EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000004116 (Gene tree)
Gene ID: 103153573
Gene Symbol: syf2
Alias: -
Full Name: SYF2 pre-mRNA-splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6970 bases
Position: chrKI519618.1:697472-704441
Accession: ZDB-GENE-040801-170
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000004074	SYF2	PF08231.12	6.7e-55	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000004082	-	1009	-	ENSPFOP00000004074	242 (aa)	-	A0A087XE71

Gene Model

Click here to download ENSPFOG00000004116's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPFOG00000004116's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPFOG00000004116	syf2	89	80.556	ENSG00000117614	SYF2	90	80.275	Homo_sapiens
ENSPFOG00000004116	syf2	92	91.031	ENSAPOG00000001174	syf2	100	87.866	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000004116	syf2	81	80.513	ENSAMEG00000010134	-	100	80.513	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPFOG00000004116	syf2	95	75.949	ENSAMEG00000010115	-	97	75.949	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPFOG00000004116	syf2	100	87.603	ENSACIG00000023688	syf2	96	87.603	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000004116	syf2	100	86.777	ENSAOCG00000022046	syf2	100	88.511	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000004116	syf2	92	86.937	ENSAOCG00000010912	syf2	69	86.937	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000004116	syf2	100	86.777	ENSAPEG00000018858	syf2	93	86.777	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000004116	syf2	90	91.705	ENSATEG00000007745	syf2	100	88.285	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000004116	syf2	83	82.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	82.000	Anas_platyrhynchos
ENSPFOG00000004116	syf2	84	81.863	ENSACAG00000013653	-	100	81.863	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000004116	syf2	69	68.263	ENSACAG00000026777	-	100	68.263	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000004116	syf2	89	81.019	ENSANAG00000032473	SYF2	90	80.734	Aotus_nancymaae
ENSPFOG00000004116	syf2	92	91.928	ENSACLG00000019916	syf2	100	88.285	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000004116	syf2	93	84.821	ENSAMXG00000004051	syf2	94	84.821	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000004116	syf2	99	74.286	ENSBTAG00000001651	SYF2	99	77.021	Bos_taurus
ENSPFOG00000004116	syf2	86	52.381	WBGene00019402	syf-2	90	51.659	Caenorhabditis_elegans
ENSPFOG00000004116	syf2	89	81.019	ENSCJAG00000046570	SYF2	90	80.734	Callithrix_jacchus
ENSPFOG00000004116	syf2	99	72.358	ENSCAFG00000012895	-	100	73.279	Canis_familiaris
ENSPFOG00000004116	syf2	86	76.555	ENSCAFG00000030331	-	92	76.555	Canis_familiaris
ENSPFOG00000004116	syf2	75	71.429	ENSCAFG00020021094	-	95	71.429	Canis_lupus_dingo
ENSPFOG00000004116	syf2	99	72.358	ENSCAFG00020021091	-	100	73.279	Canis_lupus_dingo
ENSPFOG00000004116	syf2	95	77.586	ENSCHIG00000020874	SYF2	98	76.596	Capra_hircus
ENSPFOG00000004116	syf2	95	76.824	ENSTSYG00000005114	SYF2	96	76.824	Carlito_syrichta
