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Description

Ensembl ID: ENSPCIG00000026080 (Gene tree)
Gene ID: 110216531
Gene Symbol: TNPO1
Alias: -
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Phascolarctos_cinereus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 106855 bases
Position: chrFUWB01000393.1:467931-574785
Accession: 110216531
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPCIP00000035274	IBN_N	PF03810.19	4.6e-16	1	1
ENSPCIP00000035271	IBN_N	PF03810.19	4.9e-16	1	1
ENSPCIP00000035277	IBN_N	PF03810.19	5.5e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPCIT00000043405	TNPO1-203	3172	-	ENSPCIP00000035277	915 (aa)	-	-
ENSPCIT00000043402	TNPO1-202	3057	-	ENSPCIP00000035274	865 (aa)	-	-
ENSPCIT00000043399	TNPO1-201	3132	-	ENSPCIP00000035271	890 (aa)	XP_020854025	UPI000A2827F5

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPCIG00000026080	TNPO1	99	84.633	ENSPCIG00000015327	TNPO2	95	86.931

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.315	ENSG00000083312	TNPO1	100	98.964	Homo_sapiens
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	94.831	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	94.831	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	97.439	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	97.439	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPCIG00000026080	TNPO1	89	94.186	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	94.186	Amphilophus_citrinellus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	94.944	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	94.944	Amphiprion_ocellaris
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	94.944	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	94.944	Amphiprion_percula
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	94.494	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	94.494	Anabas_testudineus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	99	93.461	ENSAPLG00000009619	-	99	93.461	Anas_platyrhynchos
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.090	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	98.090	Anolis_carolinensis
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	97.865	ENSANAG00000022453	-	99	97.865	Aotus_nancymaae
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	63.973	ENSANAG00000027118	-	99	63.861	Aotus_nancymaae
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	87.416	ENSANAG00000025351	-	99	87.416	Aotus_nancymaae
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	92.472	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	92.472	Astatotilapia_calliptera
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	93.161	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.825	Astyanax_mexicanus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.427	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	98.427	Bos_taurus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	97.978	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	97.978	Callithrix_jacchus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	96	98.250	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	98.250	Canis_familiaris
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	95.506	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	95.506	Canis_lupus_dingo
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.315	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	98.315	Capra_hircus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	99	94.463	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	96.959	Carlito_syrichta
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	97.865	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	97.865	Cebus_capucinus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.315	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	98.315	Cercocebus_atys
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	97.865	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	97.865	Chinchilla_lanigera
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.315	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	98.315	Chlorocebus_sabaeus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	96	85.542	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	85.697	Choloepus_hoffmanni
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.876	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	98.876	Chrysemys_picta_bellii
ENSPCIG00000026080	TNPO1	99	75.645	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.645	Ciona_savignyi
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.315	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	98.315	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	97.978	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	97.978	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPCIG00000026080	TNPO1	96	98.129	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	98.129	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	93.371	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	93.371	Cynoglossus_semilaevis
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	93.820	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.820	Cyprinodon_variegatus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	93.154	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.705	Danio_rerio
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	92.161	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	92.161	Dasypus_novemcinctus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	93	98.313	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	98.311	Dipodomys_ordii
ENSPCIG00000026080	TNPO1	99	58.126	FBgn0035693	CG8219	99	57.562	Drosophila_melanogaster
ENSPCIG00000026080	TNPO1	86	99.625	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	99.625	Echinops_telfairi
ENSPCIG00000026080	TNPO1	94	85.357	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.357	Eptatretus_burgeri
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.315	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	98.315	Equus_asinus_asinus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.090	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	98.090	Equus_caballus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	87.364	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.985	Esox_lucius
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.315	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	98.315	Felis_catus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.539	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	98.539	Ficedula_albicollis
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	97.978	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	97.978	Fukomys_damarensis
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	94.164	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	94.164	Fundulus_heteroclitus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	90.482	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	90.482	Gadus_morhua
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	97.640	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	97.640	Gallus_gallus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	93.049	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	93.049	Gambusia_affinis
