EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPEMG00000010834 (Gene tree)
Gene ID: 102904286
Gene Symbol: Srrt
Alias: -
Full Name: serrate%2C RNA effector molecule
Gene Type: protein_coding
Species: Peromyscus_maniculatus_bairdii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9847 bases
Position: chrKI615328.1:973419-983265
Accession: 102904286
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPEMP00000009596	ARS2	PF04959.13	1.7e-91	1	1
ENSPEMP00000009600	ARS2	PF04959.13	3.6e-91	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPEMT00000013771	-	1509	-	ENSPEMP00000009600	502 (aa)	-	-
ENSPEMT00000013767	-	2595	XM_006971243	ENSPEMP00000009596	864 (aa)	XP_006971305	-

Gene Model

Click here to download ENSPEMG00000010834's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPEMG00000010834's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	96.674	ENSG00000087087	SRRT	100	98.196	Homo_sapiens
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	72.944	ENSAPOG00000002304	srrt	51	77.143	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	93.617	ENSAMEG00000014506	SRRT	100	93.617	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	72.727	ENSACIG00000015795	srrt	85	76.923	Amphilophus_citrinellus
ENSPEMG00000010834	Srrt	93	59.343	ENSAOCG00000009189	-	96	57.858	Amphiprion_ocellaris
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	73.160	ENSAOCG00000009693	srrt	83	77.363	Amphiprion_ocellaris
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	72.727	ENSAPEG00000003646	srrt	85	76.923	Amphiprion_percula
ENSPEMG00000010834	Srrt	93	59.343	ENSAPEG00000020016	-	96	57.858	Amphiprion_percula
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	70.563	ENSATEG00000014425	srrt	83	75.824	Anabas_testudineus
ENSPEMG00000010834	Srrt	93	58.586	ENSATEG00000003652	-	85	64.530	Anabas_testudineus
ENSPEMG00000010834	Srrt	95	77.071	ENSACAG00000001014	SRRT	96	76.492	Anolis_carolinensis
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	95.548	ENSANAG00000031718	SRRT	100	95.548	Aotus_nancymaae
ENSPEMG00000010834	Srrt	93	58.045	ENSACLG00000009423	-	52	64.363	Astatotilapia_calliptera
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	71.429	ENSACLG00000013156	srrt	50	75.604	Astatotilapia_calliptera
ENSPEMG00000010834	Srrt	87	71.991	ENSAMXG00000016671	srrt	93	64.344	Astyanax_mexicanus
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	92.678	ENSBTAG00000001134	SRRT	98	93.692	Bos_taurus
ENSPEMG00000010834	Srrt	76	41.844	WBGene00017085	E01A2.2	85	42.437	Caenorhabditis_elegans
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	95.320	ENSCJAG00000014917	SRRT	100	95.320	Callithrix_jacchus
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	95.320	ENSCAFG00000023538	SRRT	100	95.320	Canis_familiaris
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	95.872	ENSCAFG00020013358	SRRT	100	95.872	Canis_lupus_dingo
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	93.398	ENSCHIG00000010495	SRRT	98	93.808	Capra_hircus
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	93.981	ENSTSYG00000036426	SRRT	99	91.827	Carlito_syrichta
ENSPEMG00000010834	Srrt	95	95.990	ENSCAPG00000013586	SRRT	100	95.990	Cavia_aperea
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	95.097	ENSCPOG00000001739	SRRT	100	95.097	Cavia_porcellus
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	95.662	ENSCCAG00000015877	SRRT	100	95.662	Cebus_capucinus
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	96.216	ENSCATG00000036306	SRRT	100	96.216	Cercocebus_atys
