EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPEMG00000012100 (Gene tree)
Gene ID: 102910674
Gene Symbol: Xpo6
Alias: -
Full Name: exportin 6
Gene Type: protein_coding
Species: Peromyscus_maniculatus_bairdii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 115140 bases
Position: chrKI615459.1:5527167-5642306
Accession: 102910674
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPEMP00000011487	Xpo1	PF08389.12	1.2e-25	1	1
ENSPEMP00000011480	Xpo1	PF08389.12	5.2e-25	1	1
ENSPEMP00000011480	IBN_N	PF03810.19	8.8e-09	1	1
ENSPEMP00000011487	IBN_N	PF03810.19	9.9e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPEMT00000015667	-	4266	XM_006980372	ENSPEMP00000011480	1125 (aa)	XP_006980434	UPI00042AA9F6
ENSPEMT00000015674	-	3270	-	ENSPEMP00000011487	1089 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	97.244	ENSG00000169180	XPO6	100	100.000	Homo_sapiens
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	75.931	ENSAPOG00000012873	xpo6	100	76.302	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	96.708	ENSAMEG00000011014	XPO6	100	96.708	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	76.418	ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.507	Amphilophus_citrinellus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	77.422	ENSAOCG00000001326	xpo6	100	76.476	Amphiprion_ocellaris
ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	77.333	ENSAPEG00000016304	xpo6	100	76.389	Amphiprion_percula
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	77.128	ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.080	Anabas_testudineus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	93.772	ENSAPLG00000007480	XPO6	99	93.772	Anas_platyrhynchos
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	79.878	ENSACAG00000016883	XPO6	100	79.878	Anolis_carolinensis
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	97.156	ENSANAG00000031761	XPO6	100	97.156	Aotus_nancymaae
ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	77.094	ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.094	Astatotilapia_calliptera
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	72.609	ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.609	Astyanax_mexicanus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	96.622	ENSBTAG00000010309	XPO6	100	96.622	Bos_taurus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	97.156	ENSCJAG00000006014	XPO6	100	97.156	Callithrix_jacchus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	96.975	ENSCAFG00000017356	XPO6	100	96.975	Canis_familiaris
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	97.067	ENSCAFG00020011808	XPO6	100	97.241	Canis_lupus_dingo
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	96.800	ENSCHIG00000022341	XPO6	100	96.800	Capra_hircus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	92.596	ENSTSYG00000012249	XPO6	100	92.596	Carlito_syrichta
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	96.889	ENSCPOG00000012824	XPO6	100	96.889	Cavia_porcellus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	97.067	ENSCCAG00000036360	XPO6	100	97.067	Cebus_capucinus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	97.422	ENSCATG00000034030	XPO6	100	97.422	Cercocebus_atys
ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	96.797	ENSCLAG00000012270	XPO6	100	96.797	Chinchilla_lanigera
ENSPEMG00000012100	Xpo6	91	95.939	ENSCHOG00000004369	XPO6	91	95.939	Choloepus_hoffmanni
ENSPEMG00000012100	Xpo6	89	92.685	ENSCPBG00000024660	XPO6	99	97.059	Chrysemys_picta_bellii
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	47.378	ENSCING00000006884	-	100	47.378	Ciona_intestinalis
ENSPEMG00000012100	Xpo6	98	50.831	ENSCSAVG00000000850	-	99	46.845	Ciona_savignyi
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	97.244	ENSCANG00000041578	XPO6	100	97.244	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	98.756	ENSCGRG00001013173	Xpo6	100	98.756	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	76.288	ENSCSEG00000013622	xpo6	100	76.288	Cynoglossus_semilaevis
ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	76.169	ENSCVAG00000017399	xpo6	100	76.169	Cyprinodon_variegatus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	97	71.634	ENSDARG00000041217	xpo6	99	71.634	Danio_rerio
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	96.800	ENSDNOG00000012449	XPO6	100	96.800	Dasypus_novemcinctus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	96.711	ENSDORG00000000919	Xpo6	100	96.711	Dipodomys_ordii
ENSPEMG00000012100	Xpo6	85	95.367	ENSETEG00000018768	XPO6	85	95.367	Echinops_telfairi
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	61.681	ENSEBUG00000015560	xpo6	99	61.736	Eptatretus_burgeri
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	96.711	ENSEASG00005017296	XPO6	100	96.711	Equus_asinus_asinus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	96.622	ENSECAG00000008601	XPO6	100	96.622	Equus_caballus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	97	89.551	ENSEEUG00000014587	XPO6	100	89.551	Erinaceus_europaeus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	78.409	ENSELUG00000009159	xpo6	100	78.409	Esox_lucius
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	96.978	ENSFCAG00000010309	XPO6	100	96.978	Felis_catus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	91.608	ENSFALG00000004441	XPO6	98	91.608	Ficedula_albicollis
ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	96.530	ENSFDAG00000012689	XPO6	100	96.530	Fukomys_damarensis
ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	75.975	ENSFHEG00000021190	xpo6	99	75.975	Fundulus_heteroclitus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	93.422	ENSGALG00000035360	XPO6	100	93.422	Gallus_gallus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	74.739	ENSGAFG00000004044	xpo6	100	74.739	Gambusia_affinis
ENSPEMG00000012100	Xpo6	95	93.621	ENSGAGG00000022738	XPO6	100	93.621	Gopherus_agassizii
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	97.156	ENSGGOG00000005609	XPO6	100	97.156	Gorilla_gorilla
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	75.521	ENSHBUG00000019504	xpo6	100	75.868	Haplochromis_burtoni
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	96.711	ENSHGLG00000009679	-	100	96.711	Heterocephalus_glaber_female
ENSPEMG00000012100	Xpo6	94	79.022	ENSHGLG00000003865	-	99	79.022	Heterocephalus_glaber_female
ENSPEMG00000012100	Xpo6	94	82.177	ENSHGLG00100001081	-	99	82.177	Heterocephalus_glaber_male
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	96.622	ENSHGLG00100003673	-	99	96.622	Heterocephalus_glaber_male
