EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPEMG00000022397 (Gene tree)
Gene ID: 102920275
Gene Symbol: Htatsf1
Alias: -
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Peromyscus_maniculatus_bairdii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11770 bases
Position: chrKI615876.1:1754465-1766234
Accession: 102920275
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPEMP00000026216	RRM_1	PF00076.22	1.3e-16	1	2
ENSPEMP00000026216	RRM_1	PF00076.22	1.3e-16	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPEMT00000030610	-	2274	XM_006991972	ENSPEMP00000026216	757 (aa)	XP_006992034	-
ENSPEMT00000030611	-	821	-	ENSPEMP00000026217	190 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	74.346	ENSG00000102241	HTATSF1	100	88.525	Homo_sapiens
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	54	59.859	ENSAPOG00000009823	htatsf1	92	59.859	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	73.650	ENSAMEG00000002921	HTATSF1	98	73.377	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	50	62.437	ENSAOCG00000020994	htatsf1	80	62.032	Amphiprion_ocellaris
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	50	62.690	ENSAPEG00000016432	htatsf1	92	59.165	Amphiprion_percula
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	93	71.849	ENSANAG00000025458	-	96	72.029	Aotus_nancymaae
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	95	63.984	ENSANAG00000027986	-	93	64.930	Aotus_nancymaae
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	51	62.347	ENSACLG00000008096	htatsf1	82	62.599	Astatotilapia_calliptera
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	100	67.451	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	98	68.717	Bos_taurus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	73.256	ENSBTAG00000055212	HTATSF1	98	72.751	Bos_taurus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	73.256	ENSBTAG00000054942	HTATSF1	98	72.751	Bos_taurus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	74.248	ENSCJAG00000003676	HTATSF1	97	74.494	Callithrix_jacchus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	74.705	ENSCAFG00000023294	HTATSF1	98	74.437	Canis_familiaris
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	73.556	ENSCAFG00020024635	HTATSF1	98	73.281	Canis_lupus_dingo
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	73.456	ENSCHIG00000000312	HTATSF1	98	72.812	Capra_hircus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	74.771	ENSTSYG00000028876	HTATSF1	98	74.901	Carlito_syrichta
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	69.725	ENSCCAG00000025329	-	97	69.501	Cebus_capucinus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	73.560	ENSCCAG00000022701	-	97	74.764	Cebus_capucinus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	74.704	ENSCATG00000029963	HTATSF1	97	76.383	Cercocebus_atys
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	71.822	ENSCLAG00000002718	HTATSF1	98	71.429	Chinchilla_lanigera
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	74.704	ENSCSAG00000007505	HTATSF1	97	76.383	Chlorocebus_sabaeus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	50	70.130	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	85	70.130	Chrysemys_picta_bellii
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	74.704	ENSCANG00000028495	HTATSF1	97	76.383	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	82.134	ENSCGRG00001021602	Htatsf1	98	83.029	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	91	76.503	ENSCGRG00000002085	Htatsf1	98	77.240	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	72.526	ENSDNOG00000002254	HTATSF1	98	73.263	Dasypus_novemcinctus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	67	49.505	ENSETEG00000006377	-	69	48.713	Echinops_telfairi
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	81	75.667	ENSEASG00005003440	HTATSF1	98	72.432	Equus_asinus_asinus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	81	75.824	ENSECAG00000009156	HTATSF1	98	72.562	Equus_caballus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	63.472	ENSEEUG00000010668	HTATSF1	97	62.517	Erinaceus_europaeus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	73.368	ENSFCAG00000031924	HTATSF1	98	73.271	Felis_catus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	50	68.380	ENSFALG00000003728	HTATSF1	87	67.164	Ficedula_albicollis
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	70.696	ENSFDAG00000008617	HTATSF1	98	71.958	Fukomys_damarensis
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	50	68.135	ENSGALG00000006410	HTATSF1	84	68.135	Gallus_gallus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	74.215	ENSGGOG00000026072	HTATSF1	96	75.806	Gorilla_gorilla
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	51	62.347	ENSHBUG00000004392	htatsf1	82	62.599	Haplochromis_burtoni
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	98	71.676	ENSHGLG00000005328	HTATSF1	98	71.809	Heterocephalus_glaber_female
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	50	61.480	ENSHCOG00000009056	htatsf1	90	61.364	Hippocampus_comes
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	76.702	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	97	76.729	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	66.798	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	90	74.475	Loxodonta_africana
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	74.835	ENSMFAG00000044705	HTATSF1	97	76.518	Macaca_fascicularis
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	74.572	ENSMMUG00000006450	HTATSF1	97	76.248	Macaca_mulatta
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	71.543	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	96	71.935	Macaca_nemestrina
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	74.572	ENSMLEG00000035511	HTATSF1	97	76.248	Mandrillus_leucophaeus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	50	63.868	ENSMAMG00000021225	htatsf1	83	63.807	Mastacembelus_armatus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	51	62.347	ENSMZEG00005000485	htatsf1	82	62.599	Maylandia_zebra
