EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPCOG00000023123 (Gene tree)
Gene ID: 105806133
Gene Symbol: XPO1
Alias: CRM1|emb
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Propithecus_coquereli
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 53231 bases
Position: chrKQ017185.1:3919134-3972364
Accession: 105806133
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPCOP00000022105	CRM1_C	PF08767.11	8.4e-135	1	1
ENSPCOP00000022108	CRM1_C	PF08767.11	8.5e-135	1	1
ENSPCOP00000022105	Xpo1	PF08389.12	6.2e-41	1	1
ENSPCOP00000022108	Xpo1	PF08389.12	5.5e-33	1	1
ENSPCOP00000022105	IBN_N	PF03810.19	2.7e-12	1	1
ENSPCOP00000022108	IBN_N	PF03810.19	4e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPCOT00000032779	XPO1-202	3243	-	ENSPCOP00000022108	1080 (aa)	-	A0A2K6G7A6
ENSPCOT00000032776	XPO1-201	4864	XM_012639193	ENSPCOP00000022105	1071 (aa)	XP_012494647	A0A2K6G794

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	98.880	ENSG00000082898	XPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	96.359	ENSAPOG00000004984	-	100	96.359	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPCOG00000023123	XPO1	88	90.532	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	90.532	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	99.907	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	99.907	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPCOG00000023123	XPO1	88	92.872	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.872	Amphilophus_citrinellus
ENSPCOG00000023123	XPO1	88	96.702	ENSACIG00000010818	-	100	96.702	Amphilophus_citrinellus
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	96.359	ENSAOCG00000010121	-	100	96.359	Amphiprion_ocellaris
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	92.157	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	92.157	Amphiprion_ocellaris
ENSPCOG00000023123	XPO1	91	92.688	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	92.688	Amphiprion_percula
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	96.359	ENSAPEG00000007038	-	100	96.359	Amphiprion_percula
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	96.359	ENSATEG00000008816	-	100	96.359	Anabas_testudineus
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	91.783	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	91.783	Anabas_testudineus
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	99.720	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	99.720	Anas_platyrhynchos
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	99.533	ENSACAG00000002501	XPO1	100	99.533	Anolis_carolinensis
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	98.880	ENSANAG00000020802	XPO1	100	98.880	Aotus_nancymaae
ENSPCOG00000023123	XPO1	88	93.191	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	93.191	Astatotilapia_calliptera
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	96.172	ENSACLG00000015192	-	100	96.172	Astatotilapia_calliptera
ENSPCOG00000023123	XPO1	88	94.068	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	94.068	Astyanax_mexicanus
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	96.732	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	96.732	Astyanax_mexicanus
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	100.000	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	100.000	Bos_taurus
ENSPCOG00000023123	XPO1	99	51.941	WBGene00002078	xpo-1	99	51.941	Caenorhabditis_elegans
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	98.880	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.880	Callithrix_jacchus
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	100.000	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	100.000	Canis_familiaris
ENSPCOG00000023123	XPO1	93	99.900	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	99.900	Canis_lupus_dingo
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	100.000	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	100.000	Capra_hircus
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	100.000	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSPCOG00000023123	XPO1	53	95.390	ENSCAPG00000006454	-	100	95.390	Cavia_aperea
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	98.506	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	98.506	Cavia_porcellus
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	79.777	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.963	Cebus_capucinus
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	97.020	ENSCATG00000032674	XPO1	100	98.723	Cercocebus_atys
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	99.720	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	99.720	Chinchilla_lanigera
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	98.880	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.880	Chlorocebus_sabaeus
ENSPCOG00000023123	XPO1	83	100.000	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	99.627	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.627	Chrysemys_picta_bellii
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	81.285	ENSCING00000024562	-	100	81.285	Ciona_intestinalis
ENSPCOG00000023123	XPO1	99	80.299	ENSCSAVG00000005965	-	99	80.299	Ciona_savignyi
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	94.678	ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.582	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	98.693	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.693	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	98.693	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	98.693	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPCOG00000023123	XPO1	88	95.532	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.532	Cynoglossus_semilaevis
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	91.410	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	91.410	Cyprinodon_variegatus
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	96.265	ENSCVAG00000016788	-	100	96.265	Cyprinodon_variegatus
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	97.106	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	97.106	Danio_rerio
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	93.371	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	95.511	Danio_rerio
