EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPCOG00000017601 (Gene tree)
Gene ID: 105822432
Gene Symbol: TWISTNB
Alias: -
Full Name: TWIST neighbor
Gene Type: protein_coding
Species: Propithecus_coquereli
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10305 bases
Position: chrKQ026069.1:4611513-4621817
Accession: 105822432
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPCOP00000012118	SHS2_Rpb7-N	PF03876.17	9.4e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPCOT00000022710	TWISTNB-201	1014	XM_012659414	ENSPCOP00000012118	337 (aa)	XP_012514868	A0A2K6FDT6

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	100	87.135	ENSG00000105849	TWISTNB	100	83.626	Homo_sapiens
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	98	71.354	ENSAMEG00000008558	TWISTNB	97	69.010	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	63	52.489	ENSAOCG00000024200	twistnb	50	56.250	Amphiprion_ocellaris
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	63	52.489	ENSAPEG00000016750	twistnb	50	56.250	Amphiprion_percula
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	50	65.089	ENSACAG00000011817	TWISTNB	86	65.089	Anolis_carolinensis
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	97	87.195	ENSANAG00000026418	TWISTNB	97	85.061	Aotus_nancymaae
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	65	52.055	ENSAMXG00000035868	twistnb	57	55.612	Astyanax_mexicanus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	98	79.167	ENSBTAG00000006721	TWISTNB	99	76.786	Bos_taurus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	97	88.110	ENSCJAG00000001148	TWISTNB	97	88.110	Callithrix_jacchus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	100	74.000	ENSCAFG00000002511	TWISTNB	100	72.857	Canis_familiaris
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	98	77.353	ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	75.588	Canis_lupus_dingo
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	98	78.571	ENSCHIG00000024078	TWISTNB	99	77.679	Capra_hircus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	100	86.550	ENSTSYG00000001471	TWISTNB	100	86.550	Carlito_syrichta
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	99	80.769	ENSCPOG00000031651	TWISTNB	99	80.178	Cavia_porcellus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	100	85.965	ENSCCAG00000026416	TWISTNB	100	85.965	Cebus_capucinus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	100	86.842	ENSCATG00000035621	TWISTNB	100	83.333	Cercocebus_atys
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	99	81.416	ENSCLAG00000012696	TWISTNB	100	80.826	Chinchilla_lanigera
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	100	86.550	ENSCSAG00000013544	TWISTNB	100	83.041	Chlorocebus_sabaeus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	79	87.879	ENSCHOG00000006034	TWISTNB	79	87.879	Choloepus_hoffmanni
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	91	60.518	ENSCPBG00000000367	TWISTNB	59	75.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	100	86.842	ENSCANG00000038759	TWISTNB	100	83.333	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	98	76.133	ENSCGRG00001000499	Twistnb	99	74.924	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	55	58.696	ENSCVAG00000014324	twistnb	75	43.643	Cyprinodon_variegatus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	97	83.129	ENSDNOG00000006438	-	96	82.515	Dasypus_novemcinctus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	92	79.421	ENSDORG00000007795	Twistnb	95	77.492	Dipodomys_ordii
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	99	84.911	ENSEASG00005021702	TWISTNB	95	84.024	Equus_asinus_asinus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	99	84.911	ENSECAG00000014563	TWISTNB	95	84.024	Equus_caballus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	91	45.426	ENSELUG00000000098	TWISTNB	52	57.979	Esox_lucius
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	97	84.663	ENSFCAG00000025987	TWISTNB	96	83.129	Felis_catus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	77	54.380	ENSFALG00000009761	TWISTNB	51	72.436	Ficedula_albicollis
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	97	82.822	ENSFDAG00000017368	TWISTNB	99	81.065	Fukomys_damarensis
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	62	55.714	ENSFHEG00000013318	twistnb	50	59.239	Fundulus_heteroclitus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	84	57.042	ENSGALG00000010863	TWISTNB	69	56.690	Gallus_gallus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	66	48.707	ENSGACG00000006425	twistnb	66	55.747	Gasterosteus_aculeatus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	100	86.842	ENSGGOG00000026888	TWISTNB	100	83.333	Gorilla_gorilla
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	99	80.882	ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	80.236	Heterocephalus_glaber_female
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	97	82.822	ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	80.236	Heterocephalus_glaber_male
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	93	43.582	ENSIPUG00000004117	twistnb	51	56.757	Ictalurus_punctatus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	99	82.353	ENSSTOG00000022702	TWISTNB	93	80.294	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	99	74.852	ENSJJAG00000015887	Twistnb	99	73.669	Jaculus_jaculus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	54	58.152	ENSKMAG00000001591	twistnb	54	55.392	Kryptolebias_marmoratus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	91	54.167	ENSLACG00000010508	TWISTNB	54	66.842	Latimeria_chalumnae
