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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPEMG00000007444 (Gene tree)
Gene ID: 102919925
Gene Symbol: Tnpo1
Alias: -
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Peromyscus_maniculatus_bairdii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 88395 bases
Position: chrKI615587.1:3569360-3657754
Accession: 102919925
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPEMP00000005043	IBN_N	PF03810.19	2.4e-15	1	1
ENSPEMP00000005033	IBN_N	PF03810.19	3.6e-15	1	1
ENSPEMP00000005028	IBN_N	PF03810.19	8e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPEMT00000008940	-	8210	XM_006985781	ENSPEMP00000005028	855 (aa)	XP_006985843	UPI00004844C8
ENSPEMT00000008958	-	2592	-	ENSPEMP00000005043	863 (aa)	-	-
ENSPEMT00000008946	-	2583	-	ENSPEMP00000005033	860 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	85.087	ENSPEMG00000018702	Tnpo2	96	85.087

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.649	ENSG00000083312	TNPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.918	ENSAPOG00000003453	tnpo1	96	93.918	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	98.725	ENSAMEG00000007147	TNPO1	95	98.725	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	86	93.234	ENSACIG00000003711	tnpo1	95	93.234	Amphilophus_citrinellus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	94.035	ENSAOCG00000008154	tnpo1	96	94.035	Amphiprion_ocellaris
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	94.035	ENSAPEG00000001112	tnpo1	96	94.035	Amphiprion_percula
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.684	ENSATEG00000010408	tnpo1	96	93.684	Anabas_testudineus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	94.309	ENSAPLG00000009619	-	96	94.309	Anas_platyrhynchos
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	96.725	ENSACAG00000009599	TNPO1	96	96.725	Anolis_carolinensis
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	64.591	ENSANAG00000027118	-	99	63.503	Aotus_nancymaae
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	90.643	ENSANAG00000025351	-	95	90.643	Aotus_nancymaae
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.181	ENSANAG00000022453	-	95	99.181	Aotus_nancymaae
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	91.813	ENSACLG00000027223	tnpo1	96	91.813	Astatotilapia_calliptera
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	92.882	ENSAMXG00000009842	tnpo1	96	92.532	Astyanax_mexicanus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.415	ENSBTAG00000007979	TNPO1	95	99.415	Bos_taurus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.298	ENSCJAG00000016409	TNPO1	95	99.298	Callithrix_jacchus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.417	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.417	Canis_familiaris
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	96.374	ENSCAFG00020017397	TNPO1	96	96.374	Canis_lupus_dingo
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.298	ENSCHIG00000023462	TNPO1	95	99.298	Capra_hircus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	97.895	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	97.895	Carlito_syrichta
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.181	ENSCCAG00000026472	TNPO1	96	99.181	Cebus_capucinus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.649	ENSCATG00000043792	TNPO1	96	99.649	Cercocebus_atys
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.181	ENSCLAG00000016191	TNPO1	96	99.181	Chinchilla_lanigera
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.532	ENSCSAG00000015616	TNPO1	95	99.532	Chlorocebus_sabaeus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	94	86.070	ENSCHOG00000001746	TNPO1	95	86.070	Choloepus_hoffmanni
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	97.778	ENSCPBG00000000260	TNPO1	91	97.778	Chrysemys_picta_bellii
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	75.698	ENSCSAVG00000010981	-	99	72.394	Ciona_savignyi
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.649	ENSCANG00000004353	TNPO1	95	99.649	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	100.000	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	95	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	100.000	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	92.632	ENSCSEG00000012674	tnpo1	96	92.632	Cynoglossus_semilaevis
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.333	ENSCVAG00000001010	tnpo1	96	93.333	Cyprinodon_variegatus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	92.991	ENSDARG00000035390	tnpo1	96	92.640	Danio_rerio
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.124	ENSDNOG00000006647	TNPO1	96	93.124	Dasypus_novemcinctus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	97	99.398	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.397	Dipodomys_ordii
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	99	58.016	FBgn0035693	CG8219	99	57.670	Drosophila_melanogaster
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	86	99.251	ENSETEG00000017805	TNPO1	85	99.251	Echinops_telfairi
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	98	85.119	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	Eptatretus_burgeri
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.649	ENSEASG00005018055	TNPO1	96	99.649	Equus_asinus_asinus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.532	ENSECAG00000024424	TNPO1	95	99.532	Equus_caballus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	86.750	ENSELUG00000002821	tnpo1	96	86.297	Esox_lucius
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.649	ENSFCAG00000013181	TNPO1	96	99.649	Felis_catus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	97.427	ENSFALG00000010292	TNPO1	96	97.427	Ficedula_albicollis
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.298	ENSFDAG00000013345	TNPO1	95	99.298	Fukomys_damarensis
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.692	ENSFHEG00000019234	tnpo1	96	93.692	Fundulus_heteroclitus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	90.326	ENSGMOG00000000347	tnpo1	96	90.326	Gadus_morhua
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	96.725	ENSGALG00000015014	TNPO1	96	96.725	Gallus_gallus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	92.415	ENSGAFG00000000943	tnpo1	96	92.415	Gambusia_affinis
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.216	ENSGACG00000015841	tnpo1	96	93.216	Gasterosteus_aculeatus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	97.544	ENSGAGG00000013419	TNPO1	96	97.544	Gopherus_agassizii
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.649	ENSGGOG00000026800	TNPO1	96	99.649	Gorilla_gorilla
