EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPCAG00000016969 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: BAF190|BRM|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Procavia_capensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 161271 bases
Position: chrGeneScaffold_806:58833-220103
Accession: 11098
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPCAP00000015897	BRK	PF07533.16	3.7e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPCAT00000016988	SMARCA2-201	4755	-	ENSPCAP00000015897	1584 (aa)	-	UPI00018B07A9

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	56	88.889	ENSPCAG00000014054	SMARCA4	59	88.889

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	86.973	ENSG00000080503	SMARCA2	98	96.721	Homo_sapiens
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	73.944	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	76	73.944	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	67	78.792	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	73	85.350	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	74.296	ENSACIG00000015607	SMARCA2	76	74.296	Amphilophus_citrinellus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	73.944	ENSAOCG00000009647	-	76	73.944	Amphiprion_ocellaris
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	73.944	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	76	73.944	Amphiprion_percula
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	76	74.296	ENSATEG00000006916	SMARCA2	75	74.296	Anabas_testudineus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	67	79.298	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	71	79.298	Anas_platyrhynchos
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	78.246	ENSACAG00000002423	SMARCA2	79	78.246	Anolis_carolinensis
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	87.051	ENSANAG00000026498	SMARCA2	79	87.564	Aotus_nancymaae
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	73.592	ENSACLG00000004248	SMARCA2	76	73.592	Astatotilapia_calliptera
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	73.333	ENSAMXG00000012404	smarca2	76	73.333	Astyanax_mexicanus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	86.100	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	79	86.100	Bos_taurus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	77	87.356	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	79	84.733	Callithrix_jacchus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	86.486	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	79	86.486	Canis_familiaris
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	51	100.000	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	66	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	86.100	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	79	86.100	Capra_hircus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	85.751	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	79	85.696	Carlito_syrichta
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	77	81.306	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	76	80.458	Cavia_aperea
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	84.635	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	76	84.097	Cavia_porcellus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	87.964	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	79	88.092	Cebus_capucinus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	86.538	ENSCATG00000031470	SMARCA2	79	86.393	Cercocebus_atys
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	84.987	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	79	84.860	Chinchilla_lanigera
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	71	100.000	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	77	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	57	100.000	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	58	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	78.947	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	79	78.947	Chrysemys_picta_bellii
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	87.275	ENSCANG00000039597	SMARCA2	76	86.874	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	74	93.893	ENSCGRG00001002323	Smarca2	70	93.893	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	70	92.437	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	70	92.437	Cynoglossus_semilaevis
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	67	75.352	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	76	75.352	Cyprinodon_variegatus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	74.296	ENSDARG00000008904	smarca2	76	74.296	Danio_rerio
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	84.025	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	79	84.277	Dasypus_novemcinctus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	85.294	ENSDORG00000014832	Smarca2	76	84.791	Dipodomys_ordii
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	62	79.412	ENSEBUG00000002449	-	69	79.412	Eptatretus_burgeri
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	68	87.879	ENSEBUG00000011442	-	70	87.879	Eptatretus_burgeri
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	85.714	ENSEASG00005010312	SMARCA2	79	85.714	Equus_asinus_asinus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	67	94.286	ENSELUG00000010318	smarca2	74	94.286	Esox_lucius
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	85.586	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	79	85.586	Felis_catus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	79.298	ENSFALG00000010416	SMARCA2	79	79.298	Ficedula_albicollis
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	77	83.655	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	77	81.603	Fukomys_damarensis
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	69	97.143	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	69	97.143	Fundulus_heteroclitus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	75	72.183	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	76	72.183	Gadus_morhua
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	79.298	ENSGALG00000010164	SMARCA2	79	79.298	Gallus_gallus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	71	95.652	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	71	95.652	Gambusia_affinis
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	76	72.183	ENSGACG00000014488	SMARCA2	76	72.183	Gasterosteus_aculeatus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	78.947	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	79	78.947	Gopherus_agassizii
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	71	94.148	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	75	94.148	Gorilla_gorilla
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	73.592	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	77	73.592	Haplochromis_burtoni
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	77	83.760	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	75	83.042	Heterocephalus_glaber_female
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	83.548	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	76	82.544	Heterocephalus_glaber_male
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	57	74.745	ENSHCOG00000015348	-	63	73.980	Hippocampus_comes
