EuRBPDB

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000005069 (Gene tree)
Gene ID: 103151020
Gene Symbol: sbno1
Alias: -
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 21891 bases
Position: chrKI519879.1:667397-689287
Accession: 103151020
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000022611	ResIII	PF04851.15	9.9e-08	1	1
ENSPFOP00000005633	ResIII	PF04851.15	1e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000005642	-	7135	-	ENSPFOP00000005633	1404 (aa)	XP_007570898	A0A087XIN0
ENSPFOT00000029035	-	7024	-	ENSPFOP00000022611	1367 (aa)	-	A0A096LTX0

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPFOG00000005069	sbno1	78	57.824	ENSPFOG00000004096	si:ch73-63e15.2	83	63.946

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPFOG00000005069	sbno1	99	76.137	ENSG00000139697	SBNO1	99	76.127	Homo_sapiens
ENSPFOG00000005069	sbno1	82	94.435	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	94.435	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000005069	sbno1	99	76.047	ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.966	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPFOG00000005069	sbno1	100	87.015	ENSACIG00000008088	sbno1	99	87.227	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000005069	sbno1	100	91.607	ENSAOCG00000014859	sbno1	99	91.607	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000005069	sbno1	100	91.536	ENSAPEG00000006069	sbno1	99	91.536	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000005069	sbno1	100	92.182	ENSATEG00000006667	sbno1	100	92.182	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000005069	sbno1	98	76.741	ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	76.554	Anas_platyrhynchos
ENSPFOG00000005069	sbno1	98	75.339	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	75.158	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000005069	sbno1	95	84.029	ENSANAG00000029958	-	99	83.513	Aotus_nancymaae
ENSPFOG00000005069	sbno1	100	85.328	ENSACLG00000024913	sbno1	100	85.470	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000005069	sbno1	100	82.199	ENSAMXG00000019473	sbno1	100	82.766	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000005069	sbno1	100	76.364	ENSBTAG00000020505	SBNO1	99	76.355	Bos_taurus
ENSPFOG00000005069	sbno1	99	76.442	ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	76.197	Callithrix_jacchus
ENSPFOG00000005069	sbno1	99	76.171	ENSCAFG00000007503	SBNO1	99	79.854	Canis_familiaris
ENSPFOG00000005069	sbno1	95	81.149	ENSCAFG00020015363	SBNO1	99	81.329	Canis_lupus_dingo
ENSPFOG00000005069	sbno1	95	83.513	ENSCHIG00000008382	SBNO1	99	83.513	Capra_hircus
ENSPFOG00000005069	sbno1	99	76.190	ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	77.477	Carlito_syrichta
ENSPFOG00000005069	sbno1	91	83.662	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	83.662	Cavia_aperea
ENSPFOG00000005069	sbno1	95	83.662	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	83.662	Cavia_porcellus
ENSPFOG00000005069	sbno1	99	72.171	ENSCCAG00000035316	SBNO1	99	72.401	Cebus_capucinus
ENSPFOG00000005069	sbno1	99	76.140	ENSCATG00000008239	SBNO1	99	83.842	Cercocebus_atys
ENSPFOG00000005069	sbno1	95	83.662	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	83.662	Chinchilla_lanigera
ENSPFOG00000005069	sbno1	82	82.464	ENSCSAG00000002064	SBNO1	99	82.530	Chlorocebus_sabaeus
ENSPFOG00000005069	sbno1	96	73.439	ENSCHOG00000008814	SBNO1	96	73.402	Choloepus_hoffmanni
ENSPFOG00000005069	sbno1	98	76.242	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	75.779	Chrysemys_picta_bellii
ENSPFOG00000005069	sbno1	99	72.370	ENSCANG00000042688	-	99	72.324	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPFOG00000005069	sbno1	95	82.437	ENSCGRG00001017470	Sbno1	99	82.437	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPFOG00000005069	sbno1	95	82.437	ENSCGRG00000004756	Sbno1	99	82.437	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPFOG00000005069	sbno1	100	88.193	ENSCSEG00000011919	sbno1	100	88.122	Cynoglossus_semilaevis
