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Description

Ensembl ID: ENSPCOG00000004254 (Gene tree)
Gene ID: 105826602
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Propithecus_coquereli
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 85558 bases
Position: chrKQ029282.1:9348448-9434005
Accession: 105826602
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPCOP00000001490	IBN_N	PF03810.19	6e-16	1	1
ENSPCOP00000001467	IBN_N	PF03810.19	6.6e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPCOT00000005313	TNPO1-203	2547	-	ENSPCOP00000001475	848 (aa)	-	A0A2K6EIB6
ENSPCOT00000005382	TNPO1-204	2613	-	ENSPCOP00000001490	870 (aa)	-	A0A2K6EID0
ENSPCOT00000005255	TNPO1-201	4820	XM_012664586	ENSPCOP00000001467	898 (aa)	XP_012520040	A0A2K6EIB8
ENSPCOT00000005296	TNPO1-202	4807	-	ENSPCOP00000001471	219 (aa)	-	A0A2K6EIB1

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	85.344	ENSPCOG00000018386	TNPO2	99	85.344

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.889	ENSG00000083312	TNPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	93.820	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.820	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	98.891	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.891	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPCOG00000004254	TNPO1	86	92.894	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.894	Amphilophus_citrinellus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	93.933	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	93.933	Amphiprion_ocellaris
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	93.933	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	Amphiprion_percula
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	93.483	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.483	Anabas_testudineus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	98	92.559	ENSAPLG00000009619	-	97	93.563	Anas_platyrhynchos
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	96.742	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.742	Anolis_carolinensis
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	64.420	ENSANAG00000027118	-	99	64.199	Aotus_nancymaae
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	88.419	ENSANAG00000025351	-	100	88.419	Aotus_nancymaae
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.443	ENSANAG00000022453	-	100	99.443	Aotus_nancymaae
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	91.573	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.573	Astatotilapia_calliptera
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	92.713	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.377	Astyanax_mexicanus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.666	ENSBTAG00000007979	TNPO1	100	99.666	Bos_taurus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.555	ENSCJAG00000016409	TNPO1	100	99.555	Callithrix_jacchus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	95	99.650	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.650	Canis_familiaris
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	98.855	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	98.855	Canis_lupus_dingo
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.555	ENSCHIG00000023462	TNPO1	100	99.555	Capra_hircus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	95.819	ENSTSYG00000001871	TNPO1	100	95.073	Carlito_syrichta
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.443	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.443	Cebus_capucinus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.889	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	99.889	Cercocebus_atys
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.443	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.443	Chinchilla_lanigera
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.777	ENSCSAG00000015616	TNPO1	100	99.777	Chlorocebus_sabaeus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	94	87.013	ENSCHOG00000001746	TNPO1	100	87.013	Choloepus_hoffmanni
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	97.755	ENSCPBG00000000260	TNPO1	100	93.563	Chrysemys_picta_bellii
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	75.421	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.421	Ciona_savignyi
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.889	ENSCANG00000004353	TNPO1	100	99.889	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.555	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	100	99.555	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPCOG00000004254	TNPO1	95	99.532	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	99.532	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	92.247	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	Cynoglossus_semilaevis
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	93.371	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.371	Cyprinodon_variegatus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	92.593	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.256	Danio_rerio
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	93.527	ENSDNOG00000006647	TNPO1	100	93.527	Dasypus_novemcinctus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	92	99.639	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.638	Dipodomys_ordii
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	57.788	FBgn0035693	CG8219	99	57.336	Drosophila_melanogaster
ENSPCOG00000004254	TNPO1	86	99.625	ENSETEG00000017805	TNPO1	90	99.625	Echinops_telfairi
ENSPCOG00000004254	TNPO1	94	85.119	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	Eptatretus_burgeri
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.889	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	99.889	Equus_asinus_asinus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.666	ENSECAG00000024424	TNPO1	100	99.666	Equus_caballus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	86.601	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.166	Esox_lucius
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.889	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	99.889	Felis_catus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	97.416	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.416	Ficedula_albicollis
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.555	ENSFDAG00000013345	TNPO1	100	99.555	Fukomys_damarensis
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	93.715	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.715	Fundulus_heteroclitus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	89.855	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	89.855	Gadus_morhua
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	96.214	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.629	Gallus_gallus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	92.377	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.377	Gambusia_affinis
