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Description

Ensembl ID: ENSPCOG00000017341 (Gene tree)
Gene ID: 105815071
Gene Symbol: MSI1
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Propithecus_coquereli
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 19718 bases
Position: chrKQ022781.1:2348997-2368714
Accession: 105815071
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPCOP00000011648	RRM_1	PF00076.22	5.3e-34	1	2
ENSPCOP00000011648	RRM_1	PF00076.22	5.3e-34	2	2
ENSPCOP00000011647	RRM_1	PF00076.22	5.8e-34	1	2
ENSPCOP00000011647	RRM_1	PF00076.22	5.8e-34	2	2
ENSPCOP00000011646	RRM_1	PF00076.22	6.1e-34	1	2
ENSPCOP00000011646	RRM_1	PF00076.22	6.1e-34	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPCOT00000022237	MSI1-203	1038	-	ENSPCOP00000011648	345 (aa)	-	A0A2K6FCF0
ENSPCOT00000022236	MSI1-202	1074	XM_012650205	ENSPCOP00000011647	357 (aa)	XP_012505659	A0A2K6FCD8
ENSPCOT00000022235	MSI1-201	1089	XM_012650204	ENSPCOP00000011646	362 (aa)	XP_012505658	A0A2K6FCD5

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPCOG00000017341	MSI1	60	33.803	ENSPCOG00000013271	TIA1	76	33.803
ENSPCOG00000017341	MSI1	55	42.188	ENSPCOG00000028658	-	74	39.655
ENSPCOG00000017341	MSI1	50	42.197	ENSPCOG00000021193	-	72	39.381
ENSPCOG00000017341	MSI1	79	36.842	ENSPCOG00000026201	RBM38	77	36.842
ENSPCOG00000017341	MSI1	73	35.766	ENSPCOG00000028522	DAZAP1	61	41.772
ENSPCOG00000017341	MSI1	52	33.516	ENSPCOG00000020527	-	88	33.333
ENSPCOG00000017341	MSI1	52	46.111	ENSPCOG00000015793	-	76	39.216
ENSPCOG00000017341	MSI1	52	35.359	ENSPCOG00000017921	-	69	32.365
ENSPCOG00000017341	MSI1	50	42.775	ENSPCOG00000027833	-	82	40.244
ENSPCOG00000017341	MSI1	54	43.590	ENSPCOG00000021331	HNRNPD	72	40.161
ENSPCOG00000017341	MSI1	57	37.179	ENSPCOG00000019183	TRA2B	69	37.179
ENSPCOG00000017341	MSI1	52	40.659	ENSPCOG00000019318	-	68	40.909
ENSPCOG00000017341	MSI1	50	49.133	ENSPCOG00000019831	-	58	39.676
ENSPCOG00000017341	MSI1	55	37.563	ENSPCOG00000014446	-	83	37.563
ENSPCOG00000017341	MSI1	52	42.308	ENSPCOG00000015986	-	76	41.584
ENSPCOG00000017341	MSI1	53	84.615	ENSPCOG00000019195	-	93	84.615

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	100.000	ENSG00000135097	MSI1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	84.254	ENSAPOG00000023458	-	100	84.254	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	83.791	ENSAPOG00000003191	MSI1	100	83.791	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPCOG00000017341	MSI1	98	82.181	ENSAMEG00000013302	MSI1	100	82.181	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPCOG00000017341	MSI1	94	83.642	ENSACIG00000017754	-	78	83.642	Amphilophus_citrinellus
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	83.791	ENSAOCG00000003804	MSI1	100	83.791	Amphiprion_ocellaris
ENSPCOG00000017341	MSI1	98	81.846	ENSAOCG00000009031	-	95	81.846	Amphiprion_ocellaris
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	84.254	ENSAPEG00000006857	-	84	84.254	Amphiprion_percula
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	83.791	ENSAPEG00000003245	MSI1	100	83.791	Amphiprion_percula
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	80.435	ENSATEG00000017059	MSI1	100	80.435	Anabas_testudineus
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	78.962	ENSATEG00000023779	-	100	78.962	Anabas_testudineus
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	96.419	ENSACAG00000002762	MSI1	100	96.419	Anolis_carolinensis
ENSPCOG00000017341	MSI1	82	96.309	ENSANAG00000027901	-	92	96.309	Aotus_nancymaae
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	100.000	ENSANAG00000027151	MSI1	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	83.242	ENSACLG00000011230	MSI1	100	83.242	Astatotilapia_calliptera
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	83.978	ENSACLG00000000117	-	100	85.337	Astatotilapia_calliptera