ENSPFOG00000004116	syf2	82	80.303	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	80.303	Cavia_aperea
ENSPFOG00000004116	syf2	90	80.734	ENSCPOG00000005326	SYF2	89	80.734	Cavia_porcellus
ENSPFOG00000004116	syf2	89	81.019	ENSCCAG00000022459	SYF2	97	75.104	Cebus_capucinus
ENSPFOG00000004116	syf2	95	75.417	ENSCATG00000026917	SYF2	99	75.417	Cercocebus_atys
ENSPFOG00000004116	syf2	95	77.778	ENSCLAG00000008474	SYF2	98	76.471	Chinchilla_lanigera
ENSPFOG00000004116	syf2	90	79.358	ENSCSAG00000000948	SYF2	90	79.358	Chlorocebus_sabaeus
ENSPFOG00000004116	syf2	73	58.101	ENSCHOG00000005273	-	99	58.101	Choloepus_hoffmanni
ENSPFOG00000004116	syf2	92	81.333	ENSCPBG00000025073	SYF2	94	79.399	Chrysemys_picta_bellii
ENSPFOG00000004116	syf2	91	52.915	ENSCING00000003017	-	93	53.363	Ciona_intestinalis
ENSPFOG00000004116	syf2	88	50.935	ENSCSAVG00000006627	-	98	50.935	Ciona_savignyi
ENSPFOG00000004116	syf2	95	67.083	ENSCANG00000037322	SYF2	100	65.021	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPFOG00000004116	syf2	95	77.682	ENSCGRG00001020733	Syf2	96	77.682	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPFOG00000004116	syf2	81	81.633	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	81.407	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPFOG00000004116	syf2	90	86.697	ENSCSEG00000000117	syf2	100	82.427	Cynoglossus_semilaevis
ENSPFOG00000004116	syf2	99	92.469	ENSCVAG00000019543	syf2	100	92.469	Cyprinodon_variegatus
ENSPFOG00000004116	syf2	94	85.088	ENSDARG00000004706	syf2	96	85.088	Danio_rerio
ENSPFOG00000004116	syf2	95	77.447	ENSDNOG00000047605	SYF2	100	74.694	Dasypus_novemcinctus
ENSPFOG00000004116	syf2	94	79.565	ENSDORG00000001274	Syf2	94	79.565	Dipodomys_ordii
ENSPFOG00000004116	syf2	93	55.752	FBgn0033556	CG12343	99	55.752	Drosophila_melanogaster
ENSPFOG00000004116	syf2	86	66.667	ENSETEG00000015729	SYF2	90	66.667	Echinops_telfairi
ENSPFOG00000004116	syf2	81	56.853	ENSEBUG00000015402	syf2	95	56.853	Eptatretus_burgeri
ENSPFOG00000004116	syf2	95	69.957	ENSEASG00005004232	-	96	69.957	Equus_asinus_asinus
ENSPFOG00000004116	syf2	95	78.298	ENSEASG00005004224	-	96	78.298	Equus_asinus_asinus
ENSPFOG00000004116	syf2	99	75.102	ENSECAG00000012023	-	100	74.694	Equus_caballus
ENSPFOG00000004116	syf2	95	78.298	ENSECAG00000010440	-	98	78.298	Equus_caballus
ENSPFOG00000004116	syf2	69	66.471	ENSEEUG00000015084	SYF2	93	66.471	Erinaceus_europaeus
ENSPFOG00000004116	syf2	92	86.486	ENSELUG00000003465	syf2	93	86.486	Esox_lucius
ENSPFOG00000004116	syf2	99	74.390	ENSFCAG00000043095	-	100	74.390	Felis_catus
ENSPFOG00000004116	syf2	95	78.788	ENSFCAG00000010324	-	78	78.788	Felis_catus
ENSPFOG00000004116	syf2	84	79.902	ENSFALG00000000460	SYF2	92	77.974	Ficedula_albicollis
ENSPFOG00000004116	syf2	95	76.923	ENSFDAG00000008310	SYF2	96	76.923	Fukomys_damarensis
ENSPFOG00000004116	syf2	93	80.531	ENSFHEG00000007238	syf2	100	80.531	Fundulus_heteroclitus
ENSPFOG00000004116	syf2	89	87.442	ENSGMOG00000019138	syf2	96	87.442	Gadus_morhua
ENSPFOG00000004116	syf2	92	81.532	ENSGALG00000013639	SYF2	88	81.532	Gallus_gallus
ENSPFOG00000004116	syf2	99	94.561	ENSGAFG00000019435	syf2	100	94.561	Gambusia_affinis
