EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPEMG00000022224 (Gene tree)
Gene ID: 102917067
Gene Symbol: Polr1a
Alias: -
Full Name: RNA polymerase I subunit A
Gene Type: protein_coding
Species: Peromyscus_maniculatus_bairdii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 64309 bases
Position: chrKI615809.1:304115-368423
Accession: 102917067
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPEMP00000025972	RNA_pol_Rpb1_5	PF04998.17	1.2e-102	1	1
ENSPEMP00000025972	RNA_pol_Rpb1_4	PF05000.17	3.5e-26	1	1
ENSPEMP00000025972	RNA_pol_Rpb1_2	PF00623.20	3.5e-70	1	1
ENSPEMP00000025972	RNA_pol_Rpb1_3	PF04983.18	9.3e-37	1	1
ENSPEMP00000025972	RNA_pol_Rpb1_1	PF04997.12	3.6e-22	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPEMT00000030365	-	6005	XM_006990994	ENSPEMP00000025972	1718 (aa)	XP_006991056	UPI00042AA3B2

Gene Model

Click here to download ENSPEMG00000022224's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPEMG00000022224's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPEMG00000022224	Polr1a	62	32.766	ENSPEMG00000006768	Polr3a	69	32.766
ENSPEMG00000022224	Polr1a	66	34.286	ENSPEMG00000012521	Polr2a	57	34.286

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	88.130	ENSG00000068654	POLR1A	100	87.898	Homo_sapiens
ENSPEMG00000022224	Polr1a	69	67.309	ENSAPOG00000017945	polr1a	99	67.309	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	88.805	ENSAMEG00000005807	POLR1A	100	91.393	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPEMG00000022224	Polr1a	96	67.196	ENSACIG00000022147	polr1a	100	66.943	Amphilophus_citrinellus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	66.029	ENSAOCG00000017336	polr1a	100	67.887	Amphiprion_ocellaris
ENSPEMG00000022224	Polr1a	94	72.917	ENSAPEG00000016105	polr1a	98	72.917	Amphiprion_percula
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	65.323	ENSATEG00000016773	polr1a	100	65.835	Anabas_testudineus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	85	72.999	ENSAPLG00000013871	POLR1A	99	72.117	Anas_platyrhynchos
ENSPEMG00000022224	Polr1a	99	69.351	ENSACAG00000012141	POLR1A	99	69.164	Anolis_carolinensis
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	87.543	ENSANAG00000033927	POLR1A	100	87.659	Aotus_nancymaae
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	61.888	ENSACLG00000020541	polr1a	100	61.973	Astatotilapia_calliptera
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	88.348	ENSBTAG00000006481	POLR1A	100	88.167	Bos_taurus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	99	39.099	WBGene00012999	rpoa-1	98	38.522	Caenorhabditis_elegans
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	86.856	ENSCJAG00000019547	POLR1A	100	87.145	Callithrix_jacchus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	88.051	ENSCAFG00000007613	POLR1A	100	88.051	Canis_familiaris
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	88.341	ENSCAFG00020014752	POLR1A	100	88.341	Canis_lupus_dingo
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	87.631	ENSCHIG00000018204	POLR1A	100	87.194	Capra_hircus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	87.065	ENSTSYG00000002761	POLR1A	100	87.007	Carlito_syrichta
ENSPEMG00000022224	Polr1a	97	84.519	ENSCAPG00000010132	POLR1A	100	84.758	Cavia_aperea
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	89.238	ENSCPOG00000012350	POLR1A	100	89.471	Cavia_porcellus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	87.435	ENSCCAG00000019839	POLR1A	100	87.276	Cebus_capucinus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	88.709	ENSCATG00000029786	POLR1A	83	90.336	Cercocebus_atys
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	89.483	ENSCLAG00000005187	POLR1A	100	89.715	Chinchilla_lanigera
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	88.188	ENSCSAG00000016251	POLR1A	100	88.086	Chlorocebus_sabaeus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	99	74.113	ENSCPBG00000001115	POLR1A	99	74.214	Chrysemys_picta_bellii
ENSPEMG00000022224	Polr1a	99	46.614	ENSCSAVG00000007184	-	97	49.541	Ciona_savignyi
