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Description

Ensembl ID: ENSPEMG00000016087 (Gene tree)
Gene ID: 102927564
Gene Symbol: Sbno1
Alias: -
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Peromyscus_maniculatus_bairdii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 38679 bases
Position: chrKI615323.1:3524779-3563457
Accession: 102927564
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPEMP00000017074	ResIII	PF04851.15	4.4e-08	1	1
ENSPEMP00000017070	ResIII	PF04851.15	5.7e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPEMT00000021388	-	5520	XM_006970692	ENSPEMP00000017070	1392 (aa)	XP_006970754	UPI00042AB696
ENSPEMT00000021392	-	3810	-	ENSPEMP00000017074	1269 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPEMG00000016087	Sbno1	82	56.670	ENSPEMG00000024122	Sbno2	70	67.574

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	98.373	ENSG00000139697	SBNO1	100	96.985	Homo_sapiens
ENSPEMG00000016087	Sbno1	84	82.531	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	80.241	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	97.206	ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	97.206	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	81.261	ENSACIG00000008088	sbno1	95	81.261	Amphilophus_citrinellus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	81.818	ENSAOCG00000014859	sbno1	94	81.818	Amphiprion_ocellaris
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	81.818	ENSAPEG00000006069	sbno1	94	81.818	Amphiprion_percula
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	84.116	ENSATEG00000006667	sbno1	95	84.116	Anabas_testudineus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	93.852	ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	91.248	Anas_platyrhynchos
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	92.473	ENSACAG00000015441	SBNO1	84	92.806	Anolis_carolinensis
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	97.830	ENSANAG00000029958	-	99	97.830	Aotus_nancymaae
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	73.838	ENSACLG00000024913	sbno1	100	73.932	Astatotilapia_calliptera
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	86.331	ENSAMXG00000019473	sbno1	95	86.331	Astyanax_mexicanus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	97.200	ENSBTAG00000020505	SBNO1	100	97.200	Bos_taurus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	98.192	ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	96.841	Callithrix_jacchus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	96.918	ENSCAFG00000007503	SBNO1	100	96.918	Canis_familiaris
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	96.693	ENSCAFG00020015363	SBNO1	100	96.693	Canis_lupus_dingo
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	97.480	ENSCHIG00000008382	SBNO1	100	97.480	Capra_hircus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	98.553	ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	97.344	Carlito_syrichta
ENSPEMG00000016087	Sbno1	97	98.011	ENSCAPG00000000384	SBNO1	100	96.844	Cavia_aperea
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	97.165	ENSCPOG00000008109	SBNO1	100	97.165	Cavia_porcellus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	93.724	ENSCCAG00000035316	SBNO1	100	92.468	Cebus_capucinus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	98.373	ENSCATG00000008239	SBNO1	98	98.373	Cercocebus_atys
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	97.244	ENSCLAG00000008995	SBNO1	100	97.244	Chinchilla_lanigera
ENSPEMG00000016087	Sbno1	84	97.153	ENSCSAG00000002064	SBNO1	100	97.927	Chlorocebus_sabaeus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	95	95.610	ENSCHOG00000008814	SBNO1	96	93.269	Choloepus_hoffmanni
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	93.548	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	91.385	Chrysemys_picta_bellii
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	91.613	ENSCANG00000042688	-	100	91.541	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	98.976	ENSCGRG00001017470	Sbno1	100	98.976	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	98.976	ENSCGRG00000004756	Sbno1	100	98.976	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	82.491	ENSCSEG00000011919	sbno1	96	81.640	Cynoglossus_semilaevis
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	82.616	ENSCVAG00000007038	sbno1	95	82.616	Cyprinodon_variegatus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	85.714	ENSDARG00000099080	sbno1	95	85.714	Danio_rerio
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	96.180	ENSDNOG00000017147	SBNO1	98	96.814	Dasypus_novemcinctus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	96.619	ENSDORG00000015261	Sbno1	95	96.619	Dipodomys_ordii
ENSPEMG00000016087	Sbno1	92	95.652	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.282	Echinops_telfairi
ENSPEMG00000016087	Sbno1	72	84.236	ENSEBUG00000013823	sbno1	85	84.236	Eptatretus_burgeri
ENSPEMG00000016087	Sbno1	54	94.323	ENSEASG00005012595	-	91	96.562	Equus_asinus_asinus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	97.416	ENSECAG00000006127	SBNO1	100	97.416	Equus_caballus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	83	97.814	ENSEEUG00000003793	SBNO1	83	97.814	Erinaceus_europaeus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	86.151	ENSELUG00000002886	sbno1	95	86.151	Esox_lucius
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	98.188	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	97.486	Felis_catus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	94.394	ENSFALG00000009273	SBNO1	100	91.463	Ficedula_albicollis
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	94.616	ENSFDAG00000014232	SBNO1	100	94.616	Fukomys_damarensis
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	82.975	ENSFHEG00000007360	sbno1	95	82.975	Fundulus_heteroclitus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	96	84.037	ENSGMOG00000018229	sbno1	98	84.037	Gadus_morhua
ENSPEMG00000016087	Sbno1	87	95.431	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	91.714	Gallus_gallus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	82.975	ENSGAFG00000003960	sbno1	95	82.975	Gambusia_affinis
ENSPEMG00000016087	Sbno1	96	83.942	ENSGACG00000015633	sbno1	94	83.942	Gasterosteus_aculeatus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	93.728	ENSGAGG00000001065	SBNO1	100	90.524	Gopherus_agassizii
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	98.373	ENSGGOG00000015000	SBNO1	100	97.242	Gorilla_gorilla
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	68.185	ENSHBUG00000011910	sbno1	100	68.298	Haplochromis_burtoni
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	98.011	ENSHGLG00000014165	-	99	98.011	Heterocephalus_glaber_female
