EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPCOG00000027011 (Gene tree)
Gene ID: 105811664
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Propithecus_coquereli
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 19920 bases
Position: chrKQ021947.1:3682426-3702345
Accession: 105811664
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPCOP00000028697	SYF2	PF08231.12	2.7e-39	1	2
ENSPCOP00000028697	SYF2	PF08231.12	2.7e-39	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPCOT00000039630	SYF2-201	507	XM_012645918	ENSPCOP00000028697	168 (aa)	XP_012501372	A0A2K6GR45

Gene Model

Click here to download ENSPCOG00000027011's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPCOG00000027011's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	77.114	ENSG00000117614	SYF2	100	77.114	Homo_sapiens
ENSPCOG00000027011	SYF2	88	58.108	ENSAPOG00000001174	syf2	100	55.556	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPCOG00000027011	SYF2	73	76.923	ENSAMEG00000010134	-	82	76.730	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPCOG00000027011	SYF2	96	62.605	ENSAMEG00000010115	-	98	63.025	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPCOG00000027011	SYF2	95	54.274	ENSACIG00000023688	syf2	92	54.274	Amphilophus_citrinellus
ENSPCOG00000027011	SYF2	90	52.655	ENSAOCG00000010912	syf2	69	52.655	Amphiprion_ocellaris
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	55.967	ENSAOCG00000022046	syf2	99	56.540	Amphiprion_ocellaris
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	55.967	ENSAPEG00000018858	syf2	92	55.967	Amphiprion_percula
ENSPCOG00000027011	SYF2	85	56.682	ENSATEG00000007745	syf2	100	53.909	Anabas_testudineus
ENSPCOG00000027011	SYF2	73	73.077	ENSAPLG00000016435	SYF2	79	72.956	Anas_platyrhynchos
ENSPCOG00000027011	SYF2	75	69.182	ENSACAG00000013653	-	78	69.182	Anolis_carolinensis
ENSPCOG00000027011	SYF2	75	62.893	ENSACAG00000026777	-	96	62.893	Anolis_carolinensis
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	76.617	ENSANAG00000032473	SYF2	100	76.617	Aotus_nancymaae
ENSPCOG00000027011	SYF2	88	55.405	ENSACLG00000019916	syf2	99	54.468	Astatotilapia_calliptera
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	56.379	ENSAMXG00000004051	syf2	100	56.379	Astyanax_mexicanus
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	62.857	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	63.559	Bos_taurus
ENSPCOG00000027011	SYF2	83	40.000	WBGene00019402	syf-2	75	40.000	Caenorhabditis_elegans
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	77.114	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	77.114	Callithrix_jacchus
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	63.821	ENSCAFG00000012895	-	100	64.228	Canis_familiaris
ENSPCOG00000027011	SYF2	73	71.154	ENSCAFG00000030331	-	70	71.069	Canis_familiaris
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	63.821	ENSCAFG00020021091	-	100	64.228	Canis_lupus_dingo
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	67.647	ENSCAFG00020021094	-	100	67.647	Canis_lupus_dingo
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	61.317	ENSCHIG00000020874	SYF2	100	61.728	Capra_hircus
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	78.109	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	78.109	Carlito_syrichta
ENSPCOG00000027011	SYF2	73	77.419	ENSCAPG00000010006	SYF2	80	77.215	Cavia_aperea
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	63.525	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	63.934	Cavia_porcellus
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	77.114	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	77.114	Cebus_capucinus
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	76.617	ENSCATG00000026917	SYF2	100	76.617	Cercocebus_atys
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	63.934	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	64.344	Chinchilla_lanigera
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	62.551	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	62.963	Chlorocebus_sabaeus
ENSPCOG00000027011	SYF2	64	64.925	ENSCHOG00000005273	-	81	64.925	Choloepus_hoffmanni
ENSPCOG00000027011	SYF2	89	60.714	ENSCPBG00000025073	SYF2	94	60.086	Chrysemys_picta_bellii
ENSPCOG00000027011	SYF2	79	45.238	ENSCING00000003017	-	70	44.643	Ciona_intestinalis
ENSPCOG00000027011	SYF2	96	40.102	ENSCSAVG00000006627	-	88	40.102	Ciona_savignyi