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	85.491	ENSCANG00000031785	POLR1A	82	87.194	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	96	97.297	ENSCGRG00001006651	Polr1a	100	91.041	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPEMG00000022224	Polr1a	60	95.419	ENSCGRG00000010834	Polr1a	100	95.419	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	61.985	ENSCSEG00000020190	polr1a	100	61.543	Cynoglossus_semilaevis
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	64.092	ENSCVAG00000020941	polr1a	100	63.940	Cyprinodon_variegatus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	66.783	ENSDARG00000098375	polr1a	100	66.705	Danio_rerio
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	82.193	ENSDNOG00000010829	POLR1A	100	82.414	Dasypus_novemcinctus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	89.751	ENSDORG00000008298	Polr1a	100	89.751	Dipodomys_ordii
ENSPEMG00000022224	Polr1a	78	44.591	FBgn0019938	RpI1	99	42.874	Drosophila_melanogaster
ENSPEMG00000022224	Polr1a	72	96.875	ENSETEG00000000412	-	72	96.875	Echinops_telfairi
ENSPEMG00000022224	Polr1a	89	47.708	ENSEBUG00000005667	-	93	67.442	Eptatretus_burgeri
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	88.825	ENSEASG00005001625	POLR1A	100	89.461	Equus_asinus_asinus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	88.709	ENSECAG00000036306	-	100	91.228	Equus_caballus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	88.709	ENSECAG00000010092	POLR1A	100	91.228	Equus_caballus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	88.709	ENSECAG00000030510	-	100	91.228	Equus_caballus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	85	95.745	ENSEEUG00000000676	POLR1A	85	95.556	Erinaceus_europaeus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	66.475	ENSELUG00000012769	polr1a	99	67.151	Esox_lucius
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	88.000	ENSFCAG00000008966	POLR1A	100	88.000	Felis_catus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	99	71.948	ENSFALG00000010082	POLR1A	99	71.512	Ficedula_albicollis
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	89.186	ENSFDAG00000013726	POLR1A	100	89.128	Fukomys_damarensis
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	61.365	ENSFHEG00000005996	polr1a	100	61.320	Fundulus_heteroclitus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	60.209	ENSGMOG00000002230	polr1a	100	60.000	Gadus_morhua
ENSPEMG00000022224	Polr1a	91	69.359	ENSGALG00000038160	-	99	69.359	Gallus_gallus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	64.501	ENSGAFG00000015266	polr1a	100	64.410	Gambusia_affinis
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	63.710	ENSGACG00000018791	polr1a	100	63.788	Gasterosteus_aculeatus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	89	75.473	ENSGAGG00000004984	-	96	80.050	Gopherus_agassizii
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	88.188	ENSGGOG00000001788	POLR1A	100	87.956	Gorilla_gorilla
ENSPEMG00000022224	Polr1a	90	63.615	ENSHBUG00000020021	polr1a	96	68.511	Haplochromis_burtoni
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	89.645	ENSHGLG00000006334	POLR1A	100	89.820	Heterocephalus_glaber_female
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	89.385	ENSHGLG00100006614	POLR1A	100	89.559	Heterocephalus_glaber_male
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	62.211	ENSHCOG00000003345	polr1a	100	62.081	Hippocampus_comes
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	66.261	ENSIPUG00000013174	polr1a	100	65.585	Ictalurus_punctatus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	87.835	ENSSTOG00000012580	POLR1A	100	87.893	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	90.354	ENSJJAG00000013113	Polr1a	100	90.413	Jaculus_jaculus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	64.873	ENSKMAG00000007399	polr1a	100	64.808	Kryptolebias_marmoratus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	94	68.547	ENSLBEG00000015401	polr1a	99	68.539	Labrus_bergylta
ENSPEMG00000022224	Polr1a	53	76.009	ENSLACG00000003218	polr1a	99	76.009	Latimeria_chalumnae
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	70.790	ENSLOCG00000010881	polr1a	100	70.790	Lepisosteus_oculatus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	88.058	ENSLAFG00000014948	POLR1A	100	87.456	Loxodonta_africana