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	82.730	ENSGGOG00000022535	-	95	82.730	Gorilla_gorilla
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.450	ENSHBUG00000008068	tnpo1	96	93.450	Haplochromis_burtoni
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	98.947	ENSHGLG00000000970	-	95	98.947	Heterocephalus_glaber_female
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	98.953	ENSHGLG00100017090	-	100	98.953	Heterocephalus_glaber_male
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	99	77.518	ENSHGLG00100000963	-	98	76.932	Heterocephalus_glaber_male
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.649	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	93	99.649	Jaculus_jaculus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.567	ENSKMAG00000018195	tnpo1	96	93.567	Kryptolebias_marmoratus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	90	90.206	ENSLBEG00000009521	tnpo1	92	90.206	Labrus_bergylta
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	89.523	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.419	Latimeria_chalumnae
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	95.322	ENSLOCG00000011092	tnpo1	93	95.322	Lepisosteus_oculatus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.415	ENSLAFG00000011796	TNPO1	99	99.415	Loxodonta_africana
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.649	ENSMFAG00000003636	TNPO1	95	99.649	Macaca_fascicularis
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.532	ENSMMUG00000020923	TNPO1	96	99.532	Macaca_mulatta
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.649	ENSMNEG00000044581	TNPO1	95	99.649	Macaca_nemestrina
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.649	ENSMLEG00000030740	TNPO1	95	99.649	Mandrillus_leucophaeus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.684	ENSMAMG00000001357	tnpo1	96	93.684	Mastacembelus_armatus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.216	ENSMZEG00005004913	tnpo1	96	93.216	Maylandia_zebra
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	100.000	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	95	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	95.322	ENSMICG00000008468	TNPO1	96	95.210	Microcebus_murinus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	100.000	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	95	100.000	Microtus_ochrogaster
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	86	92.848	ENSMMOG00000005551	tnpo1	95	92.848	Mola_mola
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	99	97.660	ENSMODG00000001721	TNPO1	77	97.660	Monodelphis_domestica
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	92.515	ENSMALG00000009782	tnpo1	96	92.515	Monopterus_albus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.766	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	96	99.766	Mus_caroli
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	100.000	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	96	100.000	Mus_musculus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.883	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	96	99.870	Mus_pahari
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.766	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	96	99.741	Mus_spretus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.532	ENSMPUG00000014387	TNPO1	95	99.532	Mustela_putorius_furo
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	98.952	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	98.952	Myotis_lucifugus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.883	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	96	99.883	Nannospalax_galili
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	86	93.099	ENSNBRG00000009998	tnpo1	95	93.099	Neolamprologus_brichardi
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.649	ENSNLEG00000004572	TNPO1	96	99.649	Nomascus_leucogenys
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	90	93.662	ENSOPRG00000012390	TNPO1	86	93.662	Ochotona_princeps
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	98.947	ENSODEG00000001771	TNPO1	95	98.947	Octodon_degus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	92.683	ENSONIG00000011151	tnpo1	95	92.683	Oreochromis_niloticus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	96	97.805	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.805	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	92.874	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	92.874	Oryctolagus_cuniculus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	86	92.693	ENSORLG00000003182	tnpo1	95	92.693	Oryzias_latipes
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	92.982	ENSORLG00020011559	tnpo1	96	92.982	Oryzias_latipes_hni
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.099	ENSORLG00015019113	tnpo1	96	93.099	Oryzias_latipes_hsok
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	92.982	ENSOMEG00000014567	tnpo1	96	92.982	Oryzias_melastigma
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.532	ENSOGAG00000000808	TNPO1	95	99.532	Otolemur_garnettii
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.415	ENSOARG00000005038	TNPO1	80	99.415	Ovis_aries
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.649	ENSPPAG00000042518	TNPO1	95	99.649	Pan_paniscus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.649	ENSPPRG00000022336	TNPO1	96	99.649	Panthera_pardus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.649	ENSPTIG00000018839	TNPO1	96	99.649	Panthera_tigris_altaica
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	94	86.522	ENSPTRG00000047731	-	96	86.522	Pan_troglodytes
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.649	ENSPTRG00000016972	TNPO1	95	99.649	Pan_troglodytes
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.649	ENSPANG00000006074	TNPO1	95	99.649	Papio_anubis
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	90.760	ENSPKIG00000019795	tnpo1	96	90.760	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	97.427	ENSPSIG00000014366	TNPO1	96	97.313	Pelodiscus_sinensis
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	90.654	ENSPMGG00000017014	tnpo1	96	90.654	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	98.129	ENSPCIG00000026080	TNPO1	96	98.129	Phascolarctos_cinereus
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.240	ENSPFOG00000011447	tnpo1	96	93.240	Poecilia_formosa
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.240	ENSPLAG00000018696	tnpo1	96	93.240	Poecilia_latipinna
ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.450	ENSPMEG00000024121	tnpo1	96	93.450	Poecilia_mexicana
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