EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPCIG00000000172 (Gene tree)
Gene ID: 110206366
Gene Symbol: AGO1
Alias: -
Full Name: argonaute 1%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Phascolarctos_cinereus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 30509 bases
Position: chrFUWB01002581.1:96454-126962
Accession: 110206366
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPCIP00000000190	PAZ	PF02170.22	1.2e-28	1	1
ENSPCIP00000000190	Piwi	PF02171.17	1.6e-110	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPCIT00000000265	AGO1-201	2975	XM_020983687	ENSPCIP00000000190	857 (aa)	XP_020839346	UPI0000D91345

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPCIG00000000172	AGO1	99	82.538	ENSPCIG00000026513	AGO2	99	82.538
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	83.949	ENSPCIG00000000198	AGO3	100	83.949
ENSPCIG00000000172	AGO1	98	83.489	ENSPCIG00000000092	AGO4	99	83.489

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSG00000092847	AGO1	100	99.744	Homo_sapiens
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	95.921	ENSAPOG00000024299	ago1	100	95.921	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSAMEG00000000504	AGO1	100	99.650	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPCIG00000000172	AGO1	82	91.880	ENSACIG00000005298	ago1	98	91.880	Amphilophus_citrinellus
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	95.921	ENSAOCG00000017727	ago1	100	95.921	Amphiprion_ocellaris
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	95.921	ENSAPEG00000004458	ago1	100	95.921	Amphiprion_percula
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	95.921	ENSATEG00000008523	ago1	100	95.921	Anabas_testudineus
ENSPCIG00000000172	AGO1	99	93.677	ENSAPLG00000010440	AGO1	98	93.677	Anas_platyrhynchos
ENSPCIG00000000172	AGO1	91	99.872	ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	Anolis_carolinensis
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSANAG00000037711	AGO1	100	99.650	Aotus_nancymaae
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	95.688	ENSACLG00000000890	ago1	100	95.688	Astatotilapia_calliptera
ENSPCIG00000000172	AGO1	80	98.688	ENSAMXG00000001917	ago1	98	98.688	Astyanax_mexicanus
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.533	ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.533	Bos_taurus
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSCJAG00000032023	AGO1	100	99.650	Callithrix_jacchus
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSCAFG00000003443	AGO1	100	99.650	Canis_familiaris
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	97.900	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	Canis_lupus_dingo
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	98.724	ENSCHIG00000011848	-	100	98.724	Capra_hircus
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSTSYG00000009767	-	100	99.650	Carlito_syrichta
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	78.530	ENSTSYG00000032426	-	100	78.530	Carlito_syrichta
ENSPCIG00000000172	AGO1	89	93.776	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	92.902	Cavia_aperea
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSCPOG00000011568	AGO1	100	99.650	Cavia_porcellus
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSCCAG00000011823	AGO1	100	99.650	Cebus_capucinus
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	98.951	ENSCATG00000031521	AGO1	100	99.744	Cercocebus_atys
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSCLAG00000011507	AGO1	100	99.650	Chinchilla_lanigera
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSCSAG00000001091	AGO1	100	99.650	Chlorocebus_sabaeus
ENSPCIG00000000172	AGO1	85	94.574	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	Choloepus_hoffmanni
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.883	ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.883	Chrysemys_picta_bellii
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSCANG00000039798	AGO1	100	99.650	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSCGRG00001022708	Ago1	100	99.650	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPCIG00000000172	AGO1	99	99.647	ENSCGRG00000010386	Ago1	100	99.646	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPCIG00000000172	AGO1	99	94.548	ENSCSEG00000001051	ago1	99	94.548	Cynoglossus_semilaevis
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	95.688	ENSCVAG00000018173	ago1	100	95.688	Cyprinodon_variegatus
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	96.270	ENSDARG00000092644	ago1	100	96.270	Danio_rerio
ENSPCIG00000000172	AGO1	91	99.744	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	99.744	Dasypus_novemcinctus
ENSPCIG00000000172	AGO1	93	98.378	ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSPCIG00000000172	AGO1	84	92.788	ENSETEG00000007626	AGO1	100	92.788	Echinops_telfairi
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSEASG00005012086	AGO1	100	99.650	Equus_asinus_asinus
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSECAG00000024353	AGO1	100	99.650	Equus_caballus
ENSPCIG00000000172	AGO1	92	91.360	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.360	Erinaceus_europaeus
ENSPCIG00000000172	AGO1	91	96.803	ENSELUG00000016803	ago1	100	96.803	Esox_lucius
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSFCAG00000000746	AGO1	100	99.650	Felis_catus
ENSPCIG00000000172	AGO1	91	92.219	ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	Ficedula_albicollis
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.650	Fukomys_damarensis
ENSPCIG00000000172	AGO1	99	92.444	ENSFHEG00000017927	ago1	99	92.444	Fundulus_heteroclitus
ENSPCIG00000000172	AGO1	87	84.379	ENSGMOG00000019413	ago1	100	84.379	Gadus_morhua
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.767	ENSGALG00000002249	AGO1	100	99.767	Gallus_gallus
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	95.921	ENSGAFG00000009775	ago1	100	95.921	Gambusia_affinis
ENSPCIG00000000172	AGO1	87	96.937	ENSGACG00000012443	ago1	100	96.937	Gasterosteus_aculeatus
ENSPCIG00000000172	AGO1	91	99.872	ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	Gopherus_agassizii
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSGGOG00000003316	AGO1	100	99.650	Gorilla_gorilla
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	95.688	ENSHBUG00000010459	ago1	100	95.688	Haplochromis_burtoni
