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Description

Ensembl ID: ENSPEMG00000019821 (Gene tree)
Gene ID: 102908323
Gene Symbol: Smarca2
Alias: -
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Peromyscus_maniculatus_bairdii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 167033 bases
Position: chrKI615408.1:242095-409127
Accession: 102908323
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPEMP00000022465	ResIII	PF04851.15	2.1e-08	1	1
ENSPEMP00000022464	ResIII	PF04851.15	2.2e-08	1	1
ENSPEMP00000022465	BRK	PF07533.16	2.5e-17	1	1
ENSPEMP00000022464	BRK	PF07533.16	2.5e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPEMT00000026831	-	4752	XM_015996404	ENSPEMP00000022464	1583 (aa)	XP_015851890	-
ENSPEMT00000026833	-	837	XM_015996403	ENSPEMP00000022466	278 (aa)	XP_015851889	-
ENSPEMT00000026832	-	4680	-	ENSPEMP00000022465	1559 (aa)	-	-
ENSPEMT00000026835	-	204	-	ENSPEMP00000022468	68 (aa)	-	UPI0007699FBA
ENSPEMT00000026834	-	783	XM_015996402	ENSPEMP00000022467	260 (aa)	XP_015851888	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPEMG00000019821	Smarca2	93	78.058	ENSPEMG00000020389	Smarca4	91	78.555

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	96.673	ENSG00000080503	SMARCA2	100	99.329	Homo_sapiens
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	79.423	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	79.665	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	80	98.279	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	98.279	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	78.647	ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.127	Amphilophus_citrinellus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	79.461	ENSAOCG00000009647	-	97	79.627	Amphiprion_ocellaris
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	79.486	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	97	79.858	Amphiprion_percula
ENSPEMG00000019821	Smarca2	99	80.368	ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	80.129	Anabas_testudineus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	89	88.606	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	94	88.162	Anas_platyrhynchos
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	88.769	ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	88.571	Anolis_carolinensis
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	96.482	ENSANAG00000026498	SMARCA2	100	96.482	Aotus_nancymaae
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	80.063	ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	80.583	Astatotilapia_calliptera
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	80.801	ENSAMXG00000012404	smarca2	97	80.102	Astyanax_mexicanus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	95.172	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	100	95.108	Bos_taurus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	99	96.543	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	96.365	Callithrix_jacchus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	96.043	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	100	96.043	Canis_familiaris
ENSPEMG00000019821	Smarca2	74	95.447	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	94	95.017	Canis_lupus_dingo
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	95.791	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	100	95.791	Capra_hircus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	96.113	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	96.113	Carlito_syrichta
ENSPEMG00000019821	Smarca2	99	91.651	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	100	92.283	Cavia_aperea
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	95.743	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	100	95.743	Cavia_porcellus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	96.545	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	100	96.545	Cebus_capucinus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	95.812	ENSCATG00000031470	SMARCA2	100	95.812	Cercocebus_atys
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	96.066	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	96.066	Chinchilla_lanigera
ENSPEMG00000019821	Smarca2	94	95.168	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	99	95.992	Chlorocebus_sabaeus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	86	89.103	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	86	89.608	Choloepus_hoffmanni
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	90.032	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	100	94.275	Chrysemys_picta_bellii
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	96.684	ENSCANG00000039597	SMARCA2	100	96.684	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	91.861	ENSCGRG00001002323	Smarca2	100	91.509	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPEMG00000019821	Smarca2	99	76.467	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	97	76.734	Cynoglossus_semilaevis
ENSPEMG00000019821	Smarca2	84	78.720	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	95	78.142	Cyprinodon_variegatus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	80.905	ENSDARG00000008904	smarca2	97	81.113	Danio_rerio
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	94.410	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	100	94.410	Dasypus_novemcinctus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	96.545	ENSDORG00000014832	Smarca2	100	96.545	Dipodomys_ordii
ENSPEMG00000019821	Smarca2	81	58.003	FBgn0000212	brm	70	62.258	Drosophila_melanogaster
ENSPEMG00000019821	Smarca2	96	69.176	ENSEBUG00000011442	-	94	70.363	Eptatretus_burgeri
ENSPEMG00000019821	Smarca2	86	62.393	ENSEBUG00000002449	-	91	65.294	Eptatretus_burgeri
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	95.743	ENSEASG00005010312	SMARCA2	100	95.743	Equus_asinus_asinus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	67	97.222	ENSEEUG00000015540	-	69	97.222	Erinaceus_europaeus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	92	79.905	ENSELUG00000010318	smarca2	96	77.978	Esox_lucius
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	94.975	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	100	95.038	Felis_catus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	90.476	ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	89.683	Ficedula_albicollis
ENSPEMG00000019821	Smarca2	99	95.105	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	99	95.130	Fukomys_damarensis
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	79.551	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	79.796	Fundulus_heteroclitus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	98	76.673	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	77.038	Gadus_morhua
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	91.175	ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	90.546	Gallus_gallus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	95	75.697	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	93	75.853	Gambusia_affinis
