EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000001000 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC103130545
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4329 bases
Position: chrKI520256.1:21-4349
Accession: 103130545
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000000940	MMR_HSR1	PF01926.23	3.1e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000000942	-	3176	XM_007541962	ENSPFOP00000000940	538 (aa)	XP_007542024	A0A087X587

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPFOG00000001000	-	88	59.420	ENSPFOG00000024669	-	98	59.420
ENSPFOG00000001000	-	86	30.992	ENSPFOG00000020108	-	93	30.579
ENSPFOG00000001000	-	82	51.794	ENSPFOG00000023267	-	99	51.794
ENSPFOG00000001000	-	93	46.911	ENSPFOG00000009476	-	100	46.973
ENSPFOG00000001000	-	89	33.267	ENSPFOG00000010758	-	78	33.068
ENSPFOG00000001000	-	96	73.321	ENSPFOG00000021874	-	100	73.512
ENSPFOG00000001000	-	94	58.301	ENSPFOG00000020664	-	96	58.301
ENSPFOG00000001000	-	94	54.651	ENSPFOG00000020555	-	98	54.651
ENSPFOG00000001000	-	93	57.312	ENSPFOG00000020556	-	97	57.115
ENSPFOG00000001000	-	94	54.191	ENSPFOG00000001008	-	98	54.191
ENSPFOG00000001000	-	93	54.403	ENSPFOG00000019823	-	97	54.191
ENSPFOG00000001000	-	92	77.264	ENSPFOG00000022760	-	99	77.264
ENSPFOG00000001000	-	94	54.876	ENSPFOG00000020973	-	96	56.592

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPFOG00000001000	-	81	34.130	ENSAPOG00000016636	-	91	34.130	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000001000	-	96	56.979	ENSAPOG00000021040	-	87	56.597	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000001000	-	96	56.464	ENSAPOG00000005726	-	97	56.464	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000001000	-	94	56.699	ENSAPOG00000005749	-	94	56.505	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000001000	-	92	59.245	ENSACIG00000012148	-	94	59.046	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001000	-	86	33.197	ENSACIG00000022269	-	81	33.197	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001000	-	93	59.020	ENSACIG00000001022	-	96	59.020	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001000	-	93	58.476	ENSACIG00000021449	-	97	58.476	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001000	-	93	56.505	ENSACIG00000008256	-	96	56.699	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001000	-	93	56.471	ENSACIG00000002240	-	96	56.471	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001000	-	96	54.633	ENSACIG00000008246	-	94	54.440	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001000	-	93	58.235	ENSACIG00000021889	-	93	58.235	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001000	-	90	60.852	ENSACIG00000021882	-	92	60.446	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001000	-	93	55.206	ENSACIG00000014898	-	94	55.126	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001000	-	71	65.544	ENSACIG00000023712	-	96	64.767	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001000	-	81	37.104	ENSACIG00000009814	-	80	37.104	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001000	-	97	56.497	ENSACIG00000003888	-	99	57.143	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001000	-	92	55.912	ENSACIG00000014973	-	95	55.912	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001000	-	94	57.171	ENSACIG00000014982	-	98	57.171	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001000	-	91	56.634	ENSACIG00000023726	-	94	56.832	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001000	-	94	57.171	ENSACIG00000014961	-	94	57.171	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001000	-	95	56.061	ENSACIG00000003168	-	98	56.439	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001000	-	91	56.487	ENSACIG00000008585	-	98	56.487	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001000	-	95	55.682	ENSACIG00000010569	-	97	54.924	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001000	-	93	53.557	ENSAPEG00000000062	-	94	53.557	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000001000	-	95	57.885	ENSATEG00000012558	-	96	57.885	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000001000	-	96	57.361	ENSATEG00000023346	-	96	57.935	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000001000	-	95	58.687	ENSATEG00000019965	-	96	58.108	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000001000	-	98	55.535	ENSATEG00000017635	-	98	55.535	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000001000	-	94	61.840	ENSACLG00000009261	-	97	61.840	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000001000	-	70	59.055	ENSACLG00000015361	-	94	58.530	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000001000	-	94	52.918	ENSACLG00000018271	-	95	52.918	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000001000	-	86	36.566	ENSACLG00000023468	-	83	36.162	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000001000	-	92	64.331	ENSACLG00000006538	-	98	64.331	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000001000	-	72	62.379	ENSACLG00000009330	-	79	62.379	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000001000	-	90	54.149	ENSACLG00000018599	-	94	54.149	Astatotilapia_calliptera
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