ENSPEMG00000016087	Sbno1	92	83.237	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	84.585	Hippocampus_comes
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	85.278	ENSIPUG00000015830	Sbno1	93	88.710	Ictalurus_punctatus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	97.715	ENSSTOG00000023221	SBNO1	100	97.715	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	97.057	ENSJJAG00000001741	Sbno1	100	97.057	Jaculus_jaculus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	84.000	ENSKMAG00000009696	sbno1	95	84.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	84.107	ENSLBEG00000007623	sbno1	95	85.018	Labrus_bergylta
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	80.670	ENSLACG00000017227	SBNO1	93	89.844	Latimeria_chalumnae
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	87.612	ENSLOCG00000005725	sbno1	96	87.612	Lepisosteus_oculatus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	97.468	ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	96.267	Loxodonta_africana
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	97.331	ENSMFAG00000031429	SBNO1	100	96.913	Macaca_fascicularis
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	97.331	ENSMMUG00000011496	SBNO1	100	96.913	Macaca_mulatta
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	98.373	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	98.373	Mandrillus_leucophaeus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	84.116	ENSMAMG00000005473	sbno1	95	84.116	Mastacembelus_armatus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	94.213	ENSMGAG00000003274	SBNO1	100	91.601	Meleagris_gallopavo
ENSPEMG00000016087	Sbno1	52	99.242	ENSMAUG00000004834	-	99	99.242	Mesocricetus_auratus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	96.123	ENSMICG00000006573	-	100	96.123	Microcebus_murinus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	99.133	ENSMOCG00000009390	Sbno1	100	99.133	Microtus_ochrogaster
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	83.244	ENSMMOG00000008691	sbno1	94	83.244	Mola_mola
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	96.558	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	93.966	Monodelphis_domestica
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	82.609	ENSMALG00000001056	sbno1	95	82.609	Monopterus_albus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	98.732	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	99	98.939	Mus_caroli
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	98.732	ENSMUSG00000038095	Sbno1	100	98.346	Mus_musculus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	98.275	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	100	98.473	Mus_pahari
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	98.732	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	99	99.091	Mus_spretus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	97.416	ENSMPUG00000001658	SBNO1	100	97.416	Mustela_putorius_furo
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	96.841	ENSMLUG00000017159	SBNO1	100	96.841	Myotis_lucifugus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	97.631	ENSNGAG00000012620	Sbno1	100	97.631	Nannospalax_galili
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	73.643	ENSNBRG00000019189	sbno1	100	73.703	Neolamprologus_brichardi
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	93.180	ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	93.180	Nomascus_leucogenys
ENSPEMG00000016087	Sbno1	60	93.548	ENSMEUG00000008768	-	86	91.753	Notamacropus_eugenii
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	96.209	ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	93.190	Ochotona_princeps
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	97.087	ENSODEG00000009997	SBNO1	100	97.087	Octodon_degus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	82.437	ENSONIG00000015348	sbno1	95	82.437	Oreochromis_niloticus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	98	95.259	ENSOCUG00000002441	SBNO1	95	95.259	Oryctolagus_cuniculus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	82.130	ENSORLG00000001593	sbno1	95	82.130	Oryzias_latipes
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	82.130	ENSORLG00020015216	sbno1	95	82.130	Oryzias_latipes_hni
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	82.310	ENSORLG00015002726	sbno1	95	82.310	Oryzias_latipes_hsok
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	82.577	ENSOMEG00000019313	sbno1	98	82.577	Oryzias_melastigma
ENSPEMG00000016087	Sbno1	52	93.041	ENSOGAG00000010781	-	99	93.343	Otolemur_garnettii
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	96.774	ENSOARG00000004404	SBNO1	100	96.774	Ovis_aries
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	97.480	ENSPPAG00000024635	SBNO1	100	97.480	Pan_paniscus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	98.188	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	97.486	Panthera_pardus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	97.126	ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	97.126	Panthera_tigris_altaica
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	97.559	ENSPTRG00000005597	SBNO1	100	97.559	Pan_troglodytes
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	97.402	ENSPANG00000011640	SBNO1	100	97.402	Papio_anubis
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	85.637	ENSPKIG00000001441	sbno1	95	85.637	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPEMG00000016087	Sbno1	91	90.315	ENSPSIG00000009256	-	100	87.325	Pelodiscus_sinensis
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	93.705	ENSPSIG00000009572	-	100	90.916	Pelodiscus_sinensis
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	96.196	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	93.539	Phascolarctos_cinereus
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	82.975	ENSPFOG00000005069	sbno1	95	82.975	Poecilia_formosa
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	82.975	ENSPLAG00000015015	sbno1	95	82.975	Poecilia_latipinna
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	82.975	ENSPMEG00000021212	sbno1	95	82.975	Poecilia_mexicana
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	82.616	ENSPREG00000017746	sbno1	95	82.616	Poecilia_reticulata
ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	98.373	ENSPPYG00000005084	SBNO1	100	96.554	Pongo_abelii
ENSPEMG00000016087	Sbno1	89	91.233	ENSPCAG00000008634	SBNO1	88	91.197	Procavia_capensis
ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	97.272	ENSPCOG00000024277	SBNO1	100	97.272	Propithecus_coquereli
ENSPEMG00000016087	Sbno1	92	97.817	ENSPVAG00000015304	SBNO1	87	97.817	Pteropus_vampyrus
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