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	96.063	ENSCLAG00000007568	SRRT	100	96.063	Chinchilla_lanigera
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	95.776	ENSCSAG00000017996	SRRT	100	95.776	Chlorocebus_sabaeus
ENSPEMG00000010834	Srrt	64	83.086	ENSCHOG00000007815	SRRT	68	90.643	Choloepus_hoffmanni
ENSPEMG00000010834	Srrt	73	84.000	ENSCPBG00000011553	SRRT	83	81.343	Chrysemys_picta_bellii
ENSPEMG00000010834	Srrt	97	47.328	ENSCING00000003506	-	54	51.046	Ciona_intestinalis
ENSPEMG00000010834	Srrt	99	45.349	ENSCSAVG00000008394	-	81	54.039	Ciona_savignyi
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	96.216	ENSCANG00000034556	SRRT	100	96.216	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	96.351	ENSCGRG00001001594	Srrt	100	96.351	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	95.340	ENSCGRG00000007292	Srrt	100	95.340	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPEMG00000010834	Srrt	96	61.789	ENSCSEG00000017878	srrt	50	69.623	Cynoglossus_semilaevis
ENSPEMG00000010834	Srrt	93	57.172	ENSCSEG00000005233	-	54	63.067	Cynoglossus_semilaevis
ENSPEMG00000010834	Srrt	90	56.266	ENSCVAG00000017344	-	51	63.657	Cyprinodon_variegatus
ENSPEMG00000010834	Srrt	98	65.970	ENSCVAG00000019848	srrt	54	76.044	Cyprinodon_variegatus
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	72.786	ENSDARG00000017762	srrt	96	67.202	Danio_rerio
ENSPEMG00000010834	Srrt	98	94.159	ENSDNOG00000003851	SRRT	98	94.276	Dasypus_novemcinctus
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	93.592	ENSDORG00000005584	Srrt	98	94.712	Dipodomys_ordii
ENSPEMG00000010834	Srrt	95	47.461	FBgn0033062	Ars2	67	52.495	Drosophila_melanogaster
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	89.753	ENSETEG00000016175	SRRT	82	92.208	Echinops_telfairi
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	59.565	ENSEBUG00000008517	-	76	66.667	Eptatretus_burgeri
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	95.205	ENSEASG00005016956	SRRT	100	95.205	Equus_asinus_asinus
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	95.205	ENSECAG00000012292	SRRT	100	95.205	Equus_caballus
ENSPEMG00000010834	Srrt	84	98.485	ENSEEUG00000009117	SRRT	85	98.485	Erinaceus_europaeus
ENSPEMG00000010834	Srrt	91	58.980	ENSELUG00000021216	-	53	65.042	Esox_lucius
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	70.968	ENSELUG00000006651	srrt	50	71.613	Esox_lucius
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	95.434	ENSFCAG00000006855	SRRT	100	95.434	Felis_catus
ENSPEMG00000010834	Srrt	57	52.980	ENSFALG00000007524	-	84	68.478	Ficedula_albicollis
ENSPEMG00000010834	Srrt	98	92.426	ENSFDAG00000021347	SRRT	98	92.663	Fukomys_damarensis
ENSPEMG00000010834	Srrt	85	71.854	ENSFHEG00000002756	srrt	86	76.724	Fundulus_heteroclitus
ENSPEMG00000010834	Srrt	93	56.933	ENSFHEG00000004105	-	93	57.987	Fundulus_heteroclitus
ENSPEMG00000010834	Srrt	82	62.679	ENSGMOG00000018694	-	53	59.161	Gadus_morhua
ENSPEMG00000010834	Srrt	95	61.021	ENSGMOG00000018619	srrt	51	71.616	Gadus_morhua
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	71.645	ENSGAFG00000005423	srrt	51	76.044	Gambusia_affinis
ENSPEMG00000010834	Srrt	92	55.187	ENSGAFG00000020383	-	54	61.039	Gambusia_affinis
ENSPEMG00000010834	Srrt	94	54.767	ENSGACG00000001100	-	53	61.803	Gasterosteus_aculeatus
ENSPEMG00000010834	Srrt	95	68.889	ENSGACG00000020387	srrt	51	75.764	Gasterosteus_aculeatus
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	96.119	ENSGGOG00000001508	SRRT	99	96.119	Gorilla_gorilla
