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Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000001856 (Gene tree)
Gene ID: 103134867
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: -
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 42480 bases
Position: chrKI519630.1:209585-252064
Accession: 103134867
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000028604	ResIII	PF04851.15	7.9e-08	1	1
ENSPFOP00000002687	ResIII	PF04851.15	1.6e-07	1	1
ENSPFOP00000028604	BRK	PF07533.16	1.9e-17	1	1
ENSPFOP00000002687	BRK	PF07533.16	1.9e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000002691	SMARCA2-202	7371	XM_007547345	ENSPFOP00000002687	1601 (aa)	XP_007547407	A0A087XA84
ENSPFOT00000025974	SMARCA2-201	7344	-	ENSPFOP00000028604	1592 (aa)	-	A0A096MB13

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	95	71.546	ENSPFOG00000007892	smarca4a	99	71.056
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	95	69.712	ENSPFOG00000012930	-	99	69.903

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	97	79.159	ENSG00000080503	SMARCA2	99	98.000	Homo_sapiens
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	100	92.085	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	91.777	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	88	77.235	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	85.066	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	100	88.702	ENSACIG00000015607	SMARCA2	100	88.639	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	100	92.231	ENSAOCG00000009647	-	100	91.980	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	100	91.970	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	100	91.850	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	99	92.176	ENSATEG00000006916	SMARCA2	98	91.985	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	87	78.623	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	78.086	Anas_platyrhynchos
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	98	78.871	ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	78.951	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	97	78.840	ENSANAG00000026498	SMARCA2	100	79.688	Aotus_nancymaae
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	100	89.586	ENSACLG00000004248	SMARCA2	100	89.586	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	99	85.139	ENSAMXG00000012404	smarca2	99	84.707	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	97	79.031	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	100	79.514	Bos_taurus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	98	78.911	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	80.546	Callithrix_jacchus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	97	79.286	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	100	79.875	Canis_familiaris
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	73	86.438	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	94	86.180	Canis_lupus_dingo
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	97	79.222	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	100	79.514	Capra_hircus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	97	78.517	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	80.706	Carlito_syrichta
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	97	76.790	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	99	77.925	Cavia_aperea
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	97	78.937	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	100	79.900	Cavia_porcellus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	98	78.151	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	100	80.062	Cebus_capucinus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	97	78.087	ENSCATG00000031470	SMARCA2	100	79.775	Cercocebus_atys
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	97	78.985	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	79.812	Chinchilla_lanigera
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	91	80.641	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	99	81.242	Chlorocebus_sabaeus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	84	82.097	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	86	82.097	Choloepus_hoffmanni
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	96	82.563	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	100	83.519	Chrysemys_picta_bellii
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	97	79.095	ENSCANG00000039597	SMARCA2	100	80.188	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	77	81.981	ENSCGRG00001002323	Smarca2	100	74.439	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	99	84.397	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	98	84.298	Cynoglossus_semilaevis
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	66	93.429	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	98	89.653	Cyprinodon_variegatus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	100	83.645	ENSDARG00000008904	smarca2	100	83.167	Danio_rerio
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	98	79.350	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	100	80.125	Dasypus_novemcinctus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	97	79.244	ENSDORG00000014832	Smarca2	100	79.713	Dipodomys_ordii
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	76	62.264	FBgn0000212	brm	83	57.442	Drosophila_melanogaster
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	87	59.789	ENSEBUG00000002449	-	95	61.655	Eptatretus_burgeri
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	95	68.373	ENSEBUG00000011442	-	97	68.084	Eptatretus_burgeri
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	97	78.776	ENSEASG00005010312	SMARCA2	100	79.750	Equus_asinus_asinus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	60	91.176	ENSEEUG00000015540	-	69	79.730	Erinaceus_europaeus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	95	82.484	ENSELUG00000010318	smarca2	99	81.187	Esox_lucius
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	97	78.904	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	100	79.750	Felis_catus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	98	79.797	ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	81.751	Ficedula_albicollis
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	97	77.792	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	100	78.523	Fukomys_damarensis
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	100	95.940	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	100	95.753	Fundulus_heteroclitus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	99	81.858	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	81.416	Gadus_morhua
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	98	79.860	ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	80.337	Gallus_gallus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	98	87.389	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	98	87.492	Gambusia_affinis
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	99	87.397	ENSGACG00000014488	SMARCA2	99	87.017	Gasterosteus_aculeatus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	98	78.589	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	100	79.950	Gopherus_agassizii