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	91.667	ENSCANG00000037322	SYF2	100	91.667	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	64.198	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	64.198	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPCOG00000027011	SYF2	73	77.564	ENSCGRG00000005095	Syf2	77	77.358	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPCOG00000027011	SYF2	85	54.587	ENSCSEG00000000117	syf2	100	50.617	Cynoglossus_semilaevis
ENSPCOG00000027011	SYF2	87	55.656	ENSCVAG00000019543	syf2	100	53.086	Cyprinodon_variegatus
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	54.321	ENSDARG00000004706	syf2	100	54.321	Danio_rerio
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	64.490	ENSDNOG00000047605	SYF2	100	64.898	Dasypus_novemcinctus
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	62.705	ENSDORG00000001274	Syf2	100	63.115	Dipodomys_ordii
ENSPCOG00000027011	SYF2	74	54.088	FBgn0033556	CG12343	70	54.088	Drosophila_melanogaster
ENSPCOG00000027011	SYF2	92	58.952	ENSETEG00000015729	SYF2	100	58.952	Echinops_telfairi
ENSPCOG00000027011	SYF2	76	55.172	ENSEBUG00000015402	syf2	76	55.172	Eptatretus_burgeri
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	63.934	ENSEASG00005004224	-	100	64.344	Equus_asinus_asinus
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	62.656	ENSEASG00005004232	-	100	63.071	Equus_asinus_asinus
ENSPCOG00000027011	SYF2	99	62.140	ENSECAG00000012023	-	99	62.551	Equus_caballus
ENSPCOG00000027011	SYF2	96	63.291	ENSECAG00000010440	-	98	64.103	Equus_caballus
ENSPCOG00000027011	SYF2	66	51.299	ENSEEUG00000015084	SYF2	84	51.299	Erinaceus_europaeus
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	55.967	ENSELUG00000003465	syf2	99	55.967	Esox_lucius
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	78.431	ENSFCAG00000043095	-	100	78.431	Felis_catus
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	62.857	ENSFCAG00000010324	-	85	63.265	Felis_catus
ENSPCOG00000027011	SYF2	75	71.698	ENSFALG00000000460	SYF2	95	55.882	Ficedula_albicollis
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	62.963	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	63.374	Fukomys_damarensis
ENSPCOG00000027011	SYF2	99	54.545	ENSFHEG00000007238	syf2	96	57.746	Fundulus_heteroclitus
ENSPCOG00000027011	SYF2	83	57.209	ENSGMOG00000019138	syf2	96	57.209	Gadus_morhua
ENSPCOG00000027011	SYF2	89	59.821	ENSGALG00000013639	SYF2	100	56.746	Gallus_gallus
ENSPCOG00000027011	SYF2	94	53.219	ENSGAFG00000019435	syf2	97	53.219	Gambusia_affinis
ENSPCOG00000027011	SYF2	85	55.963	ENSGACG00000007305	syf2	100	53.086	Gasterosteus_aculeatus
ENSPCOG00000027011	SYF2	89	61.161	ENSGAGG00000010670	SYF2	94	60.515	Gopherus_agassizii
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	77.114	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	77.114	Gorilla_gorilla
ENSPCOG00000027011	SYF2	95	54.274	ENSHBUG00000020477	syf2	100	53.498	Haplochromis_burtoni
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	63.115	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	63.525	Heterocephalus_glaber_female
ENSPCOG00000027011	SYF2	90	63.208	ENSHGLG00000004304	-	100	62.281	Heterocephalus_glaber_female
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	63.115	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	63.525	Heterocephalus_glaber_male
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	53.498	ENSHCOG00000012904	syf2	78	53.498	Hippocampus_comes
ENSPCOG00000027011	SYF2	99	55.602	ENSIPUG00000019859	syf2	99	55.602	Ictalurus_punctatus
ENSPCOG00000027011	SYF2	73	77.564	ENSJJAG00000013301	Syf2	75	77.358	Jaculus_jaculus
ENSPCOG00000027011	SYF2	89	55.263	ENSKMAG00000013856	syf2	96	55.263	Kryptolebias_marmoratus
ENSPCOG00000027011	SYF2	75	67.925	ENSLBEG00000014425	syf2	99	55.085	Labrus_bergylta
ENSPCOG00000027011	SYF2	95	55.745	ENSLACG00000012064	SYF2	97	55.745	Latimeria_chalumnae
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	54.733	ENSLOCG00000002728	syf2	95	54.733	Lepisosteus_oculatus
ENSPCOG00000027011	SYF2	54	44.355	ENSLAFG00000030814	-	73	45.865	Loxodonta_africana
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	63.673	ENSLAFG00000023150	-	100	64.082	Loxodonta_africana
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	76.617	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	76.617	Macaca_fascicularis