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	52	65.143	ENSLOCG00000011399	twistnb	55	62.703	Lepisosteus_oculatus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	98	81.845	ENSLAFG00000008755	TWISTNB	99	80.952	Loxodonta_africana
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	100	86.550	ENSMFAG00000045328	TWISTNB	100	83.041	Macaca_fascicularis
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	99	86.391	ENSMMUG00000009609	TWISTNB	98	82.840	Macaca_mulatta
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	100	85.965	ENSMNEG00000041159	TWISTNB	100	82.456	Macaca_nemestrina
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	100	87.135	ENSMLEG00000042783	TWISTNB	100	83.626	Mandrillus_leucophaeus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	98	96.073	ENSMICG00000036489	TWISTNB	99	96.073	Microcebus_murinus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	96	77.640	ENSMOCG00000003458	Twistnb	95	75.806	Microtus_ochrogaster
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	63	49.327	ENSMMOG00000020085	twistnb	50	52.308	Mola_mola
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	88	61.056	ENSMODG00000001402	-	68	58.917	Monodelphis_domestica
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	98	77.246	MGP_CAROLIEiJ_G0017692	Twistnb	99	75.749	Mus_caroli
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	98	76.276	ENSMUSG00000020561	Twistnb	99	75.075	Mus_musculus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	98	77.177	MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	99	75.375	Mus_pahari
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	98	76.577	MGP_SPRETEiJ_G0018534	Twistnb	99	75.375	Mus_spretus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	98	81.845	ENSMPUG00000013948	TWISTNB	93	81.250	Mustela_putorius_furo
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	91	76.997	ENSMLUG00000008848	TWISTNB	99	76.038	Myotis_lucifugus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	59	85.930	ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	85.930	Nannospalax_galili
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	95	87.117	ENSNLEG00000035755	TWISTNB	95	83.436	Nomascus_leucogenys
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	100	75.362	ENSOPRG00000016109	TWISTNB	100	74.783	Ochotona_princeps
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	99	80.178	ENSODEG00000007222	TWISTNB	99	77.515	Octodon_degus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	100	90.616	ENSOGAG00000009189	TWISTNB	100	90.616	Otolemur_garnettii
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	98	78.571	ENSOARG00000009803	TWISTNB	98	77.976	Ovis_aries
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	100	86.842	ENSPPAG00000034623	TWISTNB	100	83.626	Pan_paniscus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	97	83.129	ENSPPRG00000005877	TWISTNB	96	80.061	Panthera_pardus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	85	84.722	ENSPTIG00000021539	TWISTNB	95	83.333	Panthera_tigris_altaica
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	100	87.427	ENSPTRG00000018962	TWISTNB	100	83.918	Pan_troglodytes
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	100	86.842	ENSPANG00000015736	TWISTNB	100	83.333	Papio_anubis
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	61	58.294	ENSPKIG00000025635	twistnb	54	61.026	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	89	57.807	ENSPCIG00000017456	TWISTNB	57	72.632	Phascolarctos_cinereus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	100	86.550	ENSPPYG00000017752	TWISTNB	100	83.918	Pongo_abelii
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	99	78.886	ENSPVAG00000015574	TWISTNB	99	78.886	Pteropus_vampyrus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	90	47.003	ENSPNAG00000011956	twistnb	51	59.239	Pygocentrus_nattereri
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	96	76.161	ENSRNOG00000010750	Twistnb	99	74.613	Rattus_norvegicus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	99	86.726	ENSRBIG00000043007	TWISTNB	98	83.186	Rhinopithecus_bieti
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	100	86.550	ENSRROG00000040155	TWISTNB	100	83.041	Rhinopithecus_roxellana
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	97	86.890	ENSSBOG00000023188	TWISTNB	97	84.756	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	53	58.659	ENSSFOG00015012788	twistnb	52	61.212	Scleropages_formosus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	97	41.834	ENSSMAG00000012792	twistnb	53	51.942	Scophthalmus_maximus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	92	50.949	ENSSPUG00000007595	TWISTNB	64	63.731	Sphenodon_punctatus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	61	52.941	ENSSPAG00000005871	twistnb	55	52.941	Stegastes_partitus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	98	82.196	ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	78.869	Sus_scrofa
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	89	45.541	ENSTNIG00000017778	twistnb	55	55.801	Tetraodon_nigroviridis
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	100	82.164	ENSTBEG00000003554	TWISTNB	100	80.702	Tupaia_belangeri
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	98	83.036	ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	82.440	Ursus_americanus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	98	82.738	ENSUMAG00000022203	TWISTNB	99	82.143	Ursus_maritimus
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	98	77.941	ENSVVUG00000008386	TWISTNB	99	75.882	Vulpes_vulpes
ENSPCOG00000017601	TWISTNB	65	53.636	ENSXCOG00000020199	twistnb	50	58.919	Xiphophorus_couchianus