EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPCAG00000016605 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: POLR2E
Alias: RPABC1|RPB5|XAP4|hRPB25|hsRPB5
Full Name: RNA polymerase II subunit E
Gene Type: protein_coding
Species: Procavia_capensis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1246 bases
Position: chrGeneScaffold_6509:75113-76358
Accession: 9192
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPCAP00000015511	RNA_pol_Rpb5_C	PF01191.19	7.9e-22	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPCAT00000016571	POLR2E-201	333	-	ENSPCAP00000015511	111 (aa)	-	UPI00018AEEEF

Gene Model

Click here to download ENSPCAG00000016605's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPCAG00000016605's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSG00000099817	POLR2E	83	100.000	Homo_sapiens
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSAPOG00000002935	polr2eb	53	93.694	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSAMEG00000003159	POLR2E	53	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSAOCG00000018166	polr2eb	53	93.694	Amphiprion_ocellaris
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSAPEG00000009000	polr2eb	53	93.694	Amphiprion_percula
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSATEG00000023760	polr2eb	53	93.694	Anabas_testudineus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSANAG00000038488	POLR2E	56	100.000	Aotus_nancymaae
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSACLG00000005254	polr2eb	53	93.694	Astatotilapia_calliptera
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	94.595	ENSAMXG00000018915	POLR2E	53	94.595	Astyanax_mexicanus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSBTAG00000020776	POLR2E	53	100.000	Bos_taurus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	74.775	WBGene00019246	rpb-5	53	74.775	Caenorhabditis_elegans
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSCJAG00000007666	-	61	100.000	Callithrix_jacchus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	95	98.113	ENSCAFG00000019546	POLR2E	50	98.113	Canis_familiaris
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSCAFG00020017111	POLR2E	53	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSCHIG00000014151	POLR2E	53	100.000	Capra_hircus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSCAPG00000010843	POLR2E	54	100.000	Cavia_aperea
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSCPOG00000001542	POLR2E	53	100.000	Cavia_porcellus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSCCAG00000025658	POLR2E	56	100.000	Cebus_capucinus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSCATG00000008926	POLR2E	53	100.000	Cercocebus_atys
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	99.099	ENSCLAG00000014874	-	53	99.099	Chinchilla_lanigera
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	88.288	ENSCLAG00000009238	-	62	88.288	Chinchilla_lanigera
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSCSAG00000012336	POLR2E	53	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	99.099	ENSCPBG00000009702	POLR2E	53	99.099	Chrysemys_picta_bellii
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	85.586	ENSCING00000024933	-	53	85.586	Ciona_intestinalis
ENSPCAG00000016605	POLR2E	53	83.051	ENSCSAVG00000007138	-	74	83.051	Ciona_savignyi
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSCANG00000025560	POLR2E	56	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	98.198	ENSCGRG00001022927	Polr2e	53	98.198	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	86.207	ENSCGRG00000016441	Polr2e	54	86.207	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSCVAG00000019940	polr2eb	53	93.694	Cyprinodon_variegatus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSDARG00000026183	polr2eb	53	93.694	Danio_rerio
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSDORG00000001154	Polr2e	53	100.000	Dipodomys_ordii
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	84.685	FBgn0033571	Rpb5	53	84.685	Drosophila_melanogaster
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	90.090	ENSELUG00000020646	polr2e	53	90.090	Esox_lucius
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	90.991	ENSELUG00000005815	POLR2E	53	90.991	Esox_lucius
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	99.099	ENSFCAG00000007318	POLR2E	53	99.099	Felis_catus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	99.099	ENSFALG00000013986	POLR2E	57	99.099	Ficedula_albicollis
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSFDAG00000014539	POLR2E	53	100.000	Fukomys_damarensis
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSFHEG00000022398	polr2eb	53	93.694	Fundulus_heteroclitus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	91.892	ENSGMOG00000007615	polr2eb	53	91.892	Gadus_morhua