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	76.119	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	76.119	Macaca_mulatta
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	76.617	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	76.617	Macaca_nemestrina
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	76.617	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	76.617	Mandrillus_leucophaeus
ENSPCOG00000027011	SYF2	85	55.760	ENSMAMG00000010403	syf2	98	53.498	Mastacembelus_armatus
ENSPCOG00000027011	SYF2	93	54.237	ENSMZEG00005006429	syf2	99	54.237	Maylandia_zebra
ENSPCOG00000027011	SYF2	73	73.077	ENSMGAG00000002019	SYF2	80	72.956	Meleagris_gallopavo
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	62.551	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	62.963	Mesocricetus_auratus
ENSPCOG00000027011	SYF2	86	80.899	ENSMICG00000016191	SYF2	100	80.899	Microcebus_murinus
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	63.786	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	64.198	Microtus_ochrogaster
ENSPCOG00000027011	SYF2	88	54.505	ENSMMOG00000002396	syf2	93	54.505	Mola_mola
ENSPCOG00000027011	SYF2	90	59.649	ENSMODG00000013951	-	99	59.649	Monodelphis_domestica
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	53.689	ENSMALG00000010706	syf2	100	54.098	Monopterus_albus
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	62.963	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	63.374	Mus_caroli
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	62.963	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	63.374	Mus_musculus
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	62.963	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	63.374	Mus_pahari
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	62.963	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	63.374	Mus_spretus
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	62.195	ENSMPUG00000015801	-	100	62.602	Mustela_putorius_furo
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	64.228	ENSMPUG00000015802	-	100	64.634	Mustela_putorius_furo
ENSPCOG00000027011	SYF2	92	64.192	ENSMLUG00000001885	SYF2	94	64.629	Myotis_lucifugus
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	63.008	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	63.415	Nannospalax_galili
ENSPCOG00000027011	SYF2	93	52.607	ENSNBRG00000010720	syf2	99	48.707	Neolamprologus_brichardi
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	77.114	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	77.114	Nomascus_leucogenys
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	64.198	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	64.609	Ochotona_princeps
ENSPCOG00000027011	SYF2	94	62.661	ENSODEG00000017664	-	98	63.090	Octodon_degus
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	69.444	ENSODEG00000014338	-	100	69.444	Octodon_degus
ENSPCOG00000027011	SYF2	88	55.405	ENSONIG00000008213	syf2	99	54.468	Oreochromis_niloticus
ENSPCOG00000027011	SYF2	75	74.214	ENSOANG00000009552	SYF2	79	74.214	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	65.164	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	65.574	Oryctolagus_cuniculus
ENSPCOG00000027011	SYF2	90	54.185	ENSORLG00000028820	syf2	97	54.185	Oryzias_latipes
ENSPCOG00000027011	SYF2	99	52.697	ENSORLG00020018333	syf2	99	52.697	Oryzias_latipes_hni
ENSPCOG00000027011	SYF2	99	52.697	ENSORLG00015014665	syf2	99	52.697	Oryzias_latipes_hsok
ENSPCOG00000027011	SYF2	92	54.936	ENSOMEG00000013911	syf2	99	54.622	Oryzias_melastigma
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	65.574	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	65.984	Otolemur_garnettii
ENSPCOG00000027011	SYF2	74	50.633	ENSOARG00000006269	-	82	50.633	Ovis_aries
ENSPCOG00000027011	SYF2	99	61.633	ENSOARG00000006348	-	99	62.041	Ovis_aries
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	77.114	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	77.114	Pan_paniscus
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	78.431	ENSPPRG00000001651	-	100	78.431	Panthera_pardus
ENSPCOG00000027011	SYF2	99	62.705	ENSPPRG00000001638	-	99	63.115	Panthera_pardus
ENSPCOG00000027011	SYF2	84	63.889	ENSPTIG00000005711	-	81	63.677	Panthera_tigris_altaica
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	78.431	ENSPTIG00000007036	-	100	78.431	Panthera_tigris_altaica
