EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000000254 (Gene tree)
Gene ID: 103130059
Gene Symbol: mtrf1
Alias: -
Full Name: mitochondrial translation release factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4540 bases
Position: chrKI520213.1:49128-53667
Accession: 103130059
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000000256	RF-1	PF00472.20	4.1e-39	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000000257	-	1320	-	ENSPFOP00000000256	439 (aa)	XP_007541411	A0A087X3A3

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPFOG00000000254	mtrf1	85	43.583	ENSPFOG00000008440	-	87	46.970

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	55.000	ENSG00000120662	MTRF1	85	55.000	Homo_sapiens
ENSPFOG00000000254	mtrf1	88	76.215	ENSAPOG00000010181	mtrf1	95	76.215	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	55.759	ENSAMEG00000008696	MTRF1	86	55.759	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPFOG00000000254	mtrf1	55	81.452	ENSACIG00000001495	mtrf1	100	81.452	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	99	75.459	ENSAOCG00000002832	mtrf1	97	75.459	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000000254	mtrf1	97	75.814	ENSAPEG00000014844	mtrf1	96	75.814	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000000254	mtrf1	91	73.580	ENSATEG00000017403	mtrf1	97	73.580	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	96	51.429	ENSAPLG00000009317	MTRF1	95	51.429	Anas_platyrhynchos
ENSPFOG00000000254	mtrf1	92	52.427	ENSACAG00000000897	MTRF1	93	52.427	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000000254	mtrf1	76	57.015	ENSANAG00000025310	-	92	57.015	Aotus_nancymaae
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	51.706	ENSANAG00000023063	-	84	51.706	Aotus_nancymaae
ENSPFOG00000000254	mtrf1	98	74.483	ENSACLG00000023945	mtrf1	97	74.483	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000000254	mtrf1	53	74.569	ENSAMXG00000031859	mtrf1	96	74.569	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	90	54.156	ENSBTAG00000012260	MTRF1	88	55.676	Bos_taurus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	55.000	ENSCJAG00000017739	MTRF1	96	64.671	Callithrix_jacchus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	56.021	ENSCAFG00000004795	MTRF1	86	56.021	Canis_familiaris
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	56.021	ENSCAFG00020018178	MTRF1	86	56.021	Canis_lupus_dingo
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	55.263	ENSCHIG00000011810	MTRF1	85	55.263	Capra_hircus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	56.053	ENSTSYG00000006976	MTRF1	85	56.053	Carlito_syrichta
ENSPFOG00000000254	mtrf1	88	54.545	ENSCAPG00000013163	MTRF1	89	54.545	Cavia_aperea
ENSPFOG00000000254	mtrf1	88	54.286	ENSCPOG00000005264	MTRF1	86	54.286	Cavia_porcellus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	55.789	ENSCCAG00000035116	MTRF1	85	55.789	Cebus_capucinus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	55.381	ENSCATG00000009909	MTRF1	86	55.381	Cercocebus_atys
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	54.737	ENSCLAG00000000582	MTRF1	85	54.737	Chinchilla_lanigera
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	55.118	ENSCSAG00000017835	MTRF1	86	55.118	Chlorocebus_sabaeus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	80	54.857	ENSCHOG00000011915	-	86	54.857	Choloepus_hoffmanni
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	54.068	ENSCPBG00000007969	MTRF1	85	54.068	Chrysemys_picta_bellii
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	55.000	ENSCANG00000040353	MTRF1	85	55.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	86	57.447	ENSCGRG00001003065	Mtrf1	85	57.447	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPFOG00000000254	mtrf1	86	57.447	ENSCGRG00000002570	Mtrf1	85	57.447	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPFOG00000000254	mtrf1	98	66.210	ENSCSEG00000005667	mtrf1	96	66.210	Cynoglossus_semilaevis
ENSPFOG00000000254	mtrf1	100	77.778	ENSCVAG00000021729	mtrf1	100	77.778	Cyprinodon_variegatus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	53	65.086	ENSDARG00000033579	mtrf1	99	65.086	Danio_rerio
