EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000001008 (Gene tree)
Gene ID: 103130557
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: septin-2-like
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8687 bases
Position: chrKI520256.1:13942-22628
Accession: 103130557
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000000945	MMR_HSR1	PF01926.23	1.6e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000000947	-	2161	XM_016666009	ENSPFOP00000000945	521 (aa)	XP_016521495	A0A087X592

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPFOG00000001008	-	89	56.962	ENSPFOG00000024669	-	96	56.962
ENSPFOG00000001008	-	90	31.485	ENSPFOG00000010758	-	77	31.683
ENSPFOG00000001008	-	84	46.259	ENSPFOG00000023267	-	98	46.259
ENSPFOG00000001008	-	98	54.191	ENSPFOG00000001000	-	94	54.191
ENSPFOG00000001008	-	97	51.751	ENSPFOG00000019823	-	98	51.751
ENSPFOG00000001008	-	99	93.992	ENSPFOG00000020555	-	99	93.992
ENSPFOG00000001008	-	97	53.801	ENSPFOG00000020556	-	98	53.801
ENSPFOG00000001008	-	97	56.725	ENSPFOG00000020664	-	95	56.725
ENSPFOG00000001008	-	97	55.253	ENSPFOG00000021874	-	98	55.642
ENSPFOG00000001008	-	96	69.539	ENSPFOG00000022760	-	100	69.539
ENSPFOG00000001008	-	96	46.943	ENSPFOG00000009476	-	100	45.146
ENSPFOG00000001008	-	95	55.796	ENSPFOG00000020973	-	99	55.773
ENSPFOG00000001008	-	93	30.402	ENSPFOG00000020108	-	97	30.402

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPFOG00000001008	-	97	56.556	ENSAPOG00000021040	-	85	56.556	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000001008	-	96	54.706	ENSAPOG00000005726	-	94	54.706	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000001008	-	86	31.992	ENSAPOG00000016636	-	92	31.992	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000001008	-	95	54.365	ENSAPOG00000005749	-	92	54.365	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000001008	-	96	58.789	ENSACIG00000021449	-	94	58.789	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001008	-	87	32.128	ENSACIG00000009814	-	84	32.128	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001008	-	95	58.532	ENSACIG00000001022	-	95	58.532	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001008	-	97	55.684	ENSACIG00000008256	-	96	56.069	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001008	-	98	52.250	ENSACIG00000008246	-	93	52.250	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001008	-	95	53.571	ENSACIG00000008585	-	98	53.571	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001008	-	96	55.728	ENSACIG00000023726	-	96	56.117	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001008	-	97	58.157	ENSACIG00000010569	-	96	58.157	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001008	-	96	57.115	ENSACIG00000003168	-	95	57.505	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001008	-	96	56.972	ENSACIG00000014973	-	96	56.972	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001008	-	98	55.598	ENSACIG00000003888	-	97	56.371	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001008	-	75	59.102	ENSACIG00000023712	-	99	59.102	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001008	-	97	57.529	ENSACIG00000012148	-	96	58.108	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001008	-	95	56.126	ENSACIG00000014898	-	93	56.836	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001008	-	94	30.196	ENSACIG00000022269	-	86	30.196	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001008	-	94	57.143	ENSACIG00000021882	-	93	57.287	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001008	-	97	59.766	ENSACIG00000021889	-	93	60.156	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001008	-	97	55.969	ENSACIG00000014982	-	97	55.969	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001008	-	97	56.311	ENSACIG00000002240	-	97	56.311	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001008	-	97	55.577	ENSACIG00000014961	-	93	55.577	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001008	-	96	54.224	ENSAPEG00000000062	-	95	54.224	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000001008	-	96	50.884	ENSATEG00000017635	-	94	50.884	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000001008	-	97	57.004	ENSATEG00000023346	-	95	57.198	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000001008	-	97	56.420	ENSATEG00000019965	-	96	56.420	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000001008	-	97	55.814	ENSATEG00000012558	-	96	56.008	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000001008	-	72	53.525	ENSACLG00000015361	-	94	53.525	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000001008	-	94	67.143	ENSACLG00000006538	-	97	67.143	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000001008	-	95	49.901	ENSACLG00000010007	-	76	49.901	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000001008	-	91	54.605	ENSACLG00000017259	-	95	54.605	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000001008	-	91	53.279	ENSACLG00000021761	-	90	53.279	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000001008	-	96	60.792	ENSACLG00000009261	-	97	60.792	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000001008	-	95	30.784	ENSACLG00000023126	-	98	30.975	Astatotilapia_calliptera
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ENSPFOG00000001008	-	76	58.900	ENSACLG00000009330	-	82	58.900	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000001008	-	62	34.971	ENSACLG00000023033	-	85	34.971	Astatotilapia_calliptera
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