ENSPFOG00000004116	syf2	92	89.640	ENSGACG00000007305	syf2	100	84.937	Gasterosteus_aculeatus
ENSPFOG00000004116	syf2	92	81.778	ENSGAGG00000010670	SYF2	94	79.828	Gopherus_agassizii
ENSPFOG00000004116	syf2	89	80.556	ENSGGOG00000012796	SYF2	90	80.275	Gorilla_gorilla
ENSPFOG00000004116	syf2	96	90.517	ENSHBUG00000020477	syf2	99	90.517	Haplochromis_burtoni
ENSPFOG00000004116	syf2	92	70.270	ENSHGLG00000004304	-	93	70.721	Heterocephalus_glaber_female
ENSPFOG00000004116	syf2	99	74.590	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	74.590	Heterocephalus_glaber_female
ENSPFOG00000004116	syf2	99	74.590	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	74.590	Heterocephalus_glaber_male
ENSPFOG00000004116	syf2	94	90.749	ENSHCOG00000012904	syf2	74	90.749	Hippocampus_comes
ENSPFOG00000004116	syf2	100	81.481	ENSIPUG00000019859	syf2	100	81.481	Ictalurus_punctatus
ENSPFOG00000004116	syf2	60	73.973	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	73.973	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPFOG00000004116	syf2	82	80.905	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	80.905	Jaculus_jaculus
ENSPFOG00000004116	syf2	99	89.958	ENSKMAG00000013856	syf2	100	89.958	Kryptolebias_marmoratus
ENSPFOG00000004116	syf2	90	92.627	ENSLBEG00000014425	syf2	100	88.285	Labrus_bergylta
ENSPFOG00000004116	syf2	95	78.261	ENSLACG00000012064	SYF2	97	78.261	Latimeria_chalumnae
ENSPFOG00000004116	syf2	95	84.783	ENSLOCG00000002728	syf2	92	84.783	Lepisosteus_oculatus
ENSPFOG00000004116	syf2	76	53.261	ENSLAFG00000030814	-	100	53.261	Loxodonta_africana
ENSPFOG00000004116	syf2	95	78.298	ENSLAFG00000023150	-	100	75.510	Loxodonta_africana
ENSPFOG00000004116	syf2	95	75.417	ENSMFAG00000041831	SYF2	99	75.417	Macaca_fascicularis
ENSPFOG00000004116	syf2	89	80.000	ENSMMUG00000002968	SYF2	90	79.358	Macaca_mulatta
ENSPFOG00000004116	syf2	95	75.417	ENSMNEG00000030180	SYF2	99	75.417	Macaca_nemestrina
ENSPFOG00000004116	syf2	95	75.417	ENSMLEG00000030248	SYF2	99	75.417	Mandrillus_leucophaeus
ENSPFOG00000004116	syf2	90	91.705	ENSMAMG00000010403	syf2	100	86.939	Mastacembelus_armatus
ENSPFOG00000004116	syf2	99	88.285	ENSMZEG00005006429	syf2	100	88.285	Maylandia_zebra
ENSPFOG00000004116	syf2	82	81.910	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	81.910	Meleagris_gallopavo
ENSPFOG00000004116	syf2	95	78.541	ENSMAUG00000018974	Syf2	96	78.541	Mesocricetus_auratus
ENSPFOG00000004116	syf2	82	80.905	ENSMICG00000016191	SYF2	100	80.905	Microcebus_murinus
ENSPFOG00000004116	syf2	95	78.112	ENSMOCG00000022938	Syf2	96	78.112	Microtus_ochrogaster
ENSPFOG00000004116	syf2	96	87.554	ENSMMOG00000002396	syf2	97	87.554	Mola_mola
ENSPFOG00000004116	syf2	92	75.893	ENSMODG00000013951	-	98	75.893	Monodelphis_domestica
ENSPFOG00000004116	syf2	95	88.312	ENSMALG00000010706	syf2	96	88.745	Monopterus_albus
ENSPFOG00000004116	syf2	100	76.033	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	76.033	Mus_caroli
ENSPFOG00000004116	syf2	100	76.033	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	76.033	Mus_musculus
