EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPCIG00000028094 (Gene tree)
Gene ID: 110207735
Gene Symbol: PAPOLG
Alias: -
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Phascolarctos_cinereus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 46468 bases
Position: chrFUWB01001462.1:995543-1042010
Accession: 110207735
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPCIP00000038167	PAP_RNA-bind	PF04926.15	3.5e-27	1	2
ENSPCIP00000038167	PAP_RNA-bind	PF04926.15	3.5e-27	2	2
ENSPCIP00000038163	PAP_RNA-bind	PF04926.15	3.6e-27	1	2
ENSPCIP00000038163	PAP_RNA-bind	PF04926.15	3.6e-27	2	2
ENSPCIP00000038164	PAP_RNA-bind	PF04926.15	3.7e-27	1	2
ENSPCIP00000038164	PAP_RNA-bind	PF04926.15	3.7e-27	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPCIT00000046980	PAPOLG-203	2520	-	ENSPCIP00000038167	730 (aa)	-	-
ENSPCIT00000046976	PAPOLG-201	5056	-	ENSPCIP00000038163	748 (aa)	XP_020841168	UPI000A281F29
ENSPCIT00000046977	PAPOLG-202	4970	-	ENSPCIP00000038164	752 (aa)	XP_020841166	UPI000A286CAB

Gene Model

Click here to download ENSPCIG00000028094's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPCIG00000028094's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	98	58.964	ENSPCIG00000013234	PAPOLA	98	59.680

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	86.916	ENSG00000115421	PAPOLG	100	97.436	Homo_sapiens
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	71.788	ENSAPOG00000004798	papolg	98	69.680	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	99	87.802	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	100	87.802	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	67.325	ENSACIG00000010546	papolg	96	71.635	Amphilophus_citrinellus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	71.391	ENSAOCG00000010254	papolg	89	71.673	Amphiprion_ocellaris
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	71.523	ENSAPEG00000006944	papolg	89	71.805	Amphiprion_percula
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	71.751	ENSATEG00000009007	papolg	99	71.900	Anabas_testudineus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	99	75.233	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	75.233	Anas_platyrhynchos
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	81	63.725	ENSACAG00000015048	-	100	63.725	Anolis_carolinensis
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.049	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	87.049	Aotus_nancymaae
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	69.701	ENSACLG00000015592	papolg	89	70.741	Astatotilapia_calliptera
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	73.012	ENSAMXG00000004611	papolg	100	73.012	Astyanax_mexicanus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.717	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	87.717	Bos_taurus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.183	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	87.183	Callithrix_jacchus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.717	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	78.897	Canis_familiaris
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.152	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	87.152	Canis_lupus_dingo
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.450	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	87.450	Capra_hircus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.583	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	87.583	Carlito_syrichta
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	52	89.764	ENSCAPG00000014901	-	100	89.764	Cavia_aperea
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.316	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	87.316	Cavia_porcellus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.316	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	87.316	Cebus_capucinus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	91	93.939	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	93.939	Cercocebus_atys
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	88.251	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	88.251	Chinchilla_lanigera
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.183	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	87.183	Chlorocebus_sabaeus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	89	85.157	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	85.157	Choloepus_hoffmanni
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	68	63.928	ENSCING00000024664	-	93	63.928	Ciona_intestinalis
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	66	64.742	ENSCSAVG00000009085	-	97	64.742	Ciona_savignyi
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.183	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	87.183	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	99	86.775	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	86.775	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	99	86.775	ENSCGRG00000005552	-	100	86.775	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	69.282	ENSCSEG00000000771	papolg	99	69.826	Cynoglossus_semilaevis
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	68.346	ENSCVAG00000016602	papolg	88	85.455	Cyprinodon_variegatus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	73.107	ENSDARG00000012141	papolg	100	73.107	Danio_rerio
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	85.581	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	85.581	Dasypus_novemcinctus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	59	95.804	ENSDORG00000016228	Papolg	100	95.804	Dipodomys_ordii
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	67.957	ENSETEG00000011815	PAPOLG	100	68.176	Echinops_telfairi
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	59	69.895	ENSEBUG00000004020	papolg	88	69.895	Eptatretus_burgeri
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	63	58.315	ENSEBUG00000005042	-	79	58.315	Eptatretus_burgeri
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.850	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	87.850	Equus_asinus_asinus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.850	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	87.399	Equus_caballus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	76.903	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	76.903	Erinaceus_europaeus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	72.458	ENSELUG00000014497	papolg	99	65.591	Esox_lucius
