EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPEMG00000008283 (Gene tree)
Gene ID: 102917837
Gene Symbol: Syf2
Alias: -
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Peromyscus_maniculatus_bairdii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8289 bases
Position: chrKI615381.1:5101028-5109316
Accession: 102917837
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPEMP00000005905	SYF2	PF08231.12	1.4e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPEMT00000010012	-	1347	XM_006975664	ENSPEMP00000005905	242 (aa)	XP_006975726	UPI00042AC658

Gene Model

Click here to download ENSPEMG00000008283's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPEMG00000008283's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	90.947	ENSG00000117614	SYF2	100	90.947	Homo_sapiens
ENSPEMG00000008283	Syf2	92	84.685	ENSAPOG00000001174	syf2	100	80.165	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPEMG00000008283	Syf2	99	89.669	ENSAMEG00000010115	-	99	89.669	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPEMG00000008283	Syf2	81	94.872	ENSAMEG00000010134	-	100	94.872	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPEMG00000008283	Syf2	96	79.399	ENSACIG00000023688	syf2	94	78.390	Amphilophus_citrinellus
ENSPEMG00000008283	Syf2	93	79.556	ENSAOCG00000010912	syf2	69	79.556	Amphiprion_ocellaris
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	80.992	ENSAOCG00000022046	syf2	97	83.043	Amphiprion_ocellaris
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	80.992	ENSAPEG00000018858	syf2	92	80.992	Amphiprion_percula
ENSPEMG00000008283	Syf2	90	83.871	ENSATEG00000007745	syf2	100	78.512	Anabas_testudineus
ENSPEMG00000008283	Syf2	83	87.500	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	87.500	Anas_platyrhynchos
ENSPEMG00000008283	Syf2	84	83.824	ENSACAG00000013653	-	100	83.824	Anolis_carolinensis
ENSPEMG00000008283	Syf2	69	74.850	ENSACAG00000026777	-	94	75.159	Anolis_carolinensis
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	91.358	ENSANAG00000032473	SYF2	100	91.358	Aotus_nancymaae
ENSPEMG00000008283	Syf2	92	81.081	ENSACLG00000019916	syf2	100	77.273	Astatotilapia_calliptera
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	78.926	ENSAMXG00000004051	syf2	100	78.926	Astyanax_mexicanus
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	92.245	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	93.220	Bos_taurus
ENSPEMG00000008283	Syf2	86	50.000	WBGene00019402	syf-2	90	49.289	Caenorhabditis_elegans
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	91.358	ENSCJAG00000046570	SYF2	100	91.358	Callithrix_jacchus
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	89.837	ENSCAFG00000012895	-	100	89.837	Canis_familiaris
ENSPEMG00000008283	Syf2	97	82.979	ENSCAFG00000030331	-	97	82.979	Canis_familiaris
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	89.837	ENSCAFG00020021091	-	100	89.837	Canis_lupus_dingo
ENSPEMG00000008283	Syf2	75	85.165	ENSCAFG00020021094	-	83	92.949	Canis_lupus_dingo
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	92.181	ENSCHIG00000020874	SYF2	100	92.181	Capra_hircus
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	92.181	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	92.181	Carlito_syrichta
ENSPEMG00000008283	Syf2	82	95.455	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	95.455	Cavia_aperea
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	90.984	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	90.984	Cavia_porcellus
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	91.770	ENSCCAG00000022459	SYF2	100	91.770	Cebus_capucinus
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	90.123	ENSCATG00000026917	SYF2	100	90.123	Cercocebus_atys
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	93.443	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.443	Chinchilla_lanigera
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	90.535	ENSCSAG00000000948	SYF2	100	90.535	Chlorocebus_sabaeus
ENSPEMG00000008283	Syf2	74	74.033	ENSCHOG00000005273	-	100	73.481	Choloepus_hoffmanni
ENSPEMG00000008283	Syf2	93	88.000	ENSCPBG00000025073	SYF2	92	87.281	Chrysemys_picta_bellii
ENSPEMG00000008283	Syf2	87	53.521	ENSCING00000003017	-	89	53.052	Ciona_intestinalis
ENSPEMG00000008283	Syf2	87	51.163	ENSCSAVG00000006627	-	97	49.765	Ciona_savignyi