ENSPFOG00000004116	syf2	100	76.033	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	76.033	Mus_pahari
ENSPFOG00000004116	syf2	100	76.033	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	76.033	Mus_spretus
ENSPFOG00000004116	syf2	99	73.171	ENSMPUG00000015802	-	100	73.171	Mustela_putorius_furo
ENSPFOG00000004116	syf2	95	76.271	ENSMPUG00000015801	-	96	76.271	Mustela_putorius_furo
ENSPFOG00000004116	syf2	95	77.489	ENSMLUG00000001885	SYF2	93	77.489	Myotis_lucifugus
ENSPFOG00000004116	syf2	92	79.279	ENSNGAG00000007912	Syf2	90	79.279	Nannospalax_galili
ENSPFOG00000004116	syf2	99	77.406	ENSNBRG00000010720	syf2	100	77.406	Neolamprologus_brichardi
ENSPFOG00000004116	syf2	89	80.556	ENSNLEG00000035185	SYF2	90	80.275	Nomascus_leucogenys
ENSPFOG00000004116	syf2	95	77.489	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	74.486	Ochotona_princeps
ENSPFOG00000004116	syf2	100	73.967	ENSODEG00000017664	-	100	73.967	Octodon_degus
ENSPFOG00000004116	syf2	95	67.521	ENSODEG00000014338	-	98	67.521	Octodon_degus
ENSPFOG00000004116	syf2	92	91.928	ENSONIG00000008213	syf2	100	88.285	Oreochromis_niloticus
ENSPFOG00000004116	syf2	83	81.188	ENSOANG00000009552	SYF2	100	81.188	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPFOG00000004116	syf2	99	74.590	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	74.590	Oryctolagus_cuniculus
ENSPFOG00000004116	syf2	95	89.565	ENSORLG00000028820	syf2	99	89.565	Oryzias_latipes
ENSPFOG00000004116	syf2	95	89.956	ENSORLG00020018333	syf2	97	89.956	Oryzias_latipes_hni
ENSPFOG00000004116	syf2	95	90.393	ENSORLG00015014665	syf2	96	90.393	Oryzias_latipes_hsok
ENSPFOG00000004116	syf2	93	92.000	ENSOMEG00000013911	syf2	95	92.000	Oryzias_melastigma
ENSPFOG00000004116	syf2	95	78.205	ENSOGAG00000009962	SYF2	96	78.205	Otolemur_garnettii
ENSPFOG00000004116	syf2	99	73.279	ENSOARG00000006348	-	100	73.279	Ovis_aries
ENSPFOG00000004116	syf2	81	54.359	ENSOARG00000006269	-	100	54.359	Ovis_aries
ENSPFOG00000004116	syf2	89	80.556	ENSPPAG00000036579	SYF2	90	80.275	Pan_paniscus
ENSPFOG00000004116	syf2	95	78.788	ENSPPRG00000001638	-	91	78.788	Panthera_pardus
ENSPFOG00000004116	syf2	99	74.390	ENSPPRG00000001651	-	100	74.390	Panthera_pardus
ENSPFOG00000004116	syf2	89	81.481	ENSPTIG00000005711	-	80	81.193	Panthera_tigris_altaica
ENSPFOG00000004116	syf2	99	74.390	ENSPTIG00000007036	-	100	74.390	Panthera_tigris_altaica
ENSPFOG00000004116	syf2	89	80.556	ENSPTRG00000000352	SYF2	90	80.275	Pan_troglodytes
ENSPFOG00000004116	syf2	95	75.417	ENSPANG00000008139	SYF2	99	75.417	Papio_anubis
ENSPFOG00000004116	syf2	91	83.710	ENSPKIG00000008130	syf2	94	83.710	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPFOG00000004116	syf2	95	78.970	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	78.970	Pelodiscus_sinensis
ENSPFOG00000004116	syf2	99	82.988	ENSPMGG00000008755	syf2	93	82.988	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPFOG00000004116	syf2	95	77.682	ENSPEMG00000008283	Syf2	96	77.682	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPFOG00000004116	syf2	92	80.631	ENSPCIG00000014235	SYF2	89	80.631	Phascolarctos_cinereus