ENSPFOG00000005069	sbno1	100	95.658	ENSCVAG00000007038	sbno1	100	95.445	Cyprinodon_variegatus
ENSPFOG00000005069	sbno1	99	82.692	ENSDARG00000099080	sbno1	99	82.705	Danio_rerio
ENSPFOG00000005069	sbno1	99	78.707	ENSDNOG00000017147	SBNO1	96	78.707	Dasypus_novemcinctus
ENSPFOG00000005069	sbno1	99	72.222	ENSDORG00000015261	Sbno1	99	81.278	Dipodomys_ordii
ENSPFOG00000005069	sbno1	93	72.642	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	72.642	Echinops_telfairi
ENSPFOG00000005069	sbno1	75	62.696	ENSEBUG00000013823	sbno1	93	61.900	Eptatretus_burgeri
ENSPFOG00000005069	sbno1	51	73.416	ENSEASG00005012595	-	92	73.619	Equus_asinus_asinus
ENSPFOG00000005069	sbno1	99	76.347	ENSECAG00000006127	SBNO1	99	77.035	Equus_caballus
ENSPFOG00000005069	sbno1	81	77.596	ENSEEUG00000003793	SBNO1	82	77.596	Erinaceus_europaeus
ENSPFOG00000005069	sbno1	100	83.416	ENSELUG00000002886	sbno1	99	83.203	Esox_lucius
ENSPFOG00000005069	sbno1	99	76.277	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	76.127	Felis_catus
ENSPFOG00000005069	sbno1	98	76.956	ENSFALG00000009273	SBNO1	99	76.695	Ficedula_albicollis
ENSPFOG00000005069	sbno1	95	81.159	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	80.610	Fukomys_damarensis
ENSPFOG00000005069	sbno1	100	95.587	ENSFHEG00000007360	sbno1	100	95.374	Fundulus_heteroclitus
ENSPFOG00000005069	sbno1	94	85.736	ENSGMOG00000018229	sbno1	99	85.671	Gadus_morhua
ENSPFOG00000005069	sbno1	88	76.990	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	76.856	Gallus_gallus
ENSPFOG00000005069	sbno1	100	98.718	ENSGAFG00000003960	sbno1	100	98.718	Gambusia_affinis
ENSPFOG00000005069	sbno1	94	89.557	ENSGACG00000015633	sbno1	99	89.406	Gasterosteus_aculeatus
ENSPFOG00000005069	sbno1	98	75.629	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	83.039	Gopherus_agassizii
ENSPFOG00000005069	sbno1	95	83.662	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	83.662	Gorilla_gorilla
ENSPFOG00000005069	sbno1	100	79.247	ENSHBUG00000011910	sbno1	100	79.318	Haplochromis_burtoni
ENSPFOG00000005069	sbno1	95	84.392	ENSHGLG00000014165	-	99	83.993	Heterocephalus_glaber_female
ENSPFOG00000005069	sbno1	92	92.277	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	92.277	Hippocampus_comes
ENSPFOG00000005069	sbno1	100	82.307	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	83.036	Ictalurus_punctatus
ENSPFOG00000005069	sbno1	95	83.662	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	83.662	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPFOG00000005069	sbno1	99	76.137	ENSJJAG00000001741	Sbno1	99	79.892	Jaculus_jaculus
ENSPFOG00000005069	sbno1	99	93.647	ENSKMAG00000009696	sbno1	99	93.647	Kryptolebias_marmoratus
ENSPFOG00000005069	sbno1	100	89.433	ENSLBEG00000007623	sbno1	100	89.574	Labrus_bergylta
ENSPFOG00000005069	sbno1	100	72.714	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	74.781	Latimeria_chalumnae
ENSPFOG00000005069	sbno1	100	81.901	ENSLOCG00000005725	sbno1	97	81.479	Lepisosteus_oculatus
ENSPFOG00000005069	sbno1	99	75.787	ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	75.775	Loxodonta_africana
ENSPFOG00000005069	sbno1	95	80.462	ENSMFAG00000031429	SBNO1	99	80.462	Macaca_fascicularis
ENSPFOG00000005069	sbno1	95	80.462	ENSMMUG00000011496	SBNO1	99	80.462	Macaca_mulatta
ENSPFOG00000005069	sbno1	95	83.662	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	83.662	Mandrillus_leucophaeus
ENSPFOG00000005069	sbno1	100	91.595	ENSMAMG00000005473	sbno1	100	91.382	Mastacembelus_armatus
ENSPFOG00000005069	sbno1	98	77.139	ENSMGAG00000003274	SBNO1	99	76.803	Meleagris_gallopavo
ENSPFOG00000005069	sbno1	50	74.253	ENSMAUG00000004834	-	98	74.786	Mesocricetus_auratus
