EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPEMG00000023313 (Gene tree)
Gene ID: 102918379
Gene Symbol: Ago1
Alias: -
Full Name: argonaute 1%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Peromyscus_maniculatus_bairdii
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 33561 bases
Position: chrKI615453.1:2379340-2412900
Accession: 102918379
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPEMP00000027528	PAZ	PF02170.22	9.5e-29	1	1
ENSPEMP00000027529	PAZ	PF02170.22	9.5e-29	1	1
ENSPEMP00000027528	Piwi	PF02171.17	1.2e-110	1	1
ENSPEMP00000027529	Piwi	PF02171.17	1.2e-110	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPEMT00000031944	-	2577	-	ENSPEMP00000027529	858 (aa)	-	-
ENSPEMT00000031943	-	7416	XM_006980078	ENSPEMP00000027528	857 (aa)	XP_006980140	UPI000012D07D

Gene Model

Click here to download ENSPEMG00000023313's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPEMG00000023313's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPEMG00000023313	Ago1	99	79.722	ENSPEMG00000024271	-	99	80.565
ENSPEMG00000023313	Ago1	98	73.509	ENSPEMG00000022651	-	96	82.857
ENSPEMG00000023313	Ago1	79	75.327	ENSPEMG00000015845	-	96	75.472
ENSPEMG00000023313	Ago1	98	83.890	ENSPEMG00000008137	Ago2	98	83.890

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSG00000092847	AGO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.154	ENSAPOG00000024299	ago1	98	96.916	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSAMEG00000000504	AGO1	100	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPEMG00000023313	Ago1	82	92.023	ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	Amphilophus_citrinellus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.154	ENSAOCG00000017727	ago1	98	96.916	Amphiprion_ocellaris
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.154	ENSAPEG00000004458	ago1	99	96.576	Amphiprion_percula
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.154	ENSATEG00000008523	ago1	98	96.916	Anabas_testudineus
ENSPEMG00000023313	Ago1	99	93.794	ENSAPLG00000010440	AGO1	98	93.794	Anas_platyrhynchos
ENSPEMG00000023313	Ago1	91	99.872	ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	Anolis_carolinensis
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSANAG00000037711	AGO1	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	95.921	ENSACLG00000000890	ago1	98	96.679	Astatotilapia_calliptera
ENSPEMG00000023313	Ago1	80	98.542	ENSAMXG00000001917	ago1	98	98.542	Astyanax_mexicanus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	99.883	ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.883	Bos_taurus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSCJAG00000032023	AGO1	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSCAFG00000003443	AGO1	100	100.000	Canis_familiaris
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	98.133	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	Canis_lupus_dingo
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	99.072	ENSCHIG00000011848	-	100	99.072	Capra_hircus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	78.763	ENSTSYG00000032426	-	99	79.499	Carlito_syrichta
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSTSYG00000009767	-	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSPEMG00000023313	Ago1	89	93.983	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	Cavia_aperea
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSCPOG00000011568	AGO1	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSCCAG00000011823	AGO1	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	99.301	ENSCATG00000031521	AGO1	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSCLAG00000011507	AGO1	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSCSAG00000001091	AGO1	100	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSPEMG00000023313	Ago1	85	94.574	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	Choloepus_hoffmanni
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	99.767	ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	Chrysemys_picta_bellii
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSCANG00000039798	AGO1	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSCGRG00001022708	Ago1	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPEMG00000023313	Ago1	99	100.000	ENSCGRG00000010386	Ago1	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPEMG00000023313	Ago1	99	94.780	ENSCSEG00000001051	ago1	99	94.780	Cynoglossus_semilaevis
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	95.921	ENSCVAG00000018173	ago1	99	96.576	Cyprinodon_variegatus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.503	ENSDARG00000092644	ago1	99	96.145	Danio_rerio
ENSPEMG00000023313	Ago1	91	100.000	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSPEMG00000023313	Ago1	93	98.820	ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSPEMG00000023313	Ago1	84	93.204	ENSETEG00000007626	AGO1	100	93.204	Echinops_telfairi
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSEASG00005012086	AGO1	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSECAG00000024353	AGO1	100	100.000	Equus_caballus
ENSPEMG00000023313	Ago1	92	91.614	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	Erinaceus_europaeus
