EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPEMG00000019551 (Gene tree)
Gene ID: 102923558
Gene Symbol: Urb2
Alias: -
Full Name: URB2 ribosome biogenesis homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Peromyscus_maniculatus_bairdii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 36118 bases
Position: chrKI615803.1:477480-513597
Accession: 102923558
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPEMP00000022081	Urb2	PF10441.9	6.6e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPEMT00000026445	-	4656	XM_016009209	ENSPEMP00000022081	1458 (aa)	XP_015864695	-

Gene Model

Click here to download ENSPEMG00000019551's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPEMG00000019551's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	73.598	ENSG00000135763	URB2	89	84.000	Homo_sapiens
ENSPEMG00000019551	Urb2	89	34.076	ENSAPOG00000000608	urb2	91	34.220	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	71.986	ENSAMEG00000009206	URB2	96	71.986	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	34.217	ENSAOCG00000019961	urb2	96	34.319	Amphiprion_ocellaris
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	34.523	ENSAPEG00000005263	urb2	96	34.400	Amphiprion_percula
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	33.273	ENSATEG00000020930	urb2	96	33.232	Anabas_testudineus
ENSPEMG00000019551	Urb2	97	46.372	ENSAPLG00000002998	URB2	96	46.468	Anas_platyrhynchos
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	47.333	ENSACAG00000001285	URB2	96	47.333	Anolis_carolinensis
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	73.940	ENSANAG00000033963	URB2	96	73.871	Aotus_nancymaae
ENSPEMG00000019551	Urb2	89	32.765	ENSACLG00000009254	urb2	91	32.717	Astatotilapia_calliptera
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	34.765	ENSAMXG00000003474	urb2	96	34.765	Astyanax_mexicanus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	65.390	ENSBTAG00000010180	URB2	96	65.390	Bos_taurus
ENSPEMG00000019551	Urb2	94	84.211	ENSCJAG00000010968	URB2	96	73.461	Callithrix_jacchus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	71.233	ENSCAFG00000012118	URB2	96	71.233	Canis_familiaris
ENSPEMG00000019551	Urb2	93	69.779	ENSCAFG00020027217	URB2	94	69.779	Canis_lupus_dingo
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	65.527	ENSCHIG00000014513	URB2	98	65.527	Capra_hircus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	72.230	ENSTSYG00000006924	URB2	96	72.230	Carlito_syrichta
ENSPEMG00000019551	Urb2	62	79.630	ENSCPOG00000020777	-	93	76.437	Cavia_porcellus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	73.529	ENSCCAG00000023932	URB2	96	73.461	Cebus_capucinus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	73.461	ENSCATG00000043366	URB2	96	73.461	Cercocebus_atys
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	72.827	ENSCLAG00000006268	URB2	96	72.827	Chinchilla_lanigera
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	73.598	ENSCSAG00000010599	URB2	96	73.598	Chlorocebus_sabaeus
ENSPEMG00000019551	Urb2	67	72.789	ENSCHOG00000010163	URB2	66	72.789	Choloepus_hoffmanni
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	51.442	ENSCPBG00000006191	URB2	96	51.442	Chrysemys_picta_bellii
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	73.940	ENSCANG00000023711	URB2	96	73.940	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	92.044	ENSCGRG00001009591	Urb2	96	92.044	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	92.044	ENSCGRG00000011259	Urb2	96	92.044	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	32.625	ENSCSEG00000000299	urb2	96	32.602	Cynoglossus_semilaevis
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	32.871	ENSCVAG00000011011	urb2	96	32.718	Cyprinodon_variegatus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	35.868	ENSDARG00000003217	urb2	76	59.223	Danio_rerio
ENSPEMG00000019551	Urb2	97	55.915	ENSDNOG00000043064	URB2	95	55.986	Dasypus_novemcinctus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	74.880	ENSDORG00000014975	Urb2	96	74.880	Dipodomys_ordii
ENSPEMG00000019551	Urb2	92	96.552	ENSETEG00000002869	URB2	88	96.552	Echinops_telfairi
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	71.956	ENSEASG00005012060	URB2	96	71.956	Equus_asinus_asinus
ENSPEMG00000019551	Urb2	92	84.416	ENSECAG00000012338	URB2	95	84.416	Equus_caballus
ENSPEMG00000019551	Urb2	92	86.842	ENSEEUG00000002669	URB2	88	86.842	Erinaceus_europaeus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	38.031	ENSELUG00000014647	urb2	96	38.140	Esox_lucius
