EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000002393 (Gene tree)
Gene ID: 103148038
Gene Symbol: GZF1
Alias: -
Full Name: GDNF inducible zinc finger protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9605 bases
Position: chrKI519806.1:574495-584099
Accession: 103148038
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000023616	zf-C2H2	PF00096.26	1.9e-34	1	6
ENSPFOP00000023616	zf-C2H2	PF00096.26	1.9e-34	2	6
ENSPFOP00000023616	zf-C2H2	PF00096.26	1.9e-34	3	6
ENSPFOP00000023616	zf-C2H2	PF00096.26	1.9e-34	4	6
ENSPFOP00000023616	zf-C2H2	PF00096.26	1.9e-34	5	6
ENSPFOP00000023616	zf-C2H2	PF00096.26	1.9e-34	6	6
ENSPFOP00000002359	zf-C2H2	PF00096.26	9.8e-33	1	6
ENSPFOP00000002359	zf-C2H2	PF00096.26	9.8e-33	2	6
ENSPFOP00000002359	zf-C2H2	PF00096.26	9.8e-33	3	6
ENSPFOP00000002359	zf-C2H2	PF00096.26	9.8e-33	4	6
ENSPFOP00000002359	zf-C2H2	PF00096.26	9.8e-33	5	6
ENSPFOP00000002359	zf-C2H2	PF00096.26	9.8e-33	6	6
ENSPFOP00000023616	zf-met	PF12874.7	2.1e-09	1	1
ENSPFOP00000002359	zf-met	PF12874.7	9.4e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000022052	GZF1-202	6880	-	ENSPFOP00000023616	578 (aa)	-	A0A096LWS5
ENSPFOT00000002363	GZF1-201	7580	-	ENSPFOP00000002359	817 (aa)	XP_007566708	A0A087X9A6

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPFOG00000002393	GZF1	57	34.872	ENSPFOG00000023510	-	73	34.872
ENSPFOG00000002393	GZF1	65	39.085	ENSPFOG00000018784	-	100	42.060
ENSPFOG00000002393	GZF1	61	31.169	ENSPFOG00000023968	-	68	39.565
ENSPFOG00000002393	GZF1	62	34.810	ENSPFOG00000017913	-	100	36.325
ENSPFOG00000002393	GZF1	56	48.603	ENSPFOG00000004414	-	100	48.603
ENSPFOG00000002393	GZF1	50	35.211	ENSPFOG00000020182	ZNF319	95	33.788
ENSPFOG00000002393	GZF1	50	41.115	ENSPFOG00000024239	-	78	41.115
ENSPFOG00000002393	GZF1	50	42.143	ENSPFOG00000001275	-	100	42.143
ENSPFOG00000002393	GZF1	98	41.538	ENSPFOG00000009055	ZBTB14	63	39.881
ENSPFOG00000002393	GZF1	52	44.643	ENSPFOG00000007684	-	98	44.495
ENSPFOG00000002393	GZF1	53	40.449	ENSPFOG00000020449	-	100	40.449
ENSPFOG00000002393	GZF1	63	40.559	ENSPFOG00000001339	-	100	44.128
ENSPFOG00000002393	GZF1	63	32.237	ENSPFOG00000014213	PRDM15	63	32.636
ENSPFOG00000002393	GZF1	50	40.351	ENSPFOG00000023165	-	70	41.525
ENSPFOG00000002393	GZF1	63	44.041	ENSPFOG00000007833	-	97	43.114
ENSPFOG00000002393	GZF1	70	36.290	ENSPFOG00000005512	zbtb16b	61	36.290
ENSPFOG00000002393	GZF1	55	45.614	ENSPFOG00000008666	-	99	41.259
ENSPFOG00000002393	GZF1	51	42.456	ENSPFOG00000002879	-	100	42.456
ENSPFOG00000002393	GZF1	60	40.323	ENSPFOG00000004894	-	99	47.872
ENSPFOG00000002393	GZF1	60	41.016	ENSPFOG00000000624	-	99	43.701
ENSPFOG00000002393	GZF1	61	37.778	ENSPFOG00000020109	-	74	38.672
ENSPFOG00000002393	GZF1	63	38.362	ENSPFOG00000024156	-	70	38.362
ENSPFOG00000002393	GZF1	61	40.559	ENSPFOG00000024204	-	93	41.786
ENSPFOG00000002393	GZF1	59	38.462	ENSPFOG00000023476	-	94	45.509
ENSPFOG00000002393	GZF1	58	52.414	ENSPFOG00000007728	-	98	40.989
ENSPFOG00000002393	GZF1	69	36.538	ENSPFOG00000016496	zbtb16a	59	36.538
