EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPEMG00000008274 (Gene tree)
Gene ID: 102906757
Gene Symbol: Tyw1
Alias: -
Full Name: S-adenosyl-L-methionine-dependent tRNA 4-demethylwyosine synthase
Gene Type: protein_coding
Species: Peromyscus_maniculatus_bairdii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 83691 bases
Position: chrKI615328.1:8030029-8113719
Accession: 102906757
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPEMP00000005897	Wyosine_form	PF08608.12	3e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPEMT00000010004	-	2657	XM_006971343	ENSPEMP00000005897	724 (aa)	XP_006971405	UPI00042AB152
ENSPEMT00000010013	-	1335	-	ENSPEMP00000005906	444 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	80.605	ENSG00000198874	TYW1	99	80.605	Homo_sapiens
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	71.330	ENSG00000277149	TYW1B	99	71.330	Homo_sapiens
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	67.215	ENSAPOG00000014391	tyw1	97	67.627	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	65.470	ENSACIG00000007325	tyw1	99	65.284	Amphilophus_citrinellus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	65.761	ENSAOCG00000016792	tyw1	97	67.305	Amphiprion_ocellaris
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	65.625	ENSAPEG00000015939	tyw1	99	68.713	Amphiprion_percula
ENSPEMG00000008274	Tyw1	90	65.606	ENSATEG00000006856	tyw1	91	65.606	Anabas_testudineus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	100	79.235	ENSANAG00000037051	-	100	79.235	Aotus_nancymaae
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	66.989	ENSACLG00000018688	tyw1	96	66.343	Astatotilapia_calliptera
ENSPEMG00000008274	Tyw1	98	68.524	ENSAMXG00000004157	tyw1	99	67.667	Astyanax_mexicanus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	100	79.098	ENSBTAG00000008446	TYW1	100	79.098	Bos_taurus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	100	78.689	ENSCJAG00000004295	-	100	78.689	Callithrix_jacchus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	100	78.095	ENSCAFG00000010867	-	100	77.823	Canis_familiaris
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	69.487	ENSCAFG00020005367	-	99	72.414	Canis_lupus_dingo
ENSPEMG00000008274	Tyw1	100	80.055	ENSCHIG00000019510	-	100	80.055	Capra_hircus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	90	80.851	ENSTSYG00000008236	-	100	80.851	Carlito_syrichta
ENSPEMG00000008274	Tyw1	88	74.254	ENSCAPG00000013569	-	100	74.254	Cavia_aperea
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	77.341	ENSCPOG00000011182	-	99	77.341	Cavia_porcellus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	100	79.372	ENSCCAG00000026643	-	100	79.508	Cebus_capucinus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	100	80.055	ENSCATG00000043677	-	100	80.055	Cercocebus_atys
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	78.172	ENSCLAG00000006321	-	99	78.172	Chinchilla_lanigera
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	69.475	ENSCSAG00000018274	-	99	69.475	Chlorocebus_sabaeus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	67	91.453	ENSCHOG00000003801	-	75	91.453	Choloepus_hoffmanni
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	70.668	ENSCPBG00000014896	-	96	75.368	Chrysemys_picta_bellii
ENSPEMG00000008274	Tyw1	81	58.305	ENSCING00000004125	-	97	58.475	Ciona_intestinalis
ENSPEMG00000008274	Tyw1	90	53.891	ENSCSAVG00000005712	-	100	54.711	Ciona_savignyi
ENSPEMG00000008274	Tyw1	100	80.328	ENSCANG00000033209	-	100	80.328	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	71	95.139	ENSCGRG00001003679	Tyw1	88	95.139	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPEMG00000008274	Tyw1	98	67.364	ENSCSEG00000005810	tyw1	94	67.364	Cynoglossus_semilaevis
ENSPEMG00000008274	Tyw1	89	65.331	ENSCVAG00000001054	tyw1	91	66.409	Cyprinodon_variegatus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	68.895	ENSDARG00000062987	tyw1	96	68.895	Danio_rerio
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	80.907	ENSDNOG00000024165	-	99	80.495	Dasypus_novemcinctus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	68.138	ENSDORG00000014772	Tyw1	99	68.552	Dipodomys_ordii
