EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000001349 (Gene tree)
Gene ID: 103150752
Gene Symbol: xpo1a
Alias: -
Full Name: exportin-1-like
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 14216 bases
Position: chrKI519872.1:85139-99354
Accession: 103150752
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000001401	CRM1_C	PF08767.11	5.8e-131	1	1
ENSPFOP00000001401	Xpo1	PF08389.12	8.5e-42	1	1
ENSPFOP00000001401	IBN_N	PF03810.19	6.8e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000001404	-	3926	-	ENSPFOP00000001401	1066 (aa)	XP_007570545	A0A087X6J8

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	92.344	ENSPFOG00000013233	-	100	92.344

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	90.943	ENSG00000082898	XPO1	100	90.943	Homo_sapiens
ENSPFOG00000001349	xpo1a	88	95.936	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	95.936	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	92.717	ENSAPOG00000004984	-	100	92.717	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	91.604	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	91.604	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPFOG00000001349	xpo1a	88	93.617	ENSACIG00000010818	-	100	93.617	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001349	xpo1a	88	97.861	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	97.861	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	92.624	ENSAOCG00000010121	-	100	92.624	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	98.030	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	98.030	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000001349	xpo1a	91	98.240	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	98.240	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	92.624	ENSAPEG00000007038	-	100	92.624	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	92.624	ENSATEG00000008816	-	100	92.624	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	97.655	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	97.655	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	91.970	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	91.970	Anas_platyrhynchos
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	91.970	ENSACAG00000002501	XPO1	100	91.970	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	90.943	ENSANAG00000020802	XPO1	100	90.943	Aotus_nancymaae
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	92.530	ENSACLG00000015192	-	100	92.530	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000001349	xpo1a	88	98.182	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	98.182	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000001349	xpo1a	88	93.326	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	93.326	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	92.997	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	92.997	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	91.690	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	91.690	Bos_taurus
ENSPFOG00000001349	xpo1a	98	52.072	WBGene00002078	xpo-1	98	52.072	Caenorhabditis_elegans
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	90.943	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	90.943	Callithrix_jacchus
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	91.690	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	91.690	Canis_familiaris
ENSPFOG00000001349	xpo1a	93	92.184	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	92.184	Canis_lupus_dingo
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	91.690	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	91.690	Capra_hircus
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	91.690	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	91.690	Carlito_syrichta
ENSPFOG00000001349	xpo1a	53	88.298	ENSCAPG00000006454	-	100	88.298	Cavia_aperea
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	90.289	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	90.289	Cavia_porcellus
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	73.840	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	74.026	Cebus_capucinus
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	89.199	ENSCATG00000032674	XPO1	100	91.809	Cercocebus_atys
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	91.503	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	91.503	Chinchilla_lanigera
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	90.943	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	90.943	Chlorocebus_sabaeus
ENSPFOG00000001349	xpo1a	83	92.866	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	92.866	Choloepus_hoffmanni
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	91.970	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	91.970	Chrysemys_picta_bellii
ENSPFOG00000001349	xpo1a	99	80.359	ENSCING00000024562	-	99	80.359	Ciona_intestinalis
ENSPFOG00000001349	xpo1a	99	78.839	ENSCSAVG00000005965	-	99	78.839	Ciona_savignyi
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	87.208	ENSCANG00000028883	XPO1	100	91.489	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	90.943	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	90.943	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	90.943	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	90.943	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPFOG00000001349	xpo1a	88	92.660	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	92.660	Cynoglossus_semilaevis
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	98.593	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	98.593	Cyprinodon_variegatus
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	92.437	ENSCVAG00000016788	-	100	92.437	Cyprinodon_variegatus
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	93.184	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	93.184	Danio_rerio
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	93.277	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	95.046	Danio_rerio
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	91.783	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	91.783	Dasypus_novemcinctus
ENSPFOG00000001349	xpo1a	91	88.802	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	88.802	Dipodomys_ordii
ENSPFOG00000001349	xpo1a	99	69.426	FBgn0020497	emb	99	69.426	Drosophila_melanogaster
ENSPFOG00000001349	xpo1a	94	90.775	ENSETEG00000018045	XPO1	94	90.775	Echinops_telfairi
ENSPFOG00000001349	xpo1a	90	78.112	ENSEBUG00000012580	-	100	86.340	Eptatretus_burgeri
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	91.690	ENSEASG00005007223	XPO1	100	91.690	Equus_asinus_asinus
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	91.690	ENSECAG00000024920	XPO1	100	92.413	Equus_caballus
ENSPFOG00000001349	xpo1a	92	93.750	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	93.750	Erinaceus_europaeus
ENSPFOG00000001349	xpo1a	88	95.223	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	95.223	Esox_lucius
ENSPFOG00000001349	xpo1a	87	90.578	ENSELUG00000014306	-	99	90.578	Esox_lucius
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	91.690	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	91.690	Felis_catus
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	91.783	ENSFALG00000010989	XPO1	100	91.783	Ficedula_albicollis
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	90.103	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	90.103	Fukomys_damarensis
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	98.499	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	98.499	Fundulus_heteroclitus
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ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	87.115	ENSGMOG00000019063	-	100	87.115	Gadus_morhua
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ENSPFOG00000001349	xpo1a	91	93.100	ENSGAFG00000003355	-	98	93.100	Gambusia_affinis
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ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	92.624	ENSGACG00000002743	-	100	92.624	Gasterosteus_aculeatus
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ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	92.624	ENSHBUG00000020037	-	100	92.624	Haplochromis_burtoni
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	91.410	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	91.410	Heterocephalus_glaber_female
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	91.410	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	91.410	Heterocephalus_glaber_male
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ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	91.503	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	91.503	Ictidomys_tridecemlineatus
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ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	98.874	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	98.874	Kryptolebias_marmoratus
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	92.344	ENSKMAG00000016218	-	100	92.344	Kryptolebias_marmoratus
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ENSPFOG00000001349	xpo1a	88	95.314	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	95.314	Labrus_bergylta
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	71.429	ENSLACG00000018213	XPO1	100	71.429	Latimeria_chalumnae
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	92.997	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	92.997	Lepisosteus_oculatus
ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	91.597	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	91.597	Loxodonta_africana
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ENSPFOG00000001349	xpo1a	100	90.943	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	90.943	Macaca_nemestrina
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