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	78.189	ENSCANG00000037322	SYF2	100	78.189	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	97.521	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	97.521	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPEMG00000008283	Syf2	82	98.492	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	98.492	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPEMG00000008283	Syf2	90	78.899	ENSCSEG00000000117	syf2	93	77.928	Cynoglossus_semilaevis
ENSPEMG00000008283	Syf2	91	82.353	ENSCVAG00000019543	syf2	100	78.099	Cyprinodon_variegatus
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	79.339	ENSDARG00000004706	syf2	100	79.339	Danio_rerio
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	91.020	ENSDNOG00000047605	SYF2	100	91.020	Dasypus_novemcinctus
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	92.213	ENSDORG00000001274	Syf2	100	92.213	Dipodomys_ordii
ENSPEMG00000008283	Syf2	90	56.818	FBgn0033556	CG12343	97	55.455	Drosophila_melanogaster
ENSPEMG00000008283	Syf2	94	77.293	ENSETEG00000015729	SYF2	100	78.166	Echinops_telfairi
ENSPEMG00000008283	Syf2	81	59.391	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.391	Eptatretus_burgeri
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	81.481	ENSEASG00005004232	-	100	81.481	Equus_asinus_asinus
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	91.837	ENSEASG00005004224	-	100	91.837	Equus_asinus_asinus
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	92.245	ENSECAG00000012023	-	100	92.245	Equus_caballus
ENSPEMG00000008283	Syf2	96	93.191	ENSECAG00000010440	-	98	93.191	Equus_caballus
ENSPEMG00000008283	Syf2	75	79.235	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	79.235	Erinaceus_europaeus
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	80.247	ENSELUG00000003465	syf2	99	80.247	Esox_lucius
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	91.837	ENSFCAG00000010324	-	85	91.837	Felis_catus
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	91.463	ENSFCAG00000043095	-	100	91.463	Felis_catus
ENSPEMG00000008283	Syf2	84	84.314	ENSFALG00000000460	SYF2	93	80.687	Ficedula_albicollis
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	92.593	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	92.593	Fukomys_damarensis
ENSPEMG00000008283	Syf2	92	67.411	ENSFHEG00000007238	syf2	99	67.411	Fundulus_heteroclitus
ENSPEMG00000008283	Syf2	90	84.404	ENSGMOG00000019138	syf2	96	85.581	Gadus_morhua
ENSPEMG00000008283	Syf2	93	88.000	ENSGALG00000013639	SYF2	93	85.897	Gallus_gallus
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	75.620	ENSGAFG00000019435	syf2	100	75.620	Gambusia_affinis
ENSPEMG00000008283	Syf2	89	84.186	ENSGACG00000007305	syf2	99	77.824	Gasterosteus_aculeatus
ENSPEMG00000008283	Syf2	93	88.444	ENSGAGG00000010670	SYF2	92	87.719	Gopherus_agassizii
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	91.358	ENSGGOG00000012796	SYF2	100	91.358	Gorilla_gorilla
ENSPEMG00000008283	Syf2	96	79.399	ENSHBUG00000020477	syf2	99	79.399	Haplochromis_burtoni
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	91.393	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	91.393	Heterocephalus_glaber_female
ENSPEMG00000008283	Syf2	93	81.696	ENSHGLG00000004304	-	100	76.446	Heterocephalus_glaber_female
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	91.393	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	91.393	Heterocephalus_glaber_male
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	77.778	ENSHCOG00000012904	syf2	78	77.778	Hippocampus_comes
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	79.752	ENSIPUG00000019859	syf2	100	79.752	Ictalurus_punctatus
ENSPEMG00000008283	Syf2	60	93.836	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	93.836	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPEMG00000008283	Syf2	82	96.985	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	96.985	Jaculus_jaculus
ENSPEMG00000008283	Syf2	96	78.390	ENSKMAG00000013856	syf2	99	78.390	Kryptolebias_marmoratus
ENSPEMG00000008283	Syf2	90	84.018	ENSLBEG00000014425	syf2	100	78.512	Labrus_bergylta
ENSPEMG00000008283	Syf2	94	82.379	ENSLACG00000012064	SYF2	95	82.379	Latimeria_chalumnae
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	81.405	ENSLOCG00000002728	syf2	95	81.405	Lepisosteus_oculatus
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	91.429	ENSLAFG00000023150	-	100	91.429	Loxodonta_africana
ENSPEMG00000008283	Syf2	76	63.043	ENSLAFG00000030814	-	100	63.043	Loxodonta_africana