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSHGLG00000011540	AGO1	100	99.650	Heterocephalus_glaber_female
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSHGLG00100005568	AGO1	100	99.650	Heterocephalus_glaber_male
ENSPCIG00000000172	AGO1	99	96.340	ENSHCOG00000005708	ago1	99	96.340	Hippocampus_comes
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	96.154	ENSIPUG00000023216	ago1	100	96.154	Ictalurus_punctatus
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSSTOG00000010857	AGO1	100	99.650	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.767	ENSJJAG00000019449	Ago1	100	99.767	Jaculus_jaculus
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	95.921	ENSKMAG00000019464	ago1	100	95.921	Kryptolebias_marmoratus
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	95.921	ENSLBEG00000007694	ago1	100	95.921	Labrus_bergylta
ENSPCIG00000000172	AGO1	99	93.640	ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.640	Latimeria_chalumnae
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	93.823	ENSLOCG00000000504	AGO1	100	93.823	Lepisosteus_oculatus
ENSPCIG00000000172	AGO1	99	99.647	ENSLAFG00000010835	AGO1	99	99.647	Loxodonta_africana
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSMFAG00000002846	AGO1	100	99.650	Macaca_fascicularis
ENSPCIG00000000172	AGO1	99	94.620	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	95.018	Macaca_mulatta
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	95.683	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	99.744	Macaca_nemestrina
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSMLEG00000038388	AGO1	100	99.650	Mandrillus_leucophaeus
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	95.921	ENSMAMG00000008381	ago1	100	95.921	Mastacembelus_armatus
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	95.688	ENSMZEG00005007996	ago1	100	95.688	Maylandia_zebra
ENSPCIG00000000172	AGO1	99	94.179	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.179	Meleagris_gallopavo
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSMAUG00000015189	Ago1	100	99.650	Mesocricetus_auratus
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSMICG00000016147	AGO1	100	99.650	Microcebus_murinus
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.533	ENSMOCG00000000537	Ago1	100	99.533	Microtus_ochrogaster
ENSPCIG00000000172	AGO1	78	98.507	ENSMMOG00000018459	ago1	93	98.507	Mola_mola
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	100.000	ENSMODG00000023335	AGO1	100	100.000	Monodelphis_domestica
ENSPCIG00000000172	AGO1	99	96.222	ENSMALG00000011057	ago1	99	96.301	Monopterus_albus
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.650	Mus_caroli
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	99.650	Mus_musculus
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	99.650	Mus_pahari
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	99.650	Mus_spretus
ENSPCIG00000000172	AGO1	84	99.861	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	99.861	Mustela_putorius_furo
ENSPCIG00000000172	AGO1	61	99.042	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	99.042	Myotis_lucifugus
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSNGAG00000017448	Ago1	100	99.650	Nannospalax_galili
ENSPCIG00000000172	AGO1	91	96.803	ENSNBRG00000010867	ago1	100	96.803	Neolamprologus_brichardi
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.533	ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.533	Nomascus_leucogenys
ENSPCIG00000000172	AGO1	84	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSPCIG00000000172	AGO1	93	100.000	ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	Ochotona_princeps
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSODEG00000005321	AGO1	100	99.650	Octodon_degus
ENSPCIG00000000172	AGO1	99	96.104	ENSONIG00000016345	ago1	99	96.104	Oreochromis_niloticus
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	91.119	ENSOANG00000002080	AGO1	100	92.093	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.533	ENSOCUG00000023116	AGO1	100	99.533	Oryctolagus_cuniculus
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	95.921	ENSORLG00000014965	ago1	100	95.921	Oryzias_latipes
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	95.921	ENSORLG00020018253	ago1	100	95.921	Oryzias_latipes_hni
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	95.921	ENSORLG00015003287	ago1	100	95.921	Oryzias_latipes_hsok
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	95.921	ENSOMEG00000020528	ago1	100	95.921	Oryzias_melastigma
ENSPCIG00000000172	AGO1	99	99.647	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	99.647	Otolemur_garnettii
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.533	ENSOARG00000019591	AGO1	100	99.533	Ovis_aries
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSPPAG00000034838	AGO1	100	99.650	Pan_paniscus
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSPPRG00000006475	AGO1	100	99.650	Panthera_pardus
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.417	ENSPTIG00000020991	AGO1	100	99.417	Panthera_tigris_altaica
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSPTRG00000000528	AGO1	100	99.650	Pan_troglodytes
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSPANG00000009060	AGO1	100	99.650	Papio_anubis
ENSPCIG00000000172	AGO1	98	99.050	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	Pelodiscus_sinensis
ENSPCIG00000000172	AGO1	80	97.238	ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.238	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSPEMG00000023313	Ago1	100	99.650	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	95.921	ENSPFOG00000005867	ago1	100	95.921	Poecilia_formosa
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	95.921	ENSPLAG00000002824	ago1	99	97.974	Poecilia_latipinna
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	95.921	ENSPMEG00000001787	ago1	99	97.974	Poecilia_mexicana
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	95.921	ENSPREG00000006534	ago1	100	95.921	Poecilia_reticulata
ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	ENSPPYG00000001551	AGO1	100	99.650	Pongo_abelii
ENSPCIG00000000172	AGO1	58	100.000	ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	Procavia_capensis
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