EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPCIG00000000092 (Gene tree)
Gene ID: 110206367
Gene Symbol: AGO4
Alias: -
Full Name: argonaute 4%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Phascolarctos_cinereus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 41646 bases
Position: chrFUWB01002581.1:15871-57516
Accession: 110206367
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPCIP00000000121	PAZ	PF02170.22	9.2e-28	1	1
ENSPCIP00000000152	PAZ	PF02170.22	9.5e-28	1	1
ENSPCIP00000000121	Piwi	PF02171.17	3.6e-105	1	1
ENSPCIP00000000152	Piwi	PF02171.17	3.7e-105	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPCIT00000000218	AGO4-202	3964	-	ENSPCIP00000000152	877 (aa)	-	-
ENSPCIT00000000175	AGO4-201	3570	-	ENSPCIP00000000121	861 (aa)	XP_020839348	UPI00020F6BAB

Gene Model

Click here to download ENSPCIG00000000092's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPCIG00000000092's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	78.824	ENSPCIG00000026513	AGO2	100	77.231
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	80.805	ENSPCIG00000000198	AGO3	100	80.619
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	83.489	ENSPCIG00000000172	AGO1	98	83.489

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	99.652	ENSG00000134698	AGO4	100	99.652	Homo_sapiens
ENSPCIG00000000092	AGO4	96	96.420	ENSAPOG00000023867	ago4	99	96.420	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	99.185	ENSAMEG00000000573	AGO4	100	99.534	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPCIG00000000092	AGO4	92	97.859	ENSACIG00000014548	ago4	100	97.859	Amphilophus_citrinellus
ENSPCIG00000000092	AGO4	92	93.199	ENSAPEG00000022426	ago4	100	93.199	Amphiprion_percula
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	96.453	ENSATEG00000006717	ago4	100	96.522	Anabas_testudineus
ENSPCIG00000000092	AGO4	98	99.882	ENSAPLG00000010882	AGO4	100	99.882	Anas_platyrhynchos
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	98.480	ENSACAG00000017275	AGO4	99	98.480	Anolis_carolinensis
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	99.535	ENSANAG00000031428	AGO4	100	99.535	Aotus_nancymaae
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	96.339	ENSACLG00000005181	ago4	100	96.339	Astatotilapia_calliptera
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	96.568	ENSAMXG00000010318	ago4	100	96.599	Astyanax_mexicanus
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	98.485	ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.485	Bos_taurus
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	99.652	ENSCJAG00000001610	AGO4	100	99.652	Callithrix_jacchus
ENSPCIG00000000092	AGO4	92	99.622	ENSCAFG00000024306	AGO4	100	99.622	Canis_familiaris
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	99.535	ENSCHIG00000026564	AGO4	100	99.535	Capra_hircus
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	99.532	ENSTSYG00000014007	AGO4	100	99.532	Carlito_syrichta
ENSPCIG00000000092	AGO4	94	95.749	ENSCAPG00000009369	AGO4	100	95.749	Cavia_aperea
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	97.213	ENSCPOG00000011557	AGO4	99	97.658	Cavia_porcellus
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	99.652	ENSCCAG00000001397	AGO4	100	99.652	Cebus_capucinus
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	99.652	ENSCATG00000043421	AGO4	100	99.742	Cercocebus_atys
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	99.297	ENSCLAG00000012097	AGO4	100	99.297	Chinchilla_lanigera
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	99.652	ENSCSAG00000001090	AGO4	100	99.652	Chlorocebus_sabaeus
ENSPCIG00000000092	AGO4	80	100.000	ENSCHOG00000006867	AGO4	81	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	99.883	ENSCPBG00000018602	AGO4	99	99.419	Chrysemys_picta_bellii
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	99.649	ENSCANG00000016914	AGO4	100	99.649	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	99.071	ENSCGRG00001002701	Ago4	100	99.071	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	99.063	ENSCGRG00000013335	Ago4	100	99.063	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPCIG00000000092	AGO4	92	91.709	ENSCSEG00000010696	ago4	100	91.709	Cynoglossus_semilaevis
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	97.798	ENSDARG00000100854	ago4	100	97.798	Danio_rerio
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	99.419	ENSDNOG00000015674	AGO4	100	99.419	Dasypus_novemcinctus
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	99.535	ENSDORG00000008933	Ago4	100	99.535	Dipodomys_ordii
ENSPCIG00000000092	AGO4	60	99.507	ENSETEG00000018390	AGO4	83	99.507	Echinops_telfairi
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	99.652	ENSEASG00005012079	AGO4	100	99.652	Equus_asinus_asinus
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	99.652	ENSECAG00000024686	AGO4	100	99.652	Equus_caballus
ENSPCIG00000000092	AGO4	79	96.466	ENSEEUG00000000745	AGO4	79	96.466	Erinaceus_europaeus
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	95.900	ENSELUG00000023873	ago4	100	95.900	Esox_lucius
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	99.535	ENSFCAG00000006218	AGO4	100	99.535	Felis_catus