ENSPEMG00000008274	Tyw1	51	54.891	ENSETEG00000009904	-	83	54.891	Echinops_telfairi
ENSPEMG00000008274	Tyw1	60	70.833	ENSEBUG00000004494	tyw1	91	70.833	Eptatretus_burgeri
ENSPEMG00000008274	Tyw1	100	79.098	ENSEASG00005008818	-	100	79.098	Equus_asinus_asinus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	100	70.219	ENSECAG00000023164	-	100	69.726	Equus_caballus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	61	87.879	ENSEEUG00000005950	-	62	87.879	Erinaceus_europaeus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	66.531	ENSELUG00000008449	tyw1	98	66.467	Esox_lucius
ENSPEMG00000008274	Tyw1	100	77.687	ENSFCAG00000014262	-	100	76.735	Felis_catus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	66.621	ENSFALG00000013810	-	100	66.895	Ficedula_albicollis
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	77.869	ENSFDAG00000013270	-	99	77.869	Fukomys_damarensis
ENSPEMG00000008274	Tyw1	84	67.250	ENSFHEG00000020824	tyw1	81	68.071	Fundulus_heteroclitus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	67.651	ENSGALG00000001110	-	99	69.241	Gallus_gallus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	67.867	ENSGACG00000012692	tyw1	98	66.392	Gasterosteus_aculeatus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	69.701	ENSGAGG00000022393	-	99	69.701	Gopherus_agassizii
ENSPEMG00000008274	Tyw1	89	72.018	ENSGGOG00000001473	TYW1	99	72.018	Gorilla_gorilla
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	66.851	ENSHBUG00000002640	tyw1	96	66.575	Haplochromis_burtoni
ENSPEMG00000008274	Tyw1	88	75.507	ENSHGLG00000012093	-	100	75.507	Heterocephalus_glaber_female
ENSPEMG00000008274	Tyw1	100	79.098	ENSHGLG00100011743	TYW1	100	79.098	Heterocephalus_glaber_male
ENSPEMG00000008274	Tyw1	98	62.098	ENSHCOG00000019949	tyw1	96	62.098	Hippocampus_comes
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	66.892	ENSIPUG00000016330	tyw1	97	67.028	Ictalurus_punctatus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	79.287	ENSSTOG00000004067	-	91	79.424	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	82.044	ENSJJAG00000022959	Tyw1	99	82.044	Jaculus_jaculus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	98	66.529	ENSKMAG00000018599	tyw1	96	66.667	Kryptolebias_marmoratus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	65.847	ENSLACG00000018917	tyw1	96	65.847	Latimeria_chalumnae
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	68.088	ENSLOCG00000004035	tyw1	96	67.862	Lepisosteus_oculatus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	100	80.055	ENSMFAG00000035457	-	100	80.055	Macaca_fascicularis
ENSPEMG00000008274	Tyw1	100	80.055	ENSMMUG00000030374	-	100	80.055	Macaca_mulatta
ENSPEMG00000008274	Tyw1	100	80.328	ENSMNEG00000041992	-	100	80.328	Macaca_nemestrina
ENSPEMG00000008274	Tyw1	100	80.191	ENSMLEG00000039741	-	100	80.191	Mandrillus_leucophaeus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	98	66.806	ENSMAMG00000016089	tyw1	97	63.955	Mastacembelus_armatus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	91	70.659	ENSMZEG00005024386	tyw1	97	70.509	Maylandia_zebra
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	69.524	ENSMGAG00000002176	-	99	69.524	Meleagris_gallopavo
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	92.798	ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	92.798	Mesocricetus_auratus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	79.890	ENSMICG00000014374	-	100	79.890	Microcebus_murinus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	91.148	ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	91.010	Microtus_ochrogaster
ENSPEMG00000008274	Tyw1	98	62.921	ENSMMOG00000005064	tyw1	97	63.202	Mola_mola
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	70.230	ENSMODG00000025697	-	99	71.293	Monodelphis_domestica
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	67.082	ENSMALG00000010238	tyw1	96	67.082	Monopterus_albus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	100	89.641	MGP_CAROLIEiJ_G0027801	Tyw1	100	89.641	Mus_caroli
ENSPEMG00000008274	Tyw1	100	89.641	ENSMUSG00000056310	Tyw1	100	89.641	Mus_musculus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	100	88.122	MGP_PahariEiJ_G0024383	Tyw1	100	88.536	Mus_pahari