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	71.645	ENSHBUG00000002942	srrt	50	75.824	Haplochromis_burtoni
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	95.285	ENSHGLG00000008344	Srrt	100	94.118	Heterocephalus_glaber_female
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	96.245	ENSHGLG00100018857	Srrt	100	96.245	Heterocephalus_glaber_male
ENSPEMG00000010834	Srrt	98	64.261	ENSHCOG00000005403	srrt	96	62.648	Hippocampus_comes
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	58.009	ENSHCOG00000008904	-	56	61.171	Hippocampus_comes
ENSPEMG00000010834	Srrt	52	78.166	ENSIPUG00000021150	srrt	51	78.166	Ictalurus_punctatus
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	96.216	ENSSTOG00000013776	SRRT	100	96.216	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	95.661	ENSJJAG00000010446	Srrt	100	95.661	Jaculus_jaculus
ENSPEMG00000010834	Srrt	93	57.426	ENSKMAG00000008468	-	53	62.316	Kryptolebias_marmoratus
ENSPEMG00000010834	Srrt	92	69.538	ENSKMAG00000013599	srrt	54	75.824	Kryptolebias_marmoratus
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	71.706	ENSLBEG00000016308	srrt	54	76.573	Labrus_bergylta
ENSPEMG00000010834	Srrt	95	64.192	ENSLACG00000001089	SRRT	96	63.722	Latimeria_chalumnae
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	66.964	ENSLOCG00000013658	srrt	52	70.549	Lepisosteus_oculatus
ENSPEMG00000010834	Srrt	98	93.801	ENSLAFG00000007725	SRRT	98	93.684	Loxodonta_africana
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	96.330	ENSMFAG00000033745	SRRT	100	96.330	Macaca_fascicularis
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	95.776	ENSMMUG00000021255	SRRT	100	95.776	Macaca_mulatta
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	95.776	ENSMNEG00000041864	SRRT	100	95.776	Macaca_nemestrina
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	96.330	ENSMLEG00000029479	SRRT	100	96.330	Mandrillus_leucophaeus
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	70.716	ENSMAMG00000014311	srrt	51	76.211	Mastacembelus_armatus
ENSPEMG00000010834	Srrt	93	58.452	ENSMAMG00000010681	-	96	57.547	Mastacembelus_armatus
ENSPEMG00000010834	Srrt	93	58.045	ENSMZEG00005028002	-	52	64.363	Maylandia_zebra
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	71.429	ENSMZEG00005016135	srrt	50	75.604	Maylandia_zebra
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	96.229	ENSMAUG00000011386	Srrt	100	96.229	Mesocricetus_auratus
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	95.548	ENSMICG00000009471	SRRT	100	95.548	Microcebus_murinus
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	96.686	ENSMOCG00000001971	Srrt	100	96.686	Microtus_ochrogaster
ENSPEMG00000010834	Srrt	99	66.990	ENSMMOG00000016399	srrt	54	76.044	Mola_mola
ENSPEMG00000010834	Srrt	90	61.834	ENSMMOG00000011137	-	55	64.924	Mola_mola
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	84.322	ENSMODG00000004862	SRRT	90	90.084	Monodelphis_domestica
ENSPEMG00000010834	Srrt	99	50.704	ENSMALG00000005567	-	84	53.437	Monopterus_albus
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	67.028	ENSMALG00000018604	srrt	80	72.247	Monopterus_albus
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	97.917	MGP_CAROLIEiJ_G0027870	Srrt	100	99.627	Mus_caroli
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	97.917	ENSMUSG00000037364	Srrt	99	99.627	Mus_musculus
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	97.569	MGP_PahariEiJ_G0024456	Srrt	100	99.254	Mus_pahari
