EuRBPDB

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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000000577 (Gene tree)
Gene ID: 103130385
Gene Symbol: rybpb
Alias: -
Full Name: RING1 and YY1 binding protein
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 46730 bases
Position: chrKI520240.1:181503-228232
Accession: 103130385
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000000530	zf-RanBP	PF00641.18	5.1e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000000531	-	3930	XM_007541769	ENSPFOP00000000530	268 (aa)	XP_007541831	A0A087X427

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPFOG00000000577	rybpb	66	68.889	ENSPFOG00000015547	yaf2	97	68.889
ENSPFOG00000000577	rybpb	62	76.000	ENSPFOG00000005422	YAF2	96	71.429

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPFOG00000000577	rybpb	59	77.465	ENSG00000015153	YAF2	98	76.364	Homo_sapiens
ENSPFOG00000000577	rybpb	51	71.533	ENSG00000163602	RYBP	99	62.308	Homo_sapiens
ENSPFOG00000000577	rybpb	99	41.264	ENSAPOG00000012651	yaf2	97	67.778	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000000577	rybpb	55	78.378	ENSAPOG00000016986	YAF2	95	64.078	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000000577	rybpb	100	91.418	ENSAPOG00000014342	rybpb	100	91.418	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000000577	rybpb	53	75.000	ENSAMEG00000013846	YAF2	99	54.023	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPFOG00000000577	rybpb	51	71.533	ENSAMEG00000015131	RYBP	69	62.452	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPFOG00000000577	rybpb	56	78.378	ENSACIG00000002635	YAF2	90	73.333	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000000577	rybpb	76	95.455	ENSACIG00000021280	rybpb	99	69.403	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000000577	rybpb	100	91.045	ENSAOCG00000001679	rybpb	100	91.045	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000000577	rybpb	99	41.264	ENSAOCG00000015759	yaf2	97	67.778	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000000577	rybpb	60	78.378	ENSAOCG00000024572	YAF2	89	73.333	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000000577	rybpb	60	78.378	ENSAPEG00000005856	YAF2	89	73.333	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000000577	rybpb	99	41.264	ENSAPEG00000017939	yaf2	97	67.778	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000000577	rybpb	100	91.045	ENSAPEG00000021704	rybpb	100	91.045	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000000577	rybpb	99	39.033	ENSATEG00000012513	yaf2	97	68.889	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000000577	rybpb	100	90.672	ENSATEG00000008482	rybpb	100	90.672	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000000577	rybpb	55	77.027	ENSATEG00000018504	YAF2	95	63.107	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000000577	rybpb	97	62.595	ENSAPLG00000013882	RYBP	97	63.359	Anas_platyrhynchos
ENSPFOG00000000577	rybpb	60	77.465	ENSACAG00000003204	YAF2	96	66.292	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000000577	rybpb	100	64.312	ENSANAG00000027832	RYBP	99	63.569	Aotus_nancymaae
ENSPFOG00000000577	rybpb	61	62.222	ENSANAG00000021963	YAF2	99	54.054	Aotus_nancymaae
ENSPFOG00000000577	rybpb	100	89.179	ENSACLG00000023062	rybpb	100	89.179	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000000577	rybpb	58	79.452	ENSACLG00000000456	YAF2	99	72.222	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000000577	rybpb	60	72.000	ENSACLG00000001098	yaf2	98	66.667	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000000577	rybpb	100	64.655	ENSAMXG00000043350	rybpa	72	64.655	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000000577	rybpb	58	74.324	ENSAMXG00000036088	YAF2	92	70.787	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000000577	rybpb	57	72.973	ENSAMXG00000035723	YAF2	92	66.292	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000000577	rybpb	100	74.254	ENSAMXG00000034604	rybpb	100	75.273	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000000577	rybpb	100	64.312	ENSBTAG00000022689	RYBP	99	63.569	Bos_taurus
ENSPFOG00000000577	rybpb	59	77.465	ENSBTAG00000015025	YAF2	99	64.516	Bos_taurus
ENSPFOG00000000577	rybpb	59	77.465	ENSCJAG00000017762	YAF2	99	64.516	Callithrix_jacchus
ENSPFOG00000000577	rybpb	100	64.312	ENSCJAG00000045849	RYBP	99	63.569	Callithrix_jacchus