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	99.907	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	99.907	Dasypus_novemcinctus
ENSPCOG00000023123	XPO1	92	96.417	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	96.417	Dipodomys_ordii
ENSPCOG00000023123	XPO1	99	71.415	FBgn0020497	emb	99	71.415	Drosophila_melanogaster
ENSPCOG00000023123	XPO1	94	98.708	ENSETEG00000018045	XPO1	94	98.708	Echinops_telfairi
ENSPCOG00000023123	XPO1	90	79.772	ENSEBUG00000012580	-	100	88.273	Eptatretus_burgeri
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	100.000	ENSEASG00005007223	XPO1	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	100.000	ENSECAG00000024920	XPO1	100	100.000	Equus_caballus
ENSPCOG00000023123	XPO1	92	100.000	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSPCOG00000023123	XPO1	87	93.148	ENSELUG00000014306	-	99	93.148	Esox_lucius
ENSPCOG00000023123	XPO1	88	95.319	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	95.319	Esox_lucius
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	100.000	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	100.000	Felis_catus
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	99.440	ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.440	Ficedula_albicollis
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	98.133	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	98.133	Fukomys_damarensis
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	91.690	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	91.690	Fundulus_heteroclitus
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ENSPCOG00000023123	XPO1	100	92.997	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	92.997	Gadus_morhua
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	99.720	ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.720	Gallus_gallus
ENSPCOG00000023123	XPO1	91	96.395	ENSGAFG00000003355	-	98	96.395	Gambusia_affinis
ENSPCOG00000023123	XPO1	88	92.766	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.766	Gambusia_affinis
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ENSPCOG00000023123	XPO1	100	96.078	ENSGACG00000002743	-	100	96.078	Gasterosteus_aculeatus
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	99.533	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.533	Gopherus_agassizii
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	98.880	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	98.880	Gorilla_gorilla
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ENSPCOG00000023123	XPO1	100	92.344	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	92.344	Haplochromis_burtoni
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	99.627	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	99.627	Heterocephalus_glaber_female
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	99.627	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	99.627	Heterocephalus_glaber_male
ENSPCOG00000023123	XPO1	88	95.532	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	95.532	Hippocampus_comes
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ENSPCOG00000023123	XPO1	100	94.211	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.211	Ictalurus_punctatus
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	99.813	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.813	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	99.720	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	99.720	Jaculus_jaculus
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	95.798	ENSKMAG00000016218	-	100	95.798	Kryptolebias_marmoratus
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	91.597	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	91.597	Kryptolebias_marmoratus
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	96.359	ENSLBEG00000005740	-	100	96.359	Labrus_bergylta
ENSPCOG00000023123	XPO1	88	90.254	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	90.254	Labrus_bergylta
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	77.839	ENSLACG00000018213	XPO1	100	77.839	Latimeria_chalumnae
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	97.199	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	97.199	Lepisosteus_oculatus
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	99.627	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	99.627	Loxodonta_africana
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	98.880	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	98.880	Macaca_fascicularis
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	98.880	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	98.880	Macaca_mulatta
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	98.880	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	98.880	Macaca_nemestrina
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	97.023	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	97.023	Mandrillus_leucophaeus
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	92.063	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	92.063	Mastacembelus_armatus
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	96.265	ENSMAMG00000010568	-	100	96.265	Mastacembelus_armatus
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	96.172	ENSMZEG00005018158	-	98	96.395	Maylandia_zebra
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	92.344	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	92.344	Maylandia_zebra
ENSPCOG00000023123	XPO1	68	99.449	ENSMGAG00000001496	-	100	99.449	Meleagris_gallopavo
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	98.693	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	98.693	Mesocricetus_auratus
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ENSPCOG00000023123	XPO1	87	96.371	ENSMMOG00000008001	-	99	96.371	Mola_mola
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	98.693	ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.693	Monodelphis_domestica
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ENSPCOG00000023123	XPO1	100	99.160	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	100	99.160	Mus_spretus
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	100.000	ENSMPUG00000005560	XPO1	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSPCOG00000023123	XPO1	100	99.907	ENSMLUG00000010670	XPO1	100	99.907	Myotis_lucifugus
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