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	53.786	ENSDNOG00000034196	MTRF1	96	61.745	Dasypus_novemcinctus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	56.053	ENSDORG00000016429	Mtrf1	85	56.053	Dipodomys_ordii
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	55.118	ENSETEG00000014811	MTRF1	85	55.118	Echinops_telfairi
ENSPFOG00000000254	mtrf1	52	55.459	ENSEBUG00000000778	mtrf1	94	55.459	Eptatretus_burgeri
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	55.263	ENSEASG00005015715	MTRF1	85	55.263	Equus_asinus_asinus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	55.000	ENSECAG00000014389	MTRF1	83	55.000	Equus_caballus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	44.010	ENSEEUG00000004450	-	86	43.603	Erinaceus_europaeus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	99	63.927	ENSELUG00000006544	mtrf1	98	63.927	Esox_lucius
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	56.545	ENSFCAG00000031635	MTRF1	86	56.545	Felis_catus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	88	52.577	ENSFALG00000008036	MTRF1	96	52.577	Ficedula_albicollis
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	55.263	ENSFDAG00000017881	MTRF1	85	55.263	Fukomys_damarensis
ENSPFOG00000000254	mtrf1	98	79.953	ENSFHEG00000019043	mtrf1	98	79.953	Fundulus_heteroclitus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	86	66.138	ENSGMOG00000008608	mtrf1	99	66.138	Gadus_morhua
ENSPFOG00000000254	mtrf1	86	54.881	ENSGALG00000016951	MTRF1	83	54.881	Gallus_gallus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	100	92.971	ENSGAFG00000007093	mtrf1	100	92.971	Gambusia_affinis
ENSPFOG00000000254	mtrf1	85	75.332	ENSGACG00000013728	mtrf1	98	75.332	Gasterosteus_aculeatus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	72	57.643	ENSGAGG00000025696	MTRF1	99	57.643	Gopherus_agassizii
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	55.263	ENSGGOG00000002529	MTRF1	85	55.263	Gorilla_gorilla
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	53.947	ENSHGLG00000003210	MTRF1	85	53.947	Heterocephalus_glaber_female
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	53.947	ENSHGLG00100011843	MTRF1	85	53.947	Heterocephalus_glaber_male
ENSPFOG00000000254	mtrf1	94	67.883	ENSHCOG00000009449	mtrf1	93	67.883	Hippocampus_comes
ENSPFOG00000000254	mtrf1	86	55.585	ENSSTOG00000021682	MTRF1	85	55.585	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	96	50.917	ENSJJAG00000017590	Mtrf1	98	50.917	Jaculus_jaculus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	99	73.636	ENSKMAG00000003231	mtrf1	97	73.636	Kryptolebias_marmoratus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	53	84.483	ENSLBEG00000023151	mtrf1	93	84.483	Labrus_bergylta
ENSPFOG00000000254	mtrf1	53	84.483	ENSLBEG00000027169	-	93	84.483	Labrus_bergylta
ENSPFOG00000000254	mtrf1	86	59.788	ENSLACG00000010582	MTRF1	85	59.788	Latimeria_chalumnae
ENSPFOG00000000254	mtrf1	86	61.111	ENSLOCG00000005937	MTRF1	85	61.111	Lepisosteus_oculatus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	55.000	ENSLAFG00000022177	-	85	55.000	Loxodonta_africana
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	42.782	ENSLAFG00000030499	-	84	42.782	Loxodonta_africana
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	55.381	ENSMFAG00000037972	MTRF1	86	55.381	Macaca_fascicularis
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	55.381	ENSMNEG00000035487	MTRF1	86	55.381	Macaca_nemestrina
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	55.381	ENSMLEG00000033582	MTRF1	86	55.381	Mandrillus_leucophaeus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	98	74.537	ENSMAMG00000022048	mtrf1	97	74.537	Mastacembelus_armatus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	98	74.483	ENSMZEG00005017922	mtrf1	97	74.483	Maylandia_zebra
ENSPFOG00000000254	mtrf1	86	55.145	ENSMGAG00000014971	MTRF1	91	55.145	Meleagris_gallopavo
ENSPFOG00000000254	mtrf1	88	55.584	ENSMAUG00000011661	Mtrf1	86	55.584	Mesocricetus_auratus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	91	54.774	ENSMICG00000033131	MTRF1	89	54.774	Microcebus_murinus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	95	53.125	ENSMOCG00000011945	Mtrf1	92	53.125	Microtus_ochrogaster