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	97.917	MGP_SPRETEiJ_G0028875	Srrt	100	99.627	Mus_spretus
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	95.320	ENSMPUG00000015839	SRRT	100	95.320	Mustela_putorius_furo
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	95.434	ENSMLUG00000009975	SRRT	100	95.434	Myotis_lucifugus
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	96.114	ENSNGAG00000023715	Srrt	100	96.114	Nannospalax_galili
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	70.652	ENSNBRG00000019100	srrt	52	74.670	Neolamprologus_brichardi
ENSPEMG00000010834	Srrt	95	85.611	ENSNLEG00000011987	SRRT	99	84.371	Nomascus_leucogenys
ENSPEMG00000010834	Srrt	98	73.893	ENSMEUG00000011941	SRRT	98	71.795	Notamacropus_eugenii
ENSPEMG00000010834	Srrt	82	87.500	ENSOPRG00000002502	-	67	97.710	Ochotona_princeps
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	96.759	ENSODEG00000016856	SRRT	100	96.759	Octodon_degus
ENSPEMG00000010834	Srrt	93	58.502	ENSONIG00000016080	-	52	64.086	Oreochromis_niloticus
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	71.861	ENSONIG00000004242	srrt	52	75.108	Oreochromis_niloticus
ENSPEMG00000010834	Srrt	95	68.496	ENSORLG00000008120	srrt	52	75.385	Oryzias_latipes
ENSPEMG00000010834	Srrt	96	66.511	ENSORLG00020003058	srrt	52	75.165	Oryzias_latipes_hni
ENSPEMG00000010834	Srrt	95	68.293	ENSORLG00015008062	srrt	52	75.165	Oryzias_latipes_hsok
ENSPEMG00000010834	Srrt	97	68.254	ENSOMEG00000003155	srrt	89	75.604	Oryzias_melastigma
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	60.256	ENSOMEG00000006963	-	53	64.859	Oryzias_melastigma
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	95.662	ENSOGAG00000017242	SRRT	100	95.662	Otolemur_garnettii
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	93.398	ENSOARG00000015645	SRRT	98	94.366	Ovis_aries
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	96.560	ENSPPAG00000041090	SRRT	100	96.560	Pan_paniscus
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	95.413	ENSPPRG00000009557	SRRT	100	95.413	Panthera_pardus
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	95.548	ENSPTIG00000014355	SRRT	100	95.548	Panthera_tigris_altaica
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	96.560	ENSPTRG00000019511	SRRT	100	96.560	Pan_troglodytes
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	92.410	ENSPANG00000020763	SRRT	98	93.256	Papio_anubis
ENSPEMG00000010834	Srrt	94	66.909	ENSPKIG00000022212	-	52	76.703	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPEMG00000010834	Srrt	96	71.717	ENSPKIG00000005434	srrt	54	79.221	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	78.695	ENSPSIG00000016311	SRRT	96	80.144	Pelodiscus_sinensis
ENSPEMG00000010834	Srrt	96	66.029	ENSPMGG00000002841	srrt	56	72.885	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPEMG00000010834	Srrt	99	58.541	ENSPMAG00000009614	-	55	63.848	Petromyzon_marinus
ENSPEMG00000010834	Srrt	98	88.966	ENSPCIG00000000816	SRRT	98	89.895	Phascolarctos_cinereus
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	71.706	ENSPFOG00000005704	srrt	96	65.029	Poecilia_formosa
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	56.838	ENSPFOG00000016554	-	54	61.472	Poecilia_formosa
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	71.212	ENSPLAG00000021992	srrt	96	64.610	Poecilia_latipinna
ENSPEMG00000010834	Srrt	92	53.827	ENSPLAG00000004526	-	55	61.123	Poecilia_latipinna
ENSPEMG00000010834	Srrt	90	52.934	ENSPMEG00000001520	-	53	60.412	Poecilia_mexicana
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	71.274	ENSPMEG00000001182	srrt	96	65.105	Poecilia_mexicana