ENSPCOG00000017341	MSI1	98	81.040	ENSAMXG00000038960	msi1	76	83.735	Astyanax_mexicanus
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	100.000	ENSBTAG00000009800	MSI1	100	100.000	Bos_taurus
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	100.000	ENSCJAG00000008578	MSI1	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	99.724	ENSCAFG00000010283	MSI1	100	99.724	Canis_familiaris
ENSPCOG00000017341	MSI1	94	100.000	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	94.580	ENSCHIG00000024304	MSI1	100	94.580	Capra_hircus
ENSPCOG00000017341	MSI1	94	100.000	ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	Carlito_syrichta
ENSPCOG00000017341	MSI1	94	93.407	ENSCAPG00000003919	MSI1	89	89.776	Cavia_aperea
ENSPCOG00000017341	MSI1	98	100.000	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	100.000	ENSCCAG00000035567	MSI1	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	100.000	ENSCATG00000030019	MSI1	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSPCOG00000017341	MSI1	98	100.000	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSPCOG00000017341	MSI1	78	100.000	ENSCSAG00000002265	MSI1	93	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	95.856	ENSCPBG00000011349	MSI1	100	95.856	Chrysemys_picta_bellii
ENSPCOG00000017341	MSI1	98	100.000	ENSCANG00000040651	MSI1	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	100.000	ENSCGRG00001018883	Msi1	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPCOG00000017341	MSI1	94	100.000	ENSCGRG00000002191	Msi1	72	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPCOG00000017341	MSI1	98	79.167	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	79.167	Cynoglossus_semilaevis
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	83.516	ENSCSEG00000005834	-	100	83.516	Cynoglossus_semilaevis
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	83.149	ENSCSEG00000008352	-	100	83.149	Cynoglossus_semilaevis
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	84.254	ENSCVAG00000009100	MSI1	100	84.254	Cyprinodon_variegatus
ENSPCOG00000017341	MSI1	51	61.194	ENSCVAG00000017430	zgc:110796	94	61.194	Cyprinodon_variegatus
ENSPCOG00000017341	MSI1	64	68.398	ENSCVAG00000017463	-	89	68.398	Cyprinodon_variegatus
ENSPCOG00000017341	MSI1	80	82.096	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	89	82.096	Danio_rerio
ENSPCOG00000017341	MSI1	98	82.353	ENSDARG00000010710	msi1	100	85.022	Danio_rerio
ENSPCOG00000017341	MSI1	98	89.970	ENSDNOG00000005713	MSI1	91	89.970	Dasypus_novemcinctus
ENSPCOG00000017341	MSI1	98	99.102	ENSDORG00000005610	Msi1	99	95.480	Dipodomys_ordii
ENSPCOG00000017341	MSI1	98	95.732	ENSETEG00000004756	MSI1	100	95.732	Echinops_telfairi
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	100.000	ENSEASG00005004736	MSI1	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	100.000	ENSECAG00000017526	MSI1	100	100.000	Equus_caballus
ENSPCOG00000017341	MSI1	94	81.657	ENSELUG00000023280	-	100	81.361	Esox_lucius
ENSPCOG00000017341	MSI1	98	78.729	ENSELUG00000023219	MSI1	92	80.387	Esox_lucius
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	100.000	ENSFCAG00000011007	MSI1	100	100.000	Felis_catus
ENSPCOG00000017341	MSI1	98	95.820	ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	Ficedula_albicollis
ENSPCOG00000017341	MSI1	98	99.695	ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	Fukomys_damarensis
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	84.530	ENSFHEG00000022446	MSI1	100	84.530	Fundulus_heteroclitus
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	83.791	ENSFHEG00000003560	-	100	83.791	Fundulus_heteroclitus
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	76.584	ENSGMOG00000017838	-	100	76.584	Gadus_morhua
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	82.597	ENSGMOG00000001006	MSI1	99	82.370	Gadus_morhua
ENSPCOG00000017341	MSI1	94	95.238	ENSGALG00000007227	MSI1	98	86.957	Gallus_gallus