ENSPFOG00000004116	syf2	99	97.500	ENSPLAG00000006691	syf2	99	99.569	Poecilia_latipinna
ENSPFOG00000004116	syf2	99	93.305	ENSPMEG00000011684	syf2	99	94.783	Poecilia_mexicana
ENSPFOG00000004116	syf2	99	95.816	ENSPREG00000003009	syf2	100	95.816	Poecilia_reticulata
ENSPFOG00000004116	syf2	90	80.275	ENSPPYG00000001713	SYF2	90	80.275	Pongo_abelii
ENSPFOG00000004116	syf2	95	53.846	ENSPCOG00000027011	SYF2	95	53.846	Propithecus_coquereli
ENSPFOG00000004116	syf2	99	66.939	ENSPVAG00000005841	SYF2	100	66.939	Pteropus_vampyrus
ENSPFOG00000004116	syf2	92	91.928	ENSPNYG00000004979	syf2	99	88.559	Pundamilia_nyererei
ENSPFOG00000004116	syf2	95	83.478	ENSPNAG00000015570	syf2	97	83.478	Pygocentrus_nattereri
ENSPFOG00000004116	syf2	100	76.033	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	76.033	Rattus_norvegicus
ENSPFOG00000004116	syf2	95	73.333	ENSRBIG00000042970	SYF2	99	73.333	Rhinopithecus_bieti
ENSPFOG00000004116	syf2	95	75.417	ENSRROG00000001347	SYF2	99	75.417	Rhinopithecus_roxellana
ENSPFOG00000004116	syf2	89	80.556	ENSSBOG00000020184	SYF2	93	77.489	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPFOG00000004116	syf2	85	80.583	ENSSHAG00000007152	-	100	80.583	Sarcophilus_harrisii
ENSPFOG00000004116	syf2	92	79.279	ENSSHAG00000015630	-	89	79.279	Sarcophilus_harrisii
ENSPFOG00000004116	syf2	91	85.068	ENSSFOG00015023647	syf2	93	85.068	Scleropages_formosus
ENSPFOG00000004116	syf2	99	84.519	ENSSMAG00000009867	syf2	100	84.519	Scophthalmus_maximus
ENSPFOG00000004116	syf2	90	91.743	ENSSDUG00000013072	syf2	97	89.565	Seriola_dumerili
ENSPFOG00000004116	syf2	90	91.743	ENSSLDG00000012677	syf2	97	89.565	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPFOG00000004116	syf2	95	60.345	ENSSARG00000012889	SYF2	95	60.345	Sorex_araneus
ENSPFOG00000004116	syf2	99	78.279	ENSSPUG00000005251	SYF2	95	78.279	Sphenodon_punctatus
ENSPFOG00000004116	syf2	99	87.448	ENSSPAG00000009626	syf2	100	87.448	Stegastes_partitus
ENSPFOG00000004116	syf2	95	77.155	ENSSSCG00000037481	SYF2	100	73.984	Sus_scrofa
ENSPFOG00000004116	syf2	69	52.353	ENSTGUG00000001126	SYF2	86	51.429	Taeniopygia_guttata
ENSPFOG00000004116	syf2	93	87.168	ENSTRUG00000001499	syf2	91	87.168	Takifugu_rubripes
ENSPFOG00000004116	syf2	92	87.387	ENSTNIG00000016912	syf2	99	87.387	Tetraodon_nigroviridis
ENSPFOG00000004116	syf2	95	58.798	ENSTBEG00000017370	SYF2	95	58.798	Tupaia_belangeri
ENSPFOG00000004116	syf2	99	74.180	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	74.590	Tursiops_truncatus
ENSPFOG00000004116	syf2	99	73.171	ENSUAMG00000002897	SYF2	100	73.171	Ursus_americanus
ENSPFOG00000004116	syf2	99	72.358	ENSUMAG00000013108	SYF2	100	73.279	Ursus_maritimus
ENSPFOG00000004116	syf2	99	74.180	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	74.180	Vicugna_pacos
ENSPFOG00000004116	syf2	85	80.000	ENSVVUG00000027181	-	90	78.924	Vulpes_vulpes
ENSPFOG00000004116	syf2	99	72.358	ENSVVUG00000027175	-	100	73.279	Vulpes_vulpes
ENSPFOG00000004116	syf2	95	75.966	ENSXETG00000022797	syf2	94	75.966	Xenopus_tropicalis
ENSPFOG00000004116	syf2	99	93.724	ENSXMAG00000022698	syf2	100	93.724	Xiphophorus_maculatus