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	88.130	ENSMFAG00000046097	POLR1A	100	87.970	Macaca_fascicularis
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	88.130	ENSMMUG00000015815	POLR1A	100	87.970	Macaca_mulatta
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	88.130	ENSMNEG00000043313	POLR1A	100	87.970	Macaca_nemestrina
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	87.493	ENSMLEG00000042428	POLR1A	83	89.566	Mandrillus_leucophaeus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	65.913	ENSMAMG00000016565	polr1a	100	65.815	Mastacembelus_armatus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	65.112	ENSMZEG00005004915	polr1a	100	65.205	Maylandia_zebra
ENSPEMG00000022224	Polr1a	99	69.570	ENSMGAG00000013111	POLR1A	99	69.570	Meleagris_gallopavo
ENSPEMG00000022224	Polr1a	92	96.379	ENSMAUG00000008497	Polr1a	100	96.379	Mesocricetus_auratus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	88.600	ENSMICG00000000757	POLR1A	100	88.252	Microcebus_murinus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	96.158	ENSMOCG00000000122	Polr1a	100	96.100	Microtus_ochrogaster
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	65.078	ENSMMOG00000010216	polr1a	100	64.597	Mola_mola
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	75.316	ENSMODG00000009335	POLR1A	80	81.890	Monodelphis_domestica
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	65.177	ENSMALG00000013363	polr1a	100	65.081	Monopterus_albus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	93.368	MGP_CAROLIEiJ_G0028494	Polr1a	100	93.252	Mus_caroli
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	93.423	ENSMUSG00000049553	Polr1a	100	93.364	Mus_musculus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	93.946	MGP_PahariEiJ_G0022230	Polr1a	100	93.772	Mus_pahari
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	91.543	MGP_SPRETEiJ_G0029499	Polr1a	100	92.167	Mus_spretus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	88.419	ENSMPUG00000009135	POLR1A	100	88.086	Mustela_putorius_furo
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	87.261	ENSMLUG00000015723	POLR1A	100	87.551	Myotis_lucifugus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	93.136	ENSNGAG00000017907	Polr1a	100	93.136	Nannospalax_galili
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	65.681	ENSNBRG00000000519	polr1a	100	65.320	Neolamprologus_brichardi
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	86.225	ENSNLEG00000002264	POLR1A	100	85.994	Nomascus_leucogenys
ENSPEMG00000022224	Polr1a	75	93.701	ENSMEUG00000011665	-	75	93.701	Notamacropus_eugenii
ENSPEMG00000022224	Polr1a	99	82.696	ENSOPRG00000008269	POLR1A	100	82.557	Ochotona_princeps
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	89.657	ENSODEG00000003542	POLR1A	100	89.773	Octodon_degus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	65.913	ENSONIG00000015895	polr1a	100	65.665	Oreochromis_niloticus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	89.779	ENSOCUG00000010138	POLR1A	100	89.489	Oryctolagus_cuniculus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	64.928	ENSORLG00000008753	polr1a	99	64.617	Oryzias_latipes
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	63.426	ENSORLG00020020726	polr1a	99	63.246	Oryzias_latipes_hni
ENSPEMG00000022224	Polr1a	96	74.468	ENSORLG00015016071	polr1a	99	74.444	Oryzias_latipes_hsok
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	88.593	ENSOGAG00000004031	POLR1A	100	88.361	Otolemur_garnettii
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	87.041	ENSOARG00000020601	POLR1A	100	88.143	Ovis_aries
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	87.956	ENSPPAG00000042450	POLR1A	100	87.724	Pan_paniscus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	88.058	ENSPPRG00000006702	POLR1A	100	87.826	Panthera_pardus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	87.579	ENSPTIG00000018783	POLR1A	100	87.348	Panthera_tigris_altaica
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	87.782	ENSPTRG00000012147	POLR1A	100	87.724	Pan_troglodytes
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	88.709	ENSPANG00000025908	POLR1A	100	88.028	Papio_anubis