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.717	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	87.717	Felis_catus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	99	67.290	ENSFALG00000011079	PAPOLG	96	67.290	Ficedula_albicollis
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.583	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	87.583	Fukomys_damarensis
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	67	63.056	ENSFHEG00000019080	papolg	90	63.514	Fundulus_heteroclitus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	86	83.364	ENSGMOG00000018772	papolg	93	83.364	Gadus_morhua
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	71.561	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	71.561	Gallus_gallus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	69.079	ENSGAFG00000003263	papolg	99	69.060	Gambusia_affinis
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	71.126	ENSGACG00000002718	papolg	100	71.598	Gasterosteus_aculeatus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.316	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	87.316	Gorilla_gorilla
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	69.571	ENSHBUG00000004882	papolg	99	70.434	Haplochromis_burtoni
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	99	87.936	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	100	87.936	Heterocephalus_glaber_female
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	88.385	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	88.385	Heterocephalus_glaber_male
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	69.721	ENSHCOG00000006782	papolg	89	69.881	Hippocampus_comes
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	71.891	ENSIPUG00000021642	papolg	100	72.585	Ictalurus_punctatus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.583	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	87.583	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	59	95.571	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	95.571	Jaculus_jaculus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	69.594	ENSKMAG00000016439	papolg	97	67.111	Kryptolebias_marmoratus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	68.274	ENSLBEG00000023218	papolg	99	69.093	Labrus_bergylta
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	99	70.878	ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	70.878	Latimeria_chalumnae
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	73.541	ENSLOCG00000016130	papolg	100	73.541	Lepisosteus_oculatus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	86.684	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	94.872	Loxodonta_africana
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.316	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	87.316	Macaca_fascicularis
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.316	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	87.316	Macaca_mulatta
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	79.045	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	79.045	Macaca_nemestrina
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.316	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	87.316	Mandrillus_leucophaeus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	71.788	ENSMAMG00000010667	papolg	99	69.559	Mastacembelus_armatus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	69.701	ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.421	Maylandia_zebra
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	72.510	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	100	72.510	Meleagris_gallopavo
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	99	87.179	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	87.179	Mesocricetus_auratus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	88.251	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	88.251	Microcebus_murinus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.183	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	87.183	Microtus_ochrogaster
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	70.013	ENSMMOG00000008020	papolg	99	70.302	Mola_mola
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	99	97.718	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	97.718	Monodelphis_domestica
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	71.146	ENSMALG00000007012	papolg	89	71.146	Monopterus_albus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.583	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	96.028	Mus_caroli
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.600	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	96.028	Mus_musculus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	86.916	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	87.045	Mus_pahari
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.467	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	96.028	Mus_spretus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	88.117	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	88.133	Mustela_putorius_furo
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	99	86.595	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	100	86.595	Myotis_lucifugus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	86.649	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	86.649	Nannospalax_galili
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	62.797	ENSNBRG00000011943	papolg	99	63.852	Neolamprologus_brichardi
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	59	96.737	ENSNLEG00000009507	-	100	96.737	Nomascus_leucogenys
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	84	84.138	ENSMEUG00000013605	-	88	84.138	Notamacropus_eugenii
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.183	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	87.183	Ochotona_princeps
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	57	93.510	ENSODEG00000012424	PAPOLG	98	93.510	Octodon_degus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	64.861	ENSONIG00000002985	papolg	100	65.390	Oreochromis_niloticus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	99	91.544	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	91.544	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.717	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	87.717	Oryctolagus_cuniculus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	69.100	ENSORLG00000001577	papolg	99	69.725	Oryzias_latipes