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	99.532	ENSFDAG00000021483	AGO4	100	99.532	Fukomys_damarensis
ENSPCIG00000000092	AGO4	97	88.876	ENSFHEG00000019658	ago4	100	88.876	Fundulus_heteroclitus
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	97.322	ENSGMOG00000009544	ago4	99	97.322	Gadus_morhua
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	99.884	ENSGALG00000039713	AGO4	100	99.884	Gallus_gallus
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	96.339	ENSGAFG00000017239	ago4	100	96.339	Gambusia_affinis
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	97.558	ENSGACG00000002683	ago4	99	97.558	Gasterosteus_aculeatus
ENSPCIG00000000092	AGO4	92	99.874	ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.874	Gopherus_agassizii
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	96.240	ENSGGOG00000036532	AGO4	100	96.240	Gorilla_gorilla
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	96.339	ENSHBUG00000001525	ago4	100	96.339	Haplochromis_burtoni
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	99.535	ENSHGLG00000010241	AGO4	100	99.535	Heterocephalus_glaber_female
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	99.647	ENSHGLG00100005233	AGO4	99	99.647	Heterocephalus_glaber_male
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	96.224	ENSHCOG00000003725	ago4	100	96.224	Hippocampus_comes
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	96.453	ENSIPUG00000015600	ago4	100	96.453	Ictalurus_punctatus
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	99.535	ENSSTOG00000004725	AGO4	100	99.535	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	96.453	ENSKMAG00000018602	ago4	100	96.453	Kryptolebias_marmoratus
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	95.795	ENSLBEG00000010670	ago4	100	95.795	Labrus_bergylta
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	98.839	ENSLACG00000016888	AGO4	100	98.839	Latimeria_chalumnae
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	96.449	ENSLOCG00000000584	ago4	100	96.449	Lepisosteus_oculatus
ENSPCIG00000000092	AGO4	93	99.001	ENSLAFG00000010394	AGO4	100	99.001	Loxodonta_africana
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	99.652	ENSMFAG00000035543	AGO4	100	99.652	Macaca_fascicularis
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	99.417	ENSMMUG00000003343	AGO4	100	99.603	Macaca_mulatta
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	99.652	ENSMNEG00000037723	AGO4	100	99.652	Macaca_nemestrina
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	99.649	ENSMLEG00000039490	AGO4	100	99.649	Mandrillus_leucophaeus
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	96.339	ENSMAMG00000003874	ago4	100	96.356	Mastacembelus_armatus
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	96.339	ENSMZEG00005026346	ago4	100	96.339	Maylandia_zebra
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	99.532	ENSMGAG00000003851	AGO4	99	99.532	Meleagris_gallopavo
ENSPCIG00000000092	AGO4	82	100.000	ENSMAUG00000021743	Ago4	99	96.441	Mesocricetus_auratus
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	99.415	ENSMICG00000033507	AGO4	100	99.415	Microcebus_murinus
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	99.187	ENSMOCG00000005772	Ago4	100	99.187	Microtus_ochrogaster
ENSPCIG00000000092	AGO4	92	96.851	ENSMMOG00000013473	ago4	100	96.851	Mola_mola
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	100.000	ENSMODG00000017888	AGO4	100	100.000	Monodelphis_domestica
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	95.688	ENSMALG00000011797	ago4	100	95.688	Monopterus_albus
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	98.722	MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	98.722	Mus_caroli
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	98.490	ENSMUSG00000042500	Ago4	100	98.490	Mus_musculus
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	98.142	MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	98.142	Mus_pahari
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	98.258	MGP_SPRETEiJ_G0027458	Ago4	100	98.258	Mus_spretus
ENSPCIG00000000092	AGO4	92	99.622	ENSMPUG00000014876	AGO4	100	99.622	Mustela_putorius_furo
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	98.364	ENSMLUG00000017102	AGO4	98	98.364	Myotis_lucifugus
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	99.532	ENSNGAG00000020544	Ago4	100	99.532	Nannospalax_galili
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	96.339	ENSNBRG00000013492	ago4	100	96.339	Neolamprologus_brichardi
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	99.649	ENSNLEG00000011125	AGO4	100	99.649	Nomascus_leucogenys
ENSPCIG00000000092	AGO4	90	99.077	ENSMEUG00000001023	AGO4	90	99.077	Notamacropus_eugenii
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	92.272	ENSOPRG00000012309	AGO4	100	92.272	Ochotona_princeps
ENSPCIG00000000092	AGO4	93	99.499	ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.499	Octodon_degus
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	96.339	ENSONIG00000013603	ago4	100	96.339	Oreochromis_niloticus
