EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPCOG00000020029 (Gene tree)
Gene ID: 105824137
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Propithecus_coquereli
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 38786 bases
Position: chrKQ027223.1:235544-274329
Accession: 105824137
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPCOP00000016537	GTP_EFTU	PF00009.27	3.4e-45	1	1
ENSPCOP00000016542	GTP_EFTU	PF00009.27	1.8e-34	1	1
ENSPCOP00000016542	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.2e-12	1	1
ENSPCOP00000016537	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.3e-12	1	1
ENSPCOP00000016537	EFG_IV	PF03764.18	2.6e-23	1	1
ENSPCOP00000016542	EFG_IV	PF03764.18	2.6e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPCOT00000027165	EFTUD2-201	3545	XM_012661505	ENSPCOP00000016537	972 (aa)	XP_012516959	A0A2K6FRE0
ENSPCOT00000027170	EFTUD2-202	2901	-	ENSPCOP00000016542	966 (aa)	-	A0A2K6FRE7

Gene Model

Click here to download ENSPCOG00000020029's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPCOG00000020029's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	87	38.946	ENSPCOG00000023522	EEF2	99	46.386
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	51	30.986	ENSPCOG00000022259	GFM1	58	30.986

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.794	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	92.284	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	92.078	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.691	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	99.691	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	88.786	ENSACIG00000009096	eftud2	100	88.580	Amphilophus_citrinellus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	87	88.118	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.118	Amphiprion_ocellaris
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	92.387	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	92.181	Amphiprion_percula
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	92.695	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.490	Anabas_testudineus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	99	94.336	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	94.336	Anas_platyrhynchos
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	97.737	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.737	Anolis_carolinensis
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.897	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.897	Aotus_nancymaae
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	92.284	ENSACLG00000001296	eftud2	100	92.078	Astatotilapia_calliptera
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	91.709	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	Astyanax_mexicanus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.383	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	99.383	Bos_taurus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	99	70.145	WBGene00001166	eftu-2	99	69.938	Caenorhabditis_elegans
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.897	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.897	Callithrix_jacchus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.691	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	99.691	Canis_familiaris
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.691	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.691	Canis_lupus_dingo
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.383	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.383	Capra_hircus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.486	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.486	Carlito_syrichta
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	98.868	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	98.868	Cavia_aperea
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	98.868	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.868	Cavia_porcellus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.897	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	99.897	Cebus_capucinus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.897	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.897	Cercocebus_atys
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	98.765	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.765	Chinchilla_lanigera
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.897	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.897	Chlorocebus_sabaeus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	91	86.712	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.712	Choloepus_hoffmanni
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	98.663	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.663	Chrysemys_picta_bellii
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	77.538	ENSCING00000009372	-	100	77.538	Ciona_intestinalis
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	99	78.004	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.717	Ciona_savignyi
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.897	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	99.897	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.383	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.383	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.383	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	99.383	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	91.872	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.667	Cynoglossus_semilaevis
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	92.284	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.078	Cyprinodon_variegatus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	91.059	ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.152	Danio_rerio
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.383	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	99.383	Dasypus_novemcinctus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.280	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.280	Dipodomys_ordii
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	75.077	FBgn0039566	CG4849	100	75.077	Drosophila_melanogaster
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	92	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	Echinops_telfairi
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	74	93.035	ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	Eptatretus_burgeri
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.691	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	99.691	Equus_asinus_asinus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.588	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	99.588	Equus_caballus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	90.947	ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.947	Esox_lucius
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.588	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.588	Felis_catus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	97.942	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.942	Ficedula_albicollis
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.074	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.074	Fukomys_damarensis
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	92.387	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	92.181	Fundulus_heteroclitus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	91.255	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.667	Gadus_morhua
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	98.045	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	Gallus_gallus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	92.078	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	91.975	Gambusia_affinis
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	91.872	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.667	Gasterosteus_aculeatus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.897	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	99.897	Gorilla_gorilla
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	92.181	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.975	Haplochromis_burtoni
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	98.663	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	98.663	Heterocephalus_glaber_female
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	98.663	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.663	Heterocephalus_glaber_male
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	91.049	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.049	Hippocampus_comes
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	91.358	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.975	Ictalurus_punctatus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	93.416	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.416	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	96	99.359	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.359	Jaculus_jaculus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	91.770	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.564	Kryptolebias_marmoratus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	95	91.802	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	Labrus_bergylta
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	94.342	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.861	Latimeria_chalumnae
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	92.181	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	92.181	Lepisosteus_oculatus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.383	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.383	Loxodonta_africana
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.897	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	99.897	Macaca_fascicularis