ENSPFOG00000005069	sbno1	95	81.125	ENSMICG00000006573	-	99	80.645	Microcebus_murinus
ENSPFOG00000005069	sbno1	95	83.154	ENSMOCG00000009390	Sbno1	99	83.154	Microtus_ochrogaster
ENSPFOG00000005069	sbno1	100	83.642	ENSMMOG00000008691	sbno1	99	84.435	Mola_mola
ENSPFOG00000005069	sbno1	99	75.913	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	76.130	Monodelphis_domestica
ENSPFOG00000005069	sbno1	100	90.334	ENSMALG00000001056	sbno1	100	90.334	Monopterus_albus
ENSPFOG00000005069	sbno1	99	75.719	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	91.667	Mus_caroli
ENSPFOG00000005069	sbno1	99	75.806	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	91.667	Mus_musculus
ENSPFOG00000005069	sbno1	99	76.500	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	91.667	Mus_pahari
ENSPFOG00000005069	sbno1	99	75.736	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	91.667	Mus_spretus
ENSPFOG00000005069	sbno1	99	76.331	ENSMPUG00000001658	SBNO1	99	76.180	Mustela_putorius_furo
ENSPFOG00000005069	sbno1	99	76.160	ENSMLUG00000017159	SBNO1	99	75.915	Myotis_lucifugus
ENSPFOG00000005069	sbno1	92	84.570	ENSNGAG00000012620	Sbno1	98	84.570	Nannospalax_galili
ENSPFOG00000005069	sbno1	100	86.325	ENSNBRG00000019189	sbno1	100	86.396	Neolamprologus_brichardi
ENSPFOG00000005069	sbno1	99	73.282	ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	75.763	Nomascus_leucogenys
ENSPFOG00000005069	sbno1	62	73.585	ENSMEUG00000008768	-	93	74.214	Notamacropus_eugenii
ENSPFOG00000005069	sbno1	99	75.527	ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	75.915	Ochotona_princeps
ENSPFOG00000005069	sbno1	95	83.842	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	83.842	Octodon_degus
ENSPFOG00000005069	sbno1	100	90.618	ENSONIG00000015348	sbno1	100	90.689	Oreochromis_niloticus
ENSPFOG00000005069	sbno1	98	75.374	ENSOCUG00000002441	SBNO1	95	75.287	Oryctolagus_cuniculus
ENSPFOG00000005069	sbno1	100	89.694	ENSORLG00000001593	sbno1	100	89.694	Oryzias_latipes
ENSPFOG00000005069	sbno1	100	90.114	ENSORLG00020015216	sbno1	100	90.185	Oryzias_latipes_hni
ENSPFOG00000005069	sbno1	100	89.972	ENSORLG00015002726	sbno1	100	90.043	Oryzias_latipes_hsok
ENSPFOG00000005069	sbno1	100	89.395	ENSOMEG00000019313	sbno1	100	89.466	Oryzias_melastigma
ENSPFOG00000005069	sbno1	50	72.688	ENSOGAG00000010781	-	98	72.896	Otolemur_garnettii
ENSPFOG00000005069	sbno1	100	75.753	ENSOARG00000004404	SBNO1	99	76.056	Ovis_aries
ENSPFOG00000005069	sbno1	95	83.662	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	83.662	Pan_paniscus
ENSPFOG00000005069	sbno1	99	76.277	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	76.127	Panthera_pardus
ENSPFOG00000005069	sbno1	99	76.297	ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	76.147	Panthera_tigris_altaica
ENSPFOG00000005069	sbno1	95	83.662	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	83.662	Pan_troglodytes
ENSPFOG00000005069	sbno1	95	83.662	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	83.662	Papio_anubis
ENSPFOG00000005069	sbno1	100	81.427	ENSPKIG00000001441	sbno1	100	81.003	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPFOG00000005069	sbno1	98	76.040	ENSPSIG00000009572	-	99	75.811	Pelodiscus_sinensis
ENSPFOG00000005069	sbno1	92	73.191	ENSPSIG00000009256	-	99	73.186	Pelodiscus_sinensis
ENSPFOG00000005069	sbno1	95	82.975	ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	82.975	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSPFOG00000005069	sbno1	100	98.719	ENSPREG00000017746	sbno1	100	98.719	Poecilia_reticulata
ENSPFOG00000005069	sbno1	99	76.000	ENSPPYG00000005084	SBNO1	99	76.059	Pongo_abelii
ENSPFOG00000005069	sbno1	89	69.588	ENSPCAG00000008634	SBNO1	88	69.159	Procavia_capensis
ENSPFOG00000005069	sbno1	95	83.971	ENSPCOG00000024277	SBNO1	99	83.971	Propithecus_coquereli
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