ENSPEMG00000019821	Smarca2	99	78.780	ENSGACG00000014488	SMARCA2	97	77.821	Gasterosteus_aculeatus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	90.095	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	100	90.476	Gopherus_agassizii
ENSPEMG00000019821	Smarca2	78	98.529	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	85	96.288	Gorilla_gorilla
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	79.537	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	96	80.547	Haplochromis_burtoni
ENSPEMG00000019821	Smarca2	99	95.974	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	99	95.974	Heterocephalus_glaber_female
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	95.038	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	100	95.163	Heterocephalus_glaber_male
ENSPEMG00000019821	Smarca2	77	85.644	ENSHCOG00000015348	-	88	85.743	Hippocampus_comes
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	79.800	ENSIPUG00000011060	smarca2	97	79.490	Ictalurus_punctatus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	96.798	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	100	96.798	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	96.506	ENSJJAG00000010867	Smarca2	100	96.506	Jaculus_jaculus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	79.205	ENSKMAG00000015844	-	98	79.414	Kryptolebias_marmoratus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	51	78.182	ENSLACG00000000270	SMARCA2	83	86.792	Latimeria_chalumnae
ENSPEMG00000019821	Smarca2	98	83.045	ENSLOCG00000011499	smarca2	83	87.245	Lepisosteus_oculatus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	93.447	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	83	96.499	Loxodonta_africana
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	94.975	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	100	94.661	Macaca_fascicularis
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	96.547	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	100	96.547	Macaca_mulatta
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	96.053	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	100	96.053	Macaca_nemestrina
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	94.133	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	100	94.225	Mandrillus_leucophaeus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	80.025	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	97	81.122	Mastacembelus_armatus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	79.749	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	97	80.051	Maylandia_zebra
ENSPEMG00000019821	Smarca2	76	78.059	ENSMGAG00000005160	-	100	76.862	Meleagris_gallopavo
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	96.168	ENSMICG00000005162	SMARCA2	100	96.168	Microcebus_murinus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	98.556	ENSMOCG00000001611	Smarca2	100	98.556	Microtus_ochrogaster
ENSPEMG00000019821	Smarca2	99	78.347	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	97	78.669	Mola_mola
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	90.660	ENSMODG00000003578	SMARCA2	100	90.722	Monodelphis_domestica
ENSPEMG00000019821	Smarca2	99	80.064	ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	80.222	Monopterus_albus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	97.878	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	100	97.878	Mus_caroli
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	97.814	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	100.000	Mus_musculus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	97.996	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	100	97.996	Mus_pahari
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	97.815	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	99	100.000	Mus_spretus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	80	98.281	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	94	98.281	Mustela_putorius_furo
ENSPEMG00000019821	Smarca2	99	89.824	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	82	92.694	Myotis_lucifugus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	99	95.600	ENSNGAG00000000108	Smarca2	99	95.600	Nannospalax_galili
ENSPEMG00000019821	Smarca2	95	67.062	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	85	86.188	Neolamprologus_brichardi
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	93.559	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	93.622	Nomascus_leucogenys
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	84.171	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	100	84.234	Notamacropus_eugenii
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	89.494	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	90.443	Ochotona_princeps
ENSPEMG00000019821	Smarca2	99	95.660	ENSODEG00000005452	SMARCA2	99	95.660	Octodon_degus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	99	79.773	ENSONIG00000014163	SMARCA2	80	86.090	Oreochromis_niloticus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	95.446	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	100	95.446	Oryctolagus_cuniculus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	79.099	ENSORLG00000020820	SMARCA2	97	78.440	Oryzias_latipes
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	79.211	ENSORLG00015006289	SMARCA2	97	78.377	Oryzias_latipes_hsok
ENSPEMG00000019821	Smarca2	99	79.987	ENSOMEG00000009736	-	97	79.469	Oryzias_melastigma
ENSPEMG00000019821	Smarca2	99	91.890	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	92.140	Otolemur_garnettii
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	93.841	ENSOARG00000013265	SMARCA2	100	93.778	Ovis_aries
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	93.342	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	100	93.367	Pan_paniscus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	95.038	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	100	95.101	Panthera_pardus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	94.978	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	100	94.978	Pan_troglodytes
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	89.292	ENSPANG00000025121	SMARCA2	100	89.592	Papio_anubis
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	81.674	ENSPKIG00000018469	-	97	81.185	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	89.734	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	100	89.740	Pelodiscus_sinensis
ENSPEMG00000019821	Smarca2	98	73.503	ENSPMGG00000013696	-	97	74.144	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	94	71.997	ENSPMAG00000005337	-	78	77.706	Petromyzon_marinus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	92.058	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	100	92.122	Phascolarctos_cinereus
ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	78.839	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	97	79.065	Poecilia_formosa
ENSPEMG00000019821	Smarca2	99	79.106	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	96	76.542	Poecilia_latipinna
ENSPEMG00000019821	Smarca2	99	79.156	ENSPMEG00000001815	-	97	76.774	Poecilia_mexicana
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