ENSPEMG00000010834	Srrt	99	65.660	ENSPREG00000022308	srrt	51	75.877	Poecilia_reticulata
ENSPEMG00000010834	Srrt	98	84.579	ENSPPYG00000017432	SRRT	98	85.047	Pongo_abelii
ENSPEMG00000010834	Srrt	98	90.509	ENSPCAG00000001621	SRRT	98	90.509	Procavia_capensis
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	95.662	ENSPCOG00000025751	SRRT	100	95.662	Propithecus_coquereli
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	88.632	ENSPVAG00000000834	SRRT	100	87.794	Pteropus_vampyrus
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	71.429	ENSPNYG00000018710	srrt	52	75.604	Pundamilia_nyererei
ENSPEMG00000010834	Srrt	78	77.333	ENSPNAG00000010629	srrt	95	54.909	Pygocentrus_nattereri
ENSPEMG00000010834	Srrt	90	85.867	ENSRNOG00000048277	AABR07035787.1	93	86.207	Rattus_norvegicus
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	95.776	ENSRBIG00000035718	SRRT	100	95.776	Rhinopithecus_bieti
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	95.776	ENSRROG00000030622	SRRT	100	95.776	Rhinopithecus_roxellana
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	95.662	ENSSBOG00000033570	SRRT	100	95.662	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	86.312	ENSSHAG00000007349	-	100	85.354	Sarcophilus_harrisii
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	75.541	ENSSFOG00015017293	srrt	96	69.838	Scleropages_formosus
ENSPEMG00000010834	Srrt	95	66.350	ENSSMAG00000015342	srrt	96	65.957	Scophthalmus_maximus
ENSPEMG00000010834	Srrt	90	57.806	ENSSMAG00000018195	-	87	62.017	Scophthalmus_maximus
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	71.645	ENSSDUG00000012049	srrt	91	65.768	Seriola_dumerili
ENSPEMG00000010834	Srrt	92	54.639	ENSSDUG00000002051	-	94	55.297	Seriola_dumerili
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	71.429	ENSSLDG00000017477	srrt	81	76.703	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	71.828	ENSSPAG00000005665	srrt	51	75.983	Stegastes_partitus
ENSPEMG00000010834	Srrt	90	56.236	ENSSPAG00000018943	-	93	57.642	Stegastes_partitus
ENSPEMG00000010834	Srrt	95	92.261	ENSSSCG00000024789	SRRT	99	92.298	Sus_scrofa
ENSPEMG00000010834	Srrt	90	54.707	ENSTRUG00000000023	-	51	60.641	Takifugu_rubripes
ENSPEMG00000010834	Srrt	96	64.706	ENSTRUG00000016075	srrt	96	65.928	Takifugu_rubripes
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	70.513	ENSTNIG00000011779	srrt	72	74.098	Tetraodon_nigroviridis
ENSPEMG00000010834	Srrt	64	58.284	ENSTNIG00000019765	-	95	64.038	Tetraodon_nigroviridis
ENSPEMG00000010834	Srrt	93	55.781	ENSTNIG00000003111	-	96	52.791	Tetraodon_nigroviridis
ENSPEMG00000010834	Srrt	81	89.973	ENSTBEG00000005212	SRRT	62	95.935	Tupaia_belangeri
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	94.178	ENSTTRG00000011104	SRRT	98	94.626	Tursiops_truncatus
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	93.642	ENSUAMG00000027997	SRRT	98	95.215	Ursus_americanus
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	95.434	ENSUMAG00000011295	SRRT	100	95.434	Ursus_maritimus
ENSPEMG00000010834	Srrt	100	95.320	ENSVVUG00000023572	SRRT	100	95.320	Vulpes_vulpes
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	71.888	ENSXETG00000025124	srrt	96	62.089	Xenopus_tropicalis
ENSPEMG00000010834	Srrt	89	52.328	ENSXCOG00000013105	-	90	52.550	Xiphophorus_couchianus
ENSPEMG00000010834	Srrt	96	65.533	ENSXMAG00000007627	srrt	96	65.176	Xiphophorus_maculatus
ENSPEMG00000010834	Srrt	92	55.394	ENSXMAG00000002090	-	54	62.174	Xiphophorus_maculatus