ENSPCIG00000000092	AGO4	92	100.000	ENSOANG00000002082	AGO4	100	100.000	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	99.419	ENSOCUG00000004076	AGO4	100	99.419	Oryctolagus_cuniculus
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	96.453	ENSORLG00000009865	ago4	92	96.453	Oryzias_latipes
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	96.453	ENSORLG00020016978	ago4	92	96.453	Oryzias_latipes_hni
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	96.453	ENSORLG00015008800	ago4	92	96.453	Oryzias_latipes_hsok
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	96.453	ENSOMEG00000006399	ago4	100	96.453	Oryzias_melastigma
ENSPCIG00000000092	AGO4	93	98.248	ENSOGAG00000004233	-	100	98.248	Otolemur_garnettii
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	90.592	ENSOGAG00000027107	-	100	90.592	Otolemur_garnettii
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	98.719	ENSOARG00000019568	AGO4	99	97.824	Ovis_aries
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	99.649	ENSPPAG00000031752	AGO4	100	99.649	Pan_paniscus
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	99.535	ENSPPRG00000006520	AGO4	100	99.535	Panthera_pardus
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	99.532	ENSPTIG00000020262	AGO4	100	99.532	Panthera_tigris_altaica
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	99.652	ENSPTRG00000000527	AGO4	100	99.652	Pan_troglodytes
ENSPCIG00000000092	AGO4	92	99.622	ENSPANG00000007232	AGO4	100	99.622	Papio_anubis
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	96.339	ENSPKIG00000022598	ago4	100	96.339	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	99.883	ENSPSIG00000013832	AGO4	99	99.883	Pelodiscus_sinensis
ENSPCIG00000000092	AGO4	92	97.733	ENSPMGG00000023325	ago4	100	97.733	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	88.413	ENSPEMG00000022651	-	97	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	96.453	ENSPFOG00000001935	ago4	100	96.453	Poecilia_formosa
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	97.683	ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.683	Poecilia_latipinna
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	96.453	ENSPMEG00000005049	ago4	100	96.453	Poecilia_mexicana
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	96.453	ENSPREG00000010315	ago4	100	96.453	Poecilia_reticulata
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	99.649	ENSPPYG00000001552	AGO4	100	99.649	Pongo_abelii
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	99.298	ENSPCOG00000015935	AGO4	100	99.298	Propithecus_coquereli
ENSPCIG00000000092	AGO4	87	100.000	ENSPVAG00000005079	AGO4	88	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	96.339	ENSPNYG00000002089	ago4	100	96.339	Pundamilia_nyererei
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	97.219	ENSPNAG00000005191	ago4	100	97.219	Pygocentrus_nattereri
ENSPCIG00000000092	AGO4	69	98.157	ENSRNOG00000025596	Ago4	100	98.157	Rattus_norvegicus
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	98.472	ENSRBIG00000040185	AGO4	100	99.603	Rhinopithecus_bieti
ENSPCIG00000000092	AGO4	92	99.622	ENSRROG00000035783	AGO4	100	99.622	Rhinopithecus_roxellana
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	95.693	ENSSBOG00000026529	AGO4	100	99.472	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	99.187	ENSSHAG00000017320	AGO4	100	99.535	Sarcophilus_harrisii
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	96.453	ENSSFOG00015022028	ago4	100	96.522	Scleropages_formosus
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	93.966	ENSSMAG00000000808	ago4	93	95.730	Scophthalmus_maximus
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	95.470	ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.229	Seriola_dumerili
ENSPCIG00000000092	AGO4	92	97.859	ENSSLDG00000021841	ago4	100	97.859	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPCIG00000000092	AGO4	79	99.252	ENSSARG00000011504	AGO4	79	99.252	Sorex_araneus
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	99.535	ENSSPUG00000000889	AGO4	100	99.535	Sphenodon_punctatus
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	93.765	ENSTGUG00000001631	AGO4	99	93.023	Taeniopygia_guttata
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	96.110	ENSTRUG00000008052	ago4	100	96.110	Takifugu_rubripes
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	97.316	ENSTNIG00000006331	ago4	99	97.433	Tetraodon_nigroviridis
ENSPCIG00000000092	AGO4	77	100.000	ENSTBEG00000016478	AGO4	77	100.000	Tupaia_belangeri
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	95.785	ENSTTRG00000015086	AGO4	100	95.785	Tursiops_truncatus
ENSPCIG00000000092	AGO4	92	99.622	ENSUAMG00000027156	-	100	99.622	Ursus_americanus
ENSPCIG00000000092	AGO4	99	97.454	ENSUMAG00000006297	AGO4	98	97.454	Ursus_maritimus
ENSPCIG00000000092	AGO4	88	98.946	ENSVPAG00000006662	AGO4	100	98.946	Vicugna_pacos
ENSPCIG00000000092	AGO4	92	99.622	ENSVVUG00000000465	-	100	99.622	Vulpes_vulpes
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	85.731	ENSXETG00000009664	ago4	100	85.731	Xenopus_tropicalis
ENSPCIG00000000092	AGO4	100	96.453	ENSXMAG00000016657	ago4	100	96.453	Xiphophorus_maculatus