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	99.099	ENSGALG00000002591	POLR2E	53	99.099	Gallus_gallus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSGAFG00000005087	polr2eb	53	93.694	Gambusia_affinis
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	91.892	ENSGACG00000013247	polr2eb	53	91.892	Gasterosteus_aculeatus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	99.099	ENSGAGG00000008356	POLR2E	53	99.099	Gopherus_agassizii
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSGGOG00000011267	POLR2E	56	100.000	Gorilla_gorilla
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSHBUG00000011099	polr2eb	80	93.694	Haplochromis_burtoni
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSHGLG00000013330	POLR2E	53	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSHGLG00100011014	POLR2E	53	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSPCAG00000016605	POLR2E	59	92.424	ENSHCOG00000012099	-	52	92.424	Hippocampus_comes
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	92.793	ENSHCOG00000000906	polr2eb	53	92.793	Hippocampus_comes
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSIPUG00000019801	polr2e	53	93.694	Ictalurus_punctatus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSSTOG00000002853	POLR2E	53	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	98.198	ENSJJAG00000016595	-	53	98.198	Jaculus_jaculus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSKMAG00000005954	polr2eb	53	93.694	Kryptolebias_marmoratus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSLBEG00000024802	polr2eb	53	93.694	Labrus_bergylta
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	94.595	ENSLACG00000013686	POLR2E	53	94.595	Latimeria_chalumnae
ENSPCAG00000016605	POLR2E	76	95.238	ENSLOCG00000004599	POLR2E	52	95.238	Lepisosteus_oculatus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSLAFG00000025587	POLR2E	53	100.000	Loxodonta_africana
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSMFAG00000002884	POLR2E	53	100.000	Macaca_fascicularis
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSMMUG00000013927	POLR2E	53	100.000	Macaca_mulatta
ENSPCAG00000016605	POLR2E	88	68.687	ENSMNEG00000033452	-	57	68.687	Macaca_nemestrina
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSMNEG00000034046	-	53	100.000	Macaca_nemestrina
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSMAMG00000018703	polr2eb	53	93.694	Mastacembelus_armatus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSMZEG00005010796	polr2eb	56	93.694	Maylandia_zebra
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	99.099	ENSMGAG00000003769	POLR2E	53	99.099	Meleagris_gallopavo
ENSPCAG00000016605	POLR2E	85	87.234	ENSMAUG00000011003	-	54	87.234	Mesocricetus_auratus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	98.198	ENSMAUG00000010125	-	58	98.198	Mesocricetus_auratus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSMICG00000013063	POLR2E	55	100.000	Microcebus_murinus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	98.198	ENSMOCG00000013414	Polr2e	53	98.198	Microtus_ochrogaster
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	82.883	ENSMMOG00000001167	polr2eb	51	82.883	Mola_mola
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	99.099	ENSMODG00000005494	POLR2E	53	99.099	Monodelphis_domestica
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSMALG00000021888	polr2eb	53	93.694	Monopterus_albus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	98.198	MGP_CAROLIEiJ_G0015561	Polr2e	53	98.198	Mus_caroli
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	98.198	ENSMUSG00000004667	Polr2e	53	98.198	Mus_musculus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	98.198	MGP_PahariEiJ_G0030974	Polr2e	53	98.198	Mus_pahari
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	98.198	MGP_SPRETEiJ_G0016379	Polr2e	53	98.198	Mus_spretus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	99.099	ENSMPUG00000008953	POLR2E	53	99.099	Mustela_putorius_furo
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSMLUG00000013193	POLR2E	53	100.000	Myotis_lucifugus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	54	96.667	ENSMLUG00000006376	-	52	73.810	Myotis_lucifugus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	98.198	ENSNGAG00000001147	Polr2e	53	98.198	Nannospalax_galili
ENSPCAG00000016605	POLR2E	97	71.296	ENSNGAG00000017344	-	56	71.296	Nannospalax_galili
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	92.857	ENSNLEG00000001207	-	53	92.857	Nomascus_leucogenys
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	72.973	ENSNLEG00000031364	-	52	72.973	Nomascus_leucogenys