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	92.953	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.953	Gasterosteus_aculeatus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	97.528	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.528	Gopherus_agassizii
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.889	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	99.889	Gorilla_gorilla
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	83.240	ENSGGOG00000022535	-	99	83.240	Gorilla_gorilla
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	93.146	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.146	Haplochromis_burtoni
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.220	ENSHGLG00000000970	-	100	99.220	Heterocephalus_glaber_female
ENSPCOG00000004254	TNPO1	95	99.065	ENSHGLG00100017090	-	99	99.065	Heterocephalus_glaber_male
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	75.501	ENSHGLG00100000963	-	100	74.944	Heterocephalus_glaber_male
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	99.776	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.776	Jaculus_jaculus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	93.596	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.596	Kryptolebias_marmoratus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	90	90.136	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	Labrus_bergylta
ENSPCOG00000004254	TNPO1	95	89.186	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.186	Latimeria_chalumnae
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	95.302	ENSLOCG00000011092	tnpo1	98	95.302	Lepisosteus_oculatus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	96	99.076	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	99.076	Loxodonta_africana
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.889	ENSMFAG00000003636	TNPO1	100	99.889	Macaca_fascicularis
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.777	ENSMMUG00000020923	TNPO1	100	99.777	Macaca_mulatta
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.889	ENSMNEG00000044581	TNPO1	100	99.889	Macaca_nemestrina
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.889	ENSMLEG00000030740	TNPO1	100	99.889	Mandrillus_leucophaeus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	93.483	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.483	Mastacembelus_armatus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	92.921	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.921	Maylandia_zebra
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	99.442	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	95.969	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.969	Microcebus_murinus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	99.441	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.441	Microtus_ochrogaster
ENSPCOG00000004254	TNPO1	86	92.526	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	Mola_mola
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	97.872	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	Monodelphis_domestica
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	92.360	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.360	Monopterus_albus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.332	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	100.000	Mus_caroli
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.555	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	100.000	Mus_musculus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.443	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	Mus_pahari
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.332	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	100.000	Mus_spretus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.777	ENSMPUG00000014387	TNPO1	100	99.777	Mustela_putorius_furo
ENSPCOG00000004254	TNPO1	95	99.185	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.185	Myotis_lucifugus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.555	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	100	99.555	Nannospalax_galili
ENSPCOG00000004254	TNPO1	86	92.765	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.765	Neolamprologus_brichardi
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.889	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	99.889	Nomascus_leucogenys
ENSPCOG00000004254	TNPO1	91	93.272	ENSOPRG00000012390	TNPO1	91	93.272	Ochotona_princeps
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.220	ENSODEG00000001771	TNPO1	100	99.220	Octodon_degus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	92.222	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.222	Oreochromis_niloticus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	91	97.927	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.927	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	95	93.224	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.224	Oryctolagus_cuniculus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	86	92.737	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.737	Oryzias_latipes
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	93.010	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.010	Oryzias_latipes_hni
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	93.123	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	Oryzias_latipes_hsok
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	93.010	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.010	Oryzias_melastigma
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.777	ENSOGAG00000000808	TNPO1	100	99.777	Otolemur_garnettii
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.666	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.666	Ovis_aries
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.889	ENSPPAG00000042518	TNPO1	100	99.889	Pan_paniscus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.889	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	99.889	Panthera_pardus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.889	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	99.889	Panthera_tigris_altaica
ENSPCOG00000004254	TNPO1	93	87.017	ENSPTRG00000047731	-	100	87.017	Pan_troglodytes
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.889	ENSPTRG00000016972	TNPO1	100	99.889	Pan_troglodytes
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	99.889	ENSPANG00000006074	TNPO1	100	99.889	Papio_anubis
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	90.562	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPCOG00000004254	TNPO1	100	96.993	ENSPSIG00000014366	TNPO1	100	96.993	Pelodiscus_sinensis
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	90.460	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	95	99.532	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.532	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	98.315	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.315	Phascolarctos_cinereus
ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	93.281	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	93.281	Poecilia_formosa
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