ENSPEMG00000023313	Ago1	91	97.059	ENSELUG00000016803	ago1	100	97.059	Esox_lucius
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSFCAG00000000746	AGO1	100	100.000	Felis_catus
ENSPEMG00000023313	Ago1	91	92.219	ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	Ficedula_albicollis
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	99.883	ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	Fukomys_damarensis
ENSPEMG00000023313	Ago1	99	92.680	ENSFHEG00000017927	ago1	99	93.001	Fundulus_heteroclitus
ENSPEMG00000023313	Ago1	87	84.646	ENSGMOG00000019413	ago1	100	84.646	Gadus_morhua
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	99.883	ENSGALG00000002249	AGO1	100	99.883	Gallus_gallus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.270	ENSGAFG00000009775	ago1	99	96.023	Gambusia_affinis
ENSPEMG00000023313	Ago1	87	97.204	ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	Gasterosteus_aculeatus
ENSPEMG00000023313	Ago1	91	99.872	ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	Gopherus_agassizii
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSGGOG00000003316	AGO1	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	95.921	ENSHBUG00000010459	ago1	98	96.679	Haplochromis_burtoni
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSHGLG00000011540	AGO1	100	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSHGLG00100005568	AGO1	100	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSPEMG00000023313	Ago1	99	96.576	ENSHCOG00000005708	ago1	99	96.576	Hippocampus_comes
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.154	ENSIPUG00000023216	ago1	99	95.906	Ictalurus_punctatus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSSTOG00000010857	AGO1	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	99.883	ENSJJAG00000019449	Ago1	100	99.883	Jaculus_jaculus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.154	ENSKMAG00000019464	ago1	98	96.916	Kryptolebias_marmoratus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.270	ENSLBEG00000007694	ago1	99	96.023	Labrus_bergylta
ENSPEMG00000023313	Ago1	99	93.522	ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	Latimeria_chalumnae
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	94.056	ENSLOCG00000000504	AGO1	99	93.801	Lepisosteus_oculatus
ENSPEMG00000023313	Ago1	99	100.000	ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	Loxodonta_africana
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSMFAG00000002846	AGO1	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSPEMG00000023313	Ago1	99	95.406	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	95.255	Macaca_mulatta
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.033	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSMLEG00000038388	AGO1	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.154	ENSMAMG00000008381	ago1	98	96.916	Mastacembelus_armatus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	95.921	ENSMZEG00005007996	ago1	98	96.679	Maylandia_zebra
ENSPEMG00000023313	Ago1	99	94.406	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.484	Meleagris_gallopavo
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSMAUG00000015189	Ago1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSMICG00000016147	AGO1	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	99.883	ENSMOCG00000000537	Ago1	100	99.883	Microtus_ochrogaster
ENSPEMG00000023313	Ago1	78	98.657	ENSMMOG00000018459	ago1	93	98.657	Mola_mola
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	99.650	ENSMODG00000023335	AGO1	100	99.650	Monodelphis_domestica
ENSPEMG00000023313	Ago1	99	96.458	ENSMALG00000011057	ago1	99	96.797	Monopterus_albus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	100.000	Mus_caroli
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	100.000	Mus_musculus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	100.000	Mus_pahari
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	100.000	Mus_spretus
ENSPEMG00000023313	Ago1	84	100.000	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSPEMG00000023313	Ago1	61	99.617	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	99.617	Myotis_lucifugus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	99.767	ENSNGAG00000017448	Ago1	100	99.767	Nannospalax_galili
ENSPEMG00000023313	Ago1	91	97.059	ENSNBRG00000010867	ago1	100	97.059	Neolamprologus_brichardi
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	99.883	ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.883	Nomascus_leucogenys
ENSPEMG00000023313	Ago1	84	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSPEMG00000023313	Ago1	93	100.000	ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	Ochotona_princeps
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSODEG00000005321	AGO1	100	100.000	Octodon_degus
ENSPEMG00000023313	Ago1	99	96.340	ENSONIG00000016345	ago1	99	96.679	Oreochromis_niloticus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	91.003	ENSOANG00000002080	AGO1	100	91.977	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	99.883	ENSOCUG00000023116	AGO1	100	99.883	Oryctolagus_cuniculus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.154	ENSORLG00000014965	ago1	98	96.916	Oryzias_latipes
