EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPEMG00000023707 (Gene tree)
Gene ID: 102911337
Gene Symbol: Nrde2
Alias: -
Full Name: NRDE-2%2C necessary for RNA interference%2C domain containing
Gene Type: protein_coding
Species: Peromyscus_maniculatus_bairdii
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 68516 bases
Position: chrKI615860.1:1315336-1383851
Accession: 102911337
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPEMP00000028076	NRDE-2	PF08424.10	2.1e-105	1	1
ENSPEMP00000028077	NRDE-2	PF08424.10	2.2e-105	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPEMT00000032496	-	3252	XM_006991806	ENSPEMP00000028077	1083 (aa)	XP_006991868	-
ENSPEMT00000032495	-	3519	XM_006991807	ENSPEMP00000028076	1172 (aa)	XP_006991869	-

Gene Model

Click here to download ENSPEMG00000023707's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPEMG00000023707's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	81.411	ENSG00000119720	NRDE2	100	86.275	Homo_sapiens
ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	48.375	ENSAPOG00000009202	nrde2	99	45.581	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	76.692	ENSAMEG00000001807	NRDE2	99	77.148	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	49.808	ENSACIG00000014783	nrde2	97	49.002	Amphilophus_citrinellus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	49.067	ENSAOCG00000015576	nrde2	98	46.343	Amphiprion_ocellaris
ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	49.202	ENSAPEG00000001711	nrde2	99	46.281	Amphiprion_percula
ENSPEMG00000023707	Nrde2	100	45.668	ENSATEG00000010247	nrde2	99	45.090	Anabas_testudineus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	98	60.290	ENSAPLG00000015870	NRDE2	99	60.172	Anas_platyrhynchos
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	56.037	ENSACAG00000014571	NRDE2	99	55.725	Anolis_carolinensis
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	77.759	ENSANAG00000025313	NRDE2	99	77.759	Aotus_nancymaae
ENSPEMG00000023707	Nrde2	100	44.735	ENSACLG00000025154	nrde2	99	44.536	Astatotilapia_calliptera
ENSPEMG00000023707	Nrde2	87	64.103	ENSAMXG00000034642	nrde2	91	43.457	Astyanax_mexicanus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	75.322	ENSBTAG00000005427	NRDE2	99	75.322	Bos_taurus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	80.532	ENSCJAG00000017711	NRDE2	99	80.532	Callithrix_jacchus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	75.574	ENSCAFG00000017515	NRDE2	99	75.939	Canis_familiaris
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	77.673	ENSCAFG00020016346	NRDE2	99	78.130	Canis_lupus_dingo
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	74.549	ENSCHIG00000005876	NRDE2	99	74.721	Capra_hircus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	76.506	ENSTSYG00000000161	NRDE2	99	76.592	Carlito_syrichta
ENSPEMG00000023707	Nrde2	97	83.333	ENSCAPG00000012039	NRDE2	99	83.333	Cavia_aperea
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	83.046	ENSCPOG00000002428	NRDE2	99	83.046	Cavia_porcellus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	79.674	ENSCCAG00000024917	NRDE2	99	79.674	Cebus_capucinus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	82.874	ENSCLAG00000015185	NRDE2	99	82.874	Chinchilla_lanigera
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	81.756	ENSCSAG00000011451	NRDE2	99	81.756	Chlorocebus_sabaeus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	75	76.170	ENSCHOG00000006165	NRDE2	74	76.211	Choloepus_hoffmanni
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	63.598	ENSCPBG00000008537	NRDE2	97	63.032	Chrysemys_picta_bellii
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	81.325	ENSCANG00000029067	NRDE2	99	81.325	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	92.216	ENSCGRG00001015658	Nrde2	99	92.130	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	93.190	ENSCGRG00000005062	Nrde2	99	93.190	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPEMG00000023707	Nrde2	97	45.660	ENSCSEG00000000089	nrde2	98	48.189	Cynoglossus_semilaevis
ENSPEMG00000023707	Nrde2	100	44.947	ENSCVAG00000023105	nrde2	99	44.325	Cyprinodon_variegatus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	100	47.714	ENSDARG00000074726	nrde2	88	51.816	Danio_rerio
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	78.835	ENSDNOG00000024057	NRDE2	99	78.866	Dasypus_novemcinctus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	85	83.027	ENSDORG00000003197	Nrde2	99	83.189	Dipodomys_ordii
ENSPEMG00000023707	Nrde2	74	67.742	ENSETEG00000000198	NRDE2	74	67.742	Echinops_telfairi
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	39.426	ENSEBUG00000014552	nrde2	99	39.177	Eptatretus_burgeri
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	81.325	ENSEASG00005020675	NRDE2	99	81.325	Equus_asinus_asinus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	81.373	ENSECAG00000003862	NRDE2	100	80.721	Equus_caballus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	69	87.970	ENSEEUG00000004026	-	73	87.603	Erinaceus_europaeus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	100	47.733	ENSELUG00000005973	nrde2	99	47.844	Esox_lucius