ENSPEMG00000008274	Tyw1	100	89.779	MGP_SPRETEiJ_G0028799	Tyw1	100	89.779	Mus_spretus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	95	77.135	ENSMPUG00000016191	-	100	76.122	Mustela_putorius_furo
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	76.639	ENSMLUG00000013582	-	99	76.639	Myotis_lucifugus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	82.296	ENSNGAG00000002742	Tyw1	99	82.573	Nannospalax_galili
ENSPEMG00000008274	Tyw1	96	65.854	ENSNBRG00000016996	tyw1	99	65.665	Neolamprologus_brichardi
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	79.258	ENSNLEG00000013210	-	98	79.258	Nomascus_leucogenys
ENSPEMG00000008274	Tyw1	92	62.913	ENSOPRG00000008734	-	88	62.913	Ochotona_princeps
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	71.607	ENSODEG00000014729	-	99	72.000	Octodon_degus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	67.455	ENSONIG00000005872	tyw1	96	66.992	Oreochromis_niloticus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	79.012	ENSOCUG00000003173	-	99	79.012	Oryctolagus_cuniculus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	98	67.177	ENSORLG00000001393	tyw1	98	64.404	Oryzias_latipes
ENSPEMG00000008274	Tyw1	98	67.316	ENSORLG00020019361	tyw1	98	64.681	Oryzias_latipes_hni
ENSPEMG00000008274	Tyw1	98	67.406	ENSORLG00015008095	tyw1	95	66.759	Oryzias_latipes_hsok
ENSPEMG00000008274	Tyw1	98	79.334	ENSOGAG00000016555	-	98	79.334	Otolemur_garnettii
ENSPEMG00000008274	Tyw1	100	79.240	ENSOARG00000010673	-	100	79.240	Ovis_aries
ENSPEMG00000008274	Tyw1	100	78.219	ENSPPRG00000004945	-	100	77.260	Panthera_pardus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	100	78.356	ENSPTIG00000019545	-	100	77.397	Panthera_tigris_altaica
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	74.727	ENSPTRG00000023076	TYW1B	98	74.727	Pan_troglodytes
ENSPEMG00000008274	Tyw1	100	79.781	ENSPANG00000019053	-	100	79.781	Papio_anubis
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	66.164	ENSPKIG00000006545	tyw1	96	68.232	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPEMG00000008274	Tyw1	96	65.816	ENSPMGG00000004240	tyw1	100	64.888	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	67.896	ENSPFOG00000015855	tyw1	99	67.896	Poecilia_formosa
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	66.441	ENSPLAG00000000838	tyw1	92	82.199	Poecilia_latipinna
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	66.621	ENSPMEG00000019437	tyw1	100	65.551	Poecilia_mexicana
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	65.027	ENSPREG00000018773	tyw1	98	65.484	Poecilia_reticulata
ENSPEMG00000008274	Tyw1	100	80.601	ENSPPYG00000017514	TYW1	100	80.601	Pongo_abelii
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	63.874	ENSPCOG00000015294	-	96	73.913	Propithecus_coquereli
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	66.989	ENSPNYG00000022381	tyw1	96	66.343	Pundamilia_nyererei
ENSPEMG00000008274	Tyw1	98	68.283	ENSPNAG00000009001	tyw1	98	69.391	Pygocentrus_nattereri
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	90.443	ENSRNOG00000024352	Tyw1	99	90.443	Rattus_norvegicus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	100	80.491	ENSRBIG00000039619	-	100	80.491	Rhinopithecus_bieti
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	80.495	ENSRROG00000039780	-	99	80.495	Rhinopithecus_roxellana
ENSPEMG00000008274	Tyw1	94	40.805	YPL207W	-	70	55.446	Saccharomyces_cerevisiae
ENSPEMG00000008274	Tyw1	100	79.508	ENSSBOG00000025873	-	100	79.508	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	71.448	ENSSHAG00000010346	-	100	72.299	Sarcophilus_harrisii
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	70.222	ENSSFOG00015001054	tyw1	99	69.310	Scleropages_formosus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	67.036	ENSSMAG00000020514	tyw1	96	67.355	Scophthalmus_maximus
ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	66.985	ENSSDUG00000001552	tyw1	95	70.310	Seriola_dumerili
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ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	69.220	ENSSPUG00000002715	-	99	70.178	Sphenodon_punctatus
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