EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000000020 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 48680 bases
Position: chrKI520195.1:2195-50874
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000000020	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-157	1	30
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ENSPFOP00000000020	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-157	3	30
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ENSPFOP00000000020	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-157	6	30
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ENSPFOP00000000020	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-157	8	30
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ENSPFOP00000000020	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-157	11	30
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ENSPFOP00000000020	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-157	14	30
ENSPFOP00000000020	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-157	15	30
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ENSPFOP00000000020	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-157	28	30
ENSPFOP00000000020	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-157	29	30
ENSPFOP00000000020	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-157	30	30
ENSPFOP00000022368	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-15	1	3
ENSPFOP00000022368	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-15	2	3
ENSPFOP00000022368	zf-C2H2	PF00096.26	1.6e-15	3	3
ENSPFOP00000024556	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-15	1	3
ENSPFOP00000024556	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-15	2	3
ENSPFOP00000024556	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-15	3	3
ENSPFOP00000000020	zf-met	PF12874.7	2e-30	1	2
ENSPFOP00000000020	zf-met	PF12874.7	2e-30	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000000020	-	2943	-	ENSPFOP00000000020	981 (aa)	-	A0A087X2L7
ENSPFOT00000022193	-	1646	-	ENSPFOP00000024556	367 (aa)	-	A0A096LZG5
ENSPFOT00000022042	-	1698	-	ENSPFOP00000022368	367 (aa)	-	A0A096LT77

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPFOG00000000020	-	99	51.155	ENSPFOG00000004377	-	85	50.847
ENSPFOG00000000020	-	100	91.716	ENSPFOG00000022286	-	100	84.136
ENSPFOG00000000020	-	100	60.769	ENSPFOG00000000774	-	65	60.769
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ENSPFOG00000000020	-	99	55.219	ENSPFOG00000022343	-	100	52.542
ENSPFOG00000000020	-	100	46.945	ENSPFOG00000023187	-	79	46.945
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ENSPFOG00000000020	-	99	51.827	ENSPFOG00000000667	-	67	51.827
ENSPFOG00000000020	-	99	62.051	ENSPFOG00000018245	-	98	62.051
ENSPFOG00000000020	-	99	52.893	ENSPFOG00000020112	-	96	52.542
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