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	70.342	ENSFCAG00000007662	URB2	96	70.342	Felis_catus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	47.007	ENSFALG00000003385	URB2	96	47.007	Ficedula_albicollis
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	73.735	ENSFDAG00000021079	URB2	96	73.735	Fukomys_damarensis
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	33.227	ENSFHEG00000010357	urb2	96	33.376	Fundulus_heteroclitus
ENSPEMG00000019551	Urb2	91	38.407	ENSGMOG00000012459	urb2	96	32.936	Gadus_morhua
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	48.324	ENSGALG00000011101	URB2	97	48.324	Gallus_gallus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	35.667	ENSGACG00000016179	urb2	96	35.729	Gasterosteus_aculeatus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	51.237	ENSGAGG00000021879	URB2	99	51.237	Gopherus_agassizii
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	73.461	ENSGGOG00000025643	URB2	96	73.461	Gorilla_gorilla
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	51.852	ENSHBUG00000018469	urb2	93	51.852	Haplochromis_burtoni
ENSPEMG00000019551	Urb2	97	74.806	ENSHGLG00000016561	URB2	94	74.806	Heterocephalus_glaber_female
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	72.553	ENSHGLG00100001838	URB2	96	72.553	Heterocephalus_glaber_male
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	35.173	ENSIPUG00000020315	urb2	96	35.243	Ictalurus_punctatus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	73.169	ENSSTOG00000025323	URB2	96	73.169	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	78.532	ENSJJAG00000011998	Urb2	96	78.464	Jaculus_jaculus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	32.298	ENSKMAG00000020129	urb2	96	32.214	Kryptolebias_marmoratus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	43.420	ENSLACG00000002038	URB2	96	43.901	Latimeria_chalumnae
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	39.624	ENSLOCG00000015462	urb2	96	39.758	Lepisosteus_oculatus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	69.747	ENSLAFG00000012484	URB2	96	69.747	Loxodonta_africana
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	73.051	ENSMFAG00000039905	URB2	96	73.051	Macaca_fascicularis
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	73.187	ENSMMUG00000009509	URB2	96	73.187	Macaca_mulatta
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	73.461	ENSMNEG00000038762	URB2	96	73.461	Macaca_nemestrina
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	73.393	ENSMLEG00000043252	URB2	96	73.393	Mandrillus_leucophaeus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	32.648	ENSMAMG00000020365	urb2	96	32.547	Mastacembelus_armatus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	51.235	ENSMZEG00005011027	urb2	93	51.235	Maylandia_zebra
ENSPEMG00000019551	Urb2	94	45.129	ENSMGAG00000012073	URB2	95	45.129	Meleagris_gallopavo
ENSPEMG00000019551	Urb2	95	92.105	ENSMAUG00000017980	Urb2	95	92.105	Mesocricetus_auratus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	73.187	ENSMICG00000033302	URB2	96	73.187	Microcebus_murinus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	90.466	ENSMOCG00000020369	Urb2	96	90.466	Microtus_ochrogaster
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	33.903	ENSMALG00000006529	urb2	96	33.719	Monopterus_albus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	86.566	ENSMUSG00000031976	Urb2	96	86.566	Mus_musculus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	70.274	ENSMPUG00000012438	URB2	96	70.205	Mustela_putorius_furo
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	79.973	ENSNGAG00000016524	Urb2	96	79.973	Nannospalax_galili
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	73.803	ENSNLEG00000014450	URB2	96	73.803	Nomascus_leucogenys
ENSPEMG00000019551	Urb2	88	74.545	ENSMEUG00000016434	URB2	86	74.545	Notamacropus_eugenii
ENSPEMG00000019551	Urb2	92	69.420	ENSOPRG00000009906	URB2	88	69.420	Ochotona_princeps
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	72.640	ENSODEG00000005593	URB2	96	72.640	Octodon_degus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	36.230	ENSONIG00000017078	urb2	96	36.133	Oreochromis_niloticus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	46.866	ENSOANG00000013732	URB2	95	47.343	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	72.416	ENSOCUG00000010700	URB2	96	72.416	Oryctolagus_cuniculus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	33.438	ENSORLG00000010915	urb2	96	33.396	Oryzias_latipes
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	33.459	ENSORLG00020003361	urb2	96	33.333	Oryzias_latipes_hni