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	90.535	ENSMFAG00000041831	SYF2	100	90.535	Macaca_fascicularis
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	90.947	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	90.947	Macaca_mulatta
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	90.535	ENSMNEG00000030180	SYF2	100	90.535	Macaca_nemestrina
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	90.123	ENSMLEG00000030248	SYF2	100	90.123	Mandrillus_leucophaeus
ENSPEMG00000008283	Syf2	90	82.488	ENSMAMG00000010403	syf2	98	77.686	Mastacembelus_armatus
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	77.273	ENSMZEG00005006429	syf2	100	77.273	Maylandia_zebra
ENSPEMG00000008283	Syf2	82	87.940	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	87.940	Meleagris_gallopavo
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	97.934	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	97.934	Mesocricetus_auratus
ENSPEMG00000008283	Syf2	82	96.482	ENSMICG00000016191	SYF2	100	96.482	Microcebus_murinus
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	99.174	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	99.174	Microtus_ochrogaster
ENSPEMG00000008283	Syf2	96	77.682	ENSMMOG00000002396	syf2	97	77.682	Mola_mola
ENSPEMG00000008283	Syf2	93	87.336	ENSMODG00000013951	-	100	87.336	Monodelphis_domestica
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	77.366	ENSMALG00000010706	syf2	100	76.132	Monopterus_albus
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	97.521	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	97.521	Mus_caroli
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	97.521	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	97.521	Mus_musculus
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	97.521	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	97.521	Mus_pahari
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	97.521	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	97.521	Mus_spretus
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	89.837	ENSMPUG00000015801	-	100	89.837	Mustela_putorius_furo
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	90.650	ENSMPUG00000015802	-	100	90.650	Mustela_putorius_furo
ENSPEMG00000008283	Syf2	99	89.583	ENSMLUG00000001885	SYF2	98	89.583	Myotis_lucifugus
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	93.902	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	93.902	Nannospalax_galili
ENSPEMG00000008283	Syf2	96	72.414	ENSNBRG00000010720	syf2	96	72.414	Neolamprologus_brichardi
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	91.358	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	91.358	Nomascus_leucogenys
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	92.593	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	92.593	Ochotona_princeps
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	80.738	ENSODEG00000014338	-	100	80.738	Octodon_degus
ENSPEMG00000008283	Syf2	98	91.102	ENSODEG00000017664	-	98	91.102	Octodon_degus
ENSPEMG00000008283	Syf2	92	81.081	ENSONIG00000008213	syf2	100	77.273	Oreochromis_niloticus
ENSPEMG00000008283	Syf2	83	90.099	ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.099	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	93.033	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.033	Oryctolagus_cuniculus
ENSPEMG00000008283	Syf2	92	81.532	ENSORLG00000028820	syf2	94	82.648	Oryzias_latipes
ENSPEMG00000008283	Syf2	99	77.500	ENSORLG00020018333	syf2	99	77.500	Oryzias_latipes_hni
ENSPEMG00000008283	Syf2	99	78.333	ENSORLG00015014665	syf2	99	78.333	Oryzias_latipes_hsok
ENSPEMG00000008283	Syf2	99	78.661	ENSOMEG00000013911	syf2	99	78.661	Oryzias_melastigma
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	93.443	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	93.443	Otolemur_garnettii
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	91.498	ENSOARG00000006348	-	100	91.498	Ovis_aries
ENSPEMG00000008283	Syf2	81	65.128	ENSOARG00000006269	-	100	64.615	Ovis_aries
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	91.358	ENSPPAG00000036579	SYF2	100	91.358	Pan_paniscus
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	91.463	ENSPPRG00000001651	-	100	91.463	Panthera_pardus
ENSPEMG00000008283	Syf2	99	90.984	ENSPPRG00000001638	-	99	90.984	Panthera_pardus
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	91.463	ENSPTIG00000007036	-	100	91.463	Panthera_tigris_altaica