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	75.087	ENSHCOG00000004987	xpo6	100	75.261	Hippocampus_comes
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	72.203	ENSIPUG00000006516	xpo6	100	72.203	Ictalurus_punctatus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	97.333	ENSSTOG00000012161	XPO6	100	97.333	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	96.267	ENSJJAG00000019392	Xpo6	100	96.267	Jaculus_jaculus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	76.135	ENSKMAG00000010403	xpo6	99	76.135	Kryptolebias_marmoratus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	76.819	ENSLBEG00000023039	xpo6	99	76.819	Labrus_bergylta
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	85.511	ENSLACG00000017930	XPO6	100	85.511	Latimeria_chalumnae
ENSPEMG00000012100	Xpo6	94	81.232	ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.232	Lepisosteus_oculatus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	96.174	ENSLAFG00000011960	XPO6	100	96.174	Loxodonta_africana
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	97.422	ENSMFAG00000045067	XPO6	100	97.422	Macaca_fascicularis
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	97.422	ENSMMUG00000018623	XPO6	100	97.422	Macaca_mulatta
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	97.422	ENSMNEG00000028587	XPO6	100	97.422	Macaca_nemestrina
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	97.422	ENSMLEG00000029685	XPO6	100	97.422	Mandrillus_leucophaeus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	75.671	ENSMAMG00000001351	xpo6	100	76.288	Mastacembelus_armatus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	77.184	ENSMZEG00005010620	xpo6	99	77.184	Maylandia_zebra
ENSPEMG00000012100	Xpo6	97	92.707	ENSMGAG00000009566	XPO6	100	92.707	Meleagris_gallopavo
ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	88.293	ENSMAUG00000012539	Xpo6	100	88.293	Mesocricetus_auratus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	97.511	ENSMICG00000001923	XPO6	100	97.511	Microcebus_murinus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	98.578	ENSMOCG00000008015	Xpo6	100	98.578	Microtus_ochrogaster
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	76.732	ENSMMOG00000011992	xpo6	100	76.732	Mola_mola
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	94.400	ENSMODG00000015516	XPO6	100	94.400	Monodelphis_domestica
ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	70.593	ENSMALG00000020612	xpo6	99	70.859	Monopterus_albus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	98.667	MGP_CAROLIEiJ_G0030439	Xpo6	100	98.667	Mus_caroli
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	98.844	ENSMUSG00000000131	Xpo6	100	98.844	Mus_musculus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	98.667	MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	98.667	Mus_pahari
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	98.578	MGP_SPRETEiJ_G0031553	Xpo6	100	98.578	Mus_spretus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	95.907	ENSMPUG00000012920	XPO6	98	95.907	Mustela_putorius_furo
ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	96.174	ENSMLUG00000012970	XPO6	100	96.174	Myotis_lucifugus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	98.310	ENSNGAG00000012740	Xpo6	99	98.310	Nannospalax_galili
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	75.521	ENSNBRG00000007275	xpo6	100	75.868	Neolamprologus_brichardi
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	97.244	ENSNLEG00000011518	XPO6	100	97.244	Nomascus_leucogenys
ENSPEMG00000012100	Xpo6	87	95.607	ENSOPRG00000009278	XPO6	87	95.607	Ochotona_princeps
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	96.089	ENSODEG00000012917	XPO6	100	96.089	Octodon_degus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	75.347	ENSONIG00000019366	xpo6	100	75.608	Oreochromis_niloticus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	97.064	ENSOCUG00000002727	XPO6	100	97.064	Oryctolagus_cuniculus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	75.244	ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.244	Oryzias_latipes
ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	77.005	ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.005	Oryzias_latipes_hni
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	75.244	ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.244	Oryzias_latipes_hsok
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	75.391	ENSOMEG00000016505	xpo6	100	75.391	Oryzias_melastigma
ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	97.420	ENSOGAG00000012844	XPO6	100	97.420	Otolemur_garnettii
ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	96.797	ENSOARG00000000960	XPO6	100	96.797	Ovis_aries
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	97.156	ENSPPAG00000033668	XPO6	100	97.156	Pan_paniscus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	96.670	ENSPPRG00000001454	XPO6	100	96.670	Panthera_pardus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	97	96.041	ENSPTIG00000016663	XPO6	99	96.041	Panthera_tigris_altaica
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	97.156	ENSPTRG00000007919	XPO6	100	97.156	Pan_troglodytes
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	97.422	ENSPANG00000017103	XPO6	100	97.422	Papio_anubis
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	79.644	ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.644	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	91.457	ENSPSIG00000018225	XPO6	100	91.457	Pelodiscus_sinensis
ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	76.598	ENSPMGG00000014436	xpo6	100	76.598	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	99	71.265	ENSPMAG00000003127	xpo6	99	71.265	Petromyzon_marinus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	97	93.956	ENSPCIG00000003863	XPO6	100	93.991	Phascolarctos_cinereus
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	74.500	ENSPFOG00000008763	xpo6	100	74.500	Poecilia_formosa
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	74.477	ENSPLAG00000014054	xpo6	100	74.477	Poecilia_latipinna
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	74.477	ENSPMEG00000018994	xpo6	100	74.477	Poecilia_mexicana
ENSPEMG00000012100	Xpo6	97	74.127	ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.127	Poecilia_reticulata
ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	97.156	ENSPPYG00000007218	XPO6	100	97.156	Pongo_abelii
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