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	88	85.808	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	100	84.731	Gorilla_gorilla
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	100	91.217	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	100	91.217	Haplochromis_burtoni
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	97	79.086	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	98	79.823	Heterocephalus_glaber_female
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	98	78.776	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	100	79.938	Heterocephalus_glaber_male
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	90	80.856	ENSHCOG00000015348	-	97	85.430	Hippocampus_comes
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	99	83.763	ENSIPUG00000011060	smarca2	98	83.165	Ictalurus_punctatus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	97	79.757	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	100	79.925	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	97	79.231	ENSJJAG00000010867	Smarca2	100	79.302	Jaculus_jaculus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	100	93.146	ENSKMAG00000015844	-	100	93.146	Kryptolebias_marmoratus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	98	81.887	ENSLOCG00000011499	smarca2	99	82.360	Lepisosteus_oculatus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	98	79.299	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	79.752	Loxodonta_africana
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	97	77.820	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	100	79.366	Macaca_fascicularis
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	97	79.031	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	100	80.188	Macaca_mulatta
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	97	78.485	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	100	79.913	Macaca_nemestrina
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	90	85.544	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	96	86.259	Mandrillus_leucophaeus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	100	91.973	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	91.910	Mastacembelus_armatus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	100	91.343	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	100	91.343	Maylandia_zebra
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	74	68.792	ENSMGAG00000005160	-	100	68.344	Meleagris_gallopavo
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	97	79.159	ENSMICG00000005162	SMARCA2	100	80.125	Microcebus_murinus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	97	79.872	ENSMOCG00000001611	Smarca2	100	79.812	Microtus_ochrogaster
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	99	84.933	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	99	84.829	Mola_mola
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	98	79.620	ENSMODG00000003578	SMARCA2	100	80.387	Monodelphis_domestica
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	99	89.143	ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	89.206	Monopterus_albus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	96	79.716	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	99	79.912	Mus_caroli
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	80	85.547	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	98.000	Mus_musculus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	96	80.428	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	99	79.874	Mus_pahari
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	96	79.625	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	97	87.879	Mus_spretus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	79	84.645	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	94	84.867	Mustela_putorius_furo
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	97	75.934	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	99	76.662	Myotis_lucifugus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	97	78.517	ENSNGAG00000000108	Smarca2	99	78.741	Nannospalax_galili
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	95	77.024	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	82.587	Neolamprologus_brichardi
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	91	84.646	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	78.875	Nomascus_leucogenys
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	93	75.034	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	100	72.682	Notamacropus_eugenii
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	79	80.851	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	76.137	Ochotona_princeps
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	81	83.935	ENSODEG00000005452	SMARCA2	98	79.760	Octodon_degus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	99	91.409	ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	91.156	Oreochromis_niloticus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	79	86.008	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	100	79.205	Oryctolagus_cuniculus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	100	90.294	ENSORLG00000020820	SMARCA2	100	90.670	Oryzias_latipes
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	100	90.414	ENSORLG00015006289	SMARCA2	100	90.915	Oryzias_latipes_hsok
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	100	90.327	ENSOMEG00000009736	-	100	90.201	Oryzias_melastigma
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	79	85.083	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	79.146	Otolemur_garnettii
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	98	78.535	ENSOARG00000013265	SMARCA2	100	78.696	Ovis_aries
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	90	85.680	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	99	85.322	Pan_paniscus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	97	78.967	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	100	79.812	Panthera_pardus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	98	78.776	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	100	79.714	Pan_troglodytes
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	98	75.509	ENSPANG00000025121	SMARCA2	100	75.015	Papio_anubis
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	100	83.271	ENSPKIG00000018469	-	100	82.707	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	98	78.037	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	100	79.489	Pelodiscus_sinensis
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	99	82.592	ENSPMGG00000013696	-	98	82.910	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	97	79.065	ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	78.839	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	95	70.727	ENSPMAG00000005337	-	97	70.057	Petromyzon_marinus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	98	79.304	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	100	80.200	Phascolarctos_cinereus
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	99	99.874	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	97	99.874	Poecilia_latipinna
ENSPFOG00000001856	SMARCA2	100	99.688	ENSPMEG00000001815	-	99	99.688	Poecilia_mexicana
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