	Nannospalax_galili
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	55.898	ENSNBRG00000011943	papolg	98	57.201	Neolamprologus_brichardi
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	57	93.853	ENSNLEG00000009507	-	99	93.853	Nomascus_leucogenys
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	81	82.857	ENSMEUG00000013605	-	87	82.857	Notamacropus_eugenii
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.633	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	99	81.633	Ochotona_princeps
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	57	90.047	ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	90.047	Octodon_degus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	57.470	ENSONIG00000002985	papolg	99	57.739	Oreochromis_niloticus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	74.665	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	74.665	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	82.313	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	99	82.313	Oryctolagus_cuniculus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	63.501	ENSORLG00000001577	papolg	87	63.795	Oryzias_latipes
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	63.464	ENSORLG00020002482	papolg	87	64.238	Oryzias_latipes_hni
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	63.501	ENSORLG00015008836	papolg	87	63.795	Oryzias_latipes_hsok
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	63.550	ENSOMEG00000001406	papolg	87	63.807	Oryzias_melastigma
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	59	70.465	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	70.465	Otolemur_garnettii
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.633	ENSOARG00000001563	PAPOLG	90	81.633	Ovis_aries
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.633	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	99	81.633	Pan_paniscus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.769	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	99	81.769	Panthera_pardus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.769	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	99	81.769	Panthera_tigris_altaica
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.633	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	99	81.633	Pan_troglodytes
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	78.019	ENSPANG00000014543	PAPOLG	99	78.019	Papio_anubis
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	65.906	ENSPKIG00000003313	papolg	99	65.906	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	91	63.450	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	95	63.450	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	70.421	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	70.421	Pelodiscus_sinensis
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	80.628	ENSPEMG00000008960	-	100	80.628	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	64	63.278	ENSPMAG00000002961	papolg	91	63.278	Petromyzon_marinus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	64	62.179	ENSPMAG00000004864	-	92	62.179	Petromyzon_marinus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	76.851	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	99	76.851	Phascolarctos_cinereus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	84	83.439	ENSPFOG00000012909	papolg	98	63.003	Poecilia_formosa
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	84	83.439	ENSPLAG00000018445	papolg	88	63.172	Poecilia_latipinna
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	84	83.439	ENSPMEG00000003961	papolg	88	63.405	Poecilia_mexicana
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	77	83.227	ENSPREG00000010358	papolg	96	62.834	Poecilia_reticulata
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.497	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	99	81.497	Pongo_abelii
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	72.109	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	99	72.109	Propithecus_coquereli
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	78	90.776	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	78	90.776	Pteropus_vampyrus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	86	83.019	ENSPNYG00000006729	papolg	99	62.364	Pundamilia_nyererei
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	65.811	ENSPNAG00000015521	papolg	99	65.811	Pygocentrus_nattereri
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	80.952	ENSRNOG00000006261	Papolg	99	80.952	Rattus_norvegicus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	76.190	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	99	76.190	Rhinopithecus_bieti
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	82.041	ENSRROG00000035954	PAPOLG	99	82.041	Rhinopithecus_roxellana
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.633	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	99	81.633	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	95	76.454	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	76.454	Sarcophilus_harrisii
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	62.869	ENSSFOG00015002383	papolg	98	62.869	Scleropages_formosus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	57.104	ENSSFOG00015011874	papolg	99	57.104	Scleropages_formosus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	85	83.726	ENSSMAG00000015598	papolg	93	61.783	Scophthalmus_maximus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	64.642	ENSSDUG00000000912	papolg	99	63.043	Seriola_dumerili
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	63.989	ENSSLDG00000001217	papolg	96	64.123	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	70.204	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	98	70.204	Sphenodon_punctatus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	86	82.809	ENSSPAG00000009004	papolg	99	62.228	Stegastes_partitus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	82.449	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	99	82.449	Sus_scrofa
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	64	76.068	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	87	76.068	Taeniopygia_guttata
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	63.870	ENSTRUG00000006410	papolg	99	63.870	Takifugu_rubripes
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	58.699	ENSTNIG00000017106	papolg	99	58.675	Tetraodon_nigroviridis
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	74.966	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	74.966	Tupaia_belangeri
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	77.551	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	99	77.551	Tursiops_truncatus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	81.855	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	81.855	Ursus_americanus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	81.855	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	81.855	Ursus_maritimus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	77.959	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	77.959	Vicugna_pacos
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	81.905	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	98	81.905	Vulpes_vulpes
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	66.981	ENSXETG00000002208	papolg	98	66.981	Xenopus_tropicalis
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	64	82.839	ENSXCOG00000006611	papolg	69	82.839	Xiphophorus_couchianus
ENSPCAG00000012297	PAPOLG	69	80.127	ENSXMAG00000007383	papolg	84	80.127	Xiphophorus_maculatus