ENSPCOG00000017341	MSI1	98	85.380	ENSGAFG00000021522	MSI1	94	85.380	Gambusia_affinis
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	65.833	ENSGAFG00000005860	-	100	65.833	Gambusia_affinis
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	83.425	ENSGACG00000012679	MSI1	100	83.425	Gasterosteus_aculeatus
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	80.663	ENSGACG00000008674	-	100	80.663	Gasterosteus_aculeatus
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	95.580	ENSGAGG00000016037	MSI1	100	95.580	Gopherus_agassizii
ENSPCOG00000017341	MSI1	94	100.000	ENSGGOG00000010328	MSI1	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	83.242	ENSHBUG00000021921	MSI1	100	83.242	Haplochromis_burtoni
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	83.978	ENSHBUG00000011841	-	100	83.978	Haplochromis_burtoni
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	99.724	ENSHGLG00000012782	MSI1	100	99.724	Heterocephalus_glaber_female
ENSPCOG00000017341	MSI1	98	99.695	ENSHGLG00100016848	MSI1	100	99.695	Heterocephalus_glaber_male
ENSPCOG00000017341	MSI1	98	81.845	ENSHCOG00000012019	MSI1	100	81.845	Hippocampus_comes
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	78.689	ENSHCOG00000012067	-	100	78.689	Hippocampus_comes
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	82.320	ENSIPUG00000001976	msi1	100	82.320	Ictalurus_punctatus
ENSPCOG00000017341	MSI1	94	100.000	ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	100.000	ENSJJAG00000010463	Msi1	100	100.000	Jaculus_jaculus
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	86.377	ENSJJAG00000010643	-	100	86.377	Jaculus_jaculus
ENSPCOG00000017341	MSI1	98	84.524	ENSKMAG00000019877	-	100	84.524	Kryptolebias_marmoratus
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	83.702	ENSKMAG00000011251	MSI1	100	83.702	Kryptolebias_marmoratus
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	83.242	ENSLBEG00000001375	-	100	83.242	Labrus_bergylta
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	84.254	ENSLBEG00000008789	MSI1	100	84.254	Labrus_bergylta
ENSPCOG00000017341	MSI1	98	87.427	ENSLACG00000018287	MSI1	100	87.427	Latimeria_chalumnae
ENSPCOG00000017341	MSI1	52	70.000	ENSLOCG00000008618	zgc:110796	71	70.000	Lepisosteus_oculatus
ENSPCOG00000017341	MSI1	91	89.426	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	89.426	Loxodonta_africana
ENSPCOG00000017341	MSI1	98	100.000	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSPCOG00000017341	MSI1	97	98.291	ENSMMUG00000031527	MSI1	97	98.291	Macaca_mulatta
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	100.000	ENSMNEG00000040034	MSI1	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSPCOG00000017341	MSI1	98	100.000	ENSMLEG00000003921	MSI1	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	83.425	ENSMAMG00000002279	MSI1	100	83.425	Mastacembelus_armatus
ENSPCOG00000017341	MSI1	96	85.960	ENSMAMG00000018426	-	100	83.791	Mastacembelus_armatus
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	83.242	ENSMZEG00005026892	MSI1	100	83.242	Maylandia_zebra
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	83.978	ENSMZEG00005000340	-	100	83.978	Maylandia_zebra
ENSPCOG00000017341	MSI1	68	98.817	ENSMGAG00000016518	-	100	98.817	Meleagris_gallopavo
ENSPCOG00000017341	MSI1	74	100.000	ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	100.000	ENSMICG00000033181	MSI1	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSPCOG00000017341	MSI1	100	99.724	ENSMOCG00000002286	Msi1	100	99.724	Microtus_ochrogaster
ENSPCOG00000017341	MSI1	98	82.515	ENSMMOG00000012265	-	97	82.515	Mola_mola
ENSPCOG00000017341	MSI1	98	80.308	ENSMMOG00000010492	MSI1	94	80.308	Mola_mola
ENSPCOG00000017341	MSI1	91	67.868	ENSMODG00000003189	-	100	67.868	Monodelphis_domestica
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