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	83.311	ENSMAUG00000007235	Htatsf1	98	82.377	Mesocricetus_auratus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	73.472	ENSMICG00000009348	HTATSF1	98	73.942	Microcebus_murinus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	80.107	ENSMOCG00000022370	-	80	84.843	Microtus_ochrogaster
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	82.315	ENSMOCG00000023007	-	98	80.317	Microtus_ochrogaster
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	51	61.220	ENSMMOG00000011013	htatsf1	89	61.330	Mola_mola
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	51	70.951	ENSMODG00000014087	-	85	70.951	Monodelphis_domestica
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	82.166	MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	98	82.907	Mus_caroli
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	98	82.661	ENSMUSG00000067873	Htatsf1	98	82.930	Mus_musculus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	98	82.527	MGP_SPRETEiJ_G0034249	Htatsf1	98	82.796	Mus_spretus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	72.449	ENSMPUG00000001901	HTATSF1	98	72.468	Mustela_putorius_furo
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	65.737	ENSMLUG00000009234	-	97	66.309	Myotis_lucifugus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	68.709	ENSMLUG00000028418	-	98	68.289	Myotis_lucifugus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	98	78.658	ENSNGAG00000017831	Htatsf1	97	78.792	Nannospalax_galili
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	73.890	ENSNLEG00000002746	HTATSF1	96	76.383	Nomascus_leucogenys
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	73.018	ENSOCUG00000012570	HTATSF1	98	73.976	Oryctolagus_cuniculus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	98	70.938	ENSOGAG00000005565	HTATSF1	98	72.237	Otolemur_garnettii
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	72.739	ENSOARG00000011215	-	98	72.099	Ovis_aries
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	68.670	ENSOARG00000000481	-	98	67.442	Ovis_aries
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	74.346	ENSPPAG00000024268	HTATSF1	96	75.941	Pan_paniscus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	73.499	ENSPPRG00000014209	HTATSF1	98	73.404	Panthera_pardus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	92	72.855	ENSPTIG00000016887	HTATSF1	94	72.740	Panthera_tigris_altaica
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	74.346	ENSPTRG00000044591	HTATSF1	96	75.941	Pan_troglodytes
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	77	70.539	ENSPANG00000010946	HTATSF1	94	83.077	Papio_anubis
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	50	67.188	ENSPCIG00000018896	-	86	67.188	Phascolarctos_cinereus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	50	64.090	ENSPFOG00000007871	htatsf1	81	63.660	Poecilia_formosa
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	50	63.980	ENSPLAG00000007532	htatsf1	82	63.539	Poecilia_latipinna
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	50	64.070	ENSPMEG00000000352	htatsf1	82	63.636	Poecilia_mexicana
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	50	64.484	ENSPREG00000007811	htatsf1	82	64.075	Poecilia_reticulata
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	81	78.365	ENSPPYG00000020765	HTATSF1	82	78.846	Pongo_abelii
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	100	62.827	ENSPCAG00000010576	HTATSF1	98	60.211	Procavia_capensis
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	75.686	ENSPCOG00000021823	HTATSF1	98	75.529	Propithecus_coquereli
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	98	69.920	ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	69.826	Pteropus_vampyrus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	51	63.081	ENSPNYG00000016693	htatsf1	82	63.395	Pundamilia_nyererei
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	51	63.131	ENSPNAG00000006166	htatsf1	90	63.119	Pygocentrus_nattereri
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	82.861	ENSRNOG00000027761	Htatsf1	98	82.940	Rattus_norvegicus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	65.086	ENSRBIG00000035486	HTATSF1	96	65.992	Rhinopithecus_bieti
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	74.440	ENSRROG00000021939	HTATSF1	97	76.113	Rhinopithecus_roxellana
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	72.069	ENSSBOG00000027186	-	97	74.866	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	71.542	ENSSBOG00000017914	-	97	72.027	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	51	69.251	ENSSHAG00000006440	-	99	69.251	Sarcophilus_harrisii
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	50	63.947	ENSSFOG00015012002	htatsf1	76	64.045	Scleropages_formosus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	50	62.785	ENSSLDG00000016880	htatsf1	86	62.785	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	60.578	ENSSARG00000005193	HTATSF1	96	58.498	Sorex_araneus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	50	67.268	ENSSPUG00000014767	HTATSF1	84	67.268	Sphenodon_punctatus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	66.798	ENSSSCG00000023062	HTATSF1	97	66.623	Sus_scrofa
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	85	65.798	ENSTTRG00000002269	HTATSF1	93	66.557	Tursiops_truncatus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	74.316	ENSUAMG00000012048	HTATSF1	98	74.668	Ursus_americanus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	73.180	ENSUMAG00000010393	HTATSF1	98	73.506	Ursus_maritimus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	91	68.848	ENSVPAG00000004569	HTATSF1	98	68.633	Vicugna_pacos
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	73.427	ENSVVUG00000024802	HTATSF1	98	72.892	Vulpes_vulpes
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	50	66.580	ENSXCOG00000006912	htatsf1	82	66.295	Xiphophorus_couchianus
ENSPEMG00000022397	Htatsf1	50	65.722	ENSXMAG00000000490	htatsf1	82	66.116	Xiphophorus_maculatus