ENSPFOG00000000254	mtrf1	53	69.828	ENSMMOG00000013394	mtrf1	95	69.828	Mola_mola
ENSPFOG00000000254	mtrf1	86	54.787	ENSMODG00000014772	MTRF1	85	54.787	Monodelphis_domestica
ENSPFOG00000000254	mtrf1	98	74.541	ENSMALG00000013274	mtrf1	99	74.541	Monopterus_albus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	94	52.113	MGP_CAROLIEiJ_G0019539	Mtrf1	95	52.113	Mus_caroli
ENSPFOG00000000254	mtrf1	90	55.473	ENSMUSG00000022022	Mtrf1	90	55.473	Mus_musculus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	94	52.336	MGP_PahariEiJ_G0030557	Mtrf1	96	52.336	Mus_pahari
ENSPFOG00000000254	mtrf1	89	55.779	MGP_SPRETEiJ_G0020435	Mtrf1	89	55.779	Mus_spretus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	56.021	ENSMPUG00000001874	MTRF1	86	56.021	Mustela_putorius_furo
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	56.579	ENSMLUG00000017237	MTRF1	85	56.579	Myotis_lucifugus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	97	52.448	ENSNGAG00000014460	Mtrf1	95	52.448	Nannospalax_galili
ENSPFOG00000000254	mtrf1	53	85.776	ENSNBRG00000004634	mtrf1	98	85.776	Neolamprologus_brichardi
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	55.000	ENSNLEG00000001236	MTRF1	85	55.000	Nomascus_leucogenys
ENSPFOG00000000254	mtrf1	86	53.439	ENSMEUG00000001846	MTRF1	85	53.439	Notamacropus_eugenii
ENSPFOG00000000254	mtrf1	62	33.088	ENSOPRG00000006450	-	83	33.088	Ochotona_princeps
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	54.737	ENSODEG00000005782	MTRF1	85	54.737	Octodon_degus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	80.628	ENSONIG00000012476	mtrf1	98	80.628	Oreochromis_niloticus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	69	58.824	ENSOANG00000003383	-	97	58.824	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	55.789	ENSOCUG00000025207	MTRF1	85	55.789	Oryctolagus_cuniculus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	100	70.022	ENSORLG00000003225	mtrf1	100	70.022	Oryzias_latipes
ENSPFOG00000000254	mtrf1	100	69.933	ENSORLG00020021048	mtrf1	100	69.933	Oryzias_latipes_hni
ENSPFOG00000000254	mtrf1	100	69.575	ENSORLG00015020957	mtrf1	100	69.575	Oryzias_latipes_hsok
ENSPFOG00000000254	mtrf1	100	69.595	ENSOMEG00000002022	mtrf1	100	69.595	Oryzias_melastigma
ENSPFOG00000000254	mtrf1	80	58.000	ENSOGAG00000009719	-	78	58.000	Otolemur_garnettii
ENSPFOG00000000254	mtrf1	74	50.155	ENSOGAG00000026411	-	99	50.155	Otolemur_garnettii
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	55.263	ENSOARG00000006994	MTRF1	85	55.263	Ovis_aries
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	55.000	ENSPPAG00000000050	MTRF1	85	55.000	Pan_paniscus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	56.545	ENSPPRG00000009511	MTRF1	86	56.545	Panthera_pardus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	56.545	ENSPTIG00000006673	MTRF1	86	56.545	Panthera_tigris_altaica
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	55.000	ENSPTRG00000005815	MTRF1	85	55.000	Pan_troglodytes
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	55.381	ENSPANG00000010809	MTRF1	86	55.381	Papio_anubis
ENSPFOG00000000254	mtrf1	85	59.249	ENSPKIG00000015711	mtrf1	87	59.249	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	53.806	ENSPSIG00000004773	MTRF1	85	53.806	Pelodiscus_sinensis
ENSPFOG00000000254	mtrf1	53	81.466	ENSPMGG00000006724	mtrf1	94	81.466	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	96	53.318	ENSPEMG00000020982	Mtrf1	93	53.318	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPFOG00000000254	mtrf1	76	49.854	ENSPMAG00000009849	mtrf1	98	50.146	Petromyzon_marinus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	86	55.172	ENSPCIG00000012940	MTRF1	85	55.172	Phascolarctos_cinereus
ENSPFOG00000000254	mtrf1	100	99.544	ENSPLAG00000014280	mtrf1	100	99.544	Poecilia_latipinna
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ENSPFOG00000000254	mtrf1	54	87.448	ENSPREG00000018619	mtrf1	99	87.448	Poecilia_reticulata
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