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	77.114	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	77.114	Pan_troglodytes
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	76.617	ENSPANG00000008139	SYF2	100	76.617	Papio_anubis
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	54.918	ENSPKIG00000008130	syf2	100	54.918	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPCOG00000027011	SYF2	99	58.091	ENSPSIG00000011816	SYF2	94	58.506	Pelodiscus_sinensis
ENSPCOG00000027011	SYF2	93	55.172	ENSPMGG00000008755	syf2	90	55.172	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	63.374	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	63.786	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	57.600	ENSPCIG00000014235	SYF2	100	58.400	Phascolarctos_cinereus
ENSPCOG00000027011	SYF2	95	53.846	ENSPFOG00000004116	syf2	95	53.846	Poecilia_formosa
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	52.263	ENSPLAG00000006691	syf2	100	53.814	Poecilia_latipinna
ENSPCOG00000027011	SYF2	95	53.304	ENSPMEG00000011684	syf2	98	53.125	Poecilia_mexicana
ENSPCOG00000027011	SYF2	84	55.093	ENSPREG00000003009	syf2	97	53.419	Poecilia_reticulata
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	63.374	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	63.786	Pongo_abelii
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	62.449	ENSPVAG00000005841	SYF2	100	62.857	Pteropus_vampyrus
ENSPCOG00000027011	SYF2	88	55.405	ENSPNYG00000004979	syf2	98	54.701	Pundamilia_nyererei
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	57.613	ENSPNAG00000015570	syf2	100	57.613	Pygocentrus_nattereri
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	62.963	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	63.374	Rattus_norvegicus
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	73.632	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	73.632	Rhinopithecus_bieti
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	76.617	ENSRROG00000001347	SYF2	100	76.617	Rhinopithecus_roxellana
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	75.622	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	75.622	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPCOG00000027011	SYF2	75	75.472	ENSSHAG00000007152	-	77	75.472	Sarcophilus_harrisii
ENSPCOG00000027011	SYF2	90	61.947	ENSSHAG00000015630	-	100	58.635	Sarcophilus_harrisii
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	55.738	ENSSFOG00015023647	syf2	100	55.738	Scleropages_formosus
ENSPCOG00000027011	SYF2	93	53.814	ENSSMAG00000009867	syf2	99	53.814	Scophthalmus_maximus
ENSPCOG00000027011	SYF2	85	56.422	ENSSDUG00000013072	syf2	92	56.422	Seriola_dumerili
ENSPCOG00000027011	SYF2	85	56.422	ENSSLDG00000012677	syf2	92	56.422	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	62.295	ENSSARG00000012889	SYF2	100	62.295	Sorex_araneus
ENSPCOG00000027011	SYF2	93	59.307	ENSSPUG00000005251	SYF2	91	59.740	Sphenodon_punctatus
ENSPCOG00000027011	SYF2	99	53.112	ENSSPAG00000009626	syf2	99	53.112	Stegastes_partitus
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	61.633	ENSSSCG00000037481	SYF2	100	62.041	Sus_scrofa
ENSPCOG00000027011	SYF2	50	76.471	ENSTGUG00000001126	SYF2	84	52.353	Taeniopygia_guttata
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	52.263	ENSTRUG00000001499	syf2	89	55.405	Takifugu_rubripes
ENSPCOG00000027011	SYF2	88	54.709	ENSTNIG00000016912	syf2	100	54.709	Tetraodon_nigroviridis
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	59.809	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	59.809	Tupaia_belangeri
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	63.934	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	64.344	Tursiops_truncatus
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	63.821	ENSUAMG00000002897	SYF2	100	64.228	Ursus_americanus
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	63.415	ENSUMAG00000013108	SYF2	100	63.821	Ursus_maritimus
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	62.705	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	63.115	Vicugna_pacos
ENSPCOG00000027011	SYF2	73	75.641	ENSVVUG00000027181	-	100	59.677	Vulpes_vulpes
ENSPCOG00000027011	SYF2	100	63.821	ENSVVUG00000027175	-	100	64.228	Vulpes_vulpes
ENSPCOG00000027011	SYF2	94	58.369	ENSXETG00000022797	syf2	94	58.369	Xenopus_tropicalis
ENSPCOG00000027011	SYF2	83	54.884	ENSXMAG00000022698	syf2	93	54.054	Xiphophorus_maculatus