ENSPEMG00000022224	Polr1a	94	75.694	ENSPKIG00000005468	polr1a	99	75.694	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPEMG00000022224	Polr1a	63	71.640	ENSPSIG00000009321	-	99	71.548	Pelodiscus_sinensis
ENSPEMG00000022224	Polr1a	55	68.047	ENSPMGG00000009718	polr1a	95	68.047	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	95	79.220	ENSPCIG00000004222	POLR1A	99	79.159	Phascolarctos_cinereus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	64.443	ENSPFOG00000005025	polr1a	100	64.617	Poecilia_formosa
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	64.808	ENSPLAG00000021389	polr1a	100	64.925	Poecilia_latipinna
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	62.630	ENSPMEG00000006463	polr1a	100	63.094	Poecilia_mexicana
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	64.600	ENSPREG00000002389	polr1a	100	64.716	Poecilia_reticulata
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	87.666	ENSPPYG00000012217	POLR1A	100	87.435	Pongo_abelii
ENSPEMG00000022224	Polr1a	92	88.000	ENSPCAG00000011582	POLR1A	92	88.000	Procavia_capensis
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	88.497	ENSPCOG00000026987	POLR1A	100	88.150	Propithecus_coquereli
ENSPEMG00000022224	Polr1a	95	86.380	ENSPVAG00000012674	POLR1A	95	86.207	Pteropus_vampyrus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	65.112	ENSPNYG00000000026	polr1a	100	65.205	Pundamilia_nyererei
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	67.032	ENSPNAG00000019223	polr1a	100	66.955	Pygocentrus_nattereri
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	95.227	ENSRNOG00000009545	Polr1a	100	95.227	Rattus_norvegicus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	87.507	ENSRBIG00000028335	POLR1A	83	89.916	Rhinopithecus_bieti
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	87.449	ENSRROG00000031473	POLR1A	83	89.846	Rhinopithecus_roxellana
ENSPEMG00000022224	Polr1a	99	36.706	YOR341W	RPA190	99	36.687	Saccharomyces_cerevisiae
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	86.914	ENSSBOG00000030262	POLR1A	100	86.979	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	72.785	ENSSHAG00000014739	POLR1A	100	73.237	Sarcophilus_harrisii
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	67.635	ENSSFOG00015019716	polr1a	100	67.538	Scleropages_formosus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	65.295	ENSSMAG00000014342	polr1a	100	65.235	Scophthalmus_maximus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	66.396	ENSSDUG00000014631	polr1a	100	66.667	Seriola_dumerili
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	64.593	ENSSLDG00000024095	polr1a	100	64.925	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPEMG00000022224	Polr1a	75	96.809	ENSSARG00000003136	-	74	96.809	Sorex_araneus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	70.035	ENSSPUG00000004215	POLR1A	98	76.923	Sphenodon_punctatus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	63	71.914	ENSSPAG00000016341	polr1a	94	71.914	Stegastes_partitus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	83	89.455	ENSSSCG00000008226	POLR1A	99	89.426	Sus_scrofa
ENSPEMG00000022224	Polr1a	99	70.782	ENSTGUG00000010704	POLR1A	100	70.713	Taeniopygia_guttata
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	63.249	ENSTRUG00000002210	polr1a	99	63.436	Takifugu_rubripes
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	59.608	ENSTNIG00000010116	polr1a	100	59.608	Tetraodon_nigroviridis
ENSPEMG00000022224	Polr1a	74	96.460	ENSTBEG00000008646	POLR1A	74	96.460	Tupaia_belangeri
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	84.629	ENSTTRG00000008597	POLR1A	100	84.165	Tursiops_truncatus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	68	87.722	ENSUAMG00000012158	-	94	87.193	Ursus_americanus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	87.362	ENSUMAG00000006700	POLR1A	100	87.022	Ursus_maritimus
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	87.877	ENSVVUG00000001245	POLR1A	100	87.877	Vulpes_vulpes
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	68.333	ENSXETG00000001952	polr1a	100	69.638	Xenopus_tropicalis
ENSPEMG00000022224	Polr1a	100	64.501	ENSXMAG00000004032	polr1a	100	64.849	Xiphophorus_maculatus