EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000004248 (Gene tree)
Gene ID: 103149973
Gene Symbol: prpf38a
Alias: -
Full Name: pre-mRNA processing factor 38A
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 7286 bases
Position: chrKI519850.1:455913-463198
Accession: 103149973
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000004203	PRP38	PF03371.15	2.7e-63	1	1
ENSPFOP00000028824	PRP38	PF03371.15	2e-61	1	1

Transcripts

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Orthologs

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ENSPFOG00000004248	prpf38a	100	96.440	ENSAPOG00000011652	prpf38a	100	96.440	Acanthochromis_polyacanthus
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ENSPFOG00000004248	prpf38a	72	92.760	ENSACIG00000012292	prpf38a	83	83.398	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000004248	prpf38a	100	96.440	ENSAOCG00000018004	prpf38a	100	96.440	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000004248	prpf38a	100	96.440	ENSAPEG00000021414	prpf38a	100	96.440	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000004248	prpf38a	72	94.570	ENSATEG00000004608	prpf38a	100	87.500	Anabas_testudineus
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ENSPFOG00000004248	prpf38a	100	60.952	ENSANAG00000029204	-	80	52.852	Aotus_nancymaae
ENSPFOG00000004248	prpf38a	72	94.118	ENSACLG00000021595	prpf38a	100	86.218	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000004248	prpf38a	100	83.706	ENSAMXG00000029274	prpf38a	100	84.494	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000004248	prpf38a	100	82.428	ENSBTAG00000002720	PRPF38A	88	84.942	Bos_taurus
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ENSPFOG00000004248	prpf38a	100	82.428	ENSCAFG00000003740	PRPF38A	83	81.467	Canis_familiaris
ENSPFOG00000004248	prpf38a	100	82.428	ENSCAFG00020010939	PRPF38A	83	81.467	Canis_lupus_dingo
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ENSPFOG00000004248	prpf38a	100	82.428	ENSCLAG00000005816	PRPF38A	83	81.467	Chinchilla_lanigera
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ENSPFOG00000004248	prpf38a	100	82.428	ENSCGRG00000014868	Prpf38a	83	81.467	Cricetulus_griseus_crigri
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ENSPFOG00000004248	prpf38a	84	75.665	ENSDORG00000025371	-	75	82.569	Dipodomys_ordii
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