ENSPEMG00000023707	Nrde2	100	78.194	ENSFCAG00000011312	NRDE2	99	78.744	Felis_catus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	59.949	ENSFALG00000012260	NRDE2	99	59.441	Ficedula_albicollis
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	82.373	ENSFDAG00000021350	NRDE2	99	82.373	Fukomys_damarensis
ENSPEMG00000023707	Nrde2	100	45.820	ENSFHEG00000021385	nrde2	99	45.455	Fundulus_heteroclitus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	68	54.375	ENSGMOG00000015815	nrde2	89	54.088	Gadus_morhua
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	59.730	ENSGALG00000010677	NRDE2	99	58.588	Gallus_gallus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	96	48.169	ENSGAFG00000019546	nrde2	97	49.889	Gambusia_affinis
ENSPEMG00000023707	Nrde2	100	48.350	ENSGACG00000012619	nrde2	99	46.672	Gasterosteus_aculeatus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	62.660	ENSGAGG00000003252	NRDE2	99	62.181	Gopherus_agassizii
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	81.325	ENSGGOG00000008835	NRDE2	99	81.325	Gorilla_gorilla
ENSPEMG00000023707	Nrde2	100	45.033	ENSHBUG00000016736	nrde2	99	44.754	Haplochromis_burtoni
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	83.305	ENSHGLG00000006731	NRDE2	99	83.305	Heterocephalus_glaber_female
ENSPEMG00000023707	Nrde2	97	83.523	ENSHGLG00100017736	NRDE2	98	83.523	Heterocephalus_glaber_male
ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	43.340	ENSHCOG00000009559	nrde2	94	42.981	Hippocampus_comes
ENSPEMG00000023707	Nrde2	100	45.167	ENSIPUG00000016129	nrde2	99	44.276	Ictalurus_punctatus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	82.616	ENSSTOG00000001678	NRDE2	99	82.616	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	82.990	ENSJJAG00000000907	Nrde2	99	83.046	Jaculus_jaculus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	49.300	ENSKMAG00000008647	nrde2	99	45.857	Kryptolebias_marmoratus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	49.434	ENSLBEG00000021428	nrde2	98	44.751	Labrus_bergylta
ENSPEMG00000023707	Nrde2	76	59.903	ENSLACG00000013921	NRDE2	99	59.804	Latimeria_chalumnae
ENSPEMG00000023707	Nrde2	100	52.792	ENSLOCG00000009037	nrde2	98	52.044	Lepisosteus_oculatus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	80.610	ENSLAFG00000004966	NRDE2	99	77.583	Loxodonta_africana
ENSPEMG00000023707	Nrde2	85	83.731	ENSMMUG00000010442	NRDE2	100	85.784	Macaca_mulatta
ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	48.004	ENSMAMG00000013452	nrde2	99	44.490	Mastacembelus_armatus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	100	44.735	ENSMZEG00005008319	nrde2	99	44.454	Maylandia_zebra
ENSPEMG00000023707	Nrde2	90	62.828	ENSMGAG00000013052	NRDE2	99	62.819	Meleagris_gallopavo
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	93.534	ENSMAUG00000018578	Nrde2	99	93.534	Mesocricetus_auratus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	82.444	ENSMICG00000016741	NRDE2	99	82.444	Microcebus_murinus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	90.086	ENSMOCG00000014472	Nrde2	99	90.172	Microtus_ochrogaster
ENSPEMG00000023707	Nrde2	78	48.568	ENSMMOG00000004703	nrde2	93	48.225	Mola_mola
ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	68.379	ENSMODG00000002711	NRDE2	100	68.379	Monodelphis_domestica
ENSPEMG00000023707	Nrde2	96	47.256	ENSMALG00000021869	nrde2	93	47.740	Monopterus_albus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	90.690	MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	99	90.690	Mus_caroli
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	90.000	ENSMUSG00000021179	Nrde2	99	90.000	Mus_musculus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	90.431	MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	99	90.431	Mus_pahari
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	90.345	MGP_SPRETEiJ_G0018865	Nrde2	99	90.345	Mus_spretus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	75.086	ENSMPUG00000008135	NRDE2	99	75.172	Mustela_putorius_furo
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	81.153	ENSMLUG00000007484	NRDE2	99	81.153	Myotis_lucifugus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	86.477	ENSNGAG00000002993	Nrde2	99	86.477	Nannospalax_galili
ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	48.514	ENSNBRG00000010184	nrde2	97	48.109	Neolamprologus_brichardi
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	79.472	ENSNLEG00000017032	NRDE2	100	81.377	Nomascus_leucogenys
ENSPEMG00000023707	Nrde2	83	63.322	ENSMEUG00000011097	NRDE2	77	63.051	Notamacropus_eugenii
ENSPEMG00000023707	Nrde2	65	85.859	ENSOPRG00000001375	-	60	85.859	Ochotona_princeps