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	75.676	ENSOPRG00000008331	POLR2E	53	75.676	Ochotona_princeps
ENSPCAG00000016605	POLR2E	97	87.963	ENSODEG00000007985	-	56	87.963	Octodon_degus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSODEG00000013230	-	53	100.000	Octodon_degus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSONIG00000002519	polr2eb	53	93.694	Oreochromis_niloticus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSORLG00000015346	polr2eb	53	93.694	Oryzias_latipes
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSORLG00020020700	polr2e	53	93.694	Oryzias_latipes_hni
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSORLG00015016842	polr2e	53	93.694	Oryzias_latipes_hsok
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSOMEG00000002709	polr2eb	53	93.694	Oryzias_melastigma
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSOGAG00000012311	POLR2E	53	100.000	Otolemur_garnettii
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSOARG00000010994	POLR2E	53	100.000	Ovis_aries
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSPPAG00000003145	POLR2E	58	100.000	Pan_paniscus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	99.099	ENSPPRG00000000777	POLR2E	53	99.099	Panthera_pardus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	76	98.810	ENSPTIG00000012237	POLR2E	54	98.810	Panthera_tigris_altaica
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSPTRG00000010183	POLR2E	56	100.000	Pan_troglodytes
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSPANG00000018011	POLR2E	53	100.000	Papio_anubis
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	91.892	ENSPKIG00000024123	POLR2E	53	91.892	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	92.793	ENSPKIG00000009607	POLR2E	53	92.793	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	99.099	ENSPSIG00000002870	POLR2E	53	99.099	Pelodiscus_sinensis
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	98.198	ENSPEMG00000023261	Polr2e	53	98.198	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSPFOG00000005734	polr2eb	53	93.694	Poecilia_formosa
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSPLAG00000014496	polr2eb	53	93.694	Poecilia_latipinna
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSPMEG00000008053	polr2eb	53	93.694	Poecilia_mexicana
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSPREG00000006489	polr2eb	53	93.694	Poecilia_reticulata
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	85.714	ENSPPYG00000009305	POLR2E	53	85.714	Pongo_abelii
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSPCOG00000014491	POLR2E	55	100.000	Propithecus_coquereli
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSPNYG00000019797	polr2eb	56	93.694	Pundamilia_nyererei
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSPNAG00000026263	POLR2E	53	93.694	Pygocentrus_nattereri
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	98.198	ENSRNOG00000013545	Polr2e	55	98.198	Rattus_norvegicus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	73.214	ENSRBIG00000027259	-	54	73.214	Rhinopithecus_bieti
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSRBIG00000028726	-	53	100.000	Rhinopithecus_bieti
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSRROG00000043763	POLR2E	53	100.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	48.649	YBR154C	RPB5	51	48.649	Saccharomyces_cerevisiae
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSSBOG00000027241	POLR2E	55	100.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	99.099	ENSSHAG00000010690	POLR2E	53	99.099	Sarcophilus_harrisii
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSSFOG00015006073	polr2e	53	93.694	Scleropages_formosus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSSMAG00000012782	polr2eb	53	93.694	Scophthalmus_maximus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSSDUG00000003352	polr2eb	53	93.694	Seriola_dumerili
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSSLDG00000004965	polr2eb	53	93.694	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	98.198	ENSSPUG00000006114	POLR2E	53	98.198	Sphenodon_punctatus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSSPAG00000017556	polr2eb	53	93.694	Stegastes_partitus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSSSCG00000021472	POLR2E	53	100.000	Sus_scrofa
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSTNIG00000013187	polr2eb	53	93.694	Tetraodon_nigroviridis
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	100.000	ENSTTRG00000001484	POLR2E	53	100.000	Tursiops_truncatus
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	96.396	ENSXETG00000003291	polr2e	53	96.396	Xenopus_tropicalis
ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	93.694	ENSXMAG00000026495	polr2eb	53	93.694	Xiphophorus_maculatus