ENSPEMG00000008283	Syf2	89	96.296	ENSPTIG00000005711	-	81	95.067	Panthera_tigris_altaica
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	91.358	ENSPTRG00000000352	SYF2	100	91.358	Pan_troglodytes
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	90.535	ENSPANG00000008139	SYF2	100	90.535	Papio_anubis
ENSPEMG00000008283	Syf2	91	84.615	ENSPKIG00000008130	syf2	94	84.615	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPEMG00000008283	Syf2	99	83.402	ENSPSIG00000011816	SYF2	94	83.402	Pelodiscus_sinensis
ENSPEMG00000008283	Syf2	93	81.250	ENSPMGG00000008755	syf2	88	81.250	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPEMG00000008283	Syf2	93	91.518	ENSPCIG00000014235	SYF2	100	85.200	Phascolarctos_cinereus
ENSPEMG00000008283	Syf2	96	77.682	ENSPFOG00000004116	syf2	95	77.682	Poecilia_formosa
ENSPEMG00000008283	Syf2	97	77.447	ENSPLAG00000006691	syf2	100	77.447	Poecilia_latipinna
ENSPEMG00000008283	Syf2	99	73.444	ENSPMEG00000011684	syf2	98	75.652	Poecilia_mexicana
ENSPEMG00000008283	Syf2	89	81.944	ENSPREG00000003009	syf2	100	75.620	Poecilia_reticulata
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	91.358	ENSPPYG00000001713	SYF2	100	91.358	Pongo_abelii
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	63.786	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	63.374	Propithecus_coquereli
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	79.592	ENSPVAG00000005841	SYF2	100	79.592	Pteropus_vampyrus
ENSPEMG00000008283	Syf2	92	81.081	ENSPNYG00000004979	syf2	99	77.824	Pundamilia_nyererei
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	81.405	ENSPNAG00000015570	syf2	100	81.405	Pygocentrus_nattereri
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	97.521	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	97.521	Rattus_norvegicus
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	88.889	ENSRBIG00000042970	SYF2	100	88.066	Rhinopithecus_bieti
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	90.535	ENSRROG00000001347	SYF2	100	90.535	Rhinopithecus_roxellana
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	91.358	ENSSBOG00000020184	SYF2	100	91.358	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPEMG00000008283	Syf2	85	91.262	ENSSHAG00000007152	-	100	91.262	Sarcophilus_harrisii
ENSPEMG00000008283	Syf2	93	90.308	ENSSHAG00000015630	-	100	84.337	Sarcophilus_harrisii
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	79.752	ENSSFOG00015023647	syf2	100	79.752	Scleropages_formosus
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	76.033	ENSSMAG00000009867	syf2	100	76.033	Scophthalmus_maximus
ENSPEMG00000008283	Syf2	90	83.486	ENSSDUG00000013072	syf2	100	77.459	Seriola_dumerili
ENSPEMG00000008283	Syf2	90	83.486	ENSSLDG00000012677	syf2	100	77.459	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	73.361	ENSSARG00000012889	SYF2	100	73.361	Sorex_araneus
ENSPEMG00000008283	Syf2	93	87.500	ENSSPUG00000005251	SYF2	89	87.500	Sphenodon_punctatus
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	78.099	ENSSPAG00000009626	syf2	100	78.099	Stegastes_partitus
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	92.245	ENSSSCG00000037481	SYF2	100	92.245	Sus_scrofa
ENSPEMG00000008283	Syf2	62	58.278	ENSTGUG00000001126	SYF2	85	58.235	Taeniopygia_guttata
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	76.033	ENSTRUG00000001499	syf2	95	76.151	Takifugu_rubripes
ENSPEMG00000008283	Syf2	92	79.372	ENSTNIG00000016912	syf2	100	79.372	Tetraodon_nigroviridis
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	71.605	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.959	Tupaia_belangeri
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	92.623	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	92.623	Tursiops_truncatus
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	89.837	ENSUAMG00000002897	SYF2	100	89.837	Ursus_americanus
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	89.431	ENSUMAG00000013108	SYF2	100	90.244	Ursus_maritimus
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	91.393	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	91.393	Vicugna_pacos
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	89.837	ENSVVUG00000027175	-	100	89.837	Vulpes_vulpes
ENSPEMG00000008283	Syf2	100	87.500	ENSVVUG00000027181	-	100	87.500	Vulpes_vulpes
ENSPEMG00000008283	Syf2	95	83.843	ENSXETG00000022797	syf2	92	83.843	Xenopus_tropicalis
ENSPEMG00000008283	Syf2	89	81.860	ENSXMAG00000022698	syf2	100	75.207	Xiphophorus_maculatus