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	76	73.592	ENSIPUG00000011060	smarca2	76	73.592	Ictalurus_punctatus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	86.115	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	76	85.523	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	85.166	ENSJJAG00000010867	Smarca2	76	85.061	Jaculus_jaculus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	74.296	ENSKMAG00000015844	-	77	74.296	Kryptolebias_marmoratus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	75	75.439	ENSLOCG00000011499	smarca2	76	75.439	Lepisosteus_oculatus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	84.548	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	79	84.682	Loxodonta_africana
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	84.082	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	78	84.082	Macaca_fascicularis
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	87.163	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	79	87.548	Macaca_mulatta
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	84.635	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	79	85.531	Macaca_nemestrina
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	82.391	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	78	82.519	Mandrillus_leucophaeus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	74.648	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	77	74.648	Mastacembelus_armatus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	73.592	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	76	73.592	Maylandia_zebra
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	53	82.192	ENSMGAG00000005160	-	71	86.786	Meleagris_gallopavo
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	87.645	ENSMICG00000005162	SMARCA2	79	87.645	Microcebus_murinus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	84.802	ENSMOCG00000001611	Smarca2	76	84.409	Microtus_ochrogaster
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	76	73.944	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	71	94.203	Mola_mola
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	79.298	ENSMODG00000003578	SMARCA2	79	79.298	Monodelphis_domestica
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	76	74.648	ENSMALG00000009611	SMARCA2	75	74.648	Monopterus_albus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	83.774	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	79	83.201	Mus_caroli
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	84.257	ENSMUSG00000024921	Smarca2	79	83.841	Mus_musculus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	84.051	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	79	83.489	Mus_pahari
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	83.522	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	82	90.426	Mus_spretus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	59	85.412	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	69	85.412	Mustela_putorius_furo
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	81.841	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	79	80.982	Myotis_lucifugus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	77	84.467	ENSNGAG00000000108	Smarca2	75	83.919	Nannospalax_galili
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	60	92.661	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	70	92.661	Neolamprologus_brichardi
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	81.982	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	78	81.982	Nomascus_leucogenys
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	95.930	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	77	95.930	Notamacropus_eugenii
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	83.143	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	79	83.270	Ochotona_princeps
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	77	84.470	ENSODEG00000005452	SMARCA2	78	84.343	Octodon_degus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	76	74.126	ENSONIG00000014163	SMARCA2	76	74.126	Oreochromis_niloticus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	85.190	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	79	84.684	Oryctolagus_cuniculus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	75.352	ENSORLG00000020820	SMARCA2	76	75.352	Oryzias_latipes
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	75.352	ENSORLG00015006289	SMARCA2	76	75.352	Oryzias_latipes_hsok
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	71	92.754	ENSOMEG00000009736	-	72	92.754	Oryzias_melastigma
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	77	80.788	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	79	81.605	Otolemur_garnettii
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	83.718	ENSOARG00000013265	SMARCA2	79	83.718	Ovis_aries
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	74	92.248	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	78	92.248	Pan_paniscus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	85.714	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	79	85.714	Panthera_pardus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	85.223	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	79	84.076	Pan_troglodytes
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	79.649	ENSPANG00000025121	SMARCA2	79	79.649	Papio_anubis
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	76.761	ENSPKIG00000018469	-	76	76.761	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	78.626	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	79	78.596	Pelodiscus_sinensis
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	76	72.569	ENSPMGG00000013696	-	73	93.333	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	85.223	ENSPEMG00000019821	Smarca2	77	84.182	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	71	89.706	ENSPMAG00000005337	-	71	89.706	Petromyzon_marinus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	80.824	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	80	79.298	Phascolarctos_cinereus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	75.000	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	77	75.000	Poecilia_formosa
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	76	75.000	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	74	75.000	Poecilia_latipinna
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	76	75.000	ENSPMEG00000001815	-	77	75.000	Poecilia_mexicana
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	69	97.143	ENSPREG00000013800	SMARCA2	73	97.143	Poecilia_reticulata
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	86.650	ENSPPYG00000019258	SMARCA2	79	87.035	Pongo_abelii
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	88.160	ENSPCOG00000025709	SMARCA2	80	88.031	Propithecus_coquereli
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	73	84.495	ENSPVAG00000000901	SMARCA2	77	84.495	Pteropus_vampyrus
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	69	90.756	ENSPNYG00000004533	SMARCA2	69	90.756	Pundamilia_nyererei
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	76	76.056	ENSPNAG00000014635	smarca2	75	76.056	Pygocentrus_nattereri
ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	83.544	ENSRNOG00000011931	Smarca2	76	83.222	Rattus_norvegicus
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