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.154	ENSORLG00020018253	ago1	98	96.916	Oryzias_latipes_hni
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.154	ENSORLG00015003287	ago1	98	96.916	Oryzias_latipes_hsok
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.154	ENSOMEG00000020528	ago1	98	96.916	Oryzias_melastigma
ENSPEMG00000023313	Ago1	99	100.000	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	100.000	Otolemur_garnettii
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	99.883	ENSOARG00000019591	AGO1	100	99.883	Ovis_aries
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSPPAG00000034838	AGO1	100	100.000	Pan_paniscus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSPPRG00000006475	AGO1	100	100.000	Panthera_pardus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	99.767	ENSPTIG00000020991	AGO1	100	99.767	Panthera_tigris_altaica
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSPTRG00000000528	AGO1	100	100.000	Pan_troglodytes
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSPANG00000009060	AGO1	100	100.000	Papio_anubis
ENSPEMG00000023313	Ago1	98	99.050	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	Pelodiscus_sinensis
ENSPEMG00000023313	Ago1	80	97.384	ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	99.650	ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	Phascolarctos_cinereus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.270	ENSPFOG00000005867	ago1	99	96.023	Poecilia_formosa
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.270	ENSPLAG00000002824	ago1	99	98.119	Poecilia_latipinna
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.270	ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	Poecilia_mexicana
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.270	ENSPREG00000006534	ago1	99	96.023	Poecilia_reticulata
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSPPYG00000001551	AGO1	100	100.000	Pongo_abelii
ENSPEMG00000023313	Ago1	58	100.000	ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	Procavia_capensis
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSPCOG00000022061	AGO1	100	100.000	Propithecus_coquereli
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSPVAG00000005082	AGO1	100	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSPEMG00000023313	Ago1	91	92.219	ENSPNYG00000012586	ago1	100	92.219	Pundamilia_nyererei
ENSPEMG00000023313	Ago1	93	92.356	ENSPNAG00000000597	ago1	99	92.356	Pygocentrus_nattereri
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	99.883	ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.883	Rattus_norvegicus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSRBIG00000032611	AGO1	100	100.000	Rhinopithecus_bieti
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSRROG00000044469	AGO1	100	100.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSSBOG00000020867	AGO1	100	100.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPEMG00000023313	Ago1	99	98.592	ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	Sarcophilus_harrisii
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.154	ENSSFOG00015020982	ago1	97	98.121	Scleropages_formosus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.154	ENSSMAG00000002841	ago1	99	95.906	Scophthalmus_maximus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.154	ENSSDUG00000010864	ago1	98	96.916	Seriola_dumerili
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.154	ENSSLDG00000000386	ago1	98	96.916	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPEMG00000023313	Ago1	74	100.000	ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	Sorex_araneus
ENSPEMG00000023313	Ago1	99	99.646	ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	Sphenodon_punctatus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.154	ENSSPAG00000019154	ago1	98	96.916	Stegastes_partitus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	95.266	ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	Takifugu_rubripes
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	95.925	ENSTNIG00000012102	ago1	99	95.678	Tetraodon_nigroviridis
ENSPEMG00000023313	Ago1	84	99.445	ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	Tupaia_belangeri
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	98.250	ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	Tursiops_truncatus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSUAMG00000027154	AGO1	100	100.000	Ursus_americanus
ENSPEMG00000023313	Ago1	99	96.475	ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.231	Ursus_maritimus
ENSPEMG00000023313	Ago1	95	92.289	ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.289	Vicugna_pacos
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	100.000	ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	Vulpes_vulpes
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	98.021	ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	Xenopus_tropicalis
ENSPEMG00000023313	Ago1	91	96.419	ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	Xiphophorus_couchianus
ENSPEMG00000023313	Ago1	100	96.270	ENSXMAG00000021899	ago1	99	96.023	Xiphophorus_maculatus