ENSPFOG00000000577	rybpb	51	71.533	ENSCAFG00000006441	RYBP	90	62.452	Canis_familiaris
ENSPFOG00000000577	rybpb	56	54.023	ENSCAFG00000009789	YAF2	99	52.632	Canis_familiaris
ENSPFOG00000000577	rybpb	100	64.312	ENSCAFG00020016734	RYBP	99	63.569	Canis_lupus_dingo
ENSPFOG00000000577	rybpb	59	77.465	ENSCHIG00000025941	YAF2	99	64.516	Capra_hircus
ENSPFOG00000000577	rybpb	100	64.312	ENSCHIG00000026041	RYBP	99	63.569	Capra_hircus
ENSPFOG00000000577	rybpb	51	71.533	ENSCPOG00000032177	RYBP	95	62.162	Cavia_porcellus
ENSPFOG00000000577	rybpb	56	74.194	ENSCPOG00000015156	YAF2	99	55.319	Cavia_porcellus
ENSPFOG00000000577	rybpb	59	77.465	ENSCCAG00000018849	YAF2	99	64.516	Cebus_capucinus
ENSPFOG00000000577	rybpb	100	64.312	ENSCCAG00000025583	RYBP	99	63.569	Cebus_capucinus
ENSPFOG00000000577	rybpb	61	77.465	ENSCATG00000034263	YAF2	85	75.439	Cercocebus_atys
ENSPFOG00000000577	rybpb	100	64.312	ENSCATG00000034872	RYBP	99	63.569	Cercocebus_atys
ENSPFOG00000000577	rybpb	51	71.533	ENSCLAG00000006008	RYBP	100	62.308	Chinchilla_lanigera
ENSPFOG00000000577	rybpb	100	64.312	ENSCSAG00000011518	RYBP	99	63.569	Chlorocebus_sabaeus
ENSPFOG00000000577	rybpb	52	77.358	ENSCHOG00000002266	YAF2	99	54.762	Choloepus_hoffmanni
ENSPFOG00000000577	rybpb	59	77.465	ENSCPBG00000015509	YAF2	95	80.769	Chrysemys_picta_bellii
ENSPFOG00000000577	rybpb	97	62.595	ENSCPBG00000006439	RYBP	88	63.359	Chrysemys_picta_bellii
ENSPFOG00000000577	rybpb	51	71.533	ENSCANG00000013251	RYBP	99	60.517	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPFOG00000000577	rybpb	61	77.465	ENSCANG00000042756	YAF2	85	75.439	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPFOG00000000577	rybpb	60	77.465	ENSCGRG00001021765	Yaf2	99	63.830	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPFOG00000000577	rybpb	100	64.684	ENSCGRG00001020152	Rybp	99	63.569	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPFOG00000000577	rybpb	51	72.263	ENSCGRG00000009553	Rybp	90	62.452	Cricetulus_griseus_crigri
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ENSPFOG00000000577	rybpb	99	41.111	ENSCSEG00000010509	yaf2	97	67.778	Cynoglossus_semilaevis
ENSPFOG00000000577	rybpb	100	84.229	ENSCSEG00000007805	rybpb	100	84.229	Cynoglossus_semilaevis
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ENSPFOG00000000577	rybpb	59	78.378	ENSDARG00000015966	yaf2	97	70.787	Danio_rerio
ENSPFOG00000000577	rybpb	97	59.615	ENSDORG00000015021	Rybp	96	58.846	Dipodomys_ordii
ENSPFOG00000000577	rybpb	55	73.333	ENSDORG00000024619	Yaf2	99	59.259	Dipodomys_ordii
ENSPFOG00000000577	rybpb	83	38.393	ENSEBUG00000010088	RYBP	52	65.789	Eptatretus_burgeri
ENSPFOG00000000577	rybpb	51	76.190	ENSEBUG00000004738	RYBP	68	71.875	Eptatretus_burgeri
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ENSPFOG00000000577	rybpb	96	62.548	ENSFALG00000013425	RYBP	84	63.359	Ficedula_albicollis
ENSPFOG00000000577	rybpb	51	71.533	ENSFDAG00000012183	RYBP	100	62.308	Fukomys_damarensis
ENSPFOG00000000577	rybpb	100	89.925	ENSFHEG00000017560	rybpb	100	89.925	Fundulus_heteroclitus
ENSPFOG00000000577	rybpb	57	78.378	ENSFHEG00000005397	YAF2	87	75.000	Fundulus_heteroclitus
ENSPFOG00000000577	rybpb	66	68.889	ENSFHEG00000007387	yaf2	97	68.889	Fundulus_heteroclitus
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ENSPFOG00000000577	rybpb	59	77.465	ENSGALG00000009540	YAF2	99	64.516	Gallus_gallus
ENSPFOG00000000577	rybpb	66	68.889	ENSGAFG00000017418	yaf2	94	68.889	Gambusia_affinis
ENSPFOG00000000577	rybpb	60	77.027	ENSGAFG00000001176	YAF2	96	73.810	Gambusia_affinis
ENSPFOG00000000577	rybpb	100	98.507	ENSGAFG00000015676	rybpb	100	98.507	Gambusia_affinis
ENSPFOG00000000577	rybpb	52	72.185	ENSGACG00000011809	rybpb	100	62.617	Gasterosteus_aculeatus
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ENSPFOG00000000577	rybpb	59	77.465	ENSGAGG00000000538	YAF2	99	64.516	Gopherus_agassizii
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ENSPFOG00000000577	rybpb	58	79.452	ENSHBUG00000001690	YAF2	99	72.222	Haplochromis_burtoni
ENSPFOG00000000577	rybpb	100	64.312	ENSHGLG00000003273	RYBP	99	63.569	Heterocephalus_glaber_female
ENSPFOG00000000577	rybpb	99	52.652	ENSHGLG00000009354	-	99	52.652	Heterocephalus_glaber_female
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ENSPFOG00000000577	rybpb	51	71.533	ENSHGLG00100010608	-	96	62.308	Heterocephalus_glaber_male
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