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	33.125	ENSORLG00015001534	urb2	96	33.271	Oryzias_latipes_hsok
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	33.692	ENSOMEG00000010076	urb2	96	33.692	Oryzias_melastigma
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	71.018	ENSOGAG00000003021	URB2	96	71.018	Otolemur_garnettii
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	65.595	ENSOARG00000003102	URB2	96	65.595	Ovis_aries
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	74.008	ENSPPAG00000040629	URB2	96	74.008	Pan_paniscus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	69.795	ENSPPRG00000012767	URB2	96	69.795	Panthera_pardus
ENSPEMG00000019551	Urb2	96	90.909	ENSPTIG00000012577	URB2	96	90.909	Panthera_tigris_altaica
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	73.735	ENSPTRG00000002092	URB2	96	73.735	Pan_troglodytes
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	71.614	ENSPANG00000002245	URB2	96	71.614	Papio_anubis
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	37.800	ENSPKIG00000005787	urb2	96	37.825	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	50.334	ENSPSIG00000002690	URB2	96	50.334	Pelodiscus_sinensis
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	58.776	ENSPCIG00000030071	URB2	96	58.844	Phascolarctos_cinereus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	34.000	ENSPFOG00000014330	urb2	96	33.889	Poecilia_formosa
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	33.398	ENSPLAG00000014654	urb2	96	33.484	Poecilia_latipinna
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	32.988	ENSPMEG00000012356	urb2	96	33.010	Poecilia_mexicana
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	33.204	ENSPREG00000010268	urb2	96	33.096	Poecilia_reticulata
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	73.598	ENSPPYG00000000123	URB2	96	73.598	Pongo_abelii
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	73.324	ENSPCOG00000023537	URB2	96	73.324	Propithecus_coquereli
ENSPEMG00000019551	Urb2	99	60.843	ENSPVAG00000002108	URB2	95	60.843	Pteropus_vampyrus
ENSPEMG00000019551	Urb2	89	32.978	ENSPNYG00000016840	urb2	91	32.930	Pundamilia_nyererei
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	35.594	ENSPNAG00000013684	urb2	96	35.594	Pygocentrus_nattereri
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	89.589	ENSRNOG00000026853	Urb2	93	89.589	Rattus_norvegicus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	74.008	ENSRBIG00000037937	URB2	96	74.008	Rhinopithecus_bieti
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	73.803	ENSRROG00000039854	URB2	96	73.803	Rhinopithecus_roxellana
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	74.008	ENSSBOG00000023055	URB2	96	73.940	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	58.731	ENSSHAG00000014735	URB2	96	58.844	Sarcophilus_harrisii
ENSPEMG00000019551	Urb2	98	37.560	ENSSFOG00015015432	urb2	94	37.722	Scleropages_formosus
ENSPEMG00000019551	Urb2	89	32.756	ENSSMAG00000004984	urb2	91	32.687	Scophthalmus_maximus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	34.116	ENSSDUG00000000902	urb2	96	34.057	Seriola_dumerili
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	50.067	ENSSPUG00000018549	URB2	96	50.200	Sphenodon_punctatus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	34.685	ENSSPAG00000013632	urb2	96	34.541	Stegastes_partitus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	66.895	ENSSSCG00000010186	URB2	96	66.895	Sus_scrofa
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	47.458	ENSTGUG00000009990	URB2	96	47.490	Taeniopygia_guttata
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	33.827	ENSTRUG00000008173	urb2	96	33.848	Takifugu_rubripes
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	35.643	ENSTNIG00000017689	urb2	96	35.790	Tetraodon_nigroviridis
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	59.085	ENSTTRG00000014864	URB2	96	59.085	Tursiops_truncatus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	71.918	ENSUAMG00000015022	URB2	96	71.918	Ursus_americanus
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	72.260	ENSUMAG00000004728	URB2	96	72.260	Ursus_maritimus
ENSPEMG00000019551	Urb2	62	82.895	ENSVPAG00000001750	-	58	82.895	Vicugna_pacos
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	71.096	ENSVVUG00000006747	URB2	96	71.096	Vulpes_vulpes
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	39.919	ENSXETG00000023331	urb2	96	39.919	Xenopus_tropicalis
ENSPEMG00000019551	Urb2	100	33.527	ENSXMAG00000015059	urb2	96	33.312	Xiphophorus_maculatus