ENSPFOG00000002393	GZF1	52	39.130	ENSPFOG00000005289	-	99	39.053
ENSPFOG00000002393	GZF1	50	43.204	ENSPFOG00000024183	-	59	45.213
ENSPFOG00000002393	GZF1	58	39.785	ENSPFOG00000001053	-	100	44.000
ENSPFOG00000002393	GZF1	55	38.735	ENSPFOG00000018771	-	91	38.735
ENSPFOG00000002393	GZF1	61	39.493	ENSPFOG00000018774	-	86	40.711
ENSPFOG00000002393	GZF1	73	39.600	ENSPFOG00000018776	-	100	45.312
ENSPFOG00000002393	GZF1	57	40.964	ENSPFOG00000024085	-	62	45.059
ENSPFOG00000002393	GZF1	50	30.619	ENSPFOG00000004826	-	98	30.619
ENSPFOG00000002393	GZF1	58	44.162	ENSPFOG00000007847	-	100	41.608
ENSPFOG00000002393	GZF1	98	35.789	ENSPFOG00000006537	zbtb41	91	39.024
ENSPFOG00000002393	GZF1	52	43.701	ENSPFOG00000010682	-	99	36.364
ENSPFOG00000002393	GZF1	68	34.069	ENSPFOG00000022634	-	65	40.711
ENSPFOG00000002393	GZF1	50	41.709	ENSPFOG00000024133	-	68	41.709
ENSPFOG00000002393	GZF1	61	41.339	ENSPFOG00000020112	-	76	41.339
ENSPFOG00000002393	GZF1	57	40.964	ENSPFOG00000022201	-	62	45.059
ENSPFOG00000002393	GZF1	52	44.388	ENSPFOG00000021850	-	86	42.308
ENSPFOG00000002393	GZF1	55	41.379	ENSPFOG00000024470	-	70	41.379
ENSPFOG00000002393	GZF1	56	40.789	ENSPFOG00000010114	-	63	40.891
ENSPFOG00000002393	GZF1	50	41.089	ENSPFOG00000010113	-	52	41.089
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ENSPFOG00000002393	GZF1	62	42.478	ENSPFOG00000004377	-	56	42.478
ENSPFOG00000002393	GZF1	60	38.889	ENSPFOG00000021800	-	66	38.889
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ENSPFOG00000002393	GZF1	51	34.733	ENSPFOG00000022933	-	57	36.290
ENSPFOG00000002393	GZF1	50	43.096	ENSPFOG00000022934	-	50	43.096
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ENSPFOG00000002393	GZF1	55	35.849	ENSPFOG00000007465	-	100	35.849
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ENSPFOG00000002393	GZF1	57	46.626	ENSPFOG00000022286	-	99	44.828
ENSPFOG00000002393	GZF1	61	36.449	ENSPFOG00000022913	-	87	33.984
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ENSPFOG00000002393	GZF1	58	39.095	ENSPFOG00000009806	-	100	45.205
ENSPFOG00000002393	GZF1	50	43.096	ENSPFOG00000022055	-	50	43.096
ENSPFOG00000002393	GZF1	53	32.184	ENSPFOG00000008519	-	99	32.822
ENSPFOG00000002393	GZF1	53	42.616	ENSPFOG00000004126	-	100	45.263
ENSPFOG00000002393	GZF1	52	46.032	ENSPFOG00000017595	-	100	46.032
ENSPFOG00000002393	GZF1	52	37.762	ENSPFOG00000010018	-	100	39.216
ENSPFOG00000002393	GZF1	63	44.355	ENSPFOG00000018237	-	100	44.355
ENSPFOG00000002393	GZF1	52	37.597	ENSPFOG00000000407	-	66	37.597
ENSPFOG00000002393	GZF1	50	40.000	ENSPFOG00000017327	GFI1	52	40.000
ENSPFOG00000002393	GZF1	61	35.060	ENSPFOG00000023528	-	68	40.314
ENSPFOG00000002393	GZF1	51	38.621	ENSPFOG00000010422	-	95	43.721
ENSPFOG00000002393	GZF1	57	41.502	ENSPFOG00000015002	-	66	41.502
ENSPFOG00000002393	GZF1	54	41.667	ENSPFOG00000004616	-	99	42.308
ENSPFOG00000002393	GZF1	51	41.772	ENSPFOG00000023483	-	100	41.772
ENSPFOG00000002393	GZF1	73	31.469	ENSPFOG00000001375	-	100	42.045
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