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	69.150	ENSORLG00020002482	papolg	89	69.412	Oryzias_latipes_hni
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	68.840	ENSORLG00015008836	papolg	99	69.463	Oryzias_latipes_hsok
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	70.132	ENSOMEG00000001406	papolg	89	70.410	Oryzias_melastigma
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	59	79.680	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	79.680	Otolemur_garnettii
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.583	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	87.617	Ovis_aries
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	86.916	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	86.916	Pan_paniscus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.717	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	87.717	Panthera_pardus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.583	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	87.583	Panthera_tigris_altaica
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	86.916	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	86.916	Pan_troglodytes
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	83.356	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	83.356	Papio_anubis
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	96	70.270	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	70.270	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	72.487	ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.487	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	99	80.295	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	80.295	Pelodiscus_sinensis
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	99	86.640	ENSPEMG00000008960	-	100	86.640	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	67	63.395	ENSPMAG00000004864	-	96	63.395	Petromyzon_marinus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	99	52.399	ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.796	Petromyzon_marinus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	98	68.435	ENSPFOG00000012909	papolg	98	69.231	Poecilia_formosa
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	68.016	ENSPLAG00000018445	papolg	89	68.799	Poecilia_latipinna
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	68.938	ENSPMEG00000003961	papolg	89	68.709	Poecilia_mexicana
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	92	83.119	ENSPREG00000010358	papolg	99	68.889	Poecilia_reticulata
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.316	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	87.316	Pongo_abelii
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	99	76.851	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	76.851	Procavia_capensis
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	78.505	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	96	82.963	Propithecus_coquereli
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	88	90.957	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	90.957	Pteropus_vampyrus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	69.701	ENSPNYG00000006729	papolg	99	68.975	Pundamilia_nyererei
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	72.955	ENSPNAG00000015521	papolg	100	72.955	Pygocentrus_nattereri
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	86.800	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	86.800	Rattus_norvegicus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	81.175	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	81.175	Rhinopithecus_bieti
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	86.916	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	86.916	Rhinopithecus_roxellana
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.450	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	87.450	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	94	98.166	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	100	98.166	Sarcophilus_harrisii
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	62.384	ENSSFOG00015011874	papolg	100	62.384	Scleropages_formosus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	69.856	ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.856	Scleropages_formosus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	78	80.522	ENSSMAG00000015598	papolg	95	67.665	Scophthalmus_maximus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	71.126	ENSSDUG00000000912	papolg	99	71.146	Seriola_dumerili
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	70.596	ENSSLDG00000001217	papolg	99	70.619	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	78.989	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	78.989	Sphenodon_punctatus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	69.987	ENSSPAG00000009004	papolg	99	68.491	Stegastes_partitus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.984	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	87.984	Sus_scrofa
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	74	77.551	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	99	77.551	Taeniopygia_guttata
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	70.360	ENSTRUG00000006410	papolg	99	70.360	Takifugu_rubripes
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	65.450	ENSTNIG00000017106	papolg	100	65.450	Tetraodon_nigroviridis
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	99	79.408	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	79.408	Tupaia_belangeri
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	83.712	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	83.712	Tursiops_truncatus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	99	88.259	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	88.259	Ursus_americanus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	99	88.275	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	91	88.275	Ursus_maritimus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	99	83.715	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	83.715	Vicugna_pacos
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.850	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	87.850	Vulpes_vulpes
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	75.926	ENSXETG00000002208	papolg	100	75.926	Xenopus_tropicalis
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	68	85.223	ENSXCOG00000006611	papolg	73	85.223	Xiphophorus_couchianus
ENSPCIG00000028094	PAPOLG	72	82.626	ENSXMAG00000007383	papolg	94	82.626	Xiphophorus_maculatus