EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000001216 (Gene tree)
Gene ID: 103149613
Gene Symbol: apobec2b
Alias: -
Full Name: apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 2
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7706 bases
Position: chrKI519842.1:168597-176302
Accession: 103149613
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000001146	APOBEC_N	PF08210.11	8.6e-45	1	1
ENSPFOP00000001146	APOBEC_C	PF05240.14	5.9e-26	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000001148	-	4771	-	ENSPFOP00000001146	266 (aa)	XP_007568915	A0A087X5U3

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPFOG00000001216	apobec2b	62	36.697	ENSPFOG00000011197	aicda	96	36.697

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	62.827	ENSG00000124701	APOBEC2	98	58.447	Homo_sapiens
ENSPFOG00000001216	apobec2b	100	79.104	ENSAPOG00000019390	apobec2b	100	79.104	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	78	51.835	ENSAMEG00000004467	APOBEC2	92	48.918	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPFOG00000001216	apobec2b	100	78.358	ENSACIG00000002472	APOBEC2	100	74.436	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	79	51.174	ENSACIG00000016370	apobec2a	76	54.872	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	99	52.593	ENSAOCG00000003291	apobec2a	100	51.292	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000001216	apobec2b	100	79.851	ENSAOCG00000023355	apobec2b	100	79.851	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000001216	apobec2b	100	79.478	ENSAPEG00000004591	apobec2b	100	79.851	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000001216	apobec2b	99	52.593	ENSAPEG00000003630	apobec2a	99	51.111	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000001216	apobec2b	100	75.093	ENSATEG00000023043	APOBEC2	100	76.952	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	100	49.254	ENSATEG00000000956	apobec2a	98	58.857	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	87	51.899	ENSAPLG00000002895	APOBEC2	96	53.153	Anas_platyrhynchos
ENSPFOG00000001216	apobec2b	78	51.869	ENSACAG00000016506	APOBEC2	95	57.303	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	62.304	ENSANAG00000026993	APOBEC2	98	57.534	Aotus_nancymaae
ENSPFOG00000001216	apobec2b	100	77.985	ENSACLG00000007634	APOBEC2	100	77.239	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000001216	apobec2b	65	58.721	ENSACLG00000026736	-	97	58.721	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000001216	apobec2b	82	60.000	ENSAMXG00000015966	apobec2b	83	58.974	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	79	56.221	ENSAMXG00000042992	apobec2a	96	52.239	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	61.257	ENSBTAG00000005974	APOBEC2	73	54.348	Bos_taurus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	62.304	ENSCJAG00000004063	APOBEC2	99	56.306	Callithrix_jacchus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	61.257	ENSCAFG00000001575	APOBEC2	98	56.164	Canis_familiaris
ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	61.257	ENSCAFG00020008306	APOBEC2	98	56.164	Canis_lupus_dingo
ENSPFOG00000001216	apobec2b	75	57.692	ENSCHIG00000026348	APOBEC2	99	54.955	Capra_hircus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	61.257	ENSTSYG00000008206	APOBEC2	96	57.078	Carlito_syrichta
ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	60.733	ENSCAPG00000015084	APOBEC2	96	55.000	Cavia_aperea
ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	60.733	ENSCPOG00000036103	APOBEC2	96	55.000	Cavia_porcellus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	62.304	ENSCCAG00000033987	APOBEC2	98	57.078	Cebus_capucinus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	62.827	ENSCATG00000010691	APOBEC2	85	62.827	Cercocebus_atys
ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	61.257	ENSCLAG00000013817	APOBEC2	95	56.481	Chinchilla_lanigera
ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	62.827	ENSCSAG00000011177	APOBEC2	98	57.991	Chlorocebus_sabaeus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	65	60.556	ENSCHOG00000008930	APOBEC2	100	60.556	Choloepus_hoffmanni
ENSPFOG00000001216	apobec2b	68	59.459	ENSCPBG00000017469	APOBEC2	85	59.677	Chrysemys_picta_bellii
ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	62.827	ENSCANG00000035072	APOBEC2	98	57.991	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	76	56.744	ENSCGRG00001014983	Apobec2	96	56.744	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPFOG00000001216	apobec2b	76	56.744	ENSCGRG00000007835	Apobec2	96	56.744	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPFOG00000001216	apobec2b	71	75.532	ENSCSEG00000000690	-	100	63.806	Cynoglossus_semilaevis
ENSPFOG00000001216	apobec2b	100	50.370	ENSCSEG00000020201	apobec2a	100	50.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSPFOG00000001216	apobec2b	100	88.722	ENSCVAG00000012342	apobec2b	100	88.722	Cyprinodon_variegatus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	85	61.572	ENSDARG00000113992	apobec2b	85	61.207	Danio_rerio
ENSPFOG00000001216	apobec2b	100	53.818	ENSDARG00000018881	apobec2a	94	53.597	Danio_rerio
ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	43.781	ENSDNOG00000033914	APOBEC2	98	40.611	Dasypus_novemcinctus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	59.162	ENSDORG00000006447	Apobec2	98	53.571	Dipodomys_ordii
ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	59.686	ENSETEG00000000624	APOBEC2	96	54.545	Echinops_telfairi
ENSPFOG00000001216	apobec2b	66	54.545	ENSEASG00005002937	APOBEC2	97	54.545	Equus_asinus_asinus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	77	56.621	ENSECAG00000006576	APOBEC2	98	56.621	Equus_caballus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	75	58.173	ENSEEUG00000006046	APOBEC2	100	54.274	Erinaceus_europaeus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	70	60.847	ENSELUG00000003736	apobec2a	73	58.454	Esox_lucius
ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	60.733	ENSFCAG00000004108	APOBEC2	98	56.164	Felis_catus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	81	45.495	ENSFALG00000003910	APOBEC2	98	45.495	Ficedula_albicollis
ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	60.733	ENSFDAG00000006015	APOBEC2	85	60.733	Fukomys_damarensis
ENSPFOG00000001216	apobec2b	100	80.075	ENSFHEG00000005492	apobec2b	100	80.075	Fundulus_heteroclitus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	65	60.795	ENSGMOG00000007028	apobec2a	100	60.795	Gadus_morhua
ENSPFOG00000001216	apobec2b	77	73.913	ENSGMOG00000006819	apobec2b	87	72.770	Gadus_morhua
ENSPFOG00000001216	apobec2b	82	52.466	ENSGALG00000003226	APOBEC2	99	52.466	Gallus_gallus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	100	95.865	ENSGAFG00000007634	apobec2b	87	95.865	Gambusia_affinis
ENSPFOG00000001216	apobec2b	70	61.170	ENSGACG00000011671	apobec2a	100	61.170	Gasterosteus_aculeatus
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ENSPFOG00000001216	apobec2b	68	59.459	ENSGAGG00000010347	APOBEC2	90	57.000	Gopherus_agassizii
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ENSPFOG00000001216	apobec2b	80	58.716	ENSHBUG00000015890	apobec2a	88	58.716	Haplochromis_burtoni
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ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	59.686	ENSHGLG00100019442	APOBEC2	97	55.204	Heterocephalus_glaber_male
ENSPFOG00000001216	apobec2b	90	49.587	ENSHCOG00000020319	apobec2a	82	57.000	Hippocampus_comes
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ENSPFOG00000001216	apobec2b	100	59.636	ENSIPUG00000013784	Apobec2	100	58.696	Ictalurus_punctatus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	80	57.798	ENSIPUG00000017355	apobec2a	71	51.471	Ictalurus_punctatus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	61.257	ENSSTOG00000023643	APOBEC2	98	56.164	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	60.209	ENSJJAG00000009733	Apobec2	98	55.251	Jaculus_jaculus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	99	79.623	ENSKMAG00000020631	apobec2b	99	79.623	Kryptolebias_marmoratus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	88	51.464	ENSLBEG00000025214	apobec2a	97	52.137	Labrus_bergylta
ENSPFOG00000001216	apobec2b	100	72.143	ENSLBEG00000009422	-	100	70.714	Labrus_bergylta
ENSPFOG00000001216	apobec2b	85	59.031	ENSLACG00000015985	APOBEC2	96	59.031	Latimeria_chalumnae
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ENSPFOG00000001216	apobec2b	75	58.654	ENSLAFG00000016563	APOBEC2	93	58.654	Loxodonta_africana
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ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	62.827	ENSMMUG00000021171	APOBEC2	98	57.991	Macaca_mulatta
ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	62.827	ENSMNEG00000045497	APOBEC2	98	57.991	Macaca_nemestrina
ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	62.827	ENSMLEG00000028328	APOBEC2	98	57.991	Mandrillus_leucophaeus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	98	52.809	ENSMAMG00000023685	apobec2a	96	51.685	Mastacembelus_armatus
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ENSPFOG00000001216	apobec2b	100	77.985	ENSMZEG00005027159	APOBEC2	100	77.239	Maylandia_zebra
ENSPFOG00000001216	apobec2b	87	51.261	ENSMGAG00000010173	APOBEC2	94	56.425	Meleagris_gallopavo
ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	61.780	ENSMAUG00000011016	Apobec2	85	61.780	Mesocricetus_auratus
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ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	62.304	ENSMOCG00000001904	Apobec2	85	62.304	Microtus_ochrogaster
ENSPFOG00000001216	apobec2b	100	74.812	ENSMMOG00000008681	apobec2b	100	74.812	Mola_mola
ENSPFOG00000001216	apobec2b	85	52.586	ENSMODG00000013090	APOBEC2	99	52.586	Monodelphis_domestica
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ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	61.780	MGP_CAROLIEiJ_G0021727	Apobec2	85	61.780	Mus_caroli
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ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	61.780	MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	85	61.780	Mus_pahari
ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	61.780	ENSMPUG00000013691	APOBEC2	98	56.140	Mustela_putorius_furo
ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	61.257	ENSMLUG00000011327	APOBEC2	100	53.419	Myotis_lucifugus
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ENSPFOG00000001216	apobec2b	70	61.376	ENSNBRG00000021776	apobec2a	88	57.798	Neolamprologus_brichardi
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ENSPFOG00000001216	apobec2b	69	61.257	ENSODEG00000016183	APOBEC2	98	55.111	Octodon_degus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	100	79.104	ENSONIG00000012289	apobec2b	100	78.358	Oreochromis_niloticus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	80	59.174	ENSONIG00000004644	-	88	59.174	Oreochromis_niloticus
ENSPFOG00000001216	apobec2b	61	58.333	ENSOANG00000000824	APOBEC2	99	56.354	Ornithorhynchus_anatinus
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