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	93.820	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.820	Gasterosteus_aculeatus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.652	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	98.652	Gopherus_agassizii
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	81.951	ENSGGOG00000022535	-	98	81.951	Gorilla_gorilla
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.315	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	98.315	Gorilla_gorilla
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	94.157	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	94.157	Haplochromis_burtoni
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	97.865	ENSHGLG00000000970	-	99	97.865	Heterocephalus_glaber_female
ENSPCIG00000026080	TNPO1	96	97.897	ENSHGLG00100017090	-	99	97.897	Heterocephalus_glaber_male
ENSPCIG00000026080	TNPO1	97	76.744	ENSHGLG00100000963	-	99	76.163	Heterocephalus_glaber_male
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.202	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	98.202	Jaculus_jaculus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	94.157	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	94.157	Kryptolebias_marmoratus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	93	91.122	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	91.122	Labrus_bergylta
ENSPCIG00000026080	TNPO1	96	89.884	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.884	Latimeria_chalumnae
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	96.629	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	96.629	Lepisosteus_oculatus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	97	97.806	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	97.806	Loxodonta_africana
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.315	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	98.315	Macaca_fascicularis
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.202	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	98.202	Macaca_mulatta
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.315	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	98.315	Macaca_nemestrina
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.315	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	98.315	Mandrillus_leucophaeus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	94.494	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	94.494	Mastacembelus_armatus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	93.820	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.820	Maylandia_zebra
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	97.978	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	97.753	Mesocricetus_auratus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	94.270	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	94.270	Microcebus_murinus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	97.978	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	97.978	Microtus_ochrogaster
ENSPCIG00000026080	TNPO1	89	93.943	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	93.943	Mola_mola
ENSPCIG00000026080	TNPO1	99	98.511	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	98.511	Monodelphis_domestica
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	93.371	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	93.371	Monopterus_albus
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ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	97.978	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	98.017	Mus_musculus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.090	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	98.141	Mus_pahari
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	97.753	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	97.770	Mus_spretus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.202	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	98.202	Mustela_putorius_furo
ENSPCIG00000026080	TNPO1	96	97.788	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	97.788	Myotis_lucifugus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.090	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	98.090	Nannospalax_galili
ENSPCIG00000026080	TNPO1	89	94.057	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	94.057	Neolamprologus_brichardi
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.315	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	98.315	Nomascus_leucogenys
ENSPCIG00000026080	TNPO1	90	92.013	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	92.013	Ochotona_princeps
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	97.640	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	97.640	Octodon_degus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	93.415	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	93.415	Oreochromis_niloticus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	93	98.385	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	99.146	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	96	91.939	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	91.939	Oryctolagus_cuniculus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	89	94.034	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	94.034	Oryzias_latipes
ENSPCIG00000026080	TNPO1	99	93.912	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.912	Oryzias_latipes_hni
ENSPCIG00000026080	TNPO1	99	94.138	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	94.138	Oryzias_latipes_hsok
ENSPCIG00000026080	TNPO1	99	94.025	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	94.025	Oryzias_melastigma
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.315	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	98.315	Otolemur_garnettii
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.427	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	98.427	Ovis_aries
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.315	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	98.315	Pan_paniscus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.315	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	98.315	Panthera_pardus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.315	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	98.315	Panthera_tigris_altaica
ENSPCIG00000026080	TNPO1	94	85.773	ENSPTRG00000047731	-	100	85.773	Pan_troglodytes
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.315	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	98.315	Pan_troglodytes
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.315	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	98.315	Papio_anubis
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	91.124	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	91.124	Paramormyrops_kingsleyae
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ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	90.797	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.909	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPCIG00000026080	TNPO1	96	98.129	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	98.129	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	93.841	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	93.841	Poecilia_formosa
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ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	94.045	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	94.045	Poecilia_mexicana
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