ENSPEMG00000023707	Nrde2	97	81.683	ENSODEG00000012422	NRDE2	99	81.683	Octodon_degus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	100	45.207	ENSONIG00000019512	nrde2	99	45.175	Oreochromis_niloticus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	78.007	ENSOCUG00000010083	NRDE2	99	78.007	Oryctolagus_cuniculus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	49.125	ENSORLG00000017730	nrde2	98	45.813	Oryzias_latipes
ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	47.838	ENSORLG00020015965	nrde2	99	44.262	Oryzias_latipes_hni
ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	48.369	ENSORLG00015012437	nrde2	99	44.426	Oryzias_latipes_hsok
ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	47.993	ENSOMEG00000010890	nrde2	99	45.559	Oryzias_melastigma
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	81.615	ENSOGAG00000006624	NRDE2	99	81.615	Otolemur_garnettii
ENSPEMG00000023707	Nrde2	97	73.087	ENSOARG00000003475	NRDE2	100	73.263	Ovis_aries
ENSPEMG00000023707	Nrde2	97	80.982	ENSPPAG00000034133	NRDE2	99	83.839	Pan_paniscus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	100	78.961	ENSPPRG00000006422	NRDE2	99	79.088	Panthera_pardus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	100	78.876	ENSPTIG00000009989	NRDE2	99	79.002	Panthera_tigris_altaica
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	81.670	ENSPTRG00000023399	NRDE2	99	81.670	Pan_troglodytes
ENSPEMG00000023707	Nrde2	100	47.285	ENSPKIG00000009331	nrde2	99	46.167	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	62.277	ENSPSIG00000005588	NRDE2	99	62.222	Pelodiscus_sinensis
ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	47.070	ENSPMGG00000024089	nrde2	90	46.550	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	55	43.368	ENSPMAG00000003270	-	99	43.284	Petromyzon_marinus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	70.231	ENSPCIG00000018567	NRDE2	98	73.142	Phascolarctos_cinereus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	46.998	ENSPFOG00000013217	nrde2	99	44.573	Poecilia_formosa
ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	47.491	ENSPLAG00000022350	nrde2	99	44.947	Poecilia_latipinna
ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	47.491	ENSPMEG00000000778	nrde2	99	45.193	Poecilia_mexicana
ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	47.491	ENSPREG00000009066	nrde2	99	45.148	Poecilia_reticulata
ENSPEMG00000023707	Nrde2	89	81.075	ENSPPYG00000006245	NRDE2	99	81.075	Pongo_abelii
ENSPEMG00000023707	Nrde2	82	92.308	ENSPCAG00000016399	NRDE2	81	92.453	Procavia_capensis
ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	80.884	ENSPCOG00000024684	NRDE2	100	80.884	Propithecus_coquereli
ENSPEMG00000023707	Nrde2	97	76.984	ENSPVAG00000010023	NRDE2	100	76.984	Pteropus_vampyrus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	98	44.417	ENSPNYG00000022833	nrde2	93	49.224	Pundamilia_nyererei
ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	49.125	ENSPNAG00000015807	nrde2	92	49.411	Pygocentrus_nattereri
ENSPEMG00000023707	Nrde2	91	88.407	ENSRNOG00000004004	Nrde2	100	88.407	Rattus_norvegicus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	80.293	ENSSBOG00000024346	NRDE2	99	80.293	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	71.001	ENSSHAG00000016736	NRDE2	96	71.098	Sarcophilus_harrisii
ENSPEMG00000023707	Nrde2	100	48.219	ENSSFOG00015011794	nrde2	99	47.775	Scleropages_formosus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	100	45.316	ENSSMAG00000011671	nrde2	98	44.870	Scophthalmus_maximus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	100	45.440	ENSSDUG00000017948	nrde2	99	45.884	Seriola_dumerili
ENSPEMG00000023707	Nrde2	95	48.360	ENSSLDG00000023798	nrde2	98	49.779	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	64.878	ENSSPUG00000006348	NRDE2	96	65.282	Sphenodon_punctatus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	49.373	ENSSPAG00000000539	nrde2	99	47.702	Stegastes_partitus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	80.825	ENSSSCG00000002434	NRDE2	99	80.825	Sus_scrofa
ENSPEMG00000023707	Nrde2	98	61.212	ENSTGUG00000012462	-	99	60.748	Taeniopygia_guttata
ENSPEMG00000023707	Nrde2	86	48.411	ENSTRUG00000002798	nrde2	98	47.854	Takifugu_rubripes
ENSPEMG00000023707	Nrde2	88	83.614	ENSTBEG00000011834	NRDE2	94	76.111	Tupaia_belangeri
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	79.690	ENSTTRG00000013583	NRDE2	99	79.690	Tursiops_truncatus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	79.528	ENSUAMG00000004159	NRDE2	99	75.556	Ursus_americanus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	96	76.064	ENSUMAG00000006393	NRDE2	99	76.178	Ursus_maritimus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	77.126	ENSVVUG00000018202	NRDE2	99	77.494	Vulpes_vulpes
ENSPEMG00000023707	Nrde2	99	53.077	ENSXETG00000015708	nrde2	99	52.825	Xenopus_tropicalis
ENSPEMG00000023707	Nrde2	96	46.717	ENSXCOG00000013298	nrde2	96	46.168	Xiphophorus_couchianus
ENSPEMG00000023707	Nrde2	100	45.344	ENSXMAG00000009320	nrde2	99	44.881	Xiphophorus_maculatus