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.897	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.897	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	99.897	Macaca_nemestrina
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.897	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	99.897	Mandrillus_leucophaeus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	92.695	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	92.490	Mastacembelus_armatus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	92.284	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	92.078	Maylandia_zebra
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	98.049	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	98.049	Meleagris_gallopavo
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.383	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	99.383	Mesocricetus_auratus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.897	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	99.897	Microcebus_murinus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.486	ENSMOCG00000009039	-	100	99.486	Microtus_ochrogaster
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	92	81.685	ENSMOCG00000017653	-	90	81.685	Microtus_ochrogaster
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	87	93.882	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	93.882	Mola_mola
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.486	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.486	Monodelphis_domestica
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	87	92.118	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.118	Monopterus_albus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.177	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	99.177	Mus_caroli
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.177	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	99.177	Mus_musculus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.177	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.177	Mus_pahari
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.177	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	99.177	Mus_spretus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	97	99.470	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	99.470	Mustela_putorius_furo
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.691	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	99.691	Myotis_lucifugus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.383	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.383	Nannospalax_galili
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	92.181	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.975	Neolamprologus_brichardi
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	97	98.087	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	98.087	Nomascus_leucogenys
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	95.885	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.885	Notamacropus_eugenii
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	91.358	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.358	Ochotona_princeps
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	93	79.598	ENSODEG00000003385	-	100	79.598	Octodon_degus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	98.457	ENSODEG00000018041	-	100	98.457	Octodon_degus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	92.284	ENSONIG00000000912	eftud2	100	92.078	Oreochromis_niloticus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.691	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.691	Oryctolagus_cuniculus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	91.872	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.872	Oryzias_latipes
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	91.770	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.770	Oryzias_latipes_hni
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	91.770	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.573	Oryzias_latipes_hsok
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	97.634	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	97.634	Otolemur_garnettii
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.383	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	99.383	Ovis_aries
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.794	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	99.794	Pan_paniscus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.691	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	99.691	Panthera_pardus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.691	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	99.691	Panthera_tigris_altaica
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.794	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.794	Pan_troglodytes
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.897	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	99.897	Papio_anubis
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	93	97.133	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	Pelodiscus_sinensis
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	84.568	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	84.465	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.383	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	99.383	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.588	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	99.588	Phascolarctos_cinereus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	92.078	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	91.975	Poecilia_formosa
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	92.078	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	91.975	Poecilia_latipinna
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	92.078	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	91.975	Poecilia_mexicana
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	98.457	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.457	Pongo_abelii
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	95.576	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.576	Procavia_capensis
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	94.959	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.959	Pteropus_vampyrus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	92.181	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.975	Pundamilia_nyererei
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	91.975	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.490	Pygocentrus_nattereri
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.177	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.177	Rattus_norvegicus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.794	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	99.794	Rhinopithecus_bieti
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.794	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.794	Rhinopithecus_roxellana
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	97	34.091	YKL173W	SNU114	97	33.597	Saccharomyces_cerevisiae
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.897	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.897	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	97	99.574	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.574	Sarcophilus_harrisii
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	91.667	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.667	Scleropages_formosus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	92.078	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.872	Scophthalmus_maximus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	92.387	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	92.181	Seriola_dumerili
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	92.490	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	92.284	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	91.049	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	91.049	Sorex_araneus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	97.634	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.634	Sphenodon_punctatus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	92.490	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	92.284	Stegastes_partitus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.486	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.486	Sus_scrofa
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	84	97.324	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.324	Taeniopygia_guttata
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	91.461	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.255	Takifugu_rubripes
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	86.988	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.783	Tetraodon_nigroviridis
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	94.239	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	94.239	Tupaia_belangeri
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	90.844	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.844	Tursiops_truncatus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	98.563	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.563	Ursus_americanus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.691	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	99.691	Ursus_maritimus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.691	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	99.691	Vulpes_vulpes
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	97	94.883	ENSXETG00000003394	eftud2	98	95.865	Xenopus_tropicalis
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	81	93.495	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	Xiphophorus_couchianus
ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	92.078	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.975	Xiphophorus_maculatus