EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000001320 (Gene tree)
Gene ID: 103150494
Gene Symbol: si:dkey-93h22.8
Alias: -
Full Name: peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1-like
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9182 bases
Position: chrKI519866.1:68467-77648
Accession: 103150494
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000021277	RRM_1	PF00076.22	1.4e-10	1	1
ENSPFOP00000027060	RRM_1	PF00076.22	4.2e-10	1	1
ENSPFOP00000001218	RRM_1	PF00076.22	4.3e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000001221	-	3894	XM_007570142	ENSPFOP00000001218	1033 (aa)	XP_007570204	A0A087X615
ENSPFOT00000024645	-	1571	-	ENSPFOP00000021277	392 (aa)	-	A0A096LQ36
ENSPFOT00000025575	-	3837	-	ENSPFOP00000027060	1009 (aa)	-	A0A096M6L9

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	84	86.928	ENSAPOG00000001094	si:dkey-93h22.8	84	85.443	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	68	84.810	ENSAOCG00000008140	si:dkey-93h22.8	57	74.713	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	66	84.810	ENSAPEG00000014568	si:dkey-93h22.8	57	74.713	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	70	82.166	ENSATEG00000020218	-	83	82.278	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	86	82.803	ENSACLG00000019359	-	55	82.911	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	90	85.549	ENSCVAG00000019596	si:dkey-93h22.8	92	83.237	Cyprinodon_variegatus
ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	83	78.191	ENSFHEG00000019110	-	77	78.307	Fundulus_heteroclitus
ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	85	86.127	ENSGAFG00000011120	si:dkey-93h22.8	98	87.675	Gambusia_affinis
ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	63	82.803	ENSHBUG00000019347	-	55	82.911	Haplochromis_burtoni
ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	86	48.485	ENSHCOG00000015325	-	81	83.077	Hippocampus_comes
ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	66	60.645	ENSIPUG00000021651	si:dkey-93h22.8	75	69.531	Ictalurus_punctatus
ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	59	87.407	ENSKMAG00000019855	si:dkey-93h22.8	83	72.832	Kryptolebias_marmoratus
ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	59	82.051	ENSLBEG00000024075	-	56	81.646	Labrus_bergylta
ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	65	84.967	ENSMAMG00000011169	-	59	83.544	Mastacembelus_armatus
ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	86	82.803	ENSMZEG00005008228	-	57	82.911	Maylandia_zebra
ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	58	80.128	ENSMALG00000005052	-	54	78.481	Monopterus_albus
ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	63	82.051	ENSNBRG00000023152	-	99	48.246	Neolamprologus_brichardi
ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	66	34.123	ENSORLG00000012355	si:dkey-93h22.8	71	34.958	Oryzias_latipes
ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	81	76.712	ENSORLG00020004449	si:dkey-93h22.8	84	80.916	Oryzias_latipes_hni
ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	84	68.966	ENSORLG00015002960	si:dkey-93h22.8	84	80.916	Oryzias_latipes_hsok
ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	81	76.712	ENSOMEG00000012140	si:dkey-93h22.8	80	84.694	Oryzias_melastigma
ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	100	96.515	ENSPLAG00000001769	si:dkey-93h22.8	100	96.515	Poecilia_latipinna
ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	100	99.226	ENSPMEG00000014605	si:dkey-93h22.8	100	99.226	Poecilia_mexicana
ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	100	91.833	ENSPREG00000000446	si:dkey-93h22.8	100	91.833	Poecilia_reticulata
ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	86	82.911	ENSPNYG00000002682	-	57	82.911	Pundamilia_nyererei
ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	71	79.739	ENSSMAG00000005915	si:dkey-93h22.8	53	82.443	Scophthalmus_maximus
ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	70	83.333	ENSSDUG00000001268	si:dkey-93h22.8	91	82.911	Seriola_dumerili
ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	91	83.333	ENSSLDG00000012010	si:dkey-93h22.8	91	82.911	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	76	83.007	ENSSPAG00000010602	si:dkey-93h22.8	90	81.013	Stegastes_partitus
ENSPFOG00000001320	si:dkey-93h22.8	90	85.549	ENSXMAG00000000243	si